MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid cp32-12

Total Repeats: 40

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017225	GATTC	2	10	2709	2718	20 %	40 %	20 %	20 %	384206024
2	NC_017225	TTAAT	2	10	3262	3271	40 %	60 %	0 %	0 %	384206024
3	NC_017225	GCAAA	2	10	3858	3867	60 %	0 %	20 %	20 %	384206025
4	NC_017225	TAAAT	2	10	4924	4933	60 %	40 %	0 %	0 %	384206027
5	NC_017225	ATACT	2	10	5728	5737	40 %	40 %	0 %	20 %	384206028
6	NC_017225	TAATA	2	10	6287	6296	60 %	40 %	0 %	0 %	384206030
7	NC_017225	GAAAA	2	10	6905	6914	80 %	0 %	20 %	0 %	384206031
8	NC_017225	CTGCA	2	10	7559	7568	20 %	20 %	20 %	40 %	384206031
9	NC_017225	AAAAC	2	10	8295	8304	80 %	0 %	0 %	20 %	384206033
10	NC_017225	GAACT	2	10	9471	9480	40 %	20 %	20 %	20 %	384206035
11	NC_017225	ATATT	2	10	11580	11589	40 %	60 %	0 %	0 %	384206037
12	NC_017225	AATTT	2	10	12252	12261	40 %	60 %	0 %	0 %	384206038
13	NC_017225	TAAAA	2	10	12272	12281	80 %	20 %	0 %	0 %	384206038
14	NC_017225	TACAA	2	10	12742	12751	60 %	20 %	0 %	20 %	384206039
15	NC_017225	ACTCA	2	10	13302	13311	40 %	20 %	0 %	40 %	384206040
16	NC_017225	AAAGT	2	10	13369	13378	60 %	20 %	20 %	0 %	384206040
17	NC_017225	AGAAA	2	10	14135	14144	80 %	0 %	20 %	0 %	384206041
18	NC_017225	ATCTT	2	10	14872	14881	20 %	60 %	0 %	20 %	384206042
19	NC_017225	TTATG	2	10	16211	16220	20 %	60 %	20 %	0 %	384206046
20	NC_017225	TAGCA	2	10	17001	17010	40 %	20 %	20 %	20 %	384206047
21	NC_017225	GGAGA	2	10	17178	17187	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017225	AAAGC	2	10	17362	17371	60 %	0 %	20 %	20 %	384206048
23	NC_017225	TAAAA	2	10	17463	17472	80 %	20 %	0 %	0 %	384206048
24	NC_017225	CACTT	2	10	18237	18246	20 %	40 %	0 %	40 %	384206049
25	NC_017225	AATTT	2	10	18604	18613	40 %	60 %	0 %	0 %	384206049
26	NC_017225	AAAAG	2	10	19991	20000	80 %	0 %	20 %	0 %	384206051
27	NC_017225	TCCAA	2	10	20795	20804	40 %	20 %	0 %	40 %	384206052
28	NC_017225	AGAAA	2	10	21129	21138	80 %	0 %	20 %	0 %	384206053
29	NC_017225	ATTTT	2	10	22201	22210	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017225	TTATA	2	10	22618	22627	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017225	TAAAA	2	10	24200	24209	80 %	20 %	0 %	0 %	384206056
32	NC_017225	ATTTT	2	10	25298	25307	20 %	80 %	0 %	0 %	384206057
33	NC_017225	ATACT	2	10	25591	25600	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_017225	AATTT	2	10	25628	25637	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017225	AAGAA	2	10	26049	26058	80 %	0 %	20 %	0 %	384206058
36	NC_017225	TAAAA	2	10	26387	26396	80 %	20 %	0 %	0 %	384206058
37	NC_017225	AAAAG	2	10	26506	26515	80 %	0 %	20 %	0 %	384206059
38	NC_017225	AAAAG	2	10	26992	27001	80 %	0 %	20 %	0 %	384206059
39	NC_017225	TAAAA	2	10	27333	27342	80 %	20 %	0 %	0 %	384206059
40	NC_017225	GAAAA	2	10	28893	28902	80 %	0 %	20 %	0 %	384206062

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.