MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid cp32-1

Total Repeats: 32

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017230	TTAAT	2	10	3262	3271	40 %	60 %	0 %	0 %	384206224
2	NC_017230	GCAAA	2	10	3858	3867	60 %	0 %	20 %	20 %	384206225
3	NC_017230	TAAAT	2	10	4924	4933	60 %	40 %	0 %	0 %	384206227
4	NC_017230	ATACT	2	10	5728	5737	40 %	40 %	0 %	20 %	384206228
5	NC_017230	TAATA	2	10	6287	6296	60 %	40 %	0 %	0 %	384206230
6	NC_017230	GAAAA	2	10	6905	6914	80 %	0 %	20 %	0 %	384206231
7	NC_017230	CTGCA	2	10	7559	7568	20 %	20 %	20 %	40 %	384206231
8	NC_017230	AAAAC	2	10	8295	8304	80 %	0 %	0 %	20 %	384206233
9	NC_017230	ATATT	2	10	11598	11607	40 %	60 %	0 %	0 %	384206237
10	NC_017230	AATTT	2	10	12270	12279	40 %	60 %	0 %	0 %	384206238
11	NC_017230	TACAA	2	10	12760	12769	60 %	20 %	0 %	20 %	384206239
12	NC_017230	ACTCA	2	10	13320	13329	40 %	20 %	0 %	40 %	384206240
13	NC_017230	AAAGT	2	10	13387	13396	60 %	20 %	20 %	0 %	384206240
14	NC_017230	GAAAA	2	10	14154	14163	80 %	0 %	20 %	0 %	384206241
15	NC_017230	ATCTT	2	10	14890	14899	20 %	60 %	0 %	20 %	384206242
16	NC_017230	TTATG	2	10	16234	16243	20 %	60 %	20 %	0 %	384206246
17	NC_017230	AAAGC	2	10	17558	17567	60 %	0 %	20 %	20 %	384206248
18	NC_017230	TAAAA	2	10	17659	17668	80 %	20 %	0 %	0 %	384206248
19	NC_017230	CACTT	2	10	18412	18421	20 %	40 %	0 %	40 %	384206249
20	NC_017230	TTACA	2	10	19004	19013	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_017230	GTTAA	2	10	19428	19437	40 %	40 %	20 %	0 %	384206250
22	NC_017230	TTTTA	2	10	19793	19802	20 %	80 %	0 %	0 %	384206250
23	NC_017230	AAAAG	2	10	20186	20195	80 %	0 %	20 %	0 %	384206250
24	NC_017230	AAAAG	2	10	20524	20533	80 %	0 %	20 %	0 %	384206251
25	NC_017230	ATTTT	2	10	22839	22848	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017230	AAAAC	2	10	24849	24858	80 %	0 %	0 %	20 %	384206256
27	NC_017230	ATTTT	2	10	25941	25950	20 %	80 %	0 %	0 %	384206257
28	NC_017230	AATTT	2	10	26271	26280	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017230	AACAA	2	10	27085	27094	80 %	0 %	0 %	20 %	384206258
30	NC_017230	CAGAA	2	10	27313	27322	60 %	0 %	20 %	20 %	384206258
31	NC_017230	TAAAA	2	10	27331	27340	80 %	20 %	0 %	0 %	384206258
32	NC_017230	GAAAA	2	10	28828	28837	80 %	0 %	20 %	0 %	384206261

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.