MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bordetella pertussis CS chromosome

Total Repeats: 115083

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_017223	G	6	6	58473	58478	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_017223	GCC	2	6	58550	58555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1503	NC_017223	CG	3	6	58563	58568	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1504	NC_017223	CGC	2	6	58609	58614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1505	NC_017223	CGACGC	2	12	58627	58638	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
1506	NC_017223	CAC	2	6	58645	58650	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1507	NC_017223	CGC	2	6	58656	58661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1508	NC_017223	TCG	2	6	58725	58730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1509	NC_017223	GCCC	2	8	58807	58814	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1510	NC_017223	TGC	2	6	58824	58829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1511	NC_017223	CCG	2	6	58852	58857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1512	NC_017223	GCT	2	6	58864	58869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1513	NC_017223	CAA	2	6	58894	58899	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1514	NC_017223	CAC	2	6	58903	58908	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1515	NC_017223	C	8	8	58975	58982	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1516	NC_017223	GC	3	6	59023	59028	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1517	NC_017223	GCGG	2	8	59081	59088	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1518	NC_017223	GCAA	2	8	59142	59149	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1519	NC_017223	CACG	2	8	59183	59190	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1520	NC_017223	CGA	2	6	59198	59203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1521	NC_017223	CCA	2	6	59272	59277	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384202611
1522	NC_017223	ACG	2	6	59310	59315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202611
1523	NC_017223	CTT	2	6	59362	59367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384202611
1524	NC_017223	TCC	2	6	59433	59438	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384202611
1525	NC_017223	GCCA	2	8	59506	59513	25 %	0 %	25 %	50 %	384202611
1526	NC_017223	ATGT	2	8	59606	59613	25 %	50 %	25 %	0 %	384202611
1527	NC_017223	GCA	2	6	59638	59643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202611
1528	NC_017223	GCA	2	6	59695	59700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202611
1529	NC_017223	TCG	2	6	59701	59706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202611
1530	NC_017223	GCC	2	6	59729	59734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202611
1531	NC_017223	TCG	2	6	59736	59741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202611
1532	NC_017223	CCG	2	6	59753	59758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202611
1533	NC_017223	GAT	2	6	59759	59764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384202611
1534	NC_017223	CCG	2	6	59770	59775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202611
1535	NC_017223	CCG	2	6	59778	59783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202611
1536	NC_017223	CGC	2	6	59798	59803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202611
1537	NC_017223	GCA	2	6	59826	59831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202611
1538	NC_017223	CTGG	2	8	59879	59886	0 %	25 %	50 %	25 %	384202611
1539	NC_017223	GGC	2	6	59905	59910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202611
1540	NC_017223	CG	4	8	59986	59993	0 %	0 %	50 %	50 %	384202611
1541	NC_017223	CCA	2	6	60046	60051	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384202611
1542	NC_017223	CGG	2	6	60053	60058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202611
1543	NC_017223	GC	3	6	60121	60126	0 %	0 %	50 %	50 %	384202611
1544	NC_017223	TC	3	6	60184	60189	0 %	50 %	0 %	50 %	384202611
1545	NC_017223	CTG	2	6	60194	60199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202611
1546	NC_017223	TCC	2	6	60258	60263	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384202611
1547	NC_017223	GC	3	6	60265	60270	0 %	0 %	50 %	50 %	384202611
1548	NC_017223	GCA	2	6	60310	60315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202611
1549	NC_017223	GAA	2	6	60332	60337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384202611
1550	NC_017223	TCG	2	6	60360	60365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202611
1551	NC_017223	CCTT	2	8	60512	60519	0 %	50 %	0 %	50 %	384202612
1552	NC_017223	TGC	2	6	60549	60554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202612
1553	NC_017223	CAT	2	6	60612	60617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384202612
1554	NC_017223	GCA	2	6	60636	60641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202612
1555	NC_017223	GC	3	6	60671	60676	0 %	0 %	50 %	50 %	384202612
1556	NC_017223	GC	3	6	60787	60792	0 %	0 %	50 %	50 %	384202612
1557	NC_017223	TGTCC	2	10	60801	60810	0 %	40 %	20 %	40 %	384202612
1558	NC_017223	ACGC	2	8	60822	60829	25 %	0 %	25 %	50 %	384202612
1559	NC_017223	AGCGA	2	10	61056	61065	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1560	NC_017223	ACT	2	6	61106	61111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384202613
1561	NC_017223	CAA	2	6	61135	61140	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384202613
1562	NC_017223	CG	3	6	61184	61189	0 %	0 %	50 %	50 %	384202613
1563	NC_017223	TCGC	2	8	61225	61232	0 %	25 %	25 %	50 %	384202613
1564	NC_017223	GTT	2	6	61234	61239	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384202613
