MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bordetella pertussis CS chromosome

Total Repeats: 115083

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3002	NC_017223	CGT	2	6	117074	117079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202665
3003	NC_017223	CAG	2	6	117086	117091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202665
3004	NC_017223	GGC	2	6	117143	117148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202665
3005	NC_017223	GGC	2	6	117179	117184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202665
3006	NC_017223	AGA	2	6	117190	117195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384202665
3007	NC_017223	CAT	2	6	117230	117235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384202665
3008	NC_017223	CCAG	2	8	117265	117272	25 %	0 %	25 %	50 %	384202665
3009	NC_017223	GGCC	2	8	117277	117284	0 %	0 %	50 %	50 %	384202665
3010	NC_017223	GCG	2	6	117325	117330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202665
3011	NC_017223	AGA	2	6	117334	117339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384202665
3012	NC_017223	GCCACC	2	12	117354	117365	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	384202665
3013	NC_017223	GCA	2	6	117370	117375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202665
3014	NC_017223	GTT	2	6	117497	117502	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384202665
3015	NC_017223	GTC	2	6	117527	117532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202665
3016	NC_017223	GCA	2	6	117535	117540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202665
3017	NC_017223	GC	3	6	117566	117571	0 %	0 %	50 %	50 %	384202665
3018	NC_017223	CGGC	2	8	117572	117579	0 %	0 %	50 %	50 %	384202665
3019	NC_017223	GAA	2	6	117596	117601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384202665
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3021	NC_017223	CAG	2	6	117647	117652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202665
3022	NC_017223	GAC	2	6	117653	117658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202665
3023	NC_017223	GCA	2	6	117664	117669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202665
3024	NC_017223	CAG	2	6	117671	117676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202665
3025	NC_017223	CGT	2	6	117695	117700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202665
3026	NC_017223	GCA	2	6	117734	117739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202666
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3028	NC_017223	CTG	2	6	117774	117779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202666
3029	NC_017223	GTGG	2	8	117849	117856	0 %	25 %	75 %	0 %	384202666
3030	NC_017223	CG	3	6	117887	117892	0 %	0 %	50 %	50 %	384202666
3031	NC_017223	CTT	2	6	117924	117929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384202666
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3033	NC_017223	CGG	2	6	117992	117997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202666
3034	NC_017223	GTG	2	6	118009	118014	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384202666
3035	NC_017223	CTG	3	9	118041	118049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202666
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3039	NC_017223	CAT	2	6	118122	118127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384202666
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3043	NC_017223	GTG	2	6	118228	118233	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384202666
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3051	NC_017223	GGCC	2	8	118526	118533	0 %	0 %	50 %	50 %	384202666
3052	NC_017223	TTG	2	6	118549	118554	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384202666
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3056	NC_017223	TCG	2	6	118705	118710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202666
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3069	NC_017223	GGT	2	6	119049	119054	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3070	NC_017223	CCG	2	6	119063	119068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202667
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3102	NC_017223	GCCG	2	8	120009	120016	0 %	0 %	50 %	50 %	384202667
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3105	NC_017223	TTGT	2	8	120104	120111	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3106	NC_017223	CGC	2	6	120173	120178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3107	NC_017223	GCG	3	9	120186	120194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3115	NC_017223	CAG	2	6	120507	120512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202668
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3118	NC_017223	GTT	2	6	120587	120592	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384202668
3119	NC_017223	GCCA	2	8	120607	120614	25 %	0 %	25 %	50 %	384202668
3120	NC_017223	GGC	2	6	120620	120625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202668
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3123	NC_017223	GGC	2	6	120756	120761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202668
3124	NC_017223	GTC	2	6	120774	120779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202668
3125	NC_017223	CGC	2	6	120875	120880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202668
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3127	NC_017223	CGGC	2	8	120929	120936	0 %	0 %	50 %	50 %	384202668
3128	NC_017223	CGGT	2	8	120946	120953	0 %	25 %	50 %	25 %	384202668
3129	NC_017223	GCC	2	6	121052	121057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3130	NC_017223	CAC	2	6	121060	121065	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3131	NC_017223	GGC	2	6	121111	121116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3132	NC_017223	GC	3	6	121181	121186	0 %	0 %	50 %	50 %	384202669
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3144	NC_017223	GC	3	6	121801	121806	0 %	0 %	50 %	50 %	384202669
3145	NC_017223	GCG	2	6	121822	121827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202669
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3148	NC_017223	G	6	6	122098	122103	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3149	NC_017223	CGT	2	6	122177	122182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3152	NC_017223	GGCG	2	8	122270	122277	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3153	NC_017223	GCGG	2	8	122282	122289	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3154	NC_017223	TCG	2	6	122302	122307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3155	NC_017223	CAG	2	6	122316	122321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3156	NC_017223	CG	3	6	122327	122332	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3157	NC_017223	CG	3	6	122337	122342	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3158	NC_017223	CGA	2	6	122372	122377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3162	NC_017223	GGT	2	6	122502	122507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3163	NC_017223	GCA	2	6	122522	122527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3164	NC_017223	CAG	3	9	122592	122600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3165	NC_017223	CG	3	6	122603	122608	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3166	NC_017223	GC	5	10	122621	122630	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3167	NC_017223	CGCTGG	2	12	122641	122652	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
