MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid cp32-9

Total Repeats: 81

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017228	ATTA	2	8	944	951	50 %	50 %	0 %	0 %	384206151
2	NC_017228	AGTA	2	8	1110	1117	50 %	25 %	25 %	0 %	384206151
3	NC_017228	AGTA	2	8	1206	1213	50 %	25 %	25 %	0 %	384206151
4	NC_017228	AATT	2	8	1896	1903	50 %	50 %	0 %	0 %	384206152
5	NC_017228	TTAT	2	8	2526	2533	25 %	75 %	0 %	0 %	384206153
6	NC_017228	GTAA	2	8	2573	2580	50 %	25 %	25 %	0 %	384206153
7	NC_017228	GCAG	2	8	2634	2641	25 %	0 %	50 %	25 %	384206154
8	NC_017228	CAAG	2	8	2671	2678	50 %	0 %	25 %	25 %	384206154
9	NC_017228	ATGT	2	8	3008	3015	25 %	50 %	25 %	0 %	384206154
10	NC_017228	ATAA	2	8	3115	3122	75 %	25 %	0 %	0 %	384206154
11	NC_017228	CAAT	2	8	3197	3204	50 %	25 %	0 %	25 %	384206154
12	NC_017228	AGAT	2	8	3240	3247	50 %	25 %	25 %	0 %	384206154
13	NC_017228	AATG	2	8	3362	3369	50 %	25 %	25 %	0 %	384206155
14	NC_017228	GTAA	2	8	3925	3932	50 %	25 %	25 %	0 %	384206155
15	NC_017228	TCAT	2	8	4839	4846	25 %	50 %	0 %	25 %	384206156
16	NC_017228	AGTG	2	8	5393	5400	25 %	25 %	50 %	0 %	384206157
17	NC_017228	AGTA	2	8	5535	5542	50 %	25 %	25 %	0 %	384206158
18	NC_017228	GGAC	2	8	5767	5774	25 %	0 %	50 %	25 %	384206158
19	NC_017228	TTGG	2	8	5799	5806	0 %	50 %	50 %	0 %	384206159
20	NC_017228	AATC	2	8	6520	6527	50 %	25 %	0 %	25 %	384206160
21	NC_017228	TAAA	2	8	6542	6549	75 %	25 %	0 %	0 %	384206160
22	NC_017228	GAAA	3	12	7210	7221	75 %	0 %	25 %	0 %	384206161
23	NC_017228	TTAT	2	8	7227	7234	25 %	75 %	0 %	0 %	384206161
24	NC_017228	CAAG	2	8	7286	7293	50 %	0 %	25 %	25 %	384206161
25	NC_017228	TTAC	2	8	7725	7732	25 %	50 %	0 %	25 %	384206161
26	NC_017228	TGCT	2	8	8092	8099	0 %	50 %	25 %	25 %	384206162
27	NC_017228	ATTT	2	8	8489	8496	25 %	75 %	0 %	0 %	384206163
28	NC_017228	CTTA	2	8	8675	8682	25 %	50 %	0 %	25 %	384206163
29	NC_017228	CTTG	2	8	8782	8789	0 %	50 %	25 %	25 %	384206164
30	NC_017228	AATT	2	8	8928	8935	50 %	50 %	0 %	0 %	384206164
31	NC_017228	GAAA	2	8	9971	9978	75 %	0 %	25 %	0 %	384206165
32	NC_017228	ATTA	2	8	11582	11589	50 %	50 %	0 %	0 %	384206167
33	NC_017228	TCAA	2	8	12018	12025	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_017228	CCAA	2	8	12164	12171	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_017228	GAAA	2	8	12183	12190	75 %	0 %	25 %	0 %	384206168
36	NC_017228	GTTT	2	8	12314	12321	0 %	75 %	25 %	0 %	384206168
37	NC_017228	TTAT	2	8	12444	12451	25 %	75 %	0 %	0 %	384206169
38	NC_017228	TAAT	2	8	12855	12862	50 %	50 %	0 %	0 %	384206170
39	NC_017228	CAAA	2	8	13478	13485	75 %	0 %	0 %	25 %	384206170
40	NC_017228	ATTT	2	8	13953	13960	25 %	75 %	0 %	0 %	384206171
41	NC_017228	AATA	2	8	14833	14840	75 %	25 %	0 %	0 %	384206172
