MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Brachyspira intermedia PWS/A chromosome

Total Repeats: 104131

< Previous12...197198199200201202203204205206207208209Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
104001	NC_017243	A	6	6	3300512	3300517	100 %	0 %	0 %	0 %	384210363
104002	NC_017243	AT	3	6	3300528	3300533	50 %	50 %	0 %	0 %	384210363
104003	NC_017243	ATTT	2	8	3300546	3300553	25 %	75 %	0 %	0 %	384210363
104004	NC_017243	T	6	6	3300573	3300578	0 %	100 %	0 %	0 %	384210363
104005	NC_017243	ATC	2	6	3300823	3300828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384210363
104006	NC_017243	CTT	2	6	3300884	3300889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384210363
104007	NC_017243	ATAA	2	8	3300894	3300901	75 %	25 %	0 %	0 %	384210363
104008	NC_017243	TCA	2	6	3300917	3300922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384210363
104009	NC_017243	T	7	7	3300964	3300970	0 %	100 %	0 %	0 %	384210363
104010	NC_017243	TCA	2	6	3300998	3301003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384210363
104011	NC_017243	T	7	7	3301012	3301018	0 %	100 %	0 %	0 %	384210363
104012	NC_017243	TTA	2	6	3301049	3301054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384210363
104013	NC_017243	T	6	6	3301061	3301066	0 %	100 %	0 %	0 %	384210363
104014	NC_017243	TTA	2	6	3301092	3301097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384210363
104015	NC_017243	AGCA	2	8	3301153	3301160	50 %	0 %	25 %	25 %	384210363
104016	NC_017243	TA	3	6	3301162	3301167	50 %	50 %	0 %	0 %	384210363
104017	NC_017243	T	6	6	3301181	3301186	0 %	100 %	0 %	0 %	384210363
104018	NC_017243	CAT	2	6	3301194	3301199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384210363
104019	NC_017243	AT	3	6	3301273	3301278	50 %	50 %	0 %	0 %	384210363
104020	NC_017243	AAT	2	6	3301338	3301343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384210363
104021	NC_017243	A	7	7	3301382	3301388	100 %	0 %	0 %	0 %	384210363
104022	NC_017243	ATT	2	6	3301438	3301443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384210363
104023	NC_017243	TCA	2	6	3301469	3301474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384210363
104024	NC_017243	A	6	6	3301484	3301489	100 %	0 %	0 %	0 %	384210363
104025	NC_017243	TTC	2	6	3301498	3301503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384210363
104026	NC_017243	TTA	2	6	3301518	3301523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384210363
104027	NC_017243	TAT	2	6	3301573	3301578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384210363
104028	NC_017243	TAG	2	6	3301581	3301586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384210363
104029	NC_017243	TAA	2	6	3301605	3301610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384210363
104030	NC_017243	GTATTT	2	12	3301619	3301630	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384210363
104031	NC_017243	CTTC	2	8	3301709	3301716	0 %	50 %	0 %	50 %	384210363
104032	NC_017243	TTA	2	6	3301719	3301724	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384210363
104033	NC_017243	ATT	3	9	3301738	3301746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384210363
104034	NC_017243	TAA	2	6	3301762	3301767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384210363
104035	NC_017243	ACCT	2	8	3301807	3301814	25 %	25 %	0 %	50 %	384210363
104036	NC_017243	ATC	2	6	3301816	3301821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384210363
104037	NC_017243	T	6	6	3301837	3301842	0 %	100 %	0 %	0 %	384210363
104038	NC_017243	ATA	2	6	3301863	3301868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384210363
104039	NC_017243	TCA	2	6	3301869	3301874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384210363
104040	NC_017243	TGC	2	6	3301888	3301893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384210363
104041	NC_017243	TAAT	2	8	3301927	3301934	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104042	NC_017243	T	6	6	3301941	3301946	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
104043	NC_017243	ATA	2	6	3301956	3301961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104044	NC_017243	A	6	6	3301979	3301984	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104045	NC_017243	TA	3	6	3301985	3301990	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104046	NC_017243	A	6	6	3301990	3301995	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104047	NC_017243	TA	3	6	3302024	3302029	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104048	NC_017243	T	6	6	3302058	3302063	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
104049	NC_017243	TAA	2	6	3302085	3302090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104050	NC_017243	T	6	6	3302101	3302106	0 %	100 %	0 %	0 %	384210364
104051	NC_017243	TGC	2	6	3302109	3302114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384210364
104052	NC_017243	TAAA	2	8	3302150	3302157	75 %	25 %	0 %	0 %	384210364
104053	NC_017243	ATAA	2	8	3302167	3302174	75 %	25 %	0 %	0 %	384210364
104054	NC_017243	GAT	2	6	3302179	3302184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384210364
104055	NC_017243	GAA	2	6	3302239	3302244	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384210364
104056	NC_017243	TAA	2	6	3302246	3302251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384210364
104057	NC_017243	A	6	6	3302250	3302255	100 %	0 %	0 %	0 %	384210364
104058	NC_017243	A	6	6	3302349	3302354	100 %	0 %	0 %	0 %	384210364
104059	NC_017243	A	6	6	3302373	3302378	100 %	0 %	0 %	0 %	384210364
104060	NC_017243	TAT	2	6	3302441	3302446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384210364
104061	NC_017243	A	6	6	3302472	3302477	100 %	0 %	0 %	0 %	384210364
104062	NC_017243	TTAT	2	8	3302498	3302505	25 %	75 %	0 %	0 %	384210364
104063	NC_017243	ATA	2	6	3302519	3302524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384210364
104064	NC_017243	AT	3	6	3302528	3302533	50 %	50 %	0 %	0 %	384210364
104065	NC_017243	CTT	2	6	3302539	3302544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384210364
104066	NC_017243	ATG	2	6	3302579	3302584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384210364
