MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bordetella pertussis CS chromosome

Total Repeats: 115083

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017223	GGC	2	6	21026	21031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202579
502	NC_017223	GGA	2	6	21086	21091	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384202579
503	NC_017223	CCTG	2	8	21093	21100	0 %	25 %	25 %	50 %	384202579
504	NC_017223	CG	3	6	21103	21108	0 %	0 %	50 %	50 %	384202579
505	NC_017223	GCC	3	9	21163	21171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202579
506	NC_017223	GCG	2	6	21177	21182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202579
507	NC_017223	ACG	2	6	21199	21204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202579
508	NC_017223	GC	3	6	21257	21262	0 %	0 %	50 %	50 %	384202579
509	NC_017223	GAGCCG	2	12	21330	21341	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384202579
510	NC_017223	CCG	2	6	21343	21348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202579
511	NC_017223	CCG	2	6	21375	21380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202579
512	NC_017223	CGA	2	6	21386	21391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202579
513	NC_017223	ACG	2	6	21397	21402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202579
514	NC_017223	CGG	2	6	21424	21429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202579
515	NC_017223	GCA	2	6	21433	21438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202579
516	NC_017223	CTG	2	6	21453	21458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202579
517	NC_017223	TGG	2	6	21489	21494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384202579
518	NC_017223	GCG	2	6	21517	21522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202579
519	NC_017223	GAC	2	6	21545	21550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202579
520	NC_017223	CCG	2	6	21594	21599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202579
521	NC_017223	GCC	2	6	21600	21605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202579
522	NC_017223	CGC	2	6	21616	21621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202579
523	NC_017223	GCG	2	6	21625	21630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202579
524	NC_017223	GCC	2	6	21662	21667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202579
525	NC_017223	CGC	2	6	21692	21697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202579
526	NC_017223	GGA	2	6	21719	21724	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384202579
527	NC_017223	GCC	2	6	21756	21761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202579
528	NC_017223	GCG	2	6	21842	21847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202579
529	NC_017223	GCCC	2	8	21856	21863	0 %	0 %	25 %	75 %	384202579
530	NC_017223	GTC	2	6	21900	21905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202579
531	NC_017223	GCC	2	6	21923	21928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202579
532	NC_017223	CACG	2	8	21974	21981	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
533	NC_017223	GCA	2	6	22037	22042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
534	NC_017223	CGG	2	6	22055	22060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_017223	TGA	2	6	22082	22087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
536	NC_017223	CGGCC	2	10	22091	22100	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
537	NC_017223	GCC	2	6	22149	22154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
538	NC_017223	TTCG	2	8	22158	22165	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
539	NC_017223	CGG	2	6	22169	22174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
540	NC_017223	CG	3	6	22181	22186	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
541	NC_017223	CGT	2	6	22235	22240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
542	NC_017223	CACG	2	8	22271	22278	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
543	NC_017223	CGGA	2	8	22301	22308	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
544	NC_017223	CAG	2	6	22329	22334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_017223	CTG	2	6	22347	22352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_017223	GTC	2	6	22362	22367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_017223	TCG	2	6	22396	22401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_017223	CG	5	10	22418	22427	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
549	NC_017223	TCG	2	6	22442	22447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_017223	GCA	2	6	22458	22463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
551	NC_017223	CG	3	6	22507	22512	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
552	NC_017223	TCG	2	6	22529	22534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_017223	CTG	2	6	22588	22593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
554	NC_017223	CCA	2	6	22623	22628	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
555	NC_017223	GCG	2	6	22647	22652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
556	NC_017223	CG	3	6	22651	22656	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
557	NC_017223	TCG	2	6	22760	22765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
558	NC_017223	GC	3	6	22776	22781	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
559	NC_017223	GCG	2	6	22857	22862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
560	NC_017223	TCG	2	6	22901	22906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_017223	GC	3	6	22913	22918	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
562	NC_017223	CGG	2	6	22929	22934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_017223	GGCGC	2	10	22947	22956	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
564	NC_017223	CGC	2	6	22987	22992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
565	NC_017223	GCCG	2	8	23010	23017	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
566	NC_017223	CG	3	6	23016	23021	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
567	NC_017223	GCGTC	2	10	23034	23043	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
568	NC_017223	CG	3	6	23091	23096	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
569	NC_017223	CAG	2	6	23146	23151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
570	NC_017223	CGG	2	6	23179	23184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
571	NC_017223	GCA	2	6	23226	23231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
572	NC_017223	CCAGCA	2	12	23274	23285	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
