MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bifidobacterium longum subsp. longum KACC 91563 plasmid BLNIAS_P1

Total Repeats: 92

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017220	CGC	2	6	25	30	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_017220	AGG	2	6	50	55	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017220	GCG	2	6	82	87	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017220	GAT	2	6	178	183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017220	ACGA	2	8	187	194	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_017220	CAC	2	6	234	239	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_017220	GTT	2	6	318	323	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017220	CAT	2	6	336	341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_017220	AAC	2	6	346	351	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_017220	CCAG	2	8	362	369	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11	NC_017220	GAAC	2	8	417	424	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_017220	ATC	2	6	491	496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_017220	TGG	2	6	559	564	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017220	GCA	2	6	612	617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017220	CGG	2	6	839	844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202548
16	NC_017220	GC	4	8	938	945	0 %	0 %	50 %	50 %	384202548
17	NC_017220	CAT	2	6	1013	1018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384202548
18	NC_017220	CCT	2	6	1107	1112	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384202549
19	NC_017220	GC	3	6	1133	1138	0 %	0 %	50 %	50 %	384202549
20	NC_017220	CTC	2	6	1186	1191	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384202549
21	NC_017220	GCC	2	6	1198	1203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202549
22	NC_017220	GCTC	2	8	1221	1228	0 %	25 %	25 %	50 %	384202549
23	NC_017220	TCC	2	6	1283	1288	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384202549
24	NC_017220	GCC	2	6	1289	1294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202549
25	NC_017220	GGCTT	2	10	1344	1353	0 %	40 %	40 %	20 %	384202549
26	NC_017220	GCC	2	6	1383	1388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202549
27	NC_017220	GTCGTG	2	12	1426	1437	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	384202549
28	NC_017220	TGG	2	6	1446	1451	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384202549
29	NC_017220	GCA	2	6	1569	1574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202549
30	NC_017220	CG	3	6	1611	1616	0 %	0 %	50 %	50 %	384202549
31	NC_017220	GGC	2	6	1618	1623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202549
32	NC_017220	GAT	2	6	1636	1641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384202549
33	NC_017220	GGC	2	6	1648	1653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202549
34	NC_017220	CTC	2	6	1660	1665	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384202549
35	NC_017220	CTC	2	6	1676	1681	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384202549
36	NC_017220	CAC	2	6	1682	1687	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384202549
37	NC_017220	GGC	2	6	1773	1778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202549
38	NC_017220	GC	3	6	1777	1782	0 %	0 %	50 %	50 %	384202549
39	NC_017220	GGC	2	6	1861	1866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202549
40	NC_017220	CAG	2	6	1921	1926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202549
41	NC_017220	TGC	2	6	1932	1937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202549
42	NC_017220	TGG	2	6	2019	2024	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384202549
43	NC_017220	CG	3	6	2087	2092	0 %	0 %	50 %	50 %	384202549
44	NC_017220	CTGC	2	8	2179	2186	0 %	25 %	25 %	50 %	384202549
45	NC_017220	TCT	2	6	2202	2207	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384202549
46	NC_017220	GCT	2	6	2274	2279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202549
47	NC_017220	GCC	2	6	2293	2298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202549
48	NC_017220	CGA	2	6	2325	2330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202549
49	NC_017220	TTG	2	6	2348	2353	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384202549
50	NC_017220	CCCT	2	8	2354	2361	0 %	25 %	0 %	75 %	384202549
51	NC_017220	CTC	2	6	2422	2427	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384202549
52	NC_017220	CG	3	6	2460	2465	0 %	0 %	50 %	50 %	384202549
53	NC_017220	CCA	2	6	2472	2477	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384202549
54	NC_017220	TCT	2	6	2481	2486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384202549
55	NC_017220	GGCC	2	8	2488	2495	0 %	0 %	50 %	50 %	384202549
56	NC_017220	CCGT	2	8	2499	2506	0 %	25 %	25 %	50 %	384202549
57	NC_017220	CGG	2	6	2541	2546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202549
58	NC_017220	CGGC	2	8	2559	2566	0 %	0 %	50 %	50 %	384202549
59	NC_017220	GC	3	6	2565	2570	0 %	0 %	50 %	50 %	384202549
60	NC_017220	GCA	2	6	2577	2582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202549
61	NC_017220	GCA	2	6	2595	2600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202549
62	NC_017220	CGC	2	6	2631	2636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202549
63	NC_017220	CGTGGC	2	12	2677	2688	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384202549
64	NC_017220	CG	3	6	2701	2706	0 %	0 %	50 %	50 %	384202549
65	NC_017220	TCGGCT	2	12	2742	2753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202549
66	NC_017220	GCGG	2	8	2769	2776	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
67	NC_017220	GCG	2	6	2788	2793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_017220	GCG	2	6	2821	2826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_017220	GC	3	6	2903	2908	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
70	NC_017220	GAT	2	6	2998	3003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017220	AGGC	2	8	3071	3078	25 %	0 %	50 %	25 %	384202550
72	NC_017220	GGCGC	2	10	3109	3118	0 %	0 %	60 %	40 %	384202550
73	NC_017220	GAACGC	2	12	3123	3134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202550
74	NC_017220	GCG	2	6	3200	3205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_017220	GCTCG	2	10	3246	3255	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
76	NC_017220	ACC	2	6	3318	3323	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384202551
77	NC_017220	GAC	2	6	3454	3459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202551
78	NC_017220	A	7	7	3553	3559	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017220	GAAC	2	8	3719	3726	50 %	0 %	25 %	25 %	384202552
80	NC_017220	GAC	2	6	3731	3736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202552
81	NC_017220	GAAC	2	8	3788	3795	50 %	0 %	25 %	25 %	384202552
82	NC_017220	GTT	2	6	3850	3855	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384202552
83	NC_017220	T	6	6	3854	3859	0 %	100 %	0 %	0 %	384202552
84	NC_017220	CTT	2	6	3860	3865	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384202552
85	NC_017220	C	6	6	3901	3906	0 %	0 %	0 %	100 %	384202552
86	NC_017220	CCTA	2	8	3945	3952	25 %	25 %	0 %	50 %	384202552
87	NC_017220	ACCT	2	8	3966	3973	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_017220	ACCT	2	8	3989	3996	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_017220	AC	3	6	4056	4061	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_017220	GAT	3	9	4143	4151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017220	GGA	2	6	4178	4183	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017220	CGC	2	6	4220	4225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.