MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bordetella pertussis CS chromosome

Total Repeats: 115083

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_017223	CCGC	2	8	226556	226563	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6002	NC_017223	GC	3	6	226592	226597	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6003	NC_017223	AAAT	2	8	226660	226667	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6004	NC_017223	CGC	2	6	226764	226769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6005	NC_017223	CGC	2	6	226786	226791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6006	NC_017223	GTC	2	6	226842	226847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202748
6007	NC_017223	GTG	2	6	226905	226910	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384202748
6008	NC_017223	CG	3	6	226939	226944	0 %	0 %	50 %	50 %	384202748
6009	NC_017223	CCA	2	6	227146	227151	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384202748
6010	NC_017223	CGC	2	6	227196	227201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202748
6011	NC_017223	TCG	2	6	227209	227214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202748
6012	NC_017223	CTT	2	6	227222	227227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384202748
6013	NC_017223	GCCG	2	8	227231	227238	0 %	0 %	50 %	50 %	384202748
6014	NC_017223	TGG	2	6	227251	227256	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384202748
6015	NC_017223	GGT	2	6	227258	227263	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384202748
6016	NC_017223	ACG	2	6	227269	227274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202748
6017	NC_017223	TGC	2	6	227311	227316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202748
6018	NC_017223	GC	3	6	227315	227320	0 %	0 %	50 %	50 %	384202748
6019	NC_017223	CGG	2	6	227321	227326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202748
6020	NC_017223	GC	3	6	227394	227399	0 %	0 %	50 %	50 %	384202748
6021	NC_017223	CTG	2	6	227412	227417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202748
6022	NC_017223	CGA	2	6	227447	227452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202748
6023	NC_017223	GTC	2	6	227454	227459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202748
6024	NC_017223	AGC	2	6	227503	227508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202748
6025	NC_017223	CAC	2	6	227576	227581	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384202748
6026	NC_017223	GCAG	2	8	227609	227616	25 %	0 %	50 %	25 %	384202748
6027	NC_017223	GCC	2	6	227657	227662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202748
6028	NC_017223	TGC	2	6	227680	227685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202748
6029	NC_017223	CGC	2	6	227696	227701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202748
6030	NC_017223	GCC	2	6	227715	227720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202748
6031	NC_017223	C	6	6	227757	227762	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6032	NC_017223	GCC	2	6	227769	227774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6033	NC_017223	C	6	6	227807	227812	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6034	NC_017223	ACGCAA	2	12	227818	227829	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
6035	NC_017223	CTG	2	6	228024	228029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202749
6036	NC_017223	CAC	2	6	228035	228040	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384202749
6037	NC_017223	CGC	2	6	228085	228090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202749
6038	NC_017223	GACC	2	8	228092	228099	25 %	0 %	25 %	50 %	384202749
6039	NC_017223	CAT	2	6	228146	228151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384202749
6040	NC_017223	CGG	2	6	228167	228172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202749
6041	NC_017223	CGG	2	6	228212	228217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202749
6042	NC_017223	ATC	2	6	228270	228275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384202749
6043	NC_017223	GCC	3	9	228276	228284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202749
6044	NC_017223	GGCCTG	2	12	228306	228317	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384202749
6045	NC_017223	CAC	2	6	228341	228346	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384202749
6046	NC_017223	ATC	2	6	228435	228440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384202749
6047	NC_017223	GCT	2	6	228452	228457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202749
6048	NC_017223	GTC	2	6	228492	228497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202749
6049	NC_017223	AGC	2	6	228522	228527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202749
6050	NC_017223	GC	3	6	228526	228531	0 %	0 %	50 %	50 %	384202749
6051	NC_017223	CCG	2	6	228541	228546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202749
6052	NC_017223	CCG	2	6	228556	228561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202749
6053	NC_017223	GCC	2	6	228577	228582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202749
6054	NC_017223	AAC	2	6	228585	228590	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384202749
