MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bordetella pertussis CS chromosome

Total Repeats: 115083

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017223	AGG	2	6	40590	40595	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384202593
1002	NC_017223	GCCGCT	2	12	40687	40698	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384202594
1003	NC_017223	GC	4	8	40749	40756	0 %	0 %	50 %	50 %	384202594
1004	NC_017223	TTC	2	6	40856	40861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384202594
1005	NC_017223	CG	3	6	40875	40880	0 %	0 %	50 %	50 %	384202594
1006	NC_017223	AAGA	2	8	40898	40905	75 %	0 %	25 %	0 %	384202594
1007	NC_017223	TTC	2	6	40922	40927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384202594
1008	NC_017223	GCT	2	6	40942	40947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202594
1009	NC_017223	ATCG	2	8	40961	40968	25 %	25 %	25 %	25 %	384202594
1010	NC_017223	GCCAGG	2	12	41004	41015	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384202594
1011	NC_017223	GCT	2	6	41041	41046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202594
1012	NC_017223	CG	3	6	41061	41066	0 %	0 %	50 %	50 %	384202594
1013	NC_017223	GCC	2	6	41068	41073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202594
1014	NC_017223	GCG	2	6	41100	41105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202594
1015	NC_017223	GCT	2	6	41107	41112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202594
1016	NC_017223	GC	4	8	41127	41134	0 %	0 %	50 %	50 %	384202594
1017	NC_017223	ATC	2	6	41135	41140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384202594
1018	NC_017223	CTG	2	6	41343	41348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202595
1019	NC_017223	CGC	2	6	41359	41364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202595
1020	NC_017223	CGG	2	6	41365	41370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202595
1021	NC_017223	GCG	2	6	41382	41387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202595
1022	NC_017223	CGGC	2	8	41409	41416	0 %	0 %	50 %	50 %	384202595
1023	NC_017223	GCC	2	6	41417	41422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202595
1024	NC_017223	GCCG	2	8	41426	41433	0 %	0 %	50 %	50 %	384202595
1025	NC_017223	GCC	2	6	41462	41467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202595
1026	NC_017223	GC	4	8	41470	41477	0 %	0 %	50 %	50 %	384202595
1027	NC_017223	AAC	3	9	41497	41505	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384202595
1028	NC_017223	TGC	3	9	41518	41526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202595
1029	NC_017223	CGC	3	9	41532	41540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202595
1030	NC_017223	GTG	2	6	41553	41558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384202595
1031	NC_017223	CGA	2	6	41561	41566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202595
1032	NC_017223	GAT	2	6	41613	41618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384202595
1033	NC_017223	GC	3	6	41634	41639	0 %	0 %	50 %	50 %	384202595
1034	NC_017223	AAC	2	6	41680	41685	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384202595
1035	NC_017223	CGG	2	6	41714	41719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202595
1036	NC_017223	CGC	2	6	41769	41774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202595
1037	NC_017223	TGGC	2	8	41826	41833	0 %	25 %	50 %	25 %	384202595
1038	NC_017223	GC	3	6	41856	41861	0 %	0 %	50 %	50 %	384202595
1039	NC_017223	CGC	2	6	41870	41875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202595
1040	NC_017223	GC	3	6	41894	41899	0 %	0 %	50 %	50 %	384202595
1041	NC_017223	GGC	2	6	41965	41970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202595
1042	NC_017223	GCC	2	6	41979	41984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202595
1043	NC_017223	CAT	2	6	42017	42022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384202595
1044	NC_017223	CAT	2	6	42056	42061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384202595
1045	NC_017223	GCG	2	6	42176	42181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202595
1046	NC_017223	GAG	2	6	42271	42276	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_017223	TCA	2	6	42278	42283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384202596
1048	NC_017223	TGC	2	6	42302	42307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202596
1049	NC_017223	GCC	3	9	42436	42444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202596
1050	NC_017223	GGC	2	6	42559	42564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202596
1051	NC_017223	GGCC	2	8	42579	42586	0 %	0 %	50 %	50 %	384202596
1052	NC_017223	CAC	2	6	42600	42605	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384202596
1053	NC_017223	TCG	2	6	42617	42622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202596
1054	NC_017223	CTG	2	6	42724	42729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202597
1055	NC_017223	GC	4	8	42771	42778	0 %	0 %	50 %	50 %	384202597
1056	NC_017223	CGA	2	6	42783	42788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202597
1057	NC_017223	GCCGC	2	10	42829	42838	0 %	0 %	40 %	60 %	384202597
1058	NC_017223	GCCG	2	8	42903	42910	0 %	0 %	50 %	50 %	384202597
1059	NC_017223	CCG	2	6	43052	43057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202597
1060	NC_017223	GTG	2	6	43099	43104	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384202597
1061	NC_017223	ACC	2	6	43118	43123	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384202597
1062	NC_017223	CGGC	2	8	43128	43135	0 %	0 %	50 %	50 %	384202597
