MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bordetella pertussis CS chromosome

Total Repeats: 115083

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12002	NC_017223	CGCCAG	2	12	431788	431799	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
12003	NC_017223	GCC	2	6	431817	431822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12004	NC_017223	GCG	2	6	431847	431852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12005	NC_017223	CAGGGT	2	12	431866	431877	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
12006	NC_017223	CCA	2	6	431883	431888	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12007	NC_017223	CG	3	6	431904	431909	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12008	NC_017223	CGC	2	6	431920	431925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12009	NC_017223	CAC	2	6	431974	431979	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12010	NC_017223	CGT	2	6	431985	431990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12011	NC_017223	ACC	2	6	431993	431998	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12012	NC_017223	CAGGGT	2	12	432025	432036	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
12013	NC_017223	CCA	2	6	432078	432083	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12014	NC_017223	GAT	2	6	432109	432114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12015	NC_017223	GC	3	6	432119	432124	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12016	NC_017223	GAA	3	9	432136	432144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12017	NC_017223	CAC	2	6	432154	432159	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12018	NC_017223	GAT	2	6	432163	432168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12019	NC_017223	TCGA	2	8	432197	432204	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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12023	NC_017223	C	7	7	432507	432513	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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12249	NC_017223	GCACCC	2	12	441033	441044	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	384202942
12250	NC_017223	CAC	2	6	441094	441099	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384202942
12251	NC_017223	GAG	2	6	441101	441106	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384202942
12252	NC_017223	TGGC	2	8	441107	441114	0 %	25 %	50 %	25 %	384202942
12253	NC_017223	GCC	2	6	441125	441130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202942
12254	NC_017223	GCT	2	6	441166	441171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202942
12255	NC_017223	TTC	2	6	441200	441205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384202942
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12257	NC_017223	ATG	2	6	441242	441247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384202942
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12261	NC_017223	GCGCC	2	10	441296	441305	0 %	0 %	40 %	60 %	384202942
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12286	NC_017223	GC	3	6	442219	442224	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12287	NC_017223	GCC	2	6	442235	442240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12288	NC_017223	GAC	2	6	442271	442276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12354	NC_017223	CG	3	6	444293	444298	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12355	NC_017223	GC	3	6	444331	444336	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12356	NC_017223	GTGCC	2	10	444344	444353	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
12357	NC_017223	ATC	2	6	444384	444389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384202946
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12364	NC_017223	CG	3	6	444531	444536	0 %	0 %	50 %	50 %	384202946
12365	NC_017223	GCTG	2	8	444550	444557	0 %	25 %	50 %	25 %	384202946
12366	NC_017223	CGG	2	6	444581	444586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202946
12367	NC_017223	GCA	2	6	444595	444600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202946
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12492	NC_017223	GGC	2	6	448682	448687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12493	NC_017223	GTG	2	6	448733	448738	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12494	NC_017223	GGCA	2	8	448859	448866	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
12495	NC_017223	CGT	2	6	448878	448883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12496	NC_017223	GCC	2	6	448916	448921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12497	NC_017223	CA	3	6	448922	448927	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12498	NC_017223	CGT	2	6	448969	448974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12499	NC_017223	AGC	2	6	448988	448993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12500	NC_017223	GC	3	6	448992	448997	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

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