104067	NC_017243	TATG	2	8	3302598	3302605	25 %	50 %	25 %	0 %	384210364
104068	NC_017243	AGA	2	6	3302622	3302627	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384210364
104069	NC_017243	CTT	2	6	3302641	3302646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384210364
104070	NC_017243	ATA	2	6	3302651	3302656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384210364
104071	NC_017243	TGA	2	6	3302664	3302669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384210364
104072	NC_017243	ATA	2	6	3302675	3302680	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384210364
104073	NC_017243	AT	3	6	3302694	3302699	50 %	50 %	0 %	0 %	384210364
104074	NC_017243	AAT	2	6	3302719	3302724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384210364
104075	NC_017243	GAATA	2	10	3302763	3302772	60 %	20 %	20 %	0 %	384210364
104076	NC_017243	ATGAT	2	10	3302774	3302783	40 %	40 %	20 %	0 %	384210364
104077	NC_017243	AAT	2	6	3302785	3302790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384210364
104078	NC_017243	TA	3	6	3302791	3302796	50 %	50 %	0 %	0 %	384210364
104079	NC_017243	AATA	2	8	3302803	3302810	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
104080	NC_017243	TAA	2	6	3302868	3302873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104081	NC_017243	T	8	8	3302876	3302883	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
104082	NC_017243	TA	3	6	3302886	3302891	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104083	NC_017243	AAT	2	6	3302900	3302905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104084	NC_017243	AAAT	2	8	3302906	3302913	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
104085	NC_017243	AT	3	6	3302941	3302946	50 %	50 %	0 %	0 %	384210365
104086	NC_017243	TAA	2	6	3302950	3302955	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384210365
104087	NC_017243	AAAT	2	8	3303011	3303018	75 %	25 %	0 %	0 %	384210365
104088	NC_017243	TCT	2	6	3303045	3303050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384210365
104089	NC_017243	AAT	3	9	3303054	3303062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384210365
104090	NC_017243	ATA	2	6	3303079	3303084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384210365
104091	NC_017243	TAG	2	6	3303139	3303144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384210365
104092	NC_017243	CAG	2	6	3303146	3303151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384210365
104093	NC_017243	AT	3	6	3303167	3303172	50 %	50 %	0 %	0 %	384210365
104094	NC_017243	A	8	8	3303182	3303189	100 %	0 %	0 %	0 %	384210365
104095	NC_017243	TAA	2	6	3303202	3303207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384210365
104096	NC_017243	CTA	2	6	3303307	3303312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384210365
104097	NC_017243	ATG	2	6	3303340	3303345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384210365
104098	NC_017243	TTC	2	6	3303358	3303363	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384210365
104099	NC_017243	TAA	2	6	3303377	3303382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384210365
104100	NC_017243	A	6	6	3303389	3303394	100 %	0 %	0 %	0 %	384210365
104101	NC_017243	ATA	2	6	3303408	3303413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384210365
104102	NC_017243	AGA	2	6	3303422	3303427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384210365
104103	NC_017243	GATA	2	8	3303443	3303450	50 %	25 %	25 %	0 %	384210365
104104	NC_017243	AAAG	2	8	3303456	3303463	75 %	0 %	25 %	0 %	384210365
104105	NC_017243	AT	3	6	3303502	3303507	50 %	50 %	0 %	0 %	384210365
104106	NC_017243	ATG	2	6	3303610	3303615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384210365
104107	NC_017243	GATACT	2	12	3303672	3303683	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384210365
104108	NC_017243	AATA	2	8	3303686	3303693	75 %	25 %	0 %	0 %	384210365
104109	NC_017243	TAA	2	6	3303713	3303718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384210365
104110	NC_017243	ATA	2	6	3303799	3303804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384210365
104111	NC_017243	TA	3	6	3303886	3303891	50 %	50 %	0 %	0 %	384210365
104112	NC_017243	TCC	2	6	3303932	3303937	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384210365
104113	NC_017243	ATT	2	6	3303946	3303951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384210365
104114	NC_017243	AGA	2	6	3304038	3304043	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384210365
104115	NC_017243	TTTC	2	8	3304106	3304113	0 %	75 %	0 %	25 %	384210365
104116	NC_017243	AAG	2	6	3304117	3304122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384210365
104117	NC_017243	ACT	2	6	3304177	3304182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384210365
104118	NC_017243	CTTAAT	2	12	3304194	3304205	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384210365
104119	NC_017243	AAAGAA	2	12	3304239	3304250	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384210365
104120	NC_017243	ATA	2	6	3304257	3304262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384210365
104121	NC_017243	TGT	2	6	3304274	3304279	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384210365
104122	NC_017243	AT	3	6	3304285	3304290	50 %	50 %	0 %	0 %	384210365
104123	NC_017243	GAT	2	6	3304335	3304340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384210365
104124	NC_017243	TAATGG	2	12	3304364	3304375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384210365
104125	NC_017243	TTA	2	6	3304511	3304516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384210365
104126	NC_017243	AT	3	6	3304578	3304583	50 %	50 %	0 %	0 %	384210365
104127	NC_017243	AT	3	6	3304629	3304634	50 %	50 %	0 %	0 %	384210365
104128	NC_017243	TAAAA	2	10	3304645	3304654	80 %	20 %	0 %	0 %	384210365
104129	NC_017243	AT	3	6	3304693	3304698	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104130	NC_017243	AT	3	6	3304716	3304721	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104131	NC_017243	ATT	2	6	3304760	3304765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

< Previous12...197198199200201202203204205206207208209Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.