MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Brachyspira intermedia PWS/A chromosome

Total Repeats: 104131

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017243	TGG	2	6	15669	15674	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384207513
502	NC_017243	AGG	2	6	15690	15695	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384207513
503	NC_017243	AGA	2	6	15706	15711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207513
504	NC_017243	T	6	6	15795	15800	0 %	100 %	0 %	0 %	384207513
505	NC_017243	ATA	2	6	15830	15835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207513
506	NC_017243	AGA	2	6	15839	15844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207513
507	NC_017243	TAA	3	9	15865	15873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207513
508	NC_017243	A	8	8	15891	15898	100 %	0 %	0 %	0 %	384207513
509	NC_017243	GTT	2	6	16013	16018	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384207513
510	NC_017243	T	6	6	16017	16022	0 %	100 %	0 %	0 %	384207513
511	NC_017243	ATT	2	6	16140	16145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207513
512	NC_017243	AGGA	2	8	16194	16201	50 %	0 %	50 %	0 %	384207513
513	NC_017243	ACC	2	6	16300	16305	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384207513
514	NC_017243	GAT	2	6	16322	16327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207513
515	NC_017243	TA	3	6	16349	16354	50 %	50 %	0 %	0 %	384207513
516	NC_017243	TA	3	6	16366	16371	50 %	50 %	0 %	0 %	384207513
517	NC_017243	AAT	2	6	16389	16394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207513
518	NC_017243	AT	3	6	16393	16398	50 %	50 %	0 %	0 %	384207513
519	NC_017243	ATT	2	6	16402	16407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_017243	AT	3	6	16417	16422	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_017243	TA	3	6	16424	16429	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_017243	AT	3	6	16454	16459	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_017243	TCT	2	6	16464	16469	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
524	NC_017243	T	6	6	16475	16480	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_017243	TAT	2	6	16497	16502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_017243	TA	3	6	16543	16548	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_017243	ATT	3	9	16549	16557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_017243	TTA	2	6	16569	16574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_017243	TAC	2	6	16583	16588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
530	NC_017243	TGT	2	6	16617	16622	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
531	NC_017243	AT	3	6	16634	16639	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_017243	AT	3	6	16660	16665	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_017243	TTAATG	2	12	16693	16704	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
534	NC_017243	TAT	2	6	16705	16710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_017243	AT	3	6	16715	16720	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_017243	TA	3	6	16734	16739	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_017243	GTT	2	6	16757	16762	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
538	NC_017243	ATA	2	6	16763	16768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
539	NC_017243	TAGAA	2	10	16775	16784	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
540	NC_017243	A	6	6	16783	16788	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_017243	AAT	2	6	16792	16797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_017243	A	6	6	16806	16811	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_017243	TAT	2	6	16825	16830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_017243	TGT	2	6	16834	16839	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
545	NC_017243	AT	3	6	16847	16852	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_017243	TAT	2	6	16890	16895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_017243	GA	3	6	16913	16918	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
548	NC_017243	TTAG	2	8	16920	16927	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
549	NC_017243	TAA	2	6	16952	16957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_017243	AGTAA	2	10	16959	16968	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
551	NC_017243	TA	3	6	16972	16977	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_017243	ATTC	2	8	16982	16989	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
553	NC_017243	ATA	2	6	17017	17022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_017243	TAT	2	6	17034	17039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_017243	AT	4	8	17038	17045	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_017243	ATA	2	6	17054	17059	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_017243	TAT	2	6	17102	17107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_017243	ATG	2	6	17182	17187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
559	NC_017243	TAA	2	6	17190	17195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_017243	TA	4	8	17219	17226	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_017243	AAT	2	6	17273	17278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_017243	TAT	2	6	17283	17288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_017243	T	6	6	17291	17296	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_017243	AAT	2	6	17310	17315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_017243	ATA	2	6	17321	17326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_017243	TAA	2	6	17354	17359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_017243	AAT	2	6	17390	17395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207514
568	NC_017243	TAC	2	6	17424	17429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207514
