MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Bifidobacterium animalis subsp. lactis V9 chromosome

Total Repeats: 1500

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017217	ACCAC	2	10	1767	1776	40 %	0 %	0 %	60 %	384194623
2	NC_017217	CCGGC	2	10	2784	2793	0 %	0 %	40 %	60 %	384194624
3	NC_017217	CCGTT	2	10	3097	3106	0 %	40 %	20 %	40 %	384194624
4	NC_017217	AACGC	2	10	3315	3324	40 %	0 %	20 %	40 %	384194624
5	NC_017217	CGATC	2	10	5830	5839	20 %	20 %	20 %	40 %	384194627
6	NC_017217	AAGGC	2	10	7644	7653	40 %	0 %	40 %	20 %	384194627
7	NC_017217	GCACG	2	10	14420	14429	20 %	0 %	40 %	40 %	384194632
8	NC_017217	GGTGG	2	10	15065	15074	0 %	20 %	80 %	0 %	384194632
9	NC_017217	GCGAG	2	10	15797	15806	20 %	0 %	60 %	20 %	384194633
10	NC_017217	CGTGC	2	10	15944	15953	0 %	20 %	40 %	40 %	384194633
11	NC_017217	GATTG	2	10	16718	16727	20 %	40 %	40 %	0 %	384194633
12	NC_017217	TTCGA	2	10	17127	17136	20 %	40 %	20 %	20 %	384194635
13	NC_017217	ACCGA	2	10	17784	17793	40 %	0 %	20 %	40 %	384194635
14	NC_017217	TCTGT	2	10	21384	21393	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
15	NC_017217	CGCAC	2	10	24588	24597	20 %	0 %	20 %	60 %	384194642
16	NC_017217	CGACG	2	10	25256	25265	20 %	0 %	40 %	40 %	384194642
17	NC_017217	CGCTG	2	10	25402	25411	0 %	20 %	40 %	40 %	384194642
18	NC_017217	GCCGT	2	10	26067	26076	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
19	NC_017217	GGGGA	2	10	27082	27091	20 %	0 %	80 %	0 %	384194643
20	NC_017217	AGAGA	2	10	28163	28172	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017217	CGGTT	2	10	28212	28221	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
22	NC_017217	GAAGA	2	10	31023	31032	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017217	TTCAC	2	10	31435	31444	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
24	NC_017217	GGGAA	2	10	32962	32971	40 %	0 %	60 %	0 %	384194652
25	NC_017217	TTTTG	2	10	33987	33996	0 %	80 %	20 %	0 %	384194653
26	NC_017217	TGAGT	2	10	34473	34482	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017217	GATGT	2	10	35032	35041	20 %	40 %	40 %	0 %	384194654
28	NC_017217	AAATC	2	10	36007	36016	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_017217	TATGC	2	10	38421	38430	20 %	40 %	20 %	20 %	384194656
30	NC_017217	AAAGC	2	10	39670	39679	60 %	0 %	20 %	20 %	384194656
31	NC_017217	CATCA	2	10	40475	40484	40 %	20 %	0 %	40 %	384194657
32	NC_017217	TGCTG	2	10	41065	41074	0 %	40 %	40 %	20 %	384194658
33	NC_017217	GAGAT	2	10	43617	43626	40 %	20 %	40 %	0 %	384194660
34	NC_017217	CAAGC	2	10	44321	44330	40 %	0 %	20 %	40 %	384194661
35	NC_017217	TTCGT	2	10	44833	44842	0 %	60 %	20 %	20 %	384194662
36	NC_017217	GATCG	2	10	45763	45772	20 %	20 %	40 %	20 %	384194665
37	NC_017217	GGAAG	2	10	45923	45932	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017217	CGCCA	2	10	46431	46440	20 %	0 %	20 %	60 %	384194666
39	NC_017217	CCGAC	2	10	47665	47674	20 %	0 %	20 %	60 %	384194668
40	NC_017217	CTCGG	2	10	48383	48392	0 %	20 %	40 %	40 %	384194669
41	NC_017217	GCCAT	2	10	49083	49092	20 %	20 %	20 %	40 %	384194669
42	NC_017217	GCCCG	2	10	49960	49969	0 %	0 %	40 %	60 %	384194669
43	NC_017217	CGGTC	2	10	52543	52552	0 %	20 %	40 %	40 %	384194671
44	NC_017217	GCACG	2	10	53344	53353	20 %	0 %	40 %	40 %	384194671
45	NC_017217	ATTCA	2	10	55364	55373	40 %	40 %	0 %	20 %	384194673
46	NC_017217	TCCGC	2	10	55585	55594	0 %	20 %	20 %	60 %	384194673
47	NC_017217	TGAAT	2	10	56420	56429	40 %	40 %	20 %	0 %	384194673
48	NC_017217	GGATC	2	10	57076	57085	20 %	20 %	40 %	20 %	384194673
49	NC_017217	GGGAA	2	10	64393	64402	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017217	ATCGC	2	10	66393	66402	20 %	20 %	20 %	40 %	384194684
51	NC_017217	TGGGG	2	10	67092	67101	0 %	20 %	80 %	0 %	384194685
