MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bordetella pertussis CS chromosome

Total Repeats: 115083

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2502	NC_017223	GCG	2	6	99164	99169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202646
2503	NC_017223	GCCGC	2	10	99181	99190	0 %	0 %	40 %	60 %	384202646
2504	NC_017223	GGC	2	6	99219	99224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202646
2505	NC_017223	CGCC	2	8	99227	99234	0 %	0 %	25 %	75 %	384202646
2506	NC_017223	ACGC	2	8	99338	99345	25 %	0 %	25 %	50 %	384202646
2507	NC_017223	GC	3	6	99359	99364	0 %	0 %	50 %	50 %	384202646
2508	NC_017223	GCAGGT	2	12	99450	99461	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384202646
2509	NC_017223	CGC	2	6	99486	99491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202646
2510	NC_017223	TGC	2	6	99536	99541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202646
2511	NC_017223	GGT	2	6	99552	99557	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384202646
2512	NC_017223	CG	4	8	99573	99580	0 %	0 %	50 %	50 %	384202646
2513	NC_017223	GCCG	2	8	99585	99592	0 %	0 %	50 %	50 %	384202646
2514	NC_017223	GCC	2	6	99604	99609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202646
2515	NC_017223	GGC	2	6	99610	99615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202646
2516	NC_017223	CGA	2	6	99651	99656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202646
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2518	NC_017223	GGCC	2	8	99672	99679	0 %	0 %	50 %	50 %	384202646
2519	NC_017223	GCC	2	6	99688	99693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202646
2520	NC_017223	GC	5	10	99695	99704	0 %	0 %	50 %	50 %	384202646
2521	NC_017223	GCC	2	6	99780	99785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202647
2522	NC_017223	GCA	2	6	99787	99792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202647
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2524	NC_017223	CG	3	6	99826	99831	0 %	0 %	50 %	50 %	384202647
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2530	NC_017223	GC	4	8	99903	99910	0 %	0 %	50 %	50 %	384202647
2531	NC_017223	GCA	2	6	99917	99922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202647
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2533	NC_017223	TGG	2	6	100018	100023	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384202647
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2537	NC_017223	CTGATG	2	12	100158	100169	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384202647
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2543	NC_017223	GCT	2	6	100343	100348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202647
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2546	NC_017223	GCTG	2	8	100598	100605	0 %	25 %	50 %	25 %	384202648
2547	NC_017223	GCG	2	6	100620	100625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202648
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2549	NC_017223	CAG	3	9	100638	100646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202648
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2593	NC_017223	CGA	2	6	101926	101931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202649
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2622	NC_017223	CGGC	2	8	102734	102741	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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2873	NC_017223	GC	3	6	112442	112447	0 %	0 %	50 %	50 %	384202660
2874	NC_017223	CCT	2	6	112461	112466	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384202660
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2876	NC_017223	GCA	2	6	112497	112502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202660
2877	NC_017223	GC	3	6	112550	112555	0 %	0 %	50 %	50 %	384202660
2878	NC_017223	CG	3	6	112557	112562	0 %	0 %	50 %	50 %	384202660
2879	NC_017223	GTG	2	6	112573	112578	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384202660
2880	NC_017223	GTG	2	6	112603	112608	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384202660
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2882	NC_017223	GTC	2	6	112699	112704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202660
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2885	NC_017223	GCT	2	6	112816	112821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202660
2886	NC_017223	AGT	2	6	112830	112835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384202660
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2888	NC_017223	CAGGTC	2	12	112861	112872	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384202660
2889	NC_017223	GC	3	6	112978	112983	0 %	0 %	50 %	50 %	384202660
2890	NC_017223	CG	4	8	112992	112999	0 %	0 %	50 %	50 %	384202660
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2893	NC_017223	GCCGCG	2	12	113062	113073	0 %	0 %	50 %	50 %	384202660
2894	NC_017223	GTA	2	6	113122	113127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384202660
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2901	NC_017223	CGA	2	6	113424	113429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202660
2902	NC_017223	CG	3	6	113445	113450	0 %	0 %	50 %	50 %	384202660
2903	NC_017223	GCG	2	6	113455	113460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202660
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2924	NC_017223	GC	3	6	114170	114175	0 %	0 %	50 %	50 %	384202661
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2929	NC_017223	CG	3	6	114281	114286	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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2942	NC_017223	CTG	2	6	114874	114879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2967	NC_017223	CG	3	6	116049	116054	0 %	0 %	50 %	50 %	384202664
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2974	NC_017223	TGA	2	6	116219	116224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384202664
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2980	NC_017223	GCA	2	6	116396	116401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202664
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2987	NC_017223	CGGCG	2	10	116667	116676	0 %	0 %	60 %	40 %	384202664
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2989	NC_017223	CAG	2	6	116715	116720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202664
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2994	NC_017223	GT	3	6	116843	116848	0 %	50 %	50 %	0 %	384202665
2995	NC_017223	CCAG	2	8	116857	116864	25 %	0 %	25 %	50 %	384202665
2996	NC_017223	TGA	2	6	116872	116877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384202665
2997	NC_017223	GCC	2	6	116886	116891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202665
2998	NC_017223	AGC	2	6	116901	116906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202665
2999	NC_017223	CAG	3	9	116972	116980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202665
3000	NC_017223	GCC	2	6	116999	117004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202665

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