MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid cp32-7

Total Repeats: 52

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017231	AC	3	6	36	41	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_017231	TG	3	6	66	71	0 %	50 %	50 %	0 %	384206263
3	NC_017231	TA	3	6	117	122	50 %	50 %	0 %	0 %	384206263
4	NC_017231	CT	3	6	674	679	0 %	50 %	0 %	50 %	384206263
5	NC_017231	TA	3	6	3523	3528	50 %	50 %	0 %	0 %	384206267
6	NC_017231	AT	3	6	4683	4688	50 %	50 %	0 %	0 %	384206269
7	NC_017231	AT	3	6	5536	5541	50 %	50 %	0 %	0 %	384206270
8	NC_017231	AC	3	6	6622	6627	50 %	0 %	0 %	50 %	384206271
9	NC_017231	CA	3	6	6988	6993	50 %	0 %	0 %	50 %	384206272
10	NC_017231	AT	3	6	7663	7668	50 %	50 %	0 %	0 %	384206273
11	NC_017231	AT	4	8	8055	8062	50 %	50 %	0 %	0 %	384206274
12	NC_017231	AT	3	6	8333	8338	50 %	50 %	0 %	0 %	384206274
13	NC_017231	AT	3	6	8742	8747	50 %	50 %	0 %	0 %	384206275
14	NC_017231	TA	3	6	9960	9965	50 %	50 %	0 %	0 %	384206276
15	NC_017231	TA	3	6	10064	10069	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017231	TA	3	6	10073	10078	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017231	AT	3	6	10365	10370	50 %	50 %	0 %	0 %	384206278
18	NC_017231	AG	3	6	10630	10635	50 %	0 %	50 %	0 %	384206278
19	NC_017231	AT	3	6	10776	10781	50 %	50 %	0 %	0 %	384206279
20	NC_017231	AT	3	6	10944	10949	50 %	50 %	0 %	0 %	384206279
21	NC_017231	AT	3	6	11650	11655	50 %	50 %	0 %	0 %	384206281
22	NC_017231	AT	3	6	12100	12105	50 %	50 %	0 %	0 %	384206282
23	NC_017231	AT	3	6	12556	12561	50 %	50 %	0 %	0 %	384206283
24	NC_017231	AT	3	6	13036	13041	50 %	50 %	0 %	0 %	384206284
25	NC_017231	TA	3	6	14079	14084	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017231	TA	3	6	14091	14096	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017231	TA	3	6	14315	14320	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017231	AT	4	8	15469	15476	50 %	50 %	0 %	0 %	384206285
29	NC_017231	TA	3	6	16306	16311	50 %	50 %	0 %	0 %	384206287
30	NC_017231	AT	3	6	16329	16334	50 %	50 %	0 %	0 %	384206287
31	NC_017231	TA	3	6	16481	16486	50 %	50 %	0 %	0 %	384206287
32	NC_017231	AC	3	6	16515	16520	50 %	0 %	0 %	50 %	384206287
33	NC_017231	AT	3	6	16815	16820	50 %	50 %	0 %	0 %	384206287
34	NC_017231	AT	3	6	17598	17603	50 %	50 %	0 %	0 %	384206289
35	NC_017231	AT	3	6	18320	18325	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017231	TA	4	8	18443	18450	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017231	AT	3	6	18454	18459	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017231	TA	3	6	18594	18599	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017231	TA	3	6	18606	18611	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017231	TA	3	6	19001	19006	50 %	50 %	0 %	0 %	384206290
41	NC_017231	GT	3	6	20123	20128	0 %	50 %	50 %	0 %	384206291
42	NC_017231	AT	3	6	21287	21292	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017231	AT	3	6	21448	21453	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017231	GA	3	6	21523	21528	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017231	TG	3	6	23446	23451	0 %	50 %	50 %	0 %	384206295
46	NC_017231	AT	3	6	23977	23982	50 %	50 %	0 %	0 %	384206296
47	NC_017231	AT	3	6	24317	24322	50 %	50 %	0 %	0 %	384206296
48	NC_017231	CA	3	6	24707	24712	50 %	0 %	0 %	50 %	384206296
49	NC_017231	GA	3	6	24810	24815	50 %	0 %	50 %	0 %	384206296
50	NC_017231	AC	4	8	24917	24924	50 %	0 %	0 %	50 %	384206296
51	NC_017231	AT	3	6	24977	24982	50 %	50 %	0 %	0 %	384206296
52	NC_017231	AG	3	6	25223	25228	50 %	0 %	50 %	0 %	384206296

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.