MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Brachyspira intermedia PWS/A chromosome

Total Repeats: 104131

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_017243	CTA	2	6	140967	140972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207642
4502	NC_017243	TGA	2	6	140974	140979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207642
4503	NC_017243	TA	4	8	140980	140987	50 %	50 %	0 %	0 %	384207642
4504	NC_017243	ATAA	2	8	140996	141003	75 %	25 %	0 %	0 %	384207642
4505	NC_017243	TA	4	8	141031	141038	50 %	50 %	0 %	0 %	384207642
4506	NC_017243	ATA	2	6	141045	141050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207642
4507	NC_017243	TTG	2	6	141066	141071	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384207642
4508	NC_017243	AAT	2	6	141091	141096	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207642
4509	NC_017243	ATA	2	6	141099	141104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207642
4510	NC_017243	AGA	2	6	141109	141114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207642
4511	NC_017243	A	6	6	141138	141143	100 %	0 %	0 %	0 %	384207642
4512	NC_017243	TGT	2	6	141151	141156	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384207642
4513	NC_017243	ATA	2	6	141186	141191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207642
4514	NC_017243	CCT	2	6	141233	141238	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384207642
4515	NC_017243	ATG	2	6	141276	141281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207642
4516	NC_017243	T	7	7	141295	141301	0 %	100 %	0 %	0 %	384207642
4517	NC_017243	ATG	2	6	141329	141334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207642
4518	NC_017243	ATT	2	6	141352	141357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207642
4519	NC_017243	ATT	2	6	141394	141399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207642
4520	NC_017243	TAT	2	6	141412	141417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207642
4521	NC_017243	TCT	2	6	141422	141427	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384207642
4522	NC_017243	TA	3	6	141443	141448	50 %	50 %	0 %	0 %	384207642
4523	NC_017243	TGA	2	6	141481	141486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207642
4524	NC_017243	ATG	2	6	141543	141548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207642
4525	NC_017243	ATG	2	6	141578	141583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207642
4526	NC_017243	TGC	2	6	141643	141648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384207642
4527	NC_017243	TAGC	2	8	141678	141685	25 %	25 %	25 %	25 %	384207642
4528	NC_017243	GAA	2	6	141713	141718	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207642
4529	NC_017243	ATC	2	6	141757	141762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207642
4530	NC_017243	ATG	2	6	141794	141799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207642
4531	NC_017243	GTA	2	6	141815	141820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207642
4532	NC_017243	GGC	2	6	141824	141829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384207642
4533	NC_017243	TAC	2	6	141844	141849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207642
4534	NC_017243	AGA	2	6	141859	141864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207642
4535	NC_017243	ATG	2	6	141870	141875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207642
4536	NC_017243	TAAAA	2	10	141883	141892	80 %	20 %	0 %	0 %	384207642
4537	NC_017243	A	6	6	141889	141894	100 %	0 %	0 %	0 %	384207642
4538	NC_017243	AGA	2	6	141910	141915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207642
4539	NC_017243	GCA	2	6	141962	141967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384207642
4540	NC_017243	GTA	2	6	141998	142003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207642
4541	NC_017243	AGA	2	6	142069	142074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207642
4542	NC_017243	ATAA	2	8	142088	142095	75 %	25 %	0 %	0 %	384207642
4543	NC_017243	CAG	2	6	142098	142103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384207642
4544	NC_017243	AGA	2	6	142153	142158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207642
4545	NC_017243	CAG	2	6	142191	142196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384207642
4546	NC_017243	CA	3	6	142255	142260	50 %	0 %	0 %	50 %	384207642
4547	NC_017243	CTT	2	6	142269	142274	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384207642
4548	NC_017243	TAG	2	6	142275	142280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207642
4549	NC_017243	CAG	2	6	142290	142295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384207642
4550	NC_017243	TTA	2	6	142307	142312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207642
4551	NC_017243	TCTT	2	8	142343	142350	0 %	75 %	0 %	25 %	384207642
4552	NC_017243	T	6	6	142411	142416	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4553	NC_017243	A	7	7	142435	142441	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4554	NC_017243	TA	3	6	142442	142447	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4555	NC_017243	TAA	2	6	142453	142458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4556	NC_017243	TTTA	2	8	142509	142516	25 %	75 %	0 %	0 %	384207643
4557	NC_017243	AAT	2	6	142534	142539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207643
4558	NC_017243	AG	3	6	142562	142567	50 %	0 %	50 %	0 %	384207643
4559	NC_017243	TAA	2	6	142581	142586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207643
