MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid lp28-4

Total Repeats: 83

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017234	AAAG	2	8	421	428	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017234	AATA	2	8	727	734	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017234	ATAC	2	8	869	876	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_017234	TATG	2	8	916	923	25 %	50 %	25 %	0 %	384206320
5	NC_017234	AGAA	2	8	1280	1287	75 %	0 %	25 %	0 %	384206320
6	NC_017234	TAAT	2	8	1288	1295	50 %	50 %	0 %	0 %	384206320
7	NC_017234	TTTA	2	8	1652	1659	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017234	ATTA	2	8	1682	1689	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017234	ATTT	2	8	1742	1749	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017234	TAAT	2	8	2132	2139	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017234	ATTA	2	8	2155	2162	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017234	TAAC	2	8	2238	2245	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_017234	ATTA	2	8	2401	2408	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017234	TATG	2	8	2607	2614	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017234	TAAA	2	8	2760	2767	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017234	ATTA	2	8	4104	4111	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017234	AATT	2	8	4211	4218	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017234	TTAA	2	8	4547	4554	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017234	TATT	2	8	4896	4903	25 %	75 %	0 %	0 %	384206322
20	NC_017234	TAAA	2	8	5004	5011	75 %	25 %	0 %	0 %	384206322
21	NC_017234	GAAT	2	8	5121	5128	50 %	25 %	25 %	0 %	384206322
22	NC_017234	TTGG	2	8	5139	5146	0 %	50 %	50 %	0 %	384206322
23	NC_017234	TAAC	2	8	5805	5812	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_017234	TAAT	2	8	6145	6152	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017234	AAAT	2	8	6919	6926	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017234	CAAC	2	8	7377	7384	50 %	0 %	0 %	50 %	384206324
27	NC_017234	AATA	2	8	7469	7476	75 %	25 %	0 %	0 %	384206324
28	NC_017234	AATT	2	8	7713	7720	50 %	50 %	0 %	0 %	384206324
29	NC_017234	ATAA	2	8	7781	7788	75 %	25 %	0 %	0 %	384206324
30	NC_017234	GAAA	2	8	7997	8004	75 %	0 %	25 %	0 %	384206324
31	NC_017234	AAAT	2	8	8040	8047	75 %	25 %	0 %	0 %	384206324
32	NC_017234	TAAA	2	8	8228	8235	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017234	AATG	2	8	8413	8420	50 %	25 %	25 %	0 %	384206325
34	NC_017234	TTTA	2	8	8439	8446	25 %	75 %	0 %	0 %	384206325
35	NC_017234	AAAT	2	8	8980	8987	75 %	25 %	0 %	0 %	384206326
36	NC_017234	CTAT	2	8	9120	9127	25 %	50 %	0 %	25 %	384206326
37	NC_017234	AGTA	2	8	9392	9399	50 %	25 %	25 %	0 %	384206326
38	NC_017234	TAAA	2	8	9442	9449	75 %	25 %	0 %	0 %	384206326
39	NC_017234	GATT	2	8	9572	9579	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017234	TATT	2	8	10635	10642	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017234	AAAT	2	8	11188	11195	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017234	AGTA	2	8	11368	11375	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017234	ATTG	2	8	11467	11474	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017234	TAGA	2	8	11586	11593	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017234	TAAA	2	8	12870	12877	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017234	TCTT	2	8	12885	12892	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_017234	TTAA	2	8	12911	12918	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017234	AAAT	2	8	13258	13265	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017234	TAAT	2	8	13330	13337	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017234	ATTA	2	8	13348	13355	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017234	TGAT	2	8	13440	13447	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017234	GGGT	2	8	13743	13750	0 %	25 %	75 %	0 %	384206331
53	NC_017234	TAGA	2	8	13973	13980	50 %	25 %	25 %	0 %	384206332
54	NC_017234	TGAT	2	8	14169	14176	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017234	GAAA	2	8	14192	14199	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017234	TAAA	2	8	14364	14371	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017234	TAAA	2	8	14769	14776	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017234	TACT	2	8	14846	14853	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_017234	TTTA	2	8	16242	16249	25 %	75 %	0 %	0 %	384206334
60	NC_017234	TATT	2	8	16487	16494	25 %	75 %	0 %	0 %	384206334
61	NC_017234	CTTG	2	8	16881	16888	0 %	50 %	25 %	25 %	384206334
62	NC_017234	TTAA	2	8	17716	17723	50 %	50 %	0 %	0 %	384206334
63	NC_017234	AGGA	2	8	17924	17931	50 %	0 %	50 %	0 %	384206334
64	NC_017234	GAAT	2	8	18264	18271	50 %	25 %	25 %	0 %	384206334
65	NC_017234	AGTA	2	8	18304	18311	50 %	25 %	25 %	0 %	384206334
66	NC_017234	TTAA	2	8	18601	18608	50 %	50 %	0 %	0 %	384206334
67	NC_017234	AAAG	2	8	18793	18800	75 %	0 %	25 %	0 %	384206334
68	NC_017234	GATA	2	8	18816	18823	50 %	25 %	25 %	0 %	384206334
69	NC_017234	TTAT	2	8	19009	19016	25 %	75 %	0 %	0 %	384206334
70	NC_017234	TAAA	2	8	19669	19676	75 %	25 %	0 %	0 %	384206335
71	NC_017234	ATGT	2	8	19709	19716	25 %	50 %	25 %	0 %	384206335
72	NC_017234	AGAA	2	8	19752	19759	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017234	ATTT	2	8	19822	19829	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017234	AATT	2	8	19833	19840	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017234	GGTA	2	8	20810	20817	25 %	25 %	50 %	0 %	384206336
76	NC_017234	TAAA	2	8	20847	20854	75 %	25 %	0 %	0 %	384206336
77	NC_017234	TTAA	2	8	21141	21148	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017234	TTCT	2	8	21508	21515	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_017234	GATA	2	8	21756	21763	50 %	25 %	25 %	0 %	384206337
80	NC_017234	CTTT	2	8	21824	21831	0 %	75 %	0 %	25 %	384206337
81	NC_017234	AAAT	2	8	21977	21984	75 %	25 %	0 %	0 %	384206337
82	NC_017234	TGAT	2	8	22114	22121	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017234	AGGC	2	8	22337	22344	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.