6055	NC_017223	CTG	2	6	228606	228611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202749
6056	NC_017223	CTG	2	6	228618	228623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202749
6057	NC_017223	ACCTGA	2	12	228670	228681	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384202749
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6059	NC_017223	CAT	2	6	228707	228712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384202749
6060	NC_017223	CTG	2	6	228714	228719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202749
6061	NC_017223	CAT	2	6	228776	228781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384202749
6062	NC_017223	CAT	2	6	228806	228811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384202749
6063	NC_017223	CAT	2	6	228815	228820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384202749
6064	NC_017223	CAT	2	6	228824	228829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384202749
6065	NC_017223	TGG	2	6	228844	228849	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384202749
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6068	NC_017223	TCGCC	2	10	228877	228886	0 %	20 %	20 %	60 %	384202749
6069	NC_017223	TCGT	2	8	228918	228925	0 %	50 %	25 %	25 %	384202749
6070	NC_017223	CTT	2	6	228932	228937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384202749
6071	NC_017223	CGGC	2	8	228946	228953	0 %	0 %	50 %	50 %	384202749
6072	NC_017223	CGC	2	6	228989	228994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202749
6073	NC_017223	GC	3	6	229009	229014	0 %	0 %	50 %	50 %	384202749
6074	NC_017223	ACC	2	6	229023	229028	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384202749
6075	NC_017223	GCCC	2	8	229085	229092	0 %	0 %	25 %	75 %	384202749
6076	NC_017223	TCA	2	6	229138	229143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384202749
6077	NC_017223	CGC	3	9	229209	229217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6078	NC_017223	CCTT	2	8	229219	229226	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6079	NC_017223	GTC	2	6	229327	229332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202750
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6081	NC_017223	CGT	2	6	229376	229381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202750
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6087	NC_017223	CG	4	8	229625	229632	0 %	0 %	50 %	50 %	384202750
6088	NC_017223	GGT	2	6	229653	229658	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384202750
6089	NC_017223	GC	3	6	229796	229801	0 %	0 %	50 %	50 %	384202750
6090	NC_017223	CGCA	2	8	229804	229811	25 %	0 %	25 %	50 %	384202750
6091	NC_017223	CAT	2	6	229815	229820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384202750
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6093	NC_017223	TTC	2	6	229879	229884	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384202750
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6102	NC_017223	CGCC	2	8	230143	230150	0 %	0 %	25 %	75 %	384202751
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6106	NC_017223	CGCC	2	8	230231	230238	0 %	0 %	25 %	75 %	384202751
6107	NC_017223	CAG	2	6	230307	230312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202751
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6109	NC_017223	CG	3	6	230483	230488	0 %	0 %	50 %	50 %	384202751
6110	NC_017223	AGGGC	2	10	230513	230522	20 %	0 %	60 %	20 %	384202751
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6113	NC_017223	CAG	2	6	230634	230639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202751
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6116	NC_017223	GGC	3	9	230673	230681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202751
6117	NC_017223	CG	3	6	230741	230746	0 %	0 %	50 %	50 %	384202751
6118	NC_017223	CG	3	6	230839	230844	0 %	0 %	50 %	50 %	384202751
6119	NC_017223	GCCG	3	12	230871	230882	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6120	NC_017223	CGC	2	6	230883	230888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6121	NC_017223	ACC	2	6	230913	230918	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6122	NC_017223	TTC	2	6	230930	230935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6123	NC_017223	AGA	2	6	230936	230941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6124	NC_017223	GTT	2	6	230945	230950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6125	NC_017223	CGA	2	6	230986	230991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6141	NC_017223	CGTGGC	2	12	231554	231565	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384202752
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6240	NC_017223	CG	3	6	234662	234667	0 %	0 %	50 %	50 %	384202757
6241	NC_017223	TGC	2	6	234671	234676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202757
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6495	NC_017223	CG	3	6	243929	243934	0 %	0 %	50 %	50 %	384202767
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6499	NC_017223	GCC	2	6	244026	244031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202767
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