MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid cp32-5

Total Repeats: 61

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017227	AC	3	6	36	41	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_017227	TG	3	6	66	71	0 %	50 %	50 %	0 %	384206107
3	NC_017227	TA	3	6	117	122	50 %	50 %	0 %	0 %	384206107
4	NC_017227	AG	4	8	1508	1515	50 %	0 %	50 %	0 %	384206108
5	NC_017227	TA	3	6	2951	2956	50 %	50 %	0 %	0 %	384206110
6	NC_017227	CT	3	6	3174	3179	0 %	50 %	0 %	50 %	384206110
7	NC_017227	AT	3	6	4262	4267	50 %	50 %	0 %	0 %	384206112
8	NC_017227	AG	3	6	5273	5278	50 %	0 %	50 %	0 %	384206113
9	NC_017227	AG	3	6	5349	5354	50 %	0 %	50 %	0 %	384206113
10	NC_017227	AT	3	6	5601	5606	50 %	50 %	0 %	0 %	384206114
11	NC_017227	AT	3	6	5904	5909	50 %	50 %	0 %	0 %	384206115
12	NC_017227	TA	3	6	5920	5925	50 %	50 %	0 %	0 %	384206115
13	NC_017227	AT	4	8	6393	6400	50 %	50 %	0 %	0 %	384206116
14	NC_017227	TA	3	6	8630	8635	50 %	50 %	0 %	0 %	384206119
15	NC_017227	AT	3	6	11202	11207	50 %	50 %	0 %	0 %	384206123
16	NC_017227	TA	3	6	11720	11725	50 %	50 %	0 %	0 %	384206123
17	NC_017227	TA	3	6	11937	11942	50 %	50 %	0 %	0 %	384206124
18	NC_017227	CA	3	6	12111	12116	50 %	0 %	0 %	50 %	384206124
19	NC_017227	AT	3	6	12780	12785	50 %	50 %	0 %	0 %	384206125
20	NC_017227	AT	4	8	13172	13179	50 %	50 %	0 %	0 %	384206126
21	NC_017227	AT	3	6	13450	13455	50 %	50 %	0 %	0 %	384206126
22	NC_017227	AT	3	6	13859	13864	50 %	50 %	0 %	0 %	384206127
23	NC_017227	TA	3	6	15077	15082	50 %	50 %	0 %	0 %	384206128
24	NC_017227	TA	3	6	15181	15186	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017227	TA	3	6	15190	15195	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017227	AT	3	6	15482	15487	50 %	50 %	0 %	0 %	384206130
27	NC_017227	AG	3	6	15747	15752	50 %	0 %	50 %	0 %	384206130
28	NC_017227	AT	3	6	15893	15898	50 %	50 %	0 %	0 %	384206131
29	NC_017227	AT	3	6	16061	16066	50 %	50 %	0 %	0 %	384206131
30	NC_017227	AT	3	6	17186	17191	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017227	AT	3	6	17320	17325	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017227	TA	3	6	18879	18884	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017227	AT	4	8	21080	21087	50 %	50 %	0 %	0 %	384206138
34	NC_017227	TA	3	6	21259	21264	50 %	50 %	0 %	0 %	384206138
35	NC_017227	TA	3	6	21709	21714	50 %	50 %	0 %	0 %	384206139
36	NC_017227	AT	3	6	22442	22447	50 %	50 %	0 %	0 %	384206140
37	NC_017227	AT	3	6	23154	23159	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017227	AT	3	6	23193	23198	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017227	TA	4	8	23317	23324	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017227	AT	3	6	23328	23333	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017227	TA	3	6	23395	23400	50 %	50 %	0 %	0 %	384206141
42	NC_017227	TA	3	6	23467	23472	50 %	50 %	0 %	0 %	384206141
43	NC_017227	TA	3	6	23850	23855	50 %	50 %	0 %	0 %	384206142
44	NC_017227	GT	3	6	24968	24973	0 %	50 %	50 %	0 %	384206143
45	NC_017227	TA	3	6	25910	25915	50 %	50 %	0 %	0 %	384206144
46	NC_017227	AT	3	6	26132	26137	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017227	AT	3	6	26293	26298	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017227	GA	3	6	26368	26373	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017227	AC	3	6	26702	26707	50 %	0 %	0 %	50 %	384206145
50	NC_017227	GA	3	6	26885	26890	50 %	0 %	50 %	0 %	384206145
51	NC_017227	AT	3	6	27550	27555	50 %	50 %	0 %	0 %	384206146
52	NC_017227	TA	3	6	27593	27598	50 %	50 %	0 %	0 %	384206146
53	NC_017227	AT	3	6	28195	28200	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017227	AT	3	6	28393	28398	50 %	50 %	0 %	0 %	384206147
55	NC_017227	TG	3	6	29138	29143	0 %	50 %	50 %	0 %	384206148
56	NC_017227	AT	3	6	29664	29669	50 %	50 %	0 %	0 %	384206149
57	NC_017227	AT	3	6	30004	30009	50 %	50 %	0 %	0 %	384206149
58	NC_017227	GA	3	6	30497	30502	50 %	0 %	50 %	0 %	384206149
59	NC_017227	AC	4	8	30604	30611	50 %	0 %	0 %	50 %	384206149
60	NC_017227	AT	3	6	30664	30669	50 %	50 %	0 %	0 %	384206149
61	NC_017227	AG	3	6	30910	30915	50 %	0 %	50 %	0 %	384206149

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.