MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid cp32-12

Total Repeats: 94

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017225	ATTA	2	8	943	950	50 %	50 %	0 %	0 %	384206021
2	NC_017225	AGTA	2	8	1109	1116	50 %	25 %	25 %	0 %	384206021
3	NC_017225	AGTA	2	8	1205	1212	50 %	25 %	25 %	0 %	384206021
4	NC_017225	AATT	2	8	1895	1902	50 %	50 %	0 %	0 %	384206022
5	NC_017225	TTAT	2	8	2519	2526	25 %	75 %	0 %	0 %	384206023
6	NC_017225	GTAA	2	8	2566	2573	50 %	25 %	25 %	0 %	384206023
7	NC_017225	GCAG	2	8	2627	2634	25 %	0 %	50 %	25 %	384206024
8	NC_017225	GAGC	2	8	2826	2833	25 %	0 %	50 %	25 %	384206024
9	NC_017225	ATGT	2	8	3001	3008	25 %	50 %	25 %	0 %	384206024
10	NC_017225	ATAA	2	8	3108	3115	75 %	25 %	0 %	0 %	384206024
11	NC_017225	CAAT	2	8	3190	3197	50 %	25 %	0 %	25 %	384206024
12	NC_017225	AGAT	2	8	3233	3240	50 %	25 %	25 %	0 %	384206024
13	NC_017225	AATG	2	8	3355	3362	50 %	25 %	25 %	0 %	384206025
14	NC_017225	GTAA	2	8	3918	3925	50 %	25 %	25 %	0 %	384206025
15	NC_017225	TCAT	2	8	4832	4839	25 %	50 %	0 %	25 %	384206026
16	NC_017225	AGTG	2	8	5386	5393	25 %	25 %	50 %	0 %	384206027
17	NC_017225	GGAC	2	8	5760	5767	25 %	0 %	50 %	25 %	384206028
18	NC_017225	AACT	2	8	6119	6126	50 %	25 %	0 %	25 %	384206029
19	NC_017225	AATC	2	8	6513	6520	50 %	25 %	0 %	25 %	384206030
20	NC_017225	TAAA	2	8	6535	6542	75 %	25 %	0 %	0 %	384206030
21	NC_017225	AGAA	2	8	7206	7213	75 %	0 %	25 %	0 %	384206031
22	NC_017225	TTAT	2	8	7220	7227	25 %	75 %	0 %	0 %	384206031
23	NC_017225	CAAG	2	8	7279	7286	50 %	0 %	25 %	25 %	384206031
24	NC_017225	TTAC	2	8	7718	7725	25 %	50 %	0 %	25 %	384206031
25	NC_017225	TGCT	2	8	8085	8092	0 %	50 %	25 %	25 %	384206032
26	NC_017225	ATTT	2	8	8482	8489	25 %	75 %	0 %	0 %	384206033
27	NC_017225	CTTA	2	8	8668	8675	25 %	50 %	0 %	25 %	384206033
28	NC_017225	CTTG	2	8	8775	8782	0 %	50 %	25 %	25 %	384206034
29	NC_017225	AATT	2	8	8921	8928	50 %	50 %	0 %	0 %	384206034
30	NC_017225	CAAG	2	8	9587	9594	50 %	0 %	25 %	25 %	384206035
31	NC_017225	TTGG	3	12	10103	10114	0 %	50 %	50 %	0 %	384206035
32	NC_017225	AAAT	2	8	11694	11701	75 %	25 %	0 %	0 %	384206037
33	NC_017225	TCAA	2	8	12158	12165	50 %	25 %	0 %	25 %	384206038
34	NC_017225	GAAA	2	8	12323	12330	75 %	0 %	25 %	0 %	384206038
35	NC_017225	GTTT	2	8	12442	12449	0 %	75 %	25 %	0 %	384206038
36	NC_017225	TTAT	2	8	12572	12579	25 %	75 %	0 %	0 %	384206039
37	NC_017225	TAAT	2	8	12983	12990	50 %	50 %	0 %	0 %	384206040
38	NC_017225	CAAA	2	8	13606	13613	75 %	0 %	0 %	25 %	384206040
39	NC_017225	ATTT	2	8	14081	14088	25 %	75 %	0 %	0 %	384206041
40	NC_017225	ATAA	2	8	14259	14266	75 %	25 %	0 %	0 %	384206041
41	NC_017225	CTAT	2	8	15336	15343	25 %	50 %	0 %	25 %	384206043
42	NC_017225	ATCA	2	8	15636	15643	50 %	25 %	0 %	25 %	384206044
43	NC_017225	AGGA	2	8	15709	15716	50 %	0 %	50 %	0 %	384206044
44	NC_017225	CTAT	2	8	15721	15728	25 %	50 %	0 %	25 %	384206044
45	NC_017225	TTAC	2	8	16098	16105	25 %	50 %	0 %	25 %	384206046
46	NC_017225	TCAA	2	8	16329	16336	50 %	25 %	0 %	25 %	384206046
47	NC_017225	CTAA	2	8	16486	16493	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_017225	GATT	2	8	16719	16726	25 %	50 %	25 %	0 %	384206047