573	NC_017223	CGG	2	6	23296	23301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
574	NC_017223	GCC	2	6	23381	23386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
575	NC_017223	CAG	3	9	23416	23424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
576	NC_017223	GCAGC	2	10	23430	23439	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
577	NC_017223	GC	3	6	23488	23493	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
578	NC_017223	GCA	2	6	23499	23504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
579	NC_017223	GAT	2	6	23512	23517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
580	NC_017223	CGCC	2	8	23523	23530	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
581	NC_017223	CCA	2	6	23595	23600	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
582	NC_017223	GCA	2	6	23643	23648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
583	NC_017223	G	7	7	23680	23686	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
584	NC_017223	GGCC	2	8	23709	23716	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
585	NC_017223	CGC	2	6	23757	23762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
586	NC_017223	TCA	2	6	23769	23774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
587	NC_017223	GCA	2	6	23835	23840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
588	NC_017223	TGA	2	6	23865	23870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
589	NC_017223	GCG	3	9	23879	23887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
590	NC_017223	GCG	2	6	23907	23912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
591	NC_017223	CG	4	8	23926	23933	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
592	NC_017223	CAC	2	6	23947	23952	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
593	NC_017223	GCA	2	6	23955	23960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
594	NC_017223	GCG	2	6	23974	23979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
595	NC_017223	GAT	2	6	24037	24042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
596	NC_017223	CAG	2	6	24079	24084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
597	NC_017223	GTC	3	9	24136	24144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
598	NC_017223	GCTG	2	8	24169	24176	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
599	NC_017223	GCCG	2	8	24177	24184	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
600	NC_017223	GCC	2	6	24232	24237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
601	NC_017223	CAG	2	6	24247	24252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
602	NC_017223	ATG	2	6	24284	24289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
603	NC_017223	GC	3	6	24295	24300	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
604	NC_017223	GCCA	2	8	24302	24309	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
605	NC_017223	CGGG	2	8	24314	24321	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
606	NC_017223	GCG	4	12	24337	24348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
607	NC_017223	AGC	2	6	24366	24371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202580
608	NC_017223	GCCGGT	2	12	24380	24391	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384202580
609	NC_017223	GTA	2	6	24497	24502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384202580
610	NC_017223	GC	3	6	24517	24522	0 %	0 %	50 %	50 %	384202580
611	NC_017223	CCA	2	6	24559	24564	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384202580
612	NC_017223	CG	3	6	24583	24588	0 %	0 %	50 %	50 %	384202580
613	NC_017223	TA	3	6	24599	24604	50 %	50 %	0 %	0 %	384202580
614	NC_017223	GCC	2	6	24644	24649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202580
615	NC_017223	GGC	2	6	24653	24658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202580
616	NC_017223	GC	4	8	24657	24664	0 %	0 %	50 %	50 %	384202580
617	NC_017223	G	6	6	24679	24684	0 %	0 %	100 %	0 %	384202580
618	NC_017223	GCA	2	6	24688	24693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202580
619	NC_017223	GCG	2	6	24774	24779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202580
620	NC_017223	GCT	2	6	24824	24829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202580
621	NC_017223	GCC	2	6	24923	24928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202580
622	NC_017223	CG	3	6	24937	24942	0 %	0 %	50 %	50 %	384202580
623	NC_017223	GGC	2	6	25016	25021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202580
624	NC_017223	TGC	2	6	25105	25110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202580
625	NC_017223	CGA	2	6	25114	25119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202580
626	NC_017223	CGG	2	6	25150	25155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202580
627	NC_017223	ACC	2	6	25176	25181	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384202580
628	NC_017223	GCC	2	6	25191	25196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202580
629	NC_017223	GTC	2	6	25256	25261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202580
630	NC_017223	TGCT	2	8	25315	25322	0 %	50 %	25 %	25 %	384202580
631	NC_017223	TC	3	6	25366	25371	0 %	50 %	0 %	50 %	384202580
632	NC_017223	GGGCT	2	10	25385	25394	0 %	20 %	60 %	20 %	384202580
633	NC_017223	CA	3	6	25420	25425	50 %	0 %	0 %	50 %	384202580
634	NC_017223	TC	3	6	25465	25470	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
635	NC_017223	GTC	2	6	25480	25485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
636	NC_017223	CGT	2	6	25491	25496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
637	NC_017223	CTGCGG	2	12	25501	25512	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
638	NC_017223	GCAACT	2	12	25581	25592	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
639	NC_017223	CG	3	6	25677	25682	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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644	NC_017223	CG	3	6	25865	25870	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
645	NC_017223	CGG	2	6	25880	25885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
646	NC_017223	GTC	2	6	25908	25913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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650	NC_017223	CTG	2	6	26148	26153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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653	NC_017223	CG	3	6	26280	26285	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
654	NC_017223	TCG	2	6	26295	26300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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