MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid cp32-12

Total Repeats: 799

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017225	ATC	2	6	19851	19856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206051
502	NC_017225	ATG	2	6	19870	19875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206051
503	NC_017225	A	7	7	19919	19925	100 %	0 %	0 %	0 %	384206051
504	NC_017225	AAAC	2	8	19957	19964	75 %	0 %	0 %	25 %	384206051
505	NC_017225	AAAAG	2	10	19991	20000	80 %	0 %	20 %	0 %	384206051
506	NC_017225	A	7	7	20030	20036	100 %	0 %	0 %	0 %	384206051
507	NC_017225	ATA	2	6	20065	20070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206051
508	NC_017225	ATT	2	6	20096	20101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206051
509	NC_017225	TAA	2	6	20107	20112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206051
510	NC_017225	A	6	6	20111	20116	100 %	0 %	0 %	0 %	384206051
511	NC_017225	AAG	2	6	20140	20145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206051
512	NC_017225	A	6	6	20168	20173	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_017225	TAA	2	6	20193	20198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_017225	ATA	2	6	20221	20226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206052
515	NC_017225	GGT	2	6	20245	20250	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384206052
516	NC_017225	ATA	2	6	20272	20277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206052
517	NC_017225	TAT	2	6	20309	20314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206052
518	NC_017225	ATAGAT	2	12	20317	20328	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384206052
519	NC_017225	CTA	3	9	20339	20347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206052
520	NC_017225	A	6	6	20375	20380	100 %	0 %	0 %	0 %	384206052
521	NC_017225	GTAA	2	8	20389	20396	50 %	25 %	25 %	0 %	384206052
522	NC_017225	ATG	2	6	20435	20440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206052
523	NC_017225	ATTT	2	8	20546	20553	25 %	75 %	0 %	0 %	384206052
524	NC_017225	T	8	8	20551	20558	0 %	100 %	0 %	0 %	384206052
525	NC_017225	TA	3	6	20575	20580	50 %	50 %	0 %	0 %	384206052
526	NC_017225	TAA	2	6	20627	20632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206052
527	NC_017225	TTA	2	6	20692	20697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206052
528	NC_017225	TAAAAA	2	12	20717	20728	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384206052
529	NC_017225	A	8	8	20758	20765	100 %	0 %	0 %	0 %	384206052
530	NC_017225	TTA	2	6	20782	20787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206052
531	NC_017225	TCCAA	2	10	20795	20804	40 %	20 %	0 %	40 %	384206052
532	NC_017225	A	6	6	20803	20808	100 %	0 %	0 %	0 %	384206052
533	NC_017225	TAAA	2	8	20843	20850	75 %	25 %	0 %	0 %	384206052
534	NC_017225	A	7	7	20848	20854	100 %	0 %	0 %	0 %	384206052
535	NC_017225	ATG	2	6	20864	20869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206052
536	NC_017225	T	6	6	20923	20928	0 %	100 %	0 %	0 %	384206052
537	NC_017225	AT	3	6	20943	20948	50 %	50 %	0 %	0 %	384206052
538	NC_017225	A	6	6	20950	20955	100 %	0 %	0 %	0 %	384206052
539	NC_017225	GTT	2	6	20957	20962	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206052
540	NC_017225	TAT	2	6	20996	21001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206053
541	NC_017225	AGA	2	6	21032	21037	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206053
542	NC_017225	A	9	9	21055	21063	100 %	0 %	0 %	0 %	384206053
543	NC_017225	TTA	2	6	21064	21069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206053
544	NC_017225	AGAT	2	8	21107	21114	50 %	25 %	25 %	0 %	384206053
545	NC_017225	AGAAA	2	10	21129	21138	80 %	0 %	20 %	0 %	384206053
546	NC_017225	TGGA	2	8	21202	21209	25 %	25 %	50 %	0 %	384206053
547	NC_017225	ATT	2	6	21268	21273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206053
548	NC_017225	AAG	2	6	21295	21300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206053
549	NC_017225	AGA	2	6	21311	21316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206053
550	NC_017225	TA	3	6	21318	21323	50 %	50 %	0 %	0 %	384206053
551	NC_017225	AAAG	2	8	21366	21373	75 %	0 %	25 %	0 %	384206053
552	NC_017225	A	6	6	21384	21389	100 %	0 %	0 %	0 %	384206053
553	NC_017225	A	9	9	21392	21400	100 %	0 %	0 %	0 %	384206053
554	NC_017225	ATT	2	6	21494	21499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206053
555	NC_017225	TAA	2	6	21500	21505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206053
556	NC_017225	A	7	7	21522	21528	100 %	0 %	0 %	0 %	384206053
557	NC_017225	ATA	2	6	21557	21562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206053
558	NC_017225	AAT	2	6	21576	21581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206054
559	NC_017225	A	6	6	21614	21619	100 %	0 %	0 %	0 %	384206054
560	NC_017225	GAG	2	6	21645	21650	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384206054
561	NC_017225	TTC	2	6	21667	21672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206054
