MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid cp32-11

Total Repeats: 89

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017224	ATTA	2	8	943	950	50 %	50 %	0 %	0 %	384206410
2	NC_017224	AGTA	2	8	1109	1116	50 %	25 %	25 %	0 %	384206410
3	NC_017224	AGTA	2	8	1205	1212	50 %	25 %	25 %	0 %	384206410
4	NC_017224	AATT	2	8	1895	1902	50 %	50 %	0 %	0 %	384206411
5	NC_017224	TTAT	2	8	2519	2526	25 %	75 %	0 %	0 %	384206412
6	NC_017224	GTAA	2	8	2566	2573	50 %	25 %	25 %	0 %	384206412
7	NC_017224	GCAG	2	8	2627	2634	25 %	0 %	50 %	25 %	384206413
8	NC_017224	GAGC	2	8	2826	2833	25 %	0 %	50 %	25 %	384206413
9	NC_017224	ATGT	2	8	3001	3008	25 %	50 %	25 %	0 %	384206413
10	NC_017224	ATAA	2	8	3108	3115	75 %	25 %	0 %	0 %	384206413
11	NC_017224	CAAT	2	8	3190	3197	50 %	25 %	0 %	25 %	384206413
12	NC_017224	AGAT	2	8	3233	3240	50 %	25 %	25 %	0 %	384206413
13	NC_017224	AATG	2	8	3355	3362	50 %	25 %	25 %	0 %	384206414
14	NC_017224	GTAA	2	8	3918	3925	50 %	25 %	25 %	0 %	384206414
15	NC_017224	TCAT	2	8	4832	4839	25 %	50 %	0 %	25 %	384206415
16	NC_017224	AGTG	2	8	5386	5393	25 %	25 %	50 %	0 %	384206416
17	NC_017224	GGAC	2	8	5760	5767	25 %	0 %	50 %	25 %	384206417
18	NC_017224	ATGC	2	8	5959	5966	25 %	25 %	25 %	25 %	384206418
19	NC_017224	AACT	2	8	6122	6129	50 %	25 %	0 %	25 %	384206418
20	NC_017224	GAAA	3	12	7206	7217	75 %	0 %	25 %	0 %	384206420
21	NC_017224	TTAT	2	8	7223	7230	25 %	75 %	0 %	0 %	384206420
22	NC_017224	CAAG	2	8	7282	7289	50 %	0 %	25 %	25 %	384206420
23	NC_017224	TTAC	2	8	7721	7728	25 %	50 %	0 %	25 %	384206420
24	NC_017224	TGCT	2	8	8088	8095	0 %	50 %	25 %	25 %	384206421
25	NC_017224	ATTT	2	8	8485	8492	25 %	75 %	0 %	0 %	384206422
26	NC_017224	CTTG	2	8	8778	8785	0 %	50 %	25 %	25 %	384206423
27	NC_017224	AATT	2	8	8924	8931	50 %	50 %	0 %	0 %	384206423
28	NC_017224	AAGT	2	8	9609	9616	50 %	25 %	25 %	0 %	384206424
29	NC_017224	TTGG	3	12	10127	10138	0 %	50 %	50 %	0 %	384206424
30	NC_017224	AAAT	2	8	11718	11725	75 %	25 %	0 %	0 %	384206426
31	NC_017224	TCAA	2	8	12182	12189	50 %	25 %	0 %	25 %	384206427
32	NC_017224	GAAA	2	8	12347	12354	75 %	0 %	25 %	0 %	384206427
33	NC_017224	GTTT	2	8	12466	12473	0 %	75 %	25 %	0 %	384206427
34	NC_017224	TTAT	2	8	12596	12603	25 %	75 %	0 %	0 %	384206428
35	NC_017224	TAAT	2	8	13007	13014	50 %	50 %	0 %	0 %	384206429
36	NC_017224	CAAA	2	8	13631	13638	75 %	0 %	0 %	25 %	384206429
37	NC_017224	ATTT	2	8	14106	14113	25 %	75 %	0 %	0 %	384206430
38	NC_017224	TAAA	2	8	14399	14406	75 %	25 %	0 %	0 %	384206431
39	NC_017224	ATCA	2	8	15642	15649	50 %	25 %	0 %	25 %	384206433
40	NC_017224	AGGA	2	8	15715	15722	50 %	0 %	50 %	0 %	384206433
41	NC_017224	TAAC	2	8	15797	15804	50 %	25 %	0 %	25 %	384206434
42	NC_017224	TTAC	2	8	16103	16110	25 %	50 %	0 %	25 %	384206435
43	NC_017224	TCAA	2	8	16334	16341	50 %	25 %	0 %	25 %	384206435
44	NC_017224	CTAA	2	8	16491	16498	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_017224	AGAT	2	8	16723	16730	50 %	25 %	25 %	0 %	384206436
46	NC_017224	AGAT	2	8	16756	16763	50 %	25 %	25 %	0 %	384206436