4560	NC_017243	AT	3	6	142605	142610	50 %	50 %	0 %	0 %	384207643
4561	NC_017243	TGA	2	6	142641	142646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207643
4562	NC_017243	ATG	2	6	142652	142657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207643
4563	NC_017243	CTA	2	6	142679	142684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207643
4564	NC_017243	AT	3	6	142733	142738	50 %	50 %	0 %	0 %	384207643
4565	NC_017243	ATT	2	6	142747	142752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207643
4566	NC_017243	CTA	2	6	142754	142759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207643
4567	NC_017243	TTC	2	6	142832	142837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384207643
4568	NC_017243	ATG	3	9	142841	142849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207643
4569	NC_017243	TTA	2	6	142851	142856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207643
4570	NC_017243	TAAAT	2	10	142860	142869	60 %	40 %	0 %	0 %	384207643
4571	NC_017243	ATG	2	6	142910	142915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207643
4572	NC_017243	TAA	2	6	142944	142949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207643
4573	NC_017243	A	6	6	143010	143015	100 %	0 %	0 %	0 %	384207643
4574	NC_017243	AT	3	6	143034	143039	50 %	50 %	0 %	0 %	384207643
4575	NC_017243	AT	3	6	143046	143051	50 %	50 %	0 %	0 %	384207643
4576	NC_017243	A	6	6	143091	143096	100 %	0 %	0 %	0 %	384207643
4577	NC_017243	AGATAT	2	12	143145	143156	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384207643
4578	NC_017243	TATTT	2	10	143157	143166	20 %	80 %	0 %	0 %	384207643
4579	NC_017243	ATT	2	6	143180	143185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207643
4580	NC_017243	TAA	2	6	143226	143231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207643
4581	NC_017243	A	6	6	143230	143235	100 %	0 %	0 %	0 %	384207643
4582	NC_017243	TAT	2	6	143236	143241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207643
4583	NC_017243	AT	3	6	143268	143273	50 %	50 %	0 %	0 %	384207643
4584	NC_017243	GA	3	6	143278	143283	50 %	0 %	50 %	0 %	384207643
4585	NC_017243	TAAT	2	8	143304	143311	50 %	50 %	0 %	0 %	384207643
4586	NC_017243	TAC	2	6	143369	143374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4587	NC_017243	AAT	2	6	143408	143413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4588	NC_017243	T	6	6	143416	143421	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4589	NC_017243	ATT	2	6	143465	143470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4590	NC_017243	T	6	6	143474	143479	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4591	NC_017243	AT	3	6	143483	143488	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4592	NC_017243	AAT	2	6	143489	143494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4593	NC_017243	T	6	6	143494	143499	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4594	NC_017243	T	6	6	143528	143533	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4595	NC_017243	ATT	2	6	143545	143550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4596	NC_017243	TA	3	6	143582	143587	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4597	NC_017243	TAT	2	6	143628	143633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207644
4598	NC_017243	TTA	2	6	143678	143683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207644
4599	NC_017243	TAA	2	6	143717	143722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207644
4600	NC_017243	TGCTT	2	10	143820	143829	0 %	60 %	20 %	20 %	384207644
4601	NC_017243	CTA	2	6	143864	143869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207644
4602	NC_017243	A	7	7	143908	143914	100 %	0 %	0 %	0 %	384207644
4603	NC_017243	ATT	2	6	143963	143968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207644
4604	NC_017243	TCAGA	2	10	144007	144016	40 %	20 %	20 %	20 %	384207644
4605	NC_017243	CATA	2	8	144041	144048	50 %	25 %	0 %	25 %	384207644
4606	NC_017243	TGTA	2	8	144069	144076	25 %	50 %	25 %	0 %	384207644
4607	NC_017243	GTA	2	6	144100	144105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207644
4608	NC_017243	TA	3	6	144118	144123	50 %	50 %	0 %	0 %	384207644
4609	NC_017243	GAT	2	6	144180	144185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207644
4610	NC_017243	CTT	2	6	144205	144210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384207644
4611	NC_017243	AAG	2	6	144267	144272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207644
4612	NC_017243	TGA	2	6	144303	144308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207644
4613	NC_017243	CTT	2	6	144344	144349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384207644
4614	NC_017243	TAC	2	6	144429	144434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207644
4615	NC_017243	AT	3	6	144435	144440	50 %	50 %	0 %	0 %	384207644
4616	NC_017243	TC	3	6	144473	144478	0 %	50 %	0 %	50 %	384207644
4617	NC_017243	CTA	2	6	144579	144584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207644
4618	NC_017243	AGA	2	6	144592	144597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207644
4619	NC_017243	TAT	2	6	144627	144632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207644
4620	NC_017243	TAG	2	6	144662	144667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207644
4621	NC_017243	ATC	2	6	144705	144710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207644
4622	NC_017243	CGG	2	6	144720	144725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384207644
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