42	NC_017228	CTAT	2	8	15203	15210	25 %	50 %	0 %	25 %	384206173
43	NC_017228	AAAT	2	8	15501	15508	75 %	25 %	0 %	0 %	384206174
44	NC_017228	GGAA	2	8	15577	15584	50 %	0 %	50 %	0 %	384206174
45	NC_017228	TAAT	2	8	16458	16465	50 %	50 %	0 %	0 %	384206176
46	NC_017228	CTTG	2	8	16513	16520	0 %	50 %	25 %	25 %	384206176
47	NC_017228	TAAA	2	8	17047	17054	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017228	AAAC	2	8	18029	18036	75 %	0 %	0 %	25 %	384206177
49	NC_017228	AAAT	2	8	18148	18155	75 %	25 %	0 %	0 %	384206177
50	NC_017228	ATTT	2	8	18575	18582	25 %	75 %	0 %	0 %	384206178
51	NC_017228	GAAT	2	8	18955	18962	50 %	25 %	25 %	0 %	384206178
52	NC_017228	AATA	2	8	19573	19580	75 %	25 %	0 %	0 %	384206179
53	NC_017228	TGGA	2	8	20066	20073	25 %	25 %	50 %	0 %	384206180
54	NC_017228	AGAT	2	8	20621	20628	50 %	25 %	25 %	0 %	384206181
55	NC_017228	AGAT	2	8	20675	20682	50 %	25 %	25 %	0 %	384206181
56	NC_017228	ATTT	3	12	20708	20719	25 %	75 %	0 %	0 %	384206181
57	NC_017228	AGAT	2	8	20729	20736	50 %	25 %	25 %	0 %	384206181
58	NC_017228	AGAT	2	8	20816	20823	50 %	25 %	25 %	0 %	384206181
59	NC_017228	TTTA	2	8	20922	20929	25 %	75 %	0 %	0 %	384206181
60	NC_017228	TAAA	2	8	20949	20956	75 %	25 %	0 %	0 %	384206181
61	NC_017228	AGTG	2	8	21247	21254	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017228	TTAT	4	16	21661	21676	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017228	AAAT	2	8	22136	22143	75 %	25 %	0 %	0 %	384206183
64	NC_017228	GATG	2	8	22218	22225	25 %	25 %	50 %	0 %	384206183
65	NC_017228	TAAA	2	8	22768	22775	75 %	25 %	0 %	0 %	384206183
66	NC_017228	AGAT	2	8	22931	22938	50 %	25 %	25 %	0 %	384206183
67	NC_017228	AGAA	2	8	23413	23420	75 %	0 %	25 %	0 %	384206184
68	NC_017228	ATAG	2	8	23494	23501	50 %	25 %	25 %	0 %	384206184
69	NC_017228	AAAT	3	12	23655	23666	75 %	25 %	0 %	0 %	384206185
70	NC_017228	ATTT	2	8	23685	23692	25 %	75 %	0 %	0 %	384206185
71	NC_017228	CCAG	2	8	24040	24047	25 %	0 %	25 %	50 %	384206185
72	NC_017228	AAGA	2	8	24471	24478	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017228	TGAG	2	8	24794	24801	25 %	25 %	50 %	0 %	384206186
74	NC_017228	AAGT	2	8	24839	24846	50 %	25 %	25 %	0 %	384206186
75	NC_017228	TATT	2	8	26564	26571	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017228	GTTT	2	8	26737	26744	0 %	75 %	25 %	0 %	384206189
77	NC_017228	CTTT	2	8	27187	27194	0 %	75 %	0 %	25 %	384206189
78	NC_017228	CAAA	2	8	28081	28088	75 %	0 %	0 %	25 %	384206191
79	NC_017228	TAGC	2	8	28277	28284	25 %	25 %	25 %	25 %	384206191
80	NC_017228	ACAA	2	8	28465	28472	75 %	0 %	0 %	25 %	384206191
81	NC_017228	AGCA	2	8	28845	28852	50 %	0 %	25 %	25 %	384206191

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.