569	NC_017243	GGA	2	6	17444	17449	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384207514
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571	NC_017243	GGT	2	6	17493	17498	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384207514
572	NC_017243	TCT	2	6	17499	17504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384207514
573	NC_017243	AGG	2	6	17513	17518	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384207514
574	NC_017243	A	6	6	17536	17541	100 %	0 %	0 %	0 %	384207514
575	NC_017243	GA	3	6	17633	17638	50 %	0 %	50 %	0 %	384207514
576	NC_017243	TGC	2	6	17687	17692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384207514
577	NC_017243	A	6	6	17727	17732	100 %	0 %	0 %	0 %	384207514
578	NC_017243	GAT	2	6	17736	17741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207514
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580	NC_017243	CTA	2	6	17857	17862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207514
581	NC_017243	ATT	2	6	17917	17922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207514
582	NC_017243	CTG	2	6	17953	17958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384207514
583	NC_017243	ACTC	2	8	17979	17986	25 %	25 %	0 %	50 %	384207514
584	NC_017243	ATA	2	6	18064	18069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207514
585	NC_017243	AAG	2	6	18094	18099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207514
586	NC_017243	CTT	2	6	18234	18239	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384207514
587	NC_017243	CTT	2	6	18340	18345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384207514
588	NC_017243	TAAA	2	8	18349	18356	75 %	25 %	0 %	0 %	384207514
589	NC_017243	AAAC	2	8	18387	18394	75 %	0 %	0 %	25 %	384207514
590	NC_017243	TGA	2	6	18440	18445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207514
591	NC_017243	AG	3	6	18492	18497	50 %	0 %	50 %	0 %	384207514
592	NC_017243	A	6	6	18516	18521	100 %	0 %	0 %	0 %	384207514
593	NC_017243	AGC	2	6	18530	18535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384207514
594	NC_017243	ATG	2	6	18547	18552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207514
595	NC_017243	TAAT	2	8	18561	18568	50 %	50 %	0 %	0 %	384207514
596	NC_017243	AT	3	6	18567	18572	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
597	NC_017243	TTA	2	6	18598	18603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_017243	TA	3	6	18602	18607	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_017243	TAAT	2	8	18636	18643	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_017243	T	6	6	18646	18651	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
601	NC_017243	AT	5	10	18691	18700	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_017243	T	6	6	18724	18729	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_017243	TA	3	6	18737	18742	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_017243	TAT	2	6	18762	18767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_017243	AGA	2	6	18787	18792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207515
606	NC_017243	ATT	2	6	18818	18823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207515
607	NC_017243	ATA	2	6	18827	18832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207515
608	NC_017243	CTT	2	6	18866	18871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384207515
609	NC_017243	ATA	3	9	18886	18894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207515
610	NC_017243	TAT	2	6	18904	18909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207515
611	NC_017243	ATT	2	6	18932	18937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207515
612	NC_017243	TAA	2	6	18938	18943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207515
613	NC_017243	TGA	2	6	18960	18965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207515
614	NC_017243	A	8	8	18967	18974	100 %	0 %	0 %	0 %	384207515
615	NC_017243	TCA	2	6	18978	18983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207515
616	NC_017243	AT	3	6	19004	19009	50 %	50 %	0 %	0 %	384207515
617	NC_017243	TAA	2	6	19038	19043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207515
618	NC_017243	AGA	2	6	19150	19155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207515
619	NC_017243	ATG	2	6	19208	19213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207516
620	NC_017243	TAAA	2	8	19251	19258	75 %	25 %	0 %	0 %	384207516
621	NC_017243	AGA	2	6	19300	19305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207516
622	NC_017243	CTA	2	6	19306	19311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207516
623	NC_017243	TAAA	2	8	19359	19366	75 %	25 %	0 %	0 %	384207516
624	NC_017243	ATA	2	6	19383	19388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207516
625	NC_017243	AT	3	6	19397	19402	50 %	50 %	0 %	0 %	384207516
626	NC_017243	ACAAT	2	10	19406	19415	60 %	20 %	0 %	20 %	384207516
627	NC_017243	AAAG	2	8	19468	19475	75 %	0 %	25 %	0 %	384207516
628	NC_017243	ATTA	2	8	19517	19524	50 %	50 %	0 %	0 %	384207516
629	NC_017243	ATT	2	6	19558	19563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207516
630	NC_017243	TAA	2	6	19570	19575	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207516
631	NC_017243	TA	3	6	19586	19591	50 %	50 %	0 %	0 %	384207516
632	NC_017243	AAAT	2	8	19656	19663	75 %	25 %	0 %	0 %	384207516
633	NC_017243	CAG	2	6	19671	19676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384207516
634	NC_017243	A	6	6	19680	19685	100 %	0 %	0 %	0 %	384207516
635	NC_017243	ACTC	2	8	19712	19719	25 %	25 %	0 %	50 %	384207517
636	NC_017243	GAT	2	6	19806	19811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207517
637	NC_017243	AAT	2	6	19812	19817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207517
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