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3170	NC_017223	CG	3	6	122723	122728	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3171	NC_017223	GC	3	6	122733	122738	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3172	NC_017223	CGCGTA	2	12	122753	122764	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3222	NC_017223	GCA	2	6	124673	124678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3242	NC_017223	TTG	2	6	125576	125581	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384202671
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3247	NC_017223	GCG	3	9	125782	125790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3248	NC_017223	GCC	2	6	125796	125801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3249	NC_017223	GC	3	6	125823	125828	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3250	NC_017223	CAG	2	6	125862	125867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3251	NC_017223	CG	3	6	125978	125983	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3252	NC_017223	CAG	2	6	126030	126035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3254	NC_017223	CTG	2	6	126084	126089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3373	NC_017223	CCAG	2	8	130852	130859	25 %	0 %	25 %	50 %	384202674
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3375	NC_017223	CCA	2	6	130907	130912	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384202674
3376	NC_017223	CTG	2	6	130949	130954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202674
3377	NC_017223	GCAT	2	8	130962	130969	25 %	25 %	25 %	25 %	384202674
3378	NC_017223	CAG	2	6	131000	131005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202674
3379	NC_017223	GGC	2	6	131009	131014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202674
3380	NC_017223	AGC	2	6	131019	131024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202674
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3382	NC_017223	ACC	2	6	131046	131051	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384202674
3383	NC_017223	CAA	2	6	131087	131092	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384202674
3384	NC_017223	GGC	2	6	131107	131112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202674
3385	NC_017223	TCA	2	6	131146	131151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384202674
3386	NC_017223	GTC	2	6	131255	131260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202675
3387	NC_017223	GCTGGA	2	12	131261	131272	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384202675
3388	NC_017223	CGA	2	6	131318	131323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202675
3389	NC_017223	GC	3	6	131331	131336	0 %	0 %	50 %	50 %	384202675
3390	NC_017223	GAG	2	6	131337	131342	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384202675
3391	NC_017223	CGA	2	6	131378	131383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202675
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3394	NC_017223	CGA	3	9	131441	131449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202675
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3397	NC_017223	CTG	2	6	131496	131501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202675
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3399	NC_017223	CCGCG	2	10	131524	131533	0 %	0 %	40 %	60 %	384202675
3400	NC_017223	GCG	2	6	131538	131543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202675
3401	NC_017223	CTG	2	6	131553	131558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202675
3402	NC_017223	CGA	2	6	131561	131566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202675
3403	NC_017223	GCCG	2	8	131621	131628	0 %	0 %	50 %	50 %	384202675
3404	NC_017223	GC	3	6	131654	131659	0 %	0 %	50 %	50 %	384202675
3405	NC_017223	TGC	2	6	131671	131676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202675
3406	NC_017223	GGCA	2	8	131690	131697	25 %	0 %	50 %	25 %	384202675
3407	NC_017223	GC	4	8	131701	131708	0 %	0 %	50 %	50 %	384202675
3408	NC_017223	CTGCAG	2	12	131724	131735	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384202675
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3430	NC_017223	CGA	2	6	132434	132439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202675
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3432	NC_017223	CGC	2	6	132575	132580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202675
3433	NC_017223	CCT	2	6	132595	132600	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3434	NC_017223	AGC	2	6	132659	132664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3452	NC_017223	TCGGG	2	10	133339	133348	0 %	20 %	60 %	20 %	384202677
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3472	NC_017223	GGC	2	6	133975	133980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3473	NC_017223	CAT	2	6	133995	134000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3475	NC_017223	GGCGC	2	10	134036	134045	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
3476	NC_017223	CG	3	6	134053	134058	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3477	NC_017223	GC	4	8	134162	134169	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3478	NC_017223	TGC	3	9	134186	134194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3479	NC_017223	GC	3	6	134203	134208	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3480	NC_017223	GCCC	2	8	134225	134232	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3481	NC_017223	CG	3	6	134237	134242	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3482	NC_017223	CTG	2	6	134260	134265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3483	NC_017223	CAA	2	6	134274	134279	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3484	NC_017223	ACC	2	6	134314	134319	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3485	NC_017223	TTG	2	6	134362	134367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3486	NC_017223	TGGC	2	8	134406	134413	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3487	NC_017223	GCT	2	6	134439	134444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3488	NC_017223	CTG	2	6	134506	134511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3489	NC_017223	CGG	2	6	134514	134519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3490	NC_017223	GCT	2	6	134523	134528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3491	NC_017223	GCC	2	6	134571	134576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3492	NC_017223	GCT	2	6	134624	134629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3493	NC_017223	GCA	2	6	134689	134694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3494	NC_017223	TAC	2	6	134730	134735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3495	NC_017223	CTG	2	6	134811	134816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3496	NC_017223	CTG	2	6	134859	134864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3497	NC_017223	GCGG	2	8	134908	134915	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3498	NC_017223	CG	3	6	134936	134941	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3499	NC_017223	GC	4	8	134948	134955	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3500	NC_017223	CGGG	2	8	134989	134996	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding

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