MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bifidobacterium longum subsp. infantis ATCC 15697

Total Repeats: 62689

< Previous12...114115116117118119120121122123124125126Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
62501	NC_017219	ATA	2	6	2820349	2820354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384200566
62502	NC_017219	CGG	2	6	2820380	2820385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384200566
62503	NC_017219	GA	3	6	2820406	2820411	50 %	0 %	50 %	0 %	384200566
62504	NC_017219	TCC	2	6	2820524	2820529	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384200566
62505	NC_017219	CAT	2	6	2820623	2820628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384200566
62506	NC_017219	TCC	2	6	2820684	2820689	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384200566
62507	NC_017219	GCA	2	6	2820772	2820777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384200566
62508	NC_017219	CGA	2	6	2820784	2820789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384200566
62509	NC_017219	CAC	2	6	2820797	2820802	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384200566
62510	NC_017219	TTC	2	6	2820809	2820814	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384200566
62511	NC_017219	AAG	2	6	2820870	2820875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384200566
62512	NC_017219	CTG	2	6	2820883	2820888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384200566
62513	NC_017219	TCG	2	6	2820891	2820896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384200566
62514	NC_017219	AAG	2	6	2820900	2820905	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384200566
62515	NC_017219	GCT	2	6	2820942	2820947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384200566
62516	NC_017219	AAC	2	6	2820966	2820971	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384200566
62517	NC_017219	GGC	2	6	2821014	2821019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384200566
62518	NC_017219	TAC	2	6	2821035	2821040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384200566
62519	NC_017219	GGT	2	6	2821098	2821103	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384200566
62520	NC_017219	CG	3	6	2821116	2821121	0 %	0 %	50 %	50 %	384200566
62521	NC_017219	ACT	2	6	2821185	2821190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384200566
62522	NC_017219	GAAGT	2	10	2821191	2821200	40 %	20 %	40 %	0 %	384200566
62523	NC_017219	CTG	3	9	2821227	2821235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384200566
62524	NC_017219	TCT	2	6	2821291	2821296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384200566
62525	NC_017219	AAG	2	6	2821325	2821330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62526	NC_017219	GGC	2	6	2821332	2821337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
62527	NC_017219	GCC	2	6	2821361	2821366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
62528	NC_017219	TTC	2	6	2821369	2821374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62529	NC_017219	TCA	2	6	2821440	2821445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384200567
62530	NC_017219	GCC	2	6	2821475	2821480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384200567
62531	NC_017219	ATCT	2	8	2821481	2821488	25 %	50 %	0 %	25 %	384200567
62532	NC_017219	ATC	2	6	2821763	2821768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384200567
62533	NC_017219	GTC	2	6	2821777	2821782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384200567
62534	NC_017219	CTT	3	9	2821858	2821866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384200567
62535	NC_017219	ATT	2	6	2821921	2821926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384200567
62536	NC_017219	CGGTT	2	10	2821934	2821943	0 %	40 %	40 %	20 %	384200567
62537	NC_017219	TGG	2	6	2821995	2822000	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384200567
62538	NC_017219	AGCCAA	2	12	2822005	2822016	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	384200567
62539	NC_017219	CTG	2	6	2822030	2822035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384200567
62540	NC_017219	GTG	2	6	2822045	2822050	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384200567
62541	NC_017219	CCT	2	6	2822067	2822072	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384200567
62542	NC_017219	CA	3	6	2822077	2822082	50 %	0 %	0 %	50 %	384200567
62543	NC_017219	CAG	2	6	2822152	2822157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384200567
62544	NC_017219	CGTA	2	8	2822164	2822171	25 %	25 %	25 %	25 %	384200567
62545	NC_017219	GTG	2	6	2822174	2822179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384200567
62546	NC_017219	GAA	2	6	2822186	2822191	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384200567
62547	NC_017219	GAT	2	6	2822276	2822281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384200567
62548	NC_017219	GTG	2	6	2822291	2822296	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384200567
62549	NC_017219	TGC	2	6	2822335	2822340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384200567
62550	NC_017219	GCG	2	6	2822440	2822445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
62551	NC_017219	GGC	2	6	2822453	2822458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
62552	NC_017219	TCTG	2	8	2822466	2822473	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
62553	NC_017219	GCC	2	6	2822517	2822522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
62554	NC_017219	GTAC	2	8	2822531	2822538	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
62555	NC_017219	ATG	2	6	2822580	2822585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62556	NC_017219	TG	3	6	2822584	2822589	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
62557	NC_017219	TGT	2	6	2822683	2822688	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62558	NC_017219	AAT	2	6	2822706	2822711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62559	NC_017219	ACA	2	6	2822719	2822724	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62560	NC_017219	CAG	2	6	2822781	2822786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384200568
62561	NC_017219	TGC	2	6	2822849	2822854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384200568
