MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bordetella pertussis CS chromosome

Total Repeats: 115083

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2002	NC_017223	CCA	2	6	81100	81105	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384202629
2003	NC_017223	CGC	2	6	81133	81138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202629
2004	NC_017223	TGG	2	6	81145	81150	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384202629
2005	NC_017223	CGG	2	6	81172	81177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202629
2006	NC_017223	C	6	6	81204	81209	0 %	0 %	0 %	100 %	384202629
2007	NC_017223	GGC	2	6	81215	81220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202629
2008	NC_017223	CGCT	2	8	81228	81235	0 %	25 %	25 %	50 %	384202629
2009	NC_017223	CGC	2	6	81269	81274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202629
2010	NC_017223	GCC	2	6	81287	81292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202629
2011	NC_017223	GGTC	2	8	81325	81332	0 %	25 %	50 %	25 %	384202629
2012	NC_017223	GAA	2	6	81335	81340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384202629
2013	NC_017223	CAG	2	6	81380	81385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202629
2014	NC_017223	CGA	2	6	81439	81444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202629
2015	NC_017223	GACG	2	8	81482	81489	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2016	NC_017223	TGC	2	6	81537	81542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2017	NC_017223	GGACG	2	10	81555	81564	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
2018	NC_017223	CGC	2	6	81662	81667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2019	NC_017223	CAGC	2	8	81710	81717	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2020	NC_017223	CCAC	2	8	81727	81734	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
2021	NC_017223	AGA	2	6	81766	81771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2022	NC_017223	GCG	2	6	81775	81780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2023	NC_017223	CCA	2	6	81851	81856	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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2025	NC_017223	G	6	6	81956	81961	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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2027	NC_017223	ATG	2	6	82094	82099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2030	NC_017223	GC	3	6	82132	82137	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2031	NC_017223	CAG	2	6	82142	82147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2032	NC_017223	CG	3	6	82173	82178	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2033	NC_017223	CAG	2	6	82184	82189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2042	NC_017223	CAG	2	6	82594	82599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2043	NC_017223	CCG	2	6	82602	82607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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2051	NC_017223	CAG	2	6	83111	83116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202630
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2058	NC_017223	CAG	2	6	83264	83269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202630
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2060	NC_017223	CAG	2	6	83345	83350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202630
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2063	NC_017223	CG	4	8	83446	83453	0 %	0 %	50 %	50 %	384202630
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2099	NC_017223	CAG	2	6	85438	85443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202632
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2103	NC_017223	CATCGG	2	12	85526	85537	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384202633
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2128	NC_017223	ACGGCC	2	12	86506	86517	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384202633
2129	NC_017223	GGT	2	6	86577	86582	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384202633
2130	NC_017223	CAGC	2	8	86583	86590	25 %	0 %	25 %	50 %	384202633
2131	NC_017223	GGGCA	2	10	86640	86649	20 %	0 %	60 %	20 %	384202633
2132	NC_017223	GC	3	6	86697	86702	0 %	0 %	50 %	50 %	384202633
2133	NC_017223	CGG	2	6	86706	86711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202633
2134	NC_017223	GC	3	6	86745	86750	0 %	0 %	50 %	50 %	384202634
2135	NC_017223	TGC	2	6	86784	86789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202634
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2137	NC_017223	CGG	3	9	86857	86865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202634
2138	NC_017223	GGC	2	6	86900	86905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202634
2139	NC_017223	CCG	2	6	86914	86919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202634
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2141	NC_017223	TTG	2	6	87015	87020	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384202634
2142	NC_017223	CGG	2	6	87100	87105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202634
2143	NC_017223	GGCC	2	8	87151	87158	0 %	0 %	50 %	50 %	384202634
2144	NC_017223	CAG	2	6	87194	87199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202634
2145	NC_017223	CGTG	2	8	87271	87278	0 %	25 %	50 %	25 %	384202634
2146	NC_017223	GC	3	6	87328	87333	0 %	0 %	50 %	50 %	384202634
2147	NC_017223	CCG	2	6	87413	87418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202634
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2149	NC_017223	GCA	2	6	87460	87465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202634
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2153	NC_017223	GGCG	2	8	87601	87608	0 %	0 %	75 %	25 %	384202634
2154	NC_017223	CGT	2	6	87643	87648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202634
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2160	NC_017223	GC	4	8	87752	87759	0 %	0 %	50 %	50 %	384202634
2161	NC_017223	CG	3	6	87817	87822	0 %	0 %	50 %	50 %	384202634
2162	NC_017223	GCCG	2	8	87826	87833	0 %	0 %	50 %	50 %	384202634
2163	NC_017223	CCTG	2	8	87834	87841	0 %	25 %	25 %	50 %	384202634
2164	NC_017223	G	6	6	87841	87846	0 %	0 %	100 %	0 %	384202634
2165	NC_017223	CG	3	6	87847	87852	0 %	0 %	50 %	50 %	384202634
2166	NC_017223	GCC	2	6	87876	87881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202634
2167	NC_017223	ATGCCC	2	12	87893	87904	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384202634
2168	NC_017223	CAG	2	6	87977	87982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202634
2169	NC_017223	TAC	2	6	88003	88008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2170	NC_017223	GGC	2	6	88021	88026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202635
2171	NC_017223	CG	3	6	88080	88085	0 %	0 %	50 %	50 %	384202635
2172	NC_017223	CGG	2	6	88138	88143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202635
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2174	NC_017223	CTTC	2	8	88230	88237	0 %	50 %	0 %	50 %	384202635
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2183	NC_017223	CG	3	6	88474	88479	0 %	0 %	50 %	50 %	384202635
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2188	NC_017223	GTG	2	6	88561	88566	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384202635
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2192	NC_017223	CGGT	2	8	88682	88689	0 %	25 %	50 %	25 %	384202635
2193	NC_017223	GAAC	2	8	88726	88733	50 %	0 %	25 %	25 %	384202635
2194	NC_017223	GGCC	2	8	88737	88744	0 %	0 %	50 %	50 %	384202635
2195	NC_017223	CCG	2	6	88776	88781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202635
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2204	NC_017223	TGA	2	6	89055	89060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384202635
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2237	NC_017223	ACC	2	6	90360	90365	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384202637
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2239	NC_017223	CGC	2	6	90436	90441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202637
2240	NC_017223	CG	4	8	90521	90528	0 %	0 %	50 %	50 %	384202637
2241	NC_017223	CGT	2	6	90571	90576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202637
2242	NC_017223	GTT	2	6	90608	90613	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384202637
2243	NC_017223	CGA	2	6	90652	90657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202637
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2246	NC_017223	GGAT	2	8	90774	90781	25 %	25 %	50 %	0 %	384202637
2247	NC_017223	GGT	2	6	90782	90787	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384202637
2248	NC_017223	CG	4	8	90826	90833	0 %	0 %	50 %	50 %	384202638
2249	NC_017223	CAG	2	6	90851	90856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202638
2250	NC_017223	CGC	2	6	90904	90909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202638
2251	NC_017223	TGA	2	6	90919	90924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384202638
2252	NC_017223	GTA	2	6	90932	90937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384202638
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2254	NC_017223	TCG	2	6	91029	91034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202638
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2379	NC_017223	GC	3	6	94925	94930	0 %	0 %	50 %	50 %	384202642
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2498	NC_017223	CGGGC	2	10	99072	99081	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
2499	NC_017223	GAA	2	6	99120	99125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384202646
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