MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid cp26

Total Repeats: 35

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017229	CTTAA	2	10	369	378	40 %	40 %	0 %	20 %	384206194
2	NC_017229	TTATT	2	10	2348	2357	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017229	TAAAA	2	10	3624	3633	80 %	20 %	0 %	0 %	384206196
4	NC_017229	TAAAA	2	10	3853	3862	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017229	TATAA	2	10	3884	3893	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017229	TAAAA	2	10	3935	3944	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017229	TTTTA	2	10	4200	4209	20 %	80 %	0 %	0 %	384206197
8	NC_017229	GAAAA	2	10	5222	5231	80 %	0 %	20 %	0 %	384206199
9	NC_017229	AAAAT	2	10	6368	6377	80 %	20 %	0 %	0 %	384206200
10	NC_017229	ACTTT	2	10	7616	7625	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_017229	CAGCA	2	10	8021	8030	40 %	0 %	20 %	40 %	384206202
12	NC_017229	ATTAT	2	10	10430	10439	40 %	60 %	0 %	0 %	384206205
13	NC_017229	ACAAA	2	10	10937	10946	80 %	0 %	0 %	20 %	384206206
14	NC_017229	AATTA	2	10	11770	11779	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017229	TAAAT	2	10	11787	11796	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017229	TTTTA	2	10	11913	11922	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017229	ATATT	2	10	12743	12752	40 %	60 %	0 %	0 %	384206207
18	NC_017229	AAAGT	2	10	13147	13156	60 %	20 %	20 %	0 %	384206207
19	NC_017229	ATTTA	2	10	13593	13602	40 %	60 %	0 %	0 %	384206207
20	NC_017229	TAAAA	2	10	13679	13688	80 %	20 %	0 %	0 %	384206208
21	NC_017229	TGTAT	2	10	15856	15865	20 %	60 %	20 %	0 %	384206210
22	NC_017229	TTAAA	2	10	16456	16465	60 %	40 %	0 %	0 %	384206210
23	NC_017229	AATTA	2	10	16770	16779	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017229	GAAAA	2	10	16881	16890	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017229	ATTTT	2	10	19376	19385	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017229	AAAAT	2	10	19392	19401	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017229	TAAAT	2	10	19445	19454	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017229	TAAAT	2	10	20172	20181	60 %	40 %	0 %	0 %	384206213
29	NC_017229	ATTTT	2	10	21382	21391	20 %	80 %	0 %	0 %	384206215
30	NC_017229	TTATA	2	10	21895	21904	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017229	ATAAA	2	10	22454	22463	80 %	20 %	0 %	0 %	384206216
32	NC_017229	TTTTA	2	10	23035	23044	20 %	80 %	0 %	0 %	384206217
33	NC_017229	TAAAG	2	10	23222	23231	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017229	AAATT	2	10	24678	24687	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017229	GAAGA	2	10	26207	26216	60 %	0 %	40 %	0 %	384206219

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.