1565	NC_017223	AGCA	2	8	61291	61298	50 %	0 %	25 %	25 %	384202613
1566	NC_017223	CTT	2	6	61305	61310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384202613
1567	NC_017223	GCC	2	6	61311	61316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202613
1568	NC_017223	ACGA	2	8	61552	61559	50 %	0 %	25 %	25 %	384202613
1569	NC_017223	GAACG	2	10	61609	61618	40 %	0 %	40 %	20 %	384202613
1570	NC_017223	CAA	2	6	61782	61787	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384202613
1571	NC_017223	CTG	2	6	61889	61894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202613
1572	NC_017223	GGC	2	6	62246	62251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1573	NC_017223	CCG	2	6	62255	62260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1574	NC_017223	GTC	2	6	62294	62299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1575	NC_017223	G	7	7	62323	62329	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_017223	CTGCCT	2	12	62357	62368	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
1577	NC_017223	TCT	2	6	62450	62455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384202614
1578	NC_017223	TGC	2	6	62553	62558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202614
1579	NC_017223	TTA	2	6	62600	62605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384202614
1580	NC_017223	CTG	2	6	62646	62651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202614
1581	NC_017223	CAT	3	9	62676	62684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384202614
1582	NC_017223	CAT	2	6	62788	62793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384202614
1583	NC_017223	CAG	2	6	62833	62838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202614
1584	NC_017223	GCA	2	6	62877	62882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202614
1585	NC_017223	TGCC	2	8	62889	62896	0 %	25 %	25 %	50 %	384202614
1586	NC_017223	TTTTG	2	10	62972	62981	0 %	80 %	20 %	0 %	384202614
1587	NC_017223	GTG	2	6	63012	63017	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384202614
1588	NC_017223	ACC	2	6	63032	63037	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384202614
1589	NC_017223	CAT	2	6	63159	63164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384202614
1590	NC_017223	GCC	2	6	63185	63190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202614
1591	NC_017223	GCT	2	6	63234	63239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202614
1592	NC_017223	GCA	2	6	63344	63349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1593	NC_017223	C	7	7	63356	63362	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1594	NC_017223	ATTT	2	8	63444	63451	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_017223	C	7	7	63606	63612	0 %	0 %	0 %	100 %	384202615
1596	NC_017223	AC	3	6	63668	63673	50 %	0 %	0 %	50 %	384202615
1597	NC_017223	CAA	2	6	63753	63758	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384202615
1598	NC_017223	CGT	2	6	63812	63817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202615
1599	NC_017223	CAG	2	6	63932	63937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202615
1600	NC_017223	CA	3	6	63949	63954	50 %	0 %	0 %	50 %	384202615
1601	NC_017223	ATTA	2	8	64067	64074	50 %	50 %	0 %	0 %	384202616
1602	NC_017223	CTT	2	6	64097	64102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384202616
1603	NC_017223	GTC	2	6	64108	64113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202616
1604	NC_017223	GCG	2	6	64138	64143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202616
1605	NC_017223	GAA	2	6	64266	64271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384202616
1606	NC_017223	TTTTC	2	10	64313	64322	0 %	80 %	0 %	20 %	384202616
1607	NC_017223	TTC	2	6	64350	64355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384202616
1608	NC_017223	AG	3	6	64386	64391	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_017223	TTTA	2	8	64394	64401	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_017223	A	6	6	64433	64438	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_017223	CAAA	2	8	64490	64497	75 %	0 %	0 %	25 %	384202617
1612	NC_017223	ATC	2	6	64538	64543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384202617
1613	NC_017223	CCA	2	6	64563	64568	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384202617
1614	NC_017223	CGG	2	6	64570	64575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202617
1615	NC_017223	AT	3	6	64586	64591	50 %	50 %	0 %	0 %	384202617
1616	NC_017223	CAT	2	6	64620	64625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384202617
1617	NC_017223	A	6	6	64654	64659	100 %	0 %	0 %	0 %	384202617
1618	NC_017223	CCTGT	2	10	64681	64690	0 %	40 %	20 %	40 %	384202617
1619	NC_017223	AT	3	6	64701	64706	50 %	50 %	0 %	0 %	384202617
1620	NC_017223	CCG	2	6	64740	64745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202617
1621	NC_017223	ATC	2	6	64819	64824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384202617
1622	NC_017223	GGA	2	6	64834	64839	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384202617
1623	NC_017223	CCG	2	6	64883	64888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202617
1624	NC_017223	TCTT	2	8	64910	64917	0 %	75 %	0 %	25 %	384202617
1625	NC_017223	TTG	2	6	64973	64978	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384202617
1626	NC_017223	GCG	2	6	64992	64997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202617
1627	NC_017223	GAAT	2	8	65025	65032	50 %	25 %	25 %	0 %	384202617
1628	NC_017223	GC	4	8	65075	65082	0 %	0 %	50 %	50 %	384202617
1629	NC_017223	C	7	7	65086	65092	0 %	0 %	0 %	100 %	384202617
1630	NC_017223	A	6	6	65126	65131	100 %	0 %	0 %	0 %	384202617
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