MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid lp28-3

Total Repeats: 79

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017233	ATTA	2	8	82	89	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017233	ATTT	2	8	280	287	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017233	CAAA	2	8	332	339	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_017233	TTAA	2	8	353	360	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017233	ATTA	2	8	368	375	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017233	TAAT	2	8	377	384	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017233	GTTT	2	8	447	454	0 %	75 %	25 %	0 %	384206298
8	NC_017233	TAAT	2	8	654	661	50 %	50 %	0 %	0 %	384206298
9	NC_017233	AATT	2	8	843	850	50 %	50 %	0 %	0 %	384206298
10	NC_017233	ATAA	2	8	974	981	75 %	25 %	0 %	0 %	384206298
11	NC_017233	AGAT	2	8	1011	1018	50 %	25 %	25 %	0 %	384206298
12	NC_017233	AGAA	3	12	1253	1264	75 %	0 %	25 %	0 %	384206298
13	NC_017233	ATCT	2	8	1425	1432	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_017233	GATA	2	8	2432	2439	50 %	25 %	25 %	0 %	384206301
15	NC_017233	CTTT	2	8	2500	2507	0 %	75 %	0 %	25 %	384206301
16	NC_017233	TAAA	2	8	2825	2832	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017233	TTTA	3	12	2869	2880	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017233	AAAT	2	8	2992	2999	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017233	TGGG	2	8	3487	3494	0 %	25 %	75 %	0 %	384206302
20	NC_017233	TAAA	2	8	3716	3723	75 %	25 %	0 %	0 %	384206302
21	NC_017233	ACAA	2	8	3890	3897	75 %	0 %	0 %	25 %	384206302
22	NC_017233	TAAA	2	8	4115	4122	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017233	AATA	2	8	4423	4430	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017233	TAAA	2	8	4448	4455	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017233	ACTA	2	8	4619	4626	50 %	25 %	0 %	25 %	384206304
26	NC_017233	TATT	2	8	5195	5202	25 %	75 %	0 %	0 %	384206305
27	NC_017233	TTTA	2	8	5237	5244	25 %	75 %	0 %	0 %	384206305
28	NC_017233	GCAA	2	8	5250	5257	50 %	0 %	25 %	25 %	384206305
29	NC_017233	ATTA	2	8	6566	6573	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017233	ATTT	2	8	7508	7515	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017233	AAAG	2	8	7663	7670	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017233	TTTA	2	8	8109	8116	25 %	75 %	0 %	0 %	384206307
33	NC_017233	TATC	2	8	8750	8757	25 %	50 %	0 %	25 %	384206307
34	NC_017233	CTTT	2	8	8773	8780	0 %	75 %	0 %	25 %	384206307
35	NC_017233	TCCT	2	8	9636	9643	0 %	50 %	0 %	50 %	384206307
36	NC_017233	TTCT	2	8	9989	9996	0 %	75 %	0 %	25 %	384206307
37	NC_017233	CTTT	2	8	10264	10271	0 %	75 %	0 %	25 %	384206307
38	NC_017233	TTTC	2	8	10503	10510	0 %	75 %	0 %	25 %	384206307
39	NC_017233	ATTT	2	8	10931	10938	25 %	75 %	0 %	0 %	384206307
40	NC_017233	GCTA	2	8	11088	11095	25 %	25 %	25 %	25 %	384206307
41	NC_017233	TCTT	2	8	11283	11290	0 %	75 %	0 %	25 %	384206307
42	NC_017233	AAAC	2	8	11312	11319	75 %	0 %	0 %	25 %	384206307
43	NC_017233	TAAG	2	8	11552	11559	50 %	25 %	25 %	0 %	384206307
44	NC_017233	TTAT	2	8	11961	11968	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017233	GTTT	2	8	12060	12067	0 %	75 %	25 %	0 %	384206308
46	NC_017233	TTTG	2	8	12073	12080	0 %	75 %	25 %	0 %	384206308
47	NC_017233	ATTT	2	8	12265	12272	25 %	75 %	0 %	0 %	384206308
48	NC_017233	TAGA	2	8	12956	12963	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017233	TAAA	2	8	13441	13448	75 %	25 %	0 %	0 %	384206310
50	NC_017233	TTAA	2	8	13473	13480	50 %	50 %	0 %	0 %	384206310
51	NC_017233	TTAC	2	8	13492	13499	25 %	50 %	0 %	25 %	384206310
52	NC_017233	ATTG	2	8	13730	13737	25 %	50 %	25 %	0 %	384206310
53	NC_017233	TTAA	2	8	13767	13774	50 %	50 %	0 %	0 %	384206310
54	NC_017233	TCTT	2	8	13905	13912	0 %	75 %	0 %	25 %	384206310
55	NC_017233	GAAA	2	8	14162	14169	75 %	0 %	25 %	0 %	384206310
56	NC_017233	ATGG	2	8	14525	14532	25 %	25 %	50 %	0 %	384206311
57	NC_017233	TCAA	2	8	14826	14833	50 %	25 %	0 %	25 %	384206312
58	NC_017233	AATG	2	8	15015	15022	50 %	25 %	25 %	0 %	384206312
59	NC_017233	TAGT	2	8	16736	16743	25 %	50 %	25 %	0 %	384206314
60	NC_017233	ATAA	2	8	16775	16782	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017233	ATTT	2	8	16891	16898	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017233	TATT	2	8	17410	17417	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017233	AAAT	2	8	17777	17784	75 %	25 %	0 %	0 %	384206315
64	NC_017233	ATAA	2	8	17923	17930	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017233	ATTA	2	8	17935	17942	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017233	AAAT	2	8	17948	17955	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017233	TATT	2	8	17989	17996	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017233	CAAA	2	8	18466	18473	75 %	0 %	0 %	25 %	384206316
69	NC_017233	AACA	2	8	19217	19224	75 %	0 %	0 %	25 %	384206316
70	NC_017233	ATAA	2	8	19502	19509	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017233	TAAA	2	8	19645	19652	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017233	TAAT	2	8	20788	20795	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017233	TTAA	2	8	21049	21056	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017233	AATC	2	8	21146	21153	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_017233	AATT	2	8	21268	21275	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017233	CGAT	2	8	22288	22295	25 %	25 %	25 %	25 %	384206318
77	NC_017233	TTAT	2	8	22744	22751	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017233	ATTG	2	8	22767	22774	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017233	ATTT	2	8	22818	22825	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.