562	NC_017225	AAT	2	6	21710	21715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206054
563	NC_017225	AT	3	6	21742	21747	50 %	50 %	0 %	0 %	384206054
564	NC_017225	AGA	2	6	21778	21783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206054
565	NC_017225	ATAG	2	8	21798	21805	50 %	25 %	25 %	0 %	384206054
566	NC_017225	AGAT	2	8	21817	21824	50 %	25 %	25 %	0 %	384206054
567	NC_017225	A	7	7	21832	21838	100 %	0 %	0 %	0 %	384206054
568	NC_017225	ATTT	3	12	21850	21861	25 %	75 %	0 %	0 %	384206054
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570	NC_017225	AGAT	2	8	21904	21911	50 %	25 %	25 %	0 %	384206054
571	NC_017225	AT	3	6	21970	21975	50 %	50 %	0 %	0 %	384206054
572	NC_017225	AGAT	2	8	21991	21998	50 %	25 %	25 %	0 %	384206054
573	NC_017225	TTTA	2	8	22097	22104	25 %	75 %	0 %	0 %	384206054
574	NC_017225	TAAA	2	8	22124	22131	75 %	25 %	0 %	0 %	384206054
575	NC_017225	A	6	6	22133	22138	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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577	NC_017225	TAT	2	6	22161	22166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_017225	TGA	2	6	22177	22182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
579	NC_017225	A	6	6	22191	22196	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
580	NC_017225	ATTTT	2	10	22201	22210	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
581	NC_017225	T	7	7	22270	22276	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_017225	T	7	7	22347	22353	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
583	NC_017225	TTA	2	6	22379	22384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_017225	TAA	2	6	22405	22410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_017225	T	6	6	22416	22421	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_017225	T	6	6	22428	22433	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
587	NC_017225	ATA	2	6	22466	22471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_017225	ATA	2	6	22480	22485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_017225	AT	3	6	22501	22506	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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593	NC_017225	TTATA	2	10	22618	22627	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_017225	AT	3	6	22633	22638	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_017225	A	8	8	22642	22649	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_017225	TAT	2	6	22655	22660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
597	NC_017225	TA	3	6	22700	22705	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_017225	T	8	8	22724	22731	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_017225	TA	3	6	22773	22778	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_017225	ATT	3	9	22779	22787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
601	NC_017225	A	6	6	22792	22797	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_017225	A	7	7	22829	22835	100 %	0 %	0 %	0 %	384206055
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605	NC_017225	A	6	6	22963	22968	100 %	0 %	0 %	0 %	384206055
606	NC_017225	TGG	2	6	23082	23087	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384206055
607	NC_017225	TA	3	6	23162	23167	50 %	50 %	0 %	0 %	384206055
608	NC_017225	TTG	2	6	23234	23239	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206055
609	NC_017225	AAAT	2	8	23250	23257	75 %	25 %	0 %	0 %	384206055
610	NC_017225	ATT	2	6	23282	23287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206055
611	NC_017225	TAG	2	6	23315	23320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206055
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613	NC_017225	GATG	2	8	23332	23339	25 %	25 %	50 %	0 %	384206055
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617	NC_017225	AGT	2	6	23446	23451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206055
618	NC_017225	T	6	6	23457	23462	0 %	100 %	0 %	0 %	384206055
619	NC_017225	ATG	2	6	23570	23575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206055
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622	NC_017225	AAT	2	6	23680	23685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206055
623	NC_017225	ATG	2	6	23693	23698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206055
624	NC_017225	TTA	2	6	23702	23707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206055
625	NC_017225	TTG	2	6	23711	23716	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206055
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629	NC_017225	A	7	7	23905	23911	100 %	0 %	0 %	0 %	384206055
630	NC_017225	TTAAAA	2	12	23936	23947	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206055
631	NC_017225	AGAT	2	8	24045	24052	50 %	25 %	25 %	0 %	384206055
632	NC_017225	AGT	2	6	24073	24078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206055
633	NC_017225	A	6	6	24149	24154	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_017225	A	7	7	24157	24163	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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