MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bordetella pertussis CS chromosome

Total Repeats: 115083

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4502	NC_017223	CTG	2	6	170915	170920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202705
4503	NC_017223	TCG	2	6	170937	170942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202705
4504	NC_017223	TGG	2	6	171006	171011	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384202705
4505	NC_017223	GCT	2	6	171028	171033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202705
4506	NC_017223	GCC	2	6	171035	171040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202705
4507	NC_017223	TGC	2	6	171045	171050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202705
4508	NC_017223	CAC	2	6	171068	171073	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384202705
4509	NC_017223	GC	3	6	171168	171173	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4510	NC_017223	AAG	2	6	171216	171221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384202706
4511	NC_017223	CG	3	6	171223	171228	0 %	0 %	50 %	50 %	384202706
4512	NC_017223	CAT	2	6	171244	171249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384202706
4513	NC_017223	ACG	2	6	171272	171277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202706
4514	NC_017223	CTG	3	9	171290	171298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202706
4515	NC_017223	GC	3	6	171335	171340	0 %	0 %	50 %	50 %	384202706
4516	NC_017223	CGT	2	6	171357	171362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202706
4517	NC_017223	TGGA	2	8	171368	171375	25 %	25 %	50 %	0 %	384202706
4518	NC_017223	AGC	2	6	171384	171389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202706
4519	NC_017223	TCG	2	6	171407	171412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202706
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4523	NC_017223	CGC	2	6	171514	171519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202706
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4527	NC_017223	CAT	2	6	171601	171606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384202706
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4536	NC_017223	GCAA	2	8	171936	171943	50 %	0 %	25 %	25 %	384202706
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4541	NC_017223	CAA	2	6	172216	172221	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384202706
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4551	NC_017223	TGC	2	6	172500	172505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202706
4552	NC_017223	GAT	2	6	172579	172584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384202706
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4556	NC_017223	ATG	2	6	172677	172682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384202706
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4588	NC_017223	CCGG	2	8	174275	174282	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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4602	NC_017223	TGCC	2	8	175234	175241	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4603	NC_017223	GC	4	8	175242	175249	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4604	NC_017223	TCG	2	6	175255	175260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4605	NC_017223	CGG	2	6	175268	175273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4624	NC_017223	GC	3	6	175829	175834	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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4994	NC_017223	GGCCG	2	10	188908	188917	0 %	0 %	60 %	40 %	384202719
4995	NC_017223	GGC	2	6	188968	188973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202719
4996	NC_017223	ACG	2	6	189002	189007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202719
4997	NC_017223	GGCTGG	2	12	189022	189033	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	384202719
4998	NC_017223	CGGCG	2	10	189051	189060	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
4999	NC_017223	CGG	2	6	189075	189080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202720
5000	NC_017223	CGT	2	6	189087	189092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202720

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