MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid cp32-9

Total Repeats: 403

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017228	TAT	2	6	30	35	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017228	TAA	2	6	46	51	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017228	AGA	2	6	164	169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206151
4	NC_017228	TAT	2	6	272	277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206151
5	NC_017228	ACT	2	6	329	334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206151
6	NC_017228	TAA	2	6	449	454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206151
7	NC_017228	ATA	2	6	501	506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206151
8	NC_017228	CAA	2	6	685	690	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206151
9	NC_017228	CTT	2	6	691	696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206151
10	NC_017228	AGT	3	9	714	722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206151
11	NC_017228	TAA	2	6	854	859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206151
12	NC_017228	TTA	2	6	904	909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206151
13	NC_017228	ATG	2	6	1024	1029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206151
14	NC_017228	ATT	2	6	1048	1053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206151
15	NC_017228	TAA	2	6	1241	1246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206151
16	NC_017228	GAG	2	6	1248	1253	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384206151
17	NC_017228	ATT	2	6	1274	1279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206151
18	NC_017228	GAA	2	6	1318	1323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206152
19	NC_017228	AAG	2	6	1325	1330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206152
20	NC_017228	AGG	2	6	1349	1354	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384206152
21	NC_017228	AGC	2	6	1591	1596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206152
22	NC_017228	TAA	2	6	1602	1607	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206152
23	NC_017228	TTC	3	9	1812	1820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206152
24	NC_017228	ATT	2	6	1843	1848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206152
25	NC_017228	AGA	2	6	1857	1862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206152
26	NC_017228	AGA	2	6	2036	2041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206153
27	NC_017228	CAA	2	6	2088	2093	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206153
28	NC_017228	TGG	2	6	2156	2161	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384206153
29	NC_017228	AGC	2	6	2172	2177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206153
30	NC_017228	GCT	2	6	2277	2282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384206153
31	NC_017228	GGT	4	12	2283	2294	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384206153
32	NC_017228	GAT	2	6	2295	2300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206153
33	NC_017228	ACT	2	6	2460	2465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206153
34	NC_017228	AGA	2	6	2519	2524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206153
35	NC_017228	GTT	2	6	2608	2613	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206154
36	NC_017228	AGA	2	6	2700	2705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206154
37	NC_017228	GAT	2	6	2734	2739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206154
38	NC_017228	GTT	2	6	2813	2818	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206154
39	NC_017228	AGA	2	6	2883	2888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206154
40	NC_017228	TAA	2	6	3051	3056	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206154
41	NC_017228	TTA	2	6	3131	3136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206154
42	NC_017228	ATT	2	6	3260	3265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206154
43	NC_017228	ATA	2	6	3316	3321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206154
44	NC_017228	TGG	2	6	3333	3338	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384206154
45	NC_017228	AGG	2	6	3354	3359	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017228	GCA	2	6	3410	3415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206155
47	NC_017228	ATG	2	6	3446	3451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206155
48	NC_017228	ATC	2	6	3548	3553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206155
49	NC_017228	TGG	2	6	3645	3650	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384206155
50	NC_017228	CCA	2	6	3704	3709	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384206155
51	NC_017228	AAT	2	6	3724	3729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206155
52	NC_017228	TAG	2	6	3743	3748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206155
53	NC_017228	GCA	2	6	3823	3828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206155
54	NC_017228	ATG	2	6	3881	3886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206155
55	NC_017228	TAA	2	6	3937	3942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206155
56	NC_017228	AGG	2	6	3948	3953	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017228	ATT	2	6	3966	3971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206156
58	NC_017228	TGA	2	6	3972	3977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206156
59	NC_017228	ATT	2	6	3980	3985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206156
60	NC_017228	TAT	2	6	4029	4034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206156
61	NC_017228	AGA	2	6	4062	4067	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206156
62	NC_017228	TAA	3	9	4284	4292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206156
63	NC_017228	ATT	2	6	4336	4341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206156
64	NC_017228	TTA	2	6	4346	4351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206156
65	NC_017228	ACT	2	6	4431	4436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206156
66	NC_017228	AGA	2	6	4458	4463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206156
67	NC_017228	GTG	2	6	4472	4477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384206156
68	NC_017228	ATG	2	6	4561	4566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206156
69	NC_017228	CAG	2	6	4613	4618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206156
70	NC_017228	GCA	2	6	4627	4632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206156
71	NC_017228	TAA	2	6	4683	4688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206156
72	NC_017228	CTA	2	6	4877	4882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206156
73	NC_017228	GAA	3	9	4978	4986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206157
74	NC_017228	GTT	2	6	5191	5196	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206157
75	NC_017228	ATT	2	6	5252	5257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206157
76	NC_017228	TGT	2	6	5486	5491	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206158
77	NC_017228	GAC	2	6	5505	5510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206158