1063	NC_017223	CCGC	2	8	43350	43357	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1064	NC_017223	ATC	2	6	43383	43388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1065	NC_017223	CGCC	2	8	43400	43407	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1066	NC_017223	CCG	2	6	43409	43414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1067	NC_017223	CGG	2	6	43418	43423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1068	NC_017223	GCC	2	6	43435	43440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1069	NC_017223	GC	3	6	43454	43459	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1070	NC_017223	CGC	3	9	43457	43465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1071	NC_017223	CGC	2	6	43498	43503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1072	NC_017223	CAG	2	6	43512	43517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1073	NC_017223	CCG	2	6	43526	43531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1074	NC_017223	GC	3	6	43546	43551	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1075	NC_017223	GGC	2	6	43556	43561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1076	NC_017223	C	7	7	43633	43639	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1077	NC_017223	CCGG	2	8	43656	43663	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1078	NC_017223	TG	3	6	43742	43747	0 %	50 %	50 %	0 %	384202598
1079	NC_017223	GC	3	6	43931	43936	0 %	0 %	50 %	50 %	384202598
1080	NC_017223	CAGC	2	8	43959	43966	25 %	0 %	25 %	50 %	384202598
1081	NC_017223	GCCG	2	8	44020	44027	0 %	0 %	50 %	50 %	384202598
1082	NC_017223	GGT	2	6	44032	44037	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384202598
1083	NC_017223	CTG	2	6	44066	44071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202598
1084	NC_017223	AAG	2	6	44084	44089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384202598
1085	NC_017223	CTTCGT	2	12	44164	44175	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	384202598
1086	NC_017223	C	7	7	44215	44221	0 %	0 %	0 %	100 %	384202598
1087	NC_017223	CTA	2	6	44269	44274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384202598
1088	NC_017223	CGC	2	6	44344	44349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202598
1089	NC_017223	CCA	2	6	44536	44541	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384202598
1090	NC_017223	GC	3	6	44551	44556	0 %	0 %	50 %	50 %	384202598
1091	NC_017223	GGC	2	6	44614	44619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202598
1092	NC_017223	CG	3	6	44626	44631	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1093	NC_017223	GGC	2	6	44685	44690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1094	NC_017223	GC	3	6	44689	44694	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1095	NC_017223	CGG	2	6	44743	44748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1096	NC_017223	GGCC	2	8	44763	44770	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1097	NC_017223	GCG	2	6	44772	44777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1098	NC_017223	ACCGC	2	10	44796	44805	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
1099	NC_017223	GC	3	6	44811	44816	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1100	NC_017223	GGGC	2	8	44839	44846	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1101	NC_017223	TCCAG	2	10	44862	44871	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1102	NC_017223	GTC	2	6	44899	44904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1103	NC_017223	GGCC	2	8	44916	44923	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1104	NC_017223	G	7	7	44924	44930	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_017223	GC	3	6	44962	44967	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1106	NC_017223	CG	4	8	44980	44987	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1107	NC_017223	GCCA	2	8	44988	44995	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1108	NC_017223	CGGC	2	8	45015	45022	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1109	NC_017223	GCTC	2	8	45025	45032	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1110	NC_017223	GCA	2	6	45040	45045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1111	NC_017223	CGGGC	2	10	45065	45074	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1112	NC_017223	GCG	2	6	45076	45081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1113	NC_017223	GCC	2	6	45096	45101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1114	NC_017223	CGG	2	6	45136	45141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1115	NC_017223	ACCCAT	2	12	45191	45202	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	384202599
1116	NC_017223	GTTTC	2	10	45215	45224	0 %	60 %	20 %	20 %	384202599
1117	NC_017223	GCT	3	9	45272	45280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202599
1118	NC_017223	GCC	2	6	45282	45287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202599
1119	NC_017223	CGTG	2	8	45335	45342	0 %	25 %	50 %	25 %	384202599
1120	NC_017223	CCGG	2	8	45352	45359	0 %	0 %	50 %	50 %	384202599
1121	NC_017223	CCTGGC	2	12	45380	45391	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384202599
1122	NC_017223	CG	3	6	45422	45427	0 %	0 %	50 %	50 %	384202599
1123	NC_017223	GCC	2	6	45467	45472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202599
1124	NC_017223	GGC	2	6	45479	45484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202599
1125	NC_017223	GC	3	6	45492	45497	0 %	0 %	50 %	50 %	384202599
1126	NC_017223	GC	4	8	45500	45507	0 %	0 %	50 %	50 %	384202599
1127	NC_017223	GC	3	6	45522	45527	0 %	0 %	50 %	50 %	384202599
1128	NC_017223	GCC	2	6	45554	45559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202599
1129	NC_017223	CCG	2	6	45603	45608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202599
1130	NC_017223	CGA	2	6	45617	45622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202599
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1132	NC_017223	CGAC	2	8	45646	45653	25 %	0 %	25 %	50 %	384202599
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1263	NC_017223	GC	5	10	49123	49132	0 %	0 %	50 %	50 %	384202602
1264	NC_017223	CTG	2	6	49156	49161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202602
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1266	NC_017223	CG	3	6	49202	49207	0 %	0 %	50 %	50 %	384202602
1267	NC_017223	GC	4	8	49215	49222	0 %	0 %	50 %	50 %	384202602
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1293	NC_017223	TG	3	6	50220	50225	0 %	50 %	50 %	0 %	384202604
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1500	NC_017223	CCGG	2	8	58449	58456	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

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