49	NC_017225	GTAA	2	8	16945	16952	50 %	25 %	25 %	0 %	384206047
50	NC_017225	TAAT	2	8	17027	17034	50 %	50 %	0 %	0 %	384206047
51	NC_017225	TTAT	2	8	18541	18548	25 %	75 %	0 %	0 %	384206049
52	NC_017225	ATTC	2	8	18573	18580	25 %	50 %	0 %	25 %	384206049
53	NC_017225	ATTT	2	8	18906	18913	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017225	ATTA	2	8	19018	19025	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017225	AAAC	2	8	19957	19964	75 %	0 %	0 %	25 %	384206051
56	NC_017225	GTAA	2	8	20389	20396	50 %	25 %	25 %	0 %	384206052
57	NC_017225	ATTT	2	8	20546	20553	25 %	75 %	0 %	0 %	384206052
58	NC_017225	TAAA	2	8	20843	20850	75 %	25 %	0 %	0 %	384206052
59	NC_017225	AGAT	2	8	21107	21114	50 %	25 %	25 %	0 %	384206053
60	NC_017225	TGGA	2	8	21202	21209	25 %	25 %	50 %	0 %	384206053
61	NC_017225	AAAG	2	8	21366	21373	75 %	0 %	25 %	0 %	384206053
62	NC_017225	ATAG	2	8	21798	21805	50 %	25 %	25 %	0 %	384206054
63	NC_017225	AGAT	2	8	21817	21824	50 %	25 %	25 %	0 %	384206054
64	NC_017225	ATTT	3	12	21850	21861	25 %	75 %	0 %	0 %	384206054
65	NC_017225	AGAT	2	8	21871	21878	50 %	25 %	25 %	0 %	384206054
66	NC_017225	AGAT	2	8	21904	21911	50 %	25 %	25 %	0 %	384206054
67	NC_017225	AGAT	2	8	21991	21998	50 %	25 %	25 %	0 %	384206054
68	NC_017225	TTTA	2	8	22097	22104	25 %	75 %	0 %	0 %	384206054
69	NC_017225	TAAA	2	8	22124	22131	75 %	25 %	0 %	0 %	384206054
70	NC_017225	AAAT	2	8	23250	23257	75 %	25 %	0 %	0 %	384206055
71	NC_017225	GATG	2	8	23332	23339	25 %	25 %	50 %	0 %	384206055
72	NC_017225	TAAA	2	8	23882	23889	75 %	25 %	0 %	0 %	384206055
73	NC_017225	AGAT	2	8	24045	24052	50 %	25 %	25 %	0 %	384206055
74	NC_017225	AGAA	2	8	24526	24533	75 %	0 %	25 %	0 %	384206056
75	NC_017225	ATAG	2	8	24607	24614	50 %	25 %	25 %	0 %	384206056
76	NC_017225	AAAT	3	12	24768	24779	75 %	25 %	0 %	0 %	384206057
77	NC_017225	ATTT	2	8	24798	24805	25 %	75 %	0 %	0 %	384206057
78	NC_017225	CCAG	2	8	25153	25160	25 %	0 %	25 %	50 %	384206057
79	NC_017225	GTTT	2	8	25172	25179	0 %	75 %	25 %	0 %	384206057
80	NC_017225	TGCA	2	8	25516	25523	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_017225	ATTA	2	8	25752	25759	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017225	AAGT	2	8	25949	25956	50 %	25 %	25 %	0 %	384206058
83	NC_017225	AGAA	2	8	26592	26599	75 %	0 %	25 %	0 %	384206059
84	NC_017225	TATT	2	8	27240	27247	25 %	75 %	0 %	0 %	384206059
85	NC_017225	TAAA	2	8	27529	27536	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017225	TTTA	3	12	27645	27656	25 %	75 %	0 %	0 %	384206060
87	NC_017225	ATTT	2	8	27664	27671	25 %	75 %	0 %	0 %	384206060
88	NC_017225	CAAT	2	8	27703	27710	50 %	25 %	0 %	25 %	384206060
89	NC_017225	ATCT	2	8	27965	27972	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_017225	ATAA	2	8	27986	27993	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017225	CAAA	2	8	28725	28732	75 %	0 %	0 %	25 %	384206062
92	NC_017225	TAGC	2	8	28921	28928	25 %	25 %	25 %	25 %	384206062
93	NC_017225	ACAA	2	8	29109	29116	75 %	0 %	0 %	25 %	384206062
94	NC_017225	AGCA	2	8	29489	29496	50 %	0 %	25 %	25 %	384206062

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.