MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Brachyspira intermedia PWS/A chromosome

Total Repeats: 104131

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_017243	AAATG	2	10	47306	47315	60 %	20 %	20 %	0 %	384207543
1502	NC_017243	TAT	2	6	47324	47329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207543
1503	NC_017243	TGC	2	6	47339	47344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384207543
1504	NC_017243	CAT	2	6	47423	47428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207543
1505	NC_017243	TTA	2	6	47455	47460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207543
1506	NC_017243	TCA	2	6	47467	47472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207543
1507	NC_017243	TTA	2	6	47577	47582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207543
1508	NC_017243	TAC	2	6	47630	47635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207543
1509	NC_017243	AGC	2	6	47654	47659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384207543
1510	NC_017243	TAT	2	6	47665	47670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207543
1511	NC_017243	ATT	2	6	47742	47747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207543
1512	NC_017243	AGC	2	6	47771	47776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384207543
1513	NC_017243	CTA	2	6	47818	47823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207543
1514	NC_017243	TGATA	2	10	47849	47858	40 %	40 %	20 %	0 %	384207543
1515	NC_017243	CAT	2	6	47923	47928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207543
1516	NC_017243	ATAA	2	8	47934	47941	75 %	25 %	0 %	0 %	384207543
1517	NC_017243	TA	3	6	47949	47954	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_017243	A	6	6	47954	47959	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_017243	TAT	2	6	47975	47980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_017243	T	7	7	47980	47986	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_017243	T	6	6	47991	47996	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_017243	TAA	3	9	48016	48024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_017243	ATA	2	6	48037	48042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_017243	ATA	2	6	48049	48054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_017243	ATA	2	6	48081	48086	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207544
1526	NC_017243	CTT	2	6	48152	48157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384207544
1527	NC_017243	AGCAGG	2	12	48160	48171	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	384207544
1528	NC_017243	TTA	2	6	48189	48194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207544
1529	NC_017243	CTTAT	2	10	48207	48216	20 %	60 %	0 %	20 %	384207544
1530	NC_017243	AG	4	8	48289	48296	50 %	0 %	50 %	0 %	384207544
1531	NC_017243	ATT	2	6	48331	48336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207544
1532	NC_017243	ATC	2	6	48436	48441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207544
1533	NC_017243	TTA	2	6	48444	48449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207544
1534	NC_017243	AAT	2	6	48454	48459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207544
1535	NC_017243	AGA	2	6	48463	48468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207544
1536	NC_017243	GAT	2	6	48536	48541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207544
1537	NC_017243	A	6	6	48581	48586	100 %	0 %	0 %	0 %	384207544
1538	NC_017243	TGA	2	6	48625	48630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207544
1539	NC_017243	ATT	2	6	48652	48657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207544
1540	NC_017243	ATT	2	6	48681	48686	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207544
1541	NC_017243	AT	3	6	48703	48708	50 %	50 %	0 %	0 %	384207544
1542	NC_017243	CAG	2	6	48740	48745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384207544
1543	NC_017243	ATT	2	6	48760	48765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207544
1544	NC_017243	AGG	2	6	48771	48776	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384207544
1545	NC_017243	GAT	3	9	48803	48811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207544
1546	NC_017243	TA	3	6	48817	48822	50 %	50 %	0 %	0 %	384207544
1547	NC_017243	GCT	2	6	48935	48940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384207544
1548	NC_017243	TAA	2	6	48948	48953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207544
1549	NC_017243	A	6	6	48952	48957	100 %	0 %	0 %	0 %	384207544
1550	NC_017243	AGA	2	6	49042	49047	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207544
1551	NC_017243	TAT	2	6	49116	49121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207544
1552	NC_017243	AGTC	2	8	49133	49140	25 %	25 %	25 %	25 %	384207544
1553	NC_017243	T	6	6	49240	49245	0 %	100 %	0 %	0 %	384207544
1554	NC_017243	TGA	2	6	49393	49398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207544
1555	NC_017243	ATC	2	6	49399	49404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207544
1556	NC_017243	A	7	7	49411	49417	100 %	0 %	0 %	0 %	384207544
1557	NC_017243	TAT	2	6	49447	49452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207544
1558	NC_017243	AGA	2	6	49453	49458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207544
1559	NC_017243	AGA	2	6	49477	49482	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207544
1560	NC_017243	TAT	2	6	49483	49488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207544
1561	NC_017243	GAA	2	6	49493	49498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207544
1562	NC_017243	ATT	3	9	49513	49521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207544
1563	NC_017243	ATT	2	6	49545	49550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207544
