MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bordetella pertussis CS chromosome

Total Repeats: 115083

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_017223	GC	4	8	135003	135010	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3502	NC_017223	GC	3	6	135027	135032	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3503	NC_017223	GCAT	2	8	135062	135069	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3504	NC_017223	CTCATT	2	12	135091	135102	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3505	NC_017223	TCA	2	6	135138	135143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3506	NC_017223	GC	3	6	135216	135221	0 %	0 %	50 %	50 %	384202678
3507	NC_017223	TGG	2	6	135231	135236	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384202678
3508	NC_017223	GTG	2	6	135254	135259	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384202678
3509	NC_017223	GCG	2	6	135423	135428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202678
3510	NC_017223	GTA	2	6	135497	135502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384202678
3511	NC_017223	TCG	2	6	135546	135551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202678
3512	NC_017223	ACGAAG	2	12	135597	135608	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	384202678
3513	NC_017223	CTT	2	6	135683	135688	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384202678
3514	NC_017223	GCA	2	6	135700	135705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202678
3515	NC_017223	CAC	2	6	135734	135739	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384202678
3516	NC_017223	CGGC	2	8	135745	135752	0 %	0 %	50 %	50 %	384202678
3517	NC_017223	GCTG	2	8	135806	135813	0 %	25 %	50 %	25 %	384202678
3518	NC_017223	GC	3	6	135836	135841	0 %	0 %	50 %	50 %	384202678
3519	NC_017223	GCG	2	6	135857	135862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202678
3520	NC_017223	CA	3	6	136025	136030	50 %	0 %	0 %	50 %	384202678
3521	NC_017223	CCGG	2	8	136109	136116	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3522	NC_017223	G	6	6	136133	136138	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3523	NC_017223	TCG	2	6	136267	136272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3524	NC_017223	CGA	2	6	136323	136328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3525	NC_017223	TACGCC	2	12	136390	136401	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
3526	NC_017223	CCT	2	6	136512	136517	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3527	NC_017223	C	6	6	136518	136523	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3528	NC_017223	CGA	2	6	136589	136594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202679
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3530	NC_017223	GCC	2	6	136794	136799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202679
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3533	NC_017223	GGC	2	6	136878	136883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202679
3534	NC_017223	CGGCT	2	10	136893	136902	0 %	20 %	40 %	40 %	384202679
3535	NC_017223	GCG	2	6	137004	137009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202679
3536	NC_017223	GCT	2	6	137021	137026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202679
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3538	NC_017223	CGG	2	6	137201	137206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202679
3539	NC_017223	ACC	2	6	137272	137277	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384202679
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3542	NC_017223	CCA	2	6	137324	137329	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384202679
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3544	NC_017223	GCCG	2	8	137381	137388	0 %	0 %	50 %	50 %	384202679
3545	NC_017223	GAT	2	6	137436	137441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384202679
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3549	NC_017223	TGC	2	6	137638	137643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202679
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3553	NC_017223	CAGCC	2	10	137761	137770	20 %	0 %	20 %	60 %	384202679
3554	NC_017223	TGG	2	6	137771	137776	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384202679
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3557	NC_017223	GC	3	6	137835	137840	0 %	0 %	50 %	50 %	384202679
3558	NC_017223	TTG	2	6	137863	137868	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384202679
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3561	NC_017223	CAG	2	6	137949	137954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202679
3562	NC_017223	GC	4	8	137957	137964	0 %	0 %	50 %	50 %	384202679
3563	NC_017223	GCG	2	6	137969	137974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202679
3564	NC_017223	CGT	2	6	137987	137992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202679
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3566	NC_017223	A	7	7	138055	138061	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3567	NC_017223	CAT	2	6	138118	138123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3569	NC_017223	CTG	2	6	138212	138217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3570	NC_017223	GGC	2	6	138247	138252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3571	NC_017223	TGG	2	6	138303	138308	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3572	NC_017223	CGGC	2	8	138324	138331	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3573	NC_017223	CTA	2	6	138343	138348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3575	NC_017223	GGGC	2	8	138433	138440	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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3587	NC_017223	GC	3	6	138837	138842	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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3591	NC_017223	GC	3	6	138968	138973	0 %	0 %	50 %	50 %	384202680
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3598	NC_017223	CCGCG	2	10	139148	139157	0 %	0 %	40 %	60 %	384202680
3599	NC_017223	GGT	2	6	139165	139170	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384202680
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3604	NC_017223	ACA	2	6	139284	139289	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384202680
3605	NC_017223	CG	3	6	139308	139313	0 %	0 %	50 %	50 %	384202680
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3609	NC_017223	CG	3	6	139440	139445	0 %	0 %	50 %	50 %	384202680
3610	NC_017223	GCG	3	9	139443	139451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202680
3611	NC_017223	GCG	2	6	139467	139472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202680
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3622	NC_017223	TGG	2	6	139767	139772	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384202680
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3871	NC_017223	GGC	2	6	149006	149011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3872	NC_017223	GC	3	6	149029	149034	0 %	0 %	50 %	50 %	384202686
3873	NC_017223	GGC	2	6	149120	149125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202686
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4000	NC_017223	CTG	2	6	153536	153541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202690

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