62562	NC_017219	CTG	2	6	2822895	2822900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384200568
62563	NC_017219	AACC	2	8	2822909	2822916	50 %	0 %	0 %	50 %	384200568
62564	NC_017219	CTT	2	6	2822943	2822948	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384200568
62565	NC_017219	GCT	2	6	2822951	2822956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384200568
62566	NC_017219	CGA	2	6	2822978	2822983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384200568
62567	NC_017219	TGC	2	6	2822993	2822998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384200568
62568	NC_017219	AAT	2	6	2823018	2823023	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384200568
62569	NC_017219	TCC	2	6	2823046	2823051	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384200568
62570	NC_017219	CT	3	6	2823110	2823115	0 %	50 %	0 %	50 %	384200568
62571	NC_017219	CAG	2	6	2823138	2823143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384200568
62572	NC_017219	ATC	2	6	2823223	2823228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384200568
62573	NC_017219	GCC	2	6	2823241	2823246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384200568
62574	NC_017219	ATC	3	9	2823306	2823314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384200568
62575	NC_017219	TCG	2	6	2823448	2823453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384200568
62576	NC_017219	GGC	2	6	2823459	2823464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384200568
62577	NC_017219	GCA	2	6	2823472	2823477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384200568
62578	NC_017219	GCA	2	6	2823515	2823520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384200568
62579	NC_017219	TCG	2	6	2823565	2823570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384200568
62580	NC_017219	ACC	2	6	2823633	2823638	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384200568
62581	NC_017219	CTT	2	6	2823660	2823665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384200568
62582	NC_017219	GAC	2	6	2823763	2823768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384200568
62583	NC_017219	GCC	2	6	2823771	2823776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384200568
62584	NC_017219	CTG	2	6	2823777	2823782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384200568
62585	NC_017219	GCG	2	6	2823787	2823792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384200568
62586	NC_017219	ATG	2	6	2823847	2823852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384200568
62587	NC_017219	CGG	2	6	2823881	2823886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384200568
62588	NC_017219	GAT	2	6	2823907	2823912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384200568
62589	NC_017219	CTG	2	6	2823942	2823947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384200568
62590	NC_017219	CTT	2	6	2823957	2823962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384200568
62591	NC_017219	CAG	2	6	2823977	2823982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384200568
62592	NC_017219	GCC	2	6	2823985	2823990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384200568
62593	NC_017219	TCC	2	6	2824003	2824008	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384200568
62594	NC_017219	GCT	2	6	2824022	2824027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384200568
62595	NC_017219	TCC	2	6	2824039	2824044	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384200568
62596	NC_017219	TCC	2	6	2824111	2824116	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384200569
62597	NC_017219	TTG	2	6	2824139	2824144	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384200569
62598	NC_017219	GCT	2	6	2824167	2824172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384200569
62599	NC_017219	GTA	2	6	2824269	2824274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384200569
62600	NC_017219	TA	3	6	2824312	2824317	50 %	50 %	0 %	0 %	384200569
62601	NC_017219	TGG	2	6	2824363	2824368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384200569
62602	NC_017219	CAG	2	6	2824373	2824378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384200569
62603	NC_017219	ACCAA	2	10	2824401	2824410	60 %	0 %	0 %	40 %	384200569
62604	NC_017219	CA	3	6	2824486	2824491	50 %	0 %	0 %	50 %	384200569
62605	NC_017219	TGA	2	6	2824498	2824503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384200569
62606	NC_017219	GGGC	2	8	2824520	2824527	0 %	0 %	75 %	25 %	384200569
62607	NC_017219	GTAG	2	8	2824567	2824574	25 %	25 %	50 %	0 %	384200569
62608	NC_017219	CCT	2	6	2824585	2824590	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384200569
62609	NC_017219	TGA	2	6	2824696	2824701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384200569
62610	NC_017219	GC	3	6	2824822	2824827	0 %	0 %	50 %	50 %	384200569
62611	NC_017219	C	6	6	2824881	2824886	0 %	0 %	0 %	100 %	384200569
62612	NC_017219	ACG	2	6	2824907	2824912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384200569
62613	NC_017219	TCA	2	6	2824968	2824973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384200569
62614	NC_017219	TGA	2	6	2825055	2825060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384200569
62615	NC_017219	TGG	2	6	2825065	2825070	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384200569
62616	NC_017219	CTC	2	6	2825077	2825082	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
62617	NC_017219	ATG	2	6	2825124	2825129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62618	NC_017219	ATG	2	6	2825182	2825187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62619	NC_017219	TCA	2	6	2825241	2825246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62620	NC_017219	CAC	2	6	2825343	2825348	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384200570
62621	NC_017219	ACG	2	6	2825386	2825391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384200570
62622	NC_017219	GAC	3	9	2825396	2825404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384200570
62623	NC_017219	GCAACG	2	12	2825495	2825506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384200570
62624	NC_017219	CCAG	2	8	2825508	2825515	25 %	0 %	25 %	50 %	384200570
62625	NC_017219	AG	3	6	2825514	2825519	50 %	0 %	50 %	0 %	384200570