1564	NC_017243	AGA	2	6	49594	49599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207544
1565	NC_017243	AGA	2	6	49675	49680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207544
1566	NC_017243	ATG	2	6	49710	49715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207544
1567	NC_017243	TGA	2	6	49737	49742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207544
1568	NC_017243	TGT	2	6	49774	49779	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384207544
1569	NC_017243	ATT	2	6	49815	49820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207544
1570	NC_017243	GAA	2	6	49829	49834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207544
1571	NC_017243	TGA	2	6	49846	49851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207544
1572	NC_017243	AG	3	6	49852	49857	50 %	0 %	50 %	0 %	384207544
1573	NC_017243	A	7	7	49915	49921	100 %	0 %	0 %	0 %	384207544
1574	NC_017243	CTT	2	6	49956	49961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384207544
1575	NC_017243	A	6	6	49982	49987	100 %	0 %	0 %	0 %	384207544
1576	NC_017243	AAAAG	2	10	49999	50008	80 %	0 %	20 %	0 %	384207544
1577	NC_017243	ATT	3	9	50013	50021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207544
1578	NC_017243	ATT	2	6	50058	50063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207544
1579	NC_017243	T	6	6	50066	50071	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_017243	TA	4	8	50114	50121	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_017243	TA	3	6	50148	50153	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_017243	TTTAAA	2	12	50185	50196	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_017243	TGGG	2	8	50204	50211	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_017243	ATA	2	6	50232	50237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_017243	TA	3	6	50260	50265	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1586	NC_017243	A	6	6	50312	50317	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1587	NC_017243	TAAA	2	8	50318	50325	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_017243	A	6	6	50323	50328	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1589	NC_017243	TAA	2	6	50364	50369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_017243	TA	4	8	50371	50378	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_017243	T	6	6	50405	50410	0 %	100 %	0 %	0 %	384207545
1592	NC_017243	CAA	3	9	50440	50448	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384207545
1593	NC_017243	CTA	2	6	50449	50454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207545
1594	NC_017243	ATC	2	6	50477	50482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207545
1595	NC_017243	TA	3	6	50488	50493	50 %	50 %	0 %	0 %	384207545
1596	NC_017243	GAA	2	6	50510	50515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207545
1597	NC_017243	GAA	2	6	50520	50525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207545
1598	NC_017243	AAT	2	6	50532	50537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207545
1599	NC_017243	AGA	2	6	50588	50593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207545
1600	NC_017243	T	7	7	50601	50607	0 %	100 %	0 %	0 %	384207545
1601	NC_017243	AAC	2	6	50612	50617	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384207545
1602	NC_017243	T	6	6	50627	50632	0 %	100 %	0 %	0 %	384207545
1603	NC_017243	TTTGAT	2	12	50652	50663	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384207545
1604	NC_017243	TAT	2	6	50668	50673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207545
1605	NC_017243	T	7	7	50686	50692	0 %	100 %	0 %	0 %	384207545
1606	NC_017243	TAA	2	6	50741	50746	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207545
1607	NC_017243	TCA	2	6	50760	50765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207545
1608	NC_017243	ATA	2	6	50789	50794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207545
1609	NC_017243	AAT	2	6	50855	50860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207545
1610	NC_017243	T	6	6	50868	50873	0 %	100 %	0 %	0 %	384207545
1611	NC_017243	TAC	2	6	50879	50884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207545
1612	NC_017243	ATTAT	2	10	50889	50898	40 %	60 %	0 %	0 %	384207545
1613	NC_017243	TCC	2	6	50909	50914	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1614	NC_017243	AAAT	2	8	50923	50930	75 %	25 %	0 %	0 %	384207546
1615	NC_017243	T	7	7	50941	50947	0 %	100 %	0 %	0 %	384207546
1616	NC_017243	ATC	2	6	50948	50953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207546
1617	NC_017243	CTG	2	6	51012	51017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384207546
1618	NC_017243	ATT	2	6	51035	51040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207546
1619	NC_017243	TCT	2	6	51047	51052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384207546
1620	NC_017243	CT	4	8	51051	51058	0 %	50 %	0 %	50 %	384207546
1621	NC_017243	TC	3	6	51069	51074	0 %	50 %	0 %	50 %	384207546
1622	NC_017243	TCATAT	2	12	51078	51089	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384207546
1623	NC_017243	TCT	3	9	51096	51104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384207546
1624	NC_017243	TTCT	2	8	51109	51116	0 %	75 %	0 %	25 %	384207546
1625	NC_017243	TAT	2	6	51121	51126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207546
1626	NC_017243	ATA	2	6	51152	51157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207546
1627	NC_017243	TAT	2	6	51184	51189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207546
1628	NC_017243	ATC	2	6	51194	51199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207546
1629	NC_017243	TCA	3	9	51207	51215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207546
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