52	NC_017217	GGCGC	2	10	69592	69601	0 %	0 %	60 %	40 %	384194686
53	NC_017217	GCTCG	2	10	72756	72765	0 %	20 %	40 %	40 %	384194688
54	NC_017217	GCTGA	2	10	74919	74928	20 %	20 %	40 %	20 %	384194690
55	NC_017217	CATCG	2	10	76719	76728	20 %	20 %	20 %	40 %	384194690
56	NC_017217	TTGTA	2	10	77130	77139	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017217	CGGTC	2	10	79327	79336	0 %	20 %	40 %	40 %	384194692
58	NC_017217	GCACG	2	10	80128	80137	20 %	0 %	40 %	40 %	384194692
59	NC_017217	CGGTG	2	10	80718	80727	0 %	20 %	60 %	20 %	384194693
60	NC_017217	TCATT	2	10	81634	81643	20 %	60 %	0 %	20 %	384194693
61	NC_017217	CCAAA	2	10	82117	82126	60 %	0 %	0 %	40 %	384194694
62	NC_017217	CCGGG	2	10	82610	82619	0 %	0 %	60 %	40 %	384194695
63	NC_017217	CGGCT	2	10	87776	87785	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
64	NC_017217	CGAAC	2	10	89401	89410	40 %	0 %	20 %	40 %	384194699
65	NC_017217	GAGAA	2	10	89865	89874	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017217	GCTCG	2	10	90882	90891	0 %	20 %	40 %	40 %	384194701
67	NC_017217	ATACA	2	10	91486	91495	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_017217	GGTGC	2	10	96163	96172	0 %	20 %	60 %	20 %	384194705
69	NC_017217	GTCTT	2	10	102629	102638	0 %	60 %	20 %	20 %	384194710
70	NC_017217	GCGCC	2	10	106948	106957	0 %	0 %	40 %	60 %	384194712
71	NC_017217	CGCCC	2	10	107436	107445	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
72	NC_017217	GCCGC	2	10	107904	107913	0 %	0 %	40 %	60 %	384194713
73	NC_017217	AGGAA	2	10	108699	108708	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017217	TGTTT	2	10	111453	111462	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017217	GCAAA	2	10	111881	111890	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
76	NC_017217	CGGCG	2	10	115051	115060	0 %	0 %	60 %	40 %	384194719
77	NC_017217	TGGCG	2	10	115075	115084	0 %	20 %	60 %	20 %	384194719
78	NC_017217	ACGGC	2	10	115167	115176	20 %	0 %	40 %	40 %	384194719
79	NC_017217	GACGA	2	10	115223	115232	40 %	0 %	40 %	20 %	384194719
80	NC_017217	CCGAG	2	10	115449	115458	20 %	0 %	40 %	40 %	384194719
81	NC_017217	CGATT	2	10	115684	115693	20 %	40 %	20 %	20 %	384194719
82	NC_017217	ACCTG	2	10	116905	116914	20 %	20 %	20 %	40 %	384194720
83	NC_017217	GCCCG	2	10	117612	117621	0 %	0 %	40 %	60 %	384194720
84	NC_017217	AGTCG	2	10	117960	117969	20 %	20 %	40 %	20 %	384194720
85	NC_017217	GTGCG	2	10	118988	118997	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
86	NC_017217	TGGTG	2	10	121855	121864	0 %	40 %	60 %	0 %	384194723
87	NC_017217	GTTCG	2	10	123971	123980	0 %	40 %	40 %	20 %	384194725
88	NC_017217	TCGAA	2	10	125602	125611	40 %	20 %	20 %	20 %	384194726
89	NC_017217	AGGTG	2	10	125712	125721	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017217	TGGCA	2	10	128088	128097	20 %	20 %	40 %	20 %	384194730
91	NC_017217	GCCGA	2	10	128127	128136	20 %	0 %	40 %	40 %	384194730
92	NC_017217	TCGCG	2	10	129027	129036	0 %	20 %	40 %	40 %	384194731
93	NC_017217	GCGCC	2	10	133395	133404	0 %	0 %	40 %	60 %	384194735
94	NC_017217	TGGGT	2	10	134515	134524	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017217	CGCAT	2	10	135235	135244	20 %	20 %	20 %	40 %	384194738
96	NC_017217	TGGAT	2	10	136779	136788	20 %	40 %	40 %	0 %	384194740
97	NC_017217	TGAGG	2	10	138045	138054	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017217	TGCTC	2	10	139189	139198	0 %	40 %	20 %	40 %	384194743
99	NC_017217	CGGCT	2	10	141048	141057	0 %	20 %	40 %	40 %	384194745
100	NC_017217	TCTCA	2	10	144025	144034	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
101	NC_017217	ATCTC	2	10	146938	146947	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