47	NC_017224	ATAG	2	8	16845	16852	50 %	25 %	25 %	0 %	384206436
48	NC_017224	TAAT	2	8	17098	17105	50 %	50 %	0 %	0 %	384206436
49	NC_017224	AGCA	2	8	17373	17380	50 %	0 %	25 %	25 %	384206437
50	NC_017224	ACAA	2	8	17644	17651	75 %	0 %	0 %	25 %	384206437
51	NC_017224	AATA	2	8	17768	17775	75 %	25 %	0 %	0 %	384206437
52	NC_017224	GGTA	2	8	18007	18014	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017224	CTTG	2	8	18520	18527	0 %	50 %	25 %	25 %	384206438
54	NC_017224	GTTA	2	8	19049	19056	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017224	AATC	2	8	19262	19269	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_017224	TAAT	2	8	19297	19304	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017224	TAAC	2	8	19389	19396	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_017224	AACA	2	8	19451	19458	75 %	0 %	0 %	25 %	384206439
59	NC_017224	AAAC	2	8	20307	20314	75 %	0 %	0 %	25 %	384206439
60	NC_017224	AAAT	2	8	21071	21078	75 %	25 %	0 %	0 %	384206440
61	NC_017224	TAAA	2	8	21205	21212	75 %	25 %	0 %	0 %	384206440
62	NC_017224	TATG	2	8	21254	21261	25 %	50 %	25 %	0 %	384206440
63	NC_017224	ATTT	2	8	21330	21337	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017224	ATAA	2	8	21406	21413	75 %	25 %	0 %	0 %	384206441
65	NC_017224	AAAG	2	8	21727	21734	75 %	0 %	25 %	0 %	384206441
66	NC_017224	AAAG	2	8	21796	21803	75 %	0 %	25 %	0 %	384206441
67	NC_017224	TTTA	2	8	22263	22270	25 %	75 %	0 %	0 %	384206442
68	NC_017224	TAAC	2	8	22946	22953	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_017224	AAAT	2	8	23406	23413	75 %	25 %	0 %	0 %	384206443
70	NC_017224	GATG	2	8	23488	23495	25 %	25 %	50 %	0 %	384206443
71	NC_017224	TAAA	2	8	24038	24045	75 %	25 %	0 %	0 %	384206443
72	NC_017224	TAAT	2	8	24131	24138	50 %	50 %	0 %	0 %	384206443
73	NC_017224	GAAT	2	8	24621	24628	50 %	25 %	25 %	0 %	384206444
74	NC_017224	AGAA	2	8	24689	24696	75 %	0 %	25 %	0 %	384206444
75	NC_017224	ATAG	2	8	24770	24777	50 %	25 %	25 %	0 %	384206444
76	NC_017224	AAAT	3	12	24931	24942	75 %	25 %	0 %	0 %	384206445
77	NC_017224	ATTT	2	8	24961	24968	25 %	75 %	0 %	0 %	384206445
78	NC_017224	ATTT	2	8	25228	25235	25 %	75 %	0 %	0 %	384206445
79	NC_017224	TTTA	2	8	25526	25533	25 %	75 %	0 %	0 %	384206445
80	NC_017224	AAGA	2	8	26336	26343	75 %	0 %	25 %	0 %	384206446
81	NC_017224	GAAA	2	8	26396	26403	75 %	0 %	25 %	0 %	384206446
82	NC_017224	TTTA	2	8	26824	26831	25 %	75 %	0 %	0 %	384206447
83	NC_017224	TTTA	2	8	27862	27869	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017224	CAAC	2	8	28135	28142	50 %	0 %	0 %	50 %	384206448
85	NC_017224	AATA	2	8	28681	28688	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017224	CAAA	2	8	29378	29385	75 %	0 %	0 %	25 %	384206450
87	NC_017224	TAGC	2	8	29574	29581	25 %	25 %	25 %	25 %	384206450
88	NC_017224	ACAA	2	8	29762	29769	75 %	0 %	0 %	25 %	384206450
89	NC_017224	AGCA	2	8	30142	30149	50 %	0 %	25 %	25 %	384206450

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.