MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid cp32-3

Total Repeats: 66

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017226	AC	3	6	36	41	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_017226	TG	3	6	67	72	0 %	50 %	50 %	0 %	384206064
3	NC_017226	TA	3	6	118	123	50 %	50 %	0 %	0 %	384206064
4	NC_017226	AG	4	8	1509	1516	50 %	0 %	50 %	0 %	384206065
5	NC_017226	GC	3	6	2829	2834	0 %	0 %	50 %	50 %	384206067
6	NC_017226	TA	3	6	2952	2957	50 %	50 %	0 %	0 %	384206067
7	NC_017226	CT	3	6	3175	3180	0 %	50 %	0 %	50 %	384206067
8	NC_017226	AT	3	6	4263	4268	50 %	50 %	0 %	0 %	384206069
9	NC_017226	AG	3	6	5274	5279	50 %	0 %	50 %	0 %	384206070
10	NC_017226	AG	3	6	5350	5355	50 %	0 %	50 %	0 %	384206070
11	NC_017226	AT	3	6	5602	5607	50 %	50 %	0 %	0 %	384206071
12	NC_017226	AT	3	6	5905	5910	50 %	50 %	0 %	0 %	384206072
13	NC_017226	TA	3	6	5921	5926	50 %	50 %	0 %	0 %	384206072
14	NC_017226	AT	4	8	6394	6401	50 %	50 %	0 %	0 %	384206073
15	NC_017226	TA	3	6	8631	8636	50 %	50 %	0 %	0 %	384206076
16	NC_017226	AT	3	6	9809	9814	50 %	50 %	0 %	0 %	384206078
17	NC_017226	AT	3	6	10663	10668	50 %	50 %	0 %	0 %	384206079
18	NC_017226	AC	3	6	11749	11754	50 %	0 %	0 %	50 %	384206080
19	NC_017226	CA	3	6	12115	12120	50 %	0 %	0 %	50 %	384206081
20	NC_017226	AT	3	6	12790	12795	50 %	50 %	0 %	0 %	384206082
21	NC_017226	AT	4	8	13182	13189	50 %	50 %	0 %	0 %	384206083
22	NC_017226	AT	3	6	13460	13465	50 %	50 %	0 %	0 %	384206083
23	NC_017226	AC	3	6	13787	13792	50 %	0 %	0 %	50 %	384206084
24	NC_017226	AT	3	6	13869	13874	50 %	50 %	0 %	0 %	384206084
25	NC_017226	TA	3	6	15087	15092	50 %	50 %	0 %	0 %	384206085
26	NC_017226	TA	3	6	15191	15196	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017226	TA	3	6	15200	15205	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017226	AT	3	6	15491	15496	50 %	50 %	0 %	0 %	384206087
29	NC_017226	CA	3	6	15530	15535	50 %	0 %	0 %	50 %	384206087
30	NC_017226	AG	3	6	15756	15761	50 %	0 %	50 %	0 %	384206087
31	NC_017226	AT	3	6	15902	15907	50 %	50 %	0 %	0 %	384206088
32	NC_017226	AT	3	6	15967	15972	50 %	50 %	0 %	0 %	384206088
33	NC_017226	AT	3	6	17399	17404	50 %	50 %	0 %	0 %	384206091
34	NC_017226	AT	3	6	17855	17860	50 %	50 %	0 %	0 %	384206092
35	NC_017226	AT	3	6	18344	18349	50 %	50 %	0 %	0 %	384206093
36	NC_017226	TA	3	6	19398	19403	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017226	AT	3	6	20764	20769	50 %	50 %	0 %	0 %	384206094
38	NC_017226	TA	4	8	21771	21778	50 %	50 %	0 %	0 %	384206096
39	NC_017226	TA	3	6	21783	21788	50 %	50 %	0 %	0 %	384206096
40	NC_017226	TA	3	6	21849	21854	50 %	50 %	0 %	0 %	384206096
41	NC_017226	TA	3	6	22098	22103	50 %	50 %	0 %	0 %	384206096
42	NC_017226	AG	3	6	22538	22543	50 %	0 %	50 %	0 %	384206097
43	NC_017226	AT	4	8	22934	22941	50 %	50 %	0 %	0 %	384206098
44	NC_017226	AT	3	6	23096	23101	50 %	50 %	0 %	0 %	384206098
45	NC_017226	TA	3	6	23251	23256	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017226	AT	4	8	23482	23489	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017226	AT	3	6	23667	23672	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017226	TA	4	8	23790	23797	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017226	AT	3	6	23801	23806	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017226	TA	3	6	23941	23946	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017226	TA	3	6	24347	24352	50 %	50 %	0 %	0 %	384206099
52	NC_017226	GT	3	6	25470	25475	0 %	50 %	50 %	0 %	384206100
53	NC_017226	AT	3	6	26634	26639	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017226	CA	3	6	26766	26771	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_017226	TG	3	6	26789	26794	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017226	AT	3	6	26795	26800	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017226	GA	3	6	26870	26875	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017226	AT	4	8	28361	28368	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017226	AT	3	6	28563	28568	50 %	50 %	0 %	0 %	384206103
60	NC_017226	TG	3	6	29307	29312	0 %	50 %	50 %	0 %	384206104
61	NC_017226	AT	3	6	29833	29838	50 %	50 %	0 %	0 %	384206105
62	NC_017226	AT	3	6	30173	30178	50 %	50 %	0 %	0 %	384206105
63	NC_017226	GA	3	6	30666	30671	50 %	0 %	50 %	0 %	384206105
64	NC_017226	AC	4	8	30773	30780	50 %	0 %	0 %	50 %	384206105
65	NC_017226	AT	3	6	30833	30838	50 %	50 %	0 %	0 %	384206105
66	NC_017226	AG	3	6	31079	31084	50 %	0 %	50 %	0 %	384206105

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.