102	NC_017217	CTCGC	2	10	147203	147212	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
103	NC_017217	AACAG	2	10	147357	147366	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
104	NC_017217	CAAGA	2	10	147644	147653	60 %	0 %	20 %	20 %	384194750
105	NC_017217	GACAA	2	10	149868	149877	60 %	0 %	20 %	20 %	384194752
106	NC_017217	CCCGA	2	10	150045	150054	20 %	0 %	20 %	60 %	384194752
107	NC_017217	ATGAG	2	10	151762	151771	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017217	CGACG	2	10	152524	152533	20 %	0 %	40 %	40 %	384194754
109	NC_017217	GCACC	2	10	155958	155967	20 %	0 %	20 %	60 %	384194756
110	NC_017217	GCTCG	2	10	156863	156872	0 %	20 %	40 %	40 %	384194757
111	NC_017217	CGGCA	2	10	157523	157532	20 %	0 %	40 %	40 %	384194757
112	NC_017217	CGACC	2	10	158592	158601	20 %	0 %	20 %	60 %	384194758
113	NC_017217	GCTCG	2	10	158912	158921	0 %	20 %	40 %	40 %	384194759
114	NC_017217	TCCCG	2	10	160045	160054	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
115	NC_017217	CACCG	2	10	161606	161615	20 %	0 %	20 %	60 %	384194761
116	NC_017217	TGGCA	2	10	162248	162257	20 %	20 %	40 %	20 %	384194761
117	NC_017217	GCGAA	2	10	163882	163891	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
118	NC_017217	AGTGT	2	10	164379	164388	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017217	GCGCC	2	10	164849	164858	0 %	0 %	40 %	60 %	384194765
120	NC_017217	CCGCG	2	10	165533	165542	0 %	0 %	40 %	60 %	384194765
121	NC_017217	CGGCG	2	10	166540	166549	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
122	NC_017217	GTGCG	2	10	167677	167686	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
123	NC_017217	GGAGG	2	10	171907	171916	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017217	TGCCG	2	10	174261	174270	0 %	20 %	40 %	40 %	384194770
125	NC_017217	TGCCC	2	10	177031	177040	0 %	20 %	20 %	60 %	384194773
126	NC_017217	CTCAT	2	10	177634	177643	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
127	NC_017217	TGCGC	2	10	178043	178052	0 %	20 %	40 %	40 %	384194774
128	NC_017217	GCGTG	2	10	178656	178665	0 %	20 %	60 %	20 %	384194775
129	NC_017217	CCACG	2	10	179562	179571	20 %	0 %	20 %	60 %	384194775
130	NC_017217	TGAGG	2	10	180060	180069	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017217	GCACC	2	10	181804	181813	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
132	NC_017217	CTCGC	2	10	184343	184352	0 %	20 %	20 %	60 %	384194779
133	NC_017217	CGCCA	2	10	185951	185960	20 %	0 %	20 %	60 %	384194780
134	NC_017217	CGTGG	2	10	186642	186651	0 %	20 %	60 %	20 %	384194780
135	NC_017217	TCGCC	2	10	188683	188692	0 %	20 %	20 %	60 %	384194781
136	NC_017217	GTTCT	2	10	191420	191429	0 %	60 %	20 %	20 %	384194784
137	NC_017217	CAGCG	2	10	193031	193040	20 %	0 %	40 %	40 %	384194786
138	NC_017217	ATGGC	2	10	193252	193261	20 %	20 %	40 %	20 %	384194786
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400	NC_017217	CGACC	2	10	525239	525248	20 %	0 %	20 %	60 %	384195046
401	NC_017217	ATGGC	2	10	525727	525736	20 %	20 %	40 %	20 %	384195047
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403	NC_017217	ATGCG	2	10	528877	528886	20 %	20 %	40 %	20 %	384195049
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407	NC_017217	GACCC	2	10	536145	536154	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
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413	NC_017217	TCGTC	2	10	544621	544630	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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439	NC_017217	TCGAG	2	10	579653	579662	20 %	20 %	40 %	20 %	384195089
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444	NC_017217	GGGCA	2	10	590659	590668	20 %	0 %	60 %	20 %	384195097
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