62626	NC_017219	ACA	2	6	2825551	2825556	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384200570
62627	NC_017219	CTG	2	6	2825586	2825591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384200570
62628	NC_017219	AAT	2	6	2825616	2825621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384200570
62629	NC_017219	ATTCG	2	10	2825666	2825675	20 %	40 %	20 %	20 %	384200570
62630	NC_017219	CCA	2	6	2825729	2825734	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384200570
62631	NC_017219	ACC	3	9	2825745	2825753	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384200570
62632	NC_017219	ACG	2	6	2826051	2826056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62633	NC_017219	GAC	2	6	2826091	2826096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62634	NC_017219	TCG	2	6	2826128	2826133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62635	NC_017219	TCG	2	6	2826155	2826160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384200571
62636	NC_017219	CTC	2	6	2826217	2826222	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384200571
62637	NC_017219	GCGA	2	8	2826228	2826235	25 %	0 %	50 %	25 %	384200571
62638	NC_017219	TCT	2	6	2826426	2826431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384200571
62639	NC_017219	TGC	2	6	2826455	2826460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384200571
62640	NC_017219	TCA	2	6	2826515	2826520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384200571
62641	NC_017219	ACGC	2	8	2826550	2826557	25 %	0 %	25 %	50 %	384200571
62642	NC_017219	GTC	2	6	2826792	2826797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384200572
62643	NC_017219	CTT	2	6	2826799	2826804	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384200572
62644	NC_017219	CCTTGG	2	12	2826867	2826878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384200572
62645	NC_017219	CTT	3	9	2826885	2826893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384200572
62646	NC_017219	AG	3	6	2826896	2826901	50 %	0 %	50 %	0 %	384200572
62647	NC_017219	GGCC	2	8	2826906	2826913	0 %	0 %	50 %	50 %	384200572
62648	NC_017219	GCG	2	6	2826919	2826924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384200572
62649	NC_017219	GAT	2	6	2826939	2826944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384200572
62650	NC_017219	CCG	2	6	2826960	2826965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384200572
62651	NC_017219	GTT	2	6	2827030	2827035	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384200572
62652	NC_017219	TGG	2	6	2827068	2827073	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384200572
62653	NC_017219	AGA	2	6	2827080	2827085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384200572
62654	NC_017219	TGTT	2	8	2827136	2827143	0 %	75 %	25 %	0 %	384200572
62655	NC_017219	GCG	2	6	2827151	2827156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384200572
62656	NC_017219	ACC	2	6	2827232	2827237	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384200572
62657	NC_017219	AGCC	2	8	2827437	2827444	25 %	0 %	25 %	50 %	384200572
62658	NC_017219	CCT	2	6	2827494	2827499	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384200572
62659	NC_017219	CAC	2	6	2827621	2827626	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384200572
62660	NC_017219	GAT	2	6	2827636	2827641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384200572
62661	NC_017219	GAA	2	6	2827690	2827695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384200572
62662	NC_017219	TA	3	6	2827752	2827757	50 %	50 %	0 %	0 %	384200572
62663	NC_017219	CT	3	6	2827812	2827817	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62664	NC_017219	A	6	6	2827880	2827885	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62665	NC_017219	TCG	2	6	2827906	2827911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62666	NC_017219	CGGC	2	8	2827929	2827936	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
62667	NC_017219	ATA	2	6	2828025	2828030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62668	NC_017219	CAA	2	6	2828035	2828040	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62669	NC_017219	GT	3	6	2828045	2828050	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
62670	NC_017219	ATC	2	6	2828089	2828094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62671	NC_017219	AAG	2	6	2828105	2828110	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62672	NC_017219	CTG	2	6	2828162	2828167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384200573
62673	NC_017219	ACGA	2	8	2828178	2828185	50 %	0 %	25 %	25 %	384200573
62674	NC_017219	GCA	2	6	2828193	2828198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384200573
62675	NC_017219	GC	3	6	2828208	2828213	0 %	0 %	50 %	50 %	384200573
62676	NC_017219	GTC	2	6	2828354	2828359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384200573
62677	NC_017219	ATC	2	6	2828360	2828365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384200573
62678	NC_017219	ATG	2	6	2828366	2828371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384200573
62679	NC_017219	GTC	2	6	2828372	2828377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384200573
62680	NC_017219	ACG	2	6	2828394	2828399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384200573
62681	NC_017219	TGCGCA	2	12	2828571	2828582	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384200574
62682	NC_017219	CGA	2	6	2828606	2828611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384200574
62683	NC_017219	GTT	2	6	2828614	2828619	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384200574
62684	NC_017219	ACGG	2	8	2828737	2828744	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
62685	NC_017219	CGG	2	6	2828797	2828802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
62686	NC_017219	ACCA	2	8	2828806	2828813	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
62687	NC_017219	TGTT	2	8	2828844	2828851	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
62688	NC_017219	ATT	2	6	2828864	2828869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62689	NC_017219	TGT	2	6	2828920	2828925	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

< Previous12...114115116117118119120121122123124125126Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.