MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bordetella pertussis CS chromosome

Total Repeats: 115083

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_017223	GCG	2	6	449054	449059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12502	NC_017223	G	6	6	449073	449078	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
12503	NC_017223	CTG	2	6	449080	449085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12504	NC_017223	TCG	2	6	449103	449108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12505	NC_017223	ACG	3	9	449109	449117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12506	NC_017223	CGC	2	6	449150	449155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12507	NC_017223	CGT	2	6	449189	449194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12508	NC_017223	CAG	2	6	449222	449227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12509	NC_017223	ATC	2	6	449298	449303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12510	NC_017223	GC	3	6	449335	449340	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12511	NC_017223	GCT	2	6	449381	449386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12512	NC_017223	TCG	2	6	449418	449423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12513	NC_017223	CG	3	6	449422	449427	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12514	NC_017223	GAA	2	6	449437	449442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12515	NC_017223	TCT	2	6	449446	449451	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12516	NC_017223	GCC	2	6	449458	449463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12517	NC_017223	TGC	2	6	449491	449496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12518	NC_017223	GCC	2	6	449549	449554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12519	NC_017223	CG	3	6	449579	449584	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12520	NC_017223	GCCG	2	8	449609	449616	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12521	NC_017223	GC	3	6	449689	449694	0 %	0 %	50 %	50 %	384202949
12522	NC_017223	TGG	2	6	449704	449709	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384202949
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12525	NC_017223	GTA	2	6	449970	449975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384202949
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12531	NC_017223	CGGC	2	8	450218	450225	0 %	0 %	50 %	50 %	384202949
12532	NC_017223	GCTG	2	8	450279	450286	0 %	25 %	50 %	25 %	384202949
12533	NC_017223	GC	3	6	450309	450314	0 %	0 %	50 %	50 %	384202949
12534	NC_017223	GCG	2	6	450330	450335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202949
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12537	NC_017223	G	6	6	450606	450611	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
12538	NC_017223	GCG	2	6	450690	450695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202950
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12550	NC_017223	GGCT	2	8	451140	451147	0 %	25 %	50 %	25 %	384202950
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12553	NC_017223	CG	3	6	451313	451318	0 %	0 %	50 %	50 %	384202950
12554	NC_017223	GTC	2	6	451355	451360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202950
12555	NC_017223	CCGC	2	8	451363	451370	0 %	0 %	25 %	75 %	384202950
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12560	NC_017223	CGA	2	6	451555	451560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202950
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12562	NC_017223	CGC	3	9	451638	451646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12563	NC_017223	CTG	2	6	451692	451697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12565	NC_017223	GGC	2	6	451733	451738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12566	NC_017223	GC	3	6	451750	451755	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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12574	NC_017223	TCG	2	6	451930	451935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202951
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12576	NC_017223	AAGGA	2	10	452015	452024	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
12577	NC_017223	ATTG	2	8	452151	452158	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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12581	NC_017223	CGC	2	6	452374	452379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12582	NC_017223	CG	3	6	452392	452397	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12583	NC_017223	CATC	2	8	452416	452423	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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12598	NC_017223	GC	3	6	453120	453125	0 %	0 %	50 %	50 %	384202953
12599	NC_017223	ATC	2	6	453135	453140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384202953
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12601	NC_017223	TCG	2	6	453246	453251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202953
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12604	NC_017223	GTG	2	6	453450	453455	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384202953
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12608	NC_017223	GGC	2	6	453678	453683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12609	NC_017223	GCG	2	6	453758	453763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202954
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12615	NC_017223	CTGGT	2	10	453970	453979	0 %	40 %	40 %	20 %	384202954
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12622	NC_017223	GTC	2	6	454122	454127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202954
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12988	NC_017223	CGGC	2	8	468628	468635	0 %	0 %	50 %	50 %	384202964
12989	NC_017223	CG	3	6	468642	468647	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12990	NC_017223	GCG	3	9	468645	468653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12991	NC_017223	GCG	2	6	468872	468877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202965
12992	NC_017223	CCA	2	6	468911	468916	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384202965
12993	NC_017223	CCA	2	6	468926	468931	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384202965
12994	NC_017223	ACGC	2	8	469101	469108	25 %	0 %	25 %	50 %	384202965
12995	NC_017223	GCA	2	6	469181	469186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202965
12996	NC_017223	CCCA	2	8	469204	469211	25 %	0 %	0 %	75 %	384202965
12997	NC_017223	CGCAG	2	10	469238	469247	20 %	0 %	40 %	40 %	384202965
12998	NC_017223	TCG	2	6	469288	469293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202965
12999	NC_017223	GGC	2	6	469371	469376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202965
13000	NC_017223	GTA	2	6	469404	469409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384202965

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