78	NC_017228	TTA	2	6	5560	5565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206158
79	NC_017228	GGC	2	6	5846	5851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384206159
80	NC_017228	CAA	2	6	5917	5922	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206159
81	NC_017228	GTA	2	6	6075	6080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206159
82	NC_017228	TTG	2	6	6099	6104	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206159
83	NC_017228	AAT	2	6	6223	6228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206160
84	NC_017228	ATC	2	6	6257	6262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206160
85	NC_017228	ACT	2	6	6283	6288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206160
86	NC_017228	ATA	2	6	6491	6496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206160
87	NC_017228	TAA	2	6	6596	6601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206160
88	NC_017228	AGG	2	6	6683	6688	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384206160
89	NC_017228	TGC	2	6	6814	6819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384206161
90	NC_017228	TAA	2	6	6847	6852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206161
91	NC_017228	CTG	2	6	6926	6931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384206161
92	NC_017228	TGT	2	6	7054	7059	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206161
93	NC_017228	TTA	2	6	7062	7067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206161
94	NC_017228	GAT	2	6	7088	7093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206161
95	NC_017228	GAC	2	6	7112	7117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206161
96	NC_017228	GTC	2	6	7135	7140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384206161
97	NC_017228	AAT	2	6	7238	7243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206161
98	NC_017228	CTA	2	6	7332	7337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206161
99	NC_017228	CAC	2	6	7338	7343	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384206161
100	NC_017228	TGA	2	6	7348	7353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206161
101	NC_017228	TGC	2	6	7354	7359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384206161
102	NC_017228	CTT	2	6	7400	7405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206161
103	NC_017228	TTG	2	6	7512	7517	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206161
104	NC_017228	GTG	2	6	7581	7586	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384206161
105	NC_017228	CTA	2	6	7622	7627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206161
106	NC_017228	ACT	2	6	7648	7653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206161
107	NC_017228	TAC	2	6	7765	7770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206161
108	NC_017228	TGG	2	6	7862	7867	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384206162
109	NC_017228	ACA	2	6	7911	7916	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206162
110	NC_017228	GTT	2	6	7923	7928	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206162
111	NC_017228	TAA	2	6	7954	7959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206162
112	NC_017228	ATT	2	6	8130	8135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206162
113	NC_017228	GAA	2	6	8157	8162	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206162
114	NC_017228	AAG	2	6	8168	8173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206162
115	NC_017228	CAG	2	6	8179	8184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206162
116	NC_017228	TTA	2	6	8263	8268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206163
117	NC_017228	TTA	2	6	8498	8503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206163
118	NC_017228	TTG	2	6	8515	8520	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206163
119	NC_017228	TAT	2	6	8522	8527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206163
120	NC_017228	AAT	2	6	8607	8612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206163
121	NC_017228	GAT	2	6	8643	8648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206163
122	NC_017228	GAT	2	6	8846	8851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206164
123	NC_017228	ATG	2	6	8868	8873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206164
124	NC_017228	TTG	2	6	9355	9360	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206165
125	NC_017228	GAA	2	6	9468	9473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206165
126	NC_017228	AAC	2	6	9526	9531	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206165
127	NC_017228	ATT	2	6	9536	9541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206165
128	NC_017228	AAG	2	6	9559	9564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206165
129	NC_017228	GGA	2	6	9576	9581	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384206165
130	NC_017228	TAA	2	6	9587	9592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206165
131	NC_017228	AGA	2	6	9623	9628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206165
132	NC_017228	TTA	2	6	9649	9654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206165
133	NC_017228	GCA	2	6	9762	9767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206165
134	NC_017228	GGA	2	6	9795	9800	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384206165
135	NC_017228	ATG	2	6	9813	9818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206165
136	NC_017228	TGA	2	6	9965	9970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206165
137	NC_017228	AAT	2	6	10067	10072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206165
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139	NC_017228	ATA	2	6	10102	10107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206165
140	NC_017228	TGC	2	6	10178	10183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384206165
141	NC_017228	GTG	2	6	10250	10255	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384206165
142	NC_017228	ATA	2	6	10349	10354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206166
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148	NC_017228	AAC	2	6	10701	10706	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206166
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151	NC_017228	ATA	2	6	10882	10887	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206166
152	NC_017228	ATG	2	6	10950	10955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206167
153	NC_017228	AGA	2	6	11002	11007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206167
154	NC_017228	ATC	2	6	11074	11079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206167
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162	NC_017228	TAC	2	6	12011	12016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
163	NC_017228	TAG	2	6	12147	12152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
164	NC_017228	TAT	2	6	12201	12206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206168
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258	NC_017228	AAG	2	6	18487	18492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206177
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372	NC_017228	TAA	2	6	27488	27493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.