MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid lp28-7

Total Repeats: 16

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017235	TAATAT	2	12	850	861	50 %	50 %	0 %	0 %	384206453
2	NC_017235	ATTAAT	2	12	877	888	50 %	50 %	0 %	0 %	384206453
3	NC_017235	CATTTA	2	12	1236	1247	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384206453
4	NC_017235	TTTTCT	2	12	1605	1616	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	384206454
5	NC_017235	TAATAT	2	12	4787	4798	50 %	50 %	0 %	0 %	384206455
6	NC_017235	ATTAAT	2	12	4814	4825	50 %	50 %	0 %	0 %	384206455
7	NC_017235	TTTATT	4	24	5384	5407	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	384206456
8	NC_017235	ATTTTA	2	12	6491	6502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206457
9	NC_017235	CTTTTT	2	12	10852	10863	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	384206462
10	NC_017235	TGATCT	2	12	13017	13028	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384206465
11	NC_017235	CATTAA	2	12	16059	16070	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384206469
12	NC_017235	TTCGTA	2	12	16759	16770	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384206469
13	NC_017235	TAGAGA	2	12	21695	21706	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384206475
14	NC_017235	AGTGGC	2	12	22371	22382	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384206476
15	NC_017235	TGTTGG	2	12	24527	24538	0 %	50 %	50 %	0 %	384206478
16	NC_017235	TCAAAA	2	12	25237	25248	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.