MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid lp38

Total Repeats: 111

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017237	AT	3	6	142	147	50 %	50 %	0 %	0 %	384207454
2	NC_017237	TA	3	6	273	278	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017237	TA	3	6	400	405	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017237	AT	3	6	662	667	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017237	AT	4	8	1043	1050	50 %	50 %	0 %	0 %	384207455
6	NC_017237	AG	3	6	1334	1339	50 %	0 %	50 %	0 %	384207455
7	NC_017237	AT	3	6	1564	1569	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017237	CA	3	6	3593	3598	50 %	0 %	0 %	50 %	384207456
9	NC_017237	CT	3	6	3768	3773	0 %	50 %	0 %	50 %	384207456
10	NC_017237	AT	5	10	3990	3999	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017237	AT	3	6	4009	4014	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017237	AT	3	6	5813	5818	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017237	TA	3	6	5847	5852	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017237	AT	3	6	6050	6055	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017237	TC	3	6	6851	6856	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_017237	TA	3	6	7451	7456	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017237	AT	3	6	8286	8291	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017237	TA	3	6	9459	9464	50 %	50 %	0 %	0 %	384207462
19	NC_017237	GT	3	6	10037	10042	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017237	AT	4	8	10164	10171	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017237	TG	3	6	10445	10450	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017237	AT	3	6	10678	10683	50 %	50 %	0 %	0 %	384207463
23	NC_017237	TA	3	6	11147	11152	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017237	AG	3	6	11598	11603	50 %	0 %	50 %	0 %	384207465
25	NC_017237	AT	3	6	11756	11761	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017237	AT	3	6	12039	12044	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017237	AT	3	6	12220	12225	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017237	TA	4	8	12227	12234	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017237	AT	3	6	12418	12423	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017237	AT	5	10	12582	12591	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017237	AT	3	6	12858	12863	50 %	50 %	0 %	0 %	384207466
32	NC_017237	TA	3	6	13196	13201	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017237	AT	3	6	13317	13322	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017237	TA	3	6	13710	13715	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017237	TG	3	6	13793	13798	0 %	50 %	50 %	0 %	384207467
36	NC_017237	AG	3	6	13958	13963	50 %	0 %	50 %	0 %	384207467
37	NC_017237	AT	3	6	14607	14612	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017237	TA	4	8	14892	14899	50 %	50 %	0 %	0 %	384207469
39	NC_017237	TC	3	6	15530	15535	0 %	50 %	0 %	50 %	384207470
40	NC_017237	TA	3	6	15754	15759	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017237	TA	3	6	16036	16041	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017237	TA	3	6	16048	16053	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017237	AT	3	6	16099	16104	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017237	TA	4	8	16109	16116	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017237	TG	3	6	16180	16185	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017237	AT	3	6	16504	16509	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017237	TA	3	6	16678	16683	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017237	AT	3	6	16718	16723	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017237	TA	3	6	17190	17195	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017237	AC	3	6	17473	17478	50 %	0 %	0 %	50 %	384207473
51	NC_017237	TA	3	6	17490	17495	50 %	50 %	0 %	0 %	384207473
52	NC_017237	AT	3	6	17697	17702	50 %	50 %	0 %	0 %	384207473
53	NC_017237	AC	3	6	17938	17943	50 %	0 %	0 %	50 %	384207473
54	NC_017237	TA	3	6	18066	18071	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017237	TA	3	6	18156	18161	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017237	TA	3	6	18208	18213	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017237	AT	3	6	18398	18403	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017237	AT	3	6	18569	18574	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017237	AT	3	6	18801	18806	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017237	GA	3	6	19077	19082	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017237	CT	3	6	19089	19094	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_017237	TC	3	6	19152	19157	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_017237	TA	3	6	19582	19587	50 %	50 %	0 %	0 %	384207475
64	NC_017237	TA	3	6	19843	19848	50 %	50 %	0 %	0 %	384207475
65	NC_017237	TA	3	6	20226	20231	50 %	50 %	0 %	0 %	384207476
66	NC_017237	TA	3	6	20246	20251	50 %	50 %	0 %	0 %	384207476
67	NC_017237	TA	3	6	20842	20847	50 %	50 %	0 %	0 %	384207477
68	NC_017237	AT	3	6	21257	21262	50 %	50 %	0 %	0 %	384207477
69	NC_017237	GT	3	6	21683	21688	0 %	50 %	50 %	0 %	384207478
70	NC_017237	TA	4	8	21845	21852	50 %	50 %	0 %	0 %	384207478
71	NC_017237	TA	4	8	21867	21874	50 %	50 %	0 %	0 %	384207478
72	NC_017237	TA	4	8	22001	22008	50 %	50 %	0 %	0 %	384207478
73	NC_017237	TA	3	6	22863	22868	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017237	AT	3	6	23080	23085	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017237	TA	3	6	23124	23129	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017237	AT	3	6	23150	23155	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017237	CT	3	6	23270	23275	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_017237	GT	3	6	24491	24496	0 %	50 %	50 %	0 %	384207480
79	NC_017237	TA	3	6	24939	24944	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017237	TG	3	6	24955	24960	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017237	TA	3	6	25166	25171	50 %	50 %	0 %	0 %	384207481
82	NC_017237	TA	3	6	25238	25243	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017237	AT	3	6	25272	25277	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017237	TA	3	6	25344	25349	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017237	AT	3	6	25385	25390	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017237	TA	3	6	25602	25607	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017237	AT	3	6	25922	25927	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017237	AT	4	8	25958	25965	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017237	TA	4	8	26014	26021	50 %	50 %	0 %	0 %	384207482
90	NC_017237	TA	3	6	26146	26151	50 %	50 %	0 %	0 %	384207482
91	NC_017237	TG	4	8	26420	26427	0 %	50 %	50 %	0 %	384207482
92	NC_017237	AT	3	6	26441	26446	50 %	50 %	0 %	0 %	384207482
93	NC_017237	AG	3	6	26696	26701	50 %	0 %	50 %	0 %	384207482
94	NC_017237	AG	3	6	26756	26761	50 %	0 %	50 %	0 %	384207482
95	NC_017237	TG	3	6	27044	27049	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017237	CA	4	8	27104	27111	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_017237	AT	3	6	27588	27593	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017237	TA	3	6	27727	27732	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017237	AT	3	6	28658	28663	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017237	AT	3	6	30540	30545	50 %	50 %	0 %	0 %	384207487
101	NC_017237	AT	3	6	30689	30694	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017237	AT	4	8	30747	30754	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017237	AT	3	6	31222	31227	50 %	50 %	0 %	0 %	384207489
104	NC_017237	GT	3	6	31228	31233	0 %	50 %	50 %	0 %	384207489
105	NC_017237	AT	3	6	31257	31262	50 %	50 %	0 %	0 %	384207489
106	NC_017237	TA	3	6	31333	31338	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017237	TA	3	6	31517	31522	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017237	TA	3	6	31753	31758	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017237	TC	3	6	32492	32497	0 %	50 %	0 %	50 %	384207490
110	NC_017237	TA	3	6	33269	33274	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017237	TA	3	6	33486	33491	50 %	50 %	0 %	0 %	384207491

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.