MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Bifidobacterium animalis subsp. lactis CNCM I-2494 chromosome

Total Repeats: 4525

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017215	GGCT	2	8	265	272	0 %	25 %	50 %	25 %	384191412
2	NC_017215	GTTC	2	8	821	828	0 %	50 %	25 %	25 %	384191412
3	NC_017215	CGAG	2	8	1085	1092	25 %	0 %	50 %	25 %	384191412
4	NC_017215	ACGA	2	8	1099	1106	50 %	0 %	25 %	25 %	384191412
5	NC_017215	CATG	2	8	1809	1816	25 %	25 %	25 %	25 %	384191412
6	NC_017215	TTCG	2	8	2541	2548	0 %	50 %	25 %	25 %	384191413
7	NC_017215	ACGC	2	8	2582	2589	25 %	0 %	25 %	50 %	384191413
8	NC_017215	CGGC	2	8	3395	3402	0 %	0 %	50 %	50 %	384191413
9	NC_017215	AGGA	2	8	3674	3681	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017215	CGTT	2	8	4123	4130	0 %	50 %	25 %	25 %	384191414
11	NC_017215	GCCG	2	8	4935	4942	0 %	0 %	50 %	50 %	384191414
12	NC_017215	GCAT	2	8	4997	5004	25 %	25 %	25 %	25 %	384191414
13	NC_017215	GCAG	2	8	5005	5012	25 %	0 %	50 %	25 %	384191414
14	NC_017215	GAGC	2	8	5114	5121	25 %	0 %	50 %	25 %	384191414
15	NC_017215	GCCG	2	8	5162	5169	0 %	0 %	50 %	50 %	384191415
16	NC_017215	CGCA	2	8	5381	5388	25 %	0 %	25 %	50 %	384191415
17	NC_017215	TGGG	2	8	5394	5401	0 %	25 %	75 %	0 %	384191415
18	NC_017215	GCAA	2	8	5572	5579	50 %	0 %	25 %	25 %	384191415
19	NC_017215	CAAC	2	8	5815	5822	50 %	0 %	0 %	50 %	384191416
20	NC_017215	CGAG	2	8	7244	7251	25 %	0 %	50 %	25 %	384191416
21	NC_017215	CGGC	2	8	7565	7572	0 %	0 %	50 %	50 %	384191416
22	NC_017215	AACC	2	8	8002	8009	50 %	0 %	0 %	50 %	384191417
23	NC_017215	CGAT	2	8	8146	8153	25 %	25 %	25 %	25 %	384191417
24	NC_017215	GAGC	2	8	8208	8215	25 %	0 %	50 %	25 %	384191417
25	NC_017215	CCGC	2	8	8596	8603	0 %	0 %	25 %	75 %	384191417
26	NC_017215	TGCG	2	8	8854	8861	0 %	25 %	50 %	25 %	384191417
27	NC_017215	CATT	2	8	9172	9179	25 %	50 %	0 %	25 %	384191417
28	NC_017215	CGCC	2	8	9212	9219	0 %	0 %	25 %	75 %	384191417
29	NC_017215	GCAC	2	8	9778	9785	25 %	0 %	25 %	50 %	384191417
30	NC_017215	CGAC	2	8	10111	10118	25 %	0 %	25 %	50 %	384191417
31	NC_017215	GATG	2	8	10250	10257	25 %	25 %	50 %	0 %	384191417
32	NC_017215	ACCG	2	8	11016	11023	25 %	0 %	25 %	50 %	384191418
33	NC_017215	CGCC	2	8	11056	11063	0 %	0 %	25 %	75 %	384191418
34	NC_017215	CGGT	2	8	11187	11194	0 %	25 %	50 %	25 %	384191418
35	NC_017215	CTGC	2	8	11502	11509	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
36	NC_017215	CGCA	2	8	11510	11517	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
37	NC_017215	TTCA	2	8	11836	11843	25 %	50 %	0 %	25 %	384191419
38	NC_017215	TGCG	2	8	12093	12100	0 %	25 %	50 %	25 %	384191419
39	NC_017215	TTGC	2	8	12556	12563	0 %	50 %	25 %	25 %	384191419
40	NC_017215	TGCA	2	8	13697	13704	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_017215	GTTG	2	8	13908	13915	0 %	50 %	50 %	0 %	384191421
42	NC_017215	GCGA	3	12	14773	14784	25 %	0 %	50 %	25 %	384191422
43	NC_017215	CGCC	2	8	14892	14899	0 %	0 %	25 %	75 %	384191422
44	NC_017215	GCCG	2	8	15247	15254	0 %	0 %	50 %	50 %	384191422
45	NC_017215	CCTC	2	8	15421	15428	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
46	NC_017215	TCGG	2	8	16519	16526	0 %	25 %	50 %	25 %	384191423
47	NC_017215	GCCG	2	8	16706	16713	0 %	0 %	50 %	50 %	384191423
48	NC_017215	GCCG	2	8	17126	17133	0 %	0 %	50 %	50 %	384191425
49	NC_017215	TGGC	2	8	17377	17384	0 %	25 %	50 %	25 %	384191425
50	NC_017215	GATC	2	8	17578	17585	25 %	25 %	25 %	25 %	384191425
51	NC_017215	TTCC	2	8	17751	17758	0 %	50 %	0 %	50 %	384191425
52	NC_017215	TGCA	2	8	18251	18258	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_017215	GCGT	2	8	19345	19352	0 %	25 %	50 %	25 %	384191427
54	NC_017215	ATGT	2	8	19497	19504	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017215	AGAA	2	8	19885	19892	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017215	GGTG	2	8	19952	19959	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017215	ATTC	2	8	19960	19967	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_017215	TCGA	2	8	20435	20442	25 %	25 %	25 %	25 %	384191428
59	NC_017215	ACTC	2	8	20626	20633	25 %	25 %	0 %	50 %	384191428
60	NC_017215	GGAA	2	8	20697	20704	50 %	0 %	50 %	0 %	384191428
61	NC_017215	TGAC	2	8	21739	21746	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_017215	CAGT	2	8	21846	21853	25 %	25 %	25 %	25 %	384191430
63	NC_017215	GCAT	2	8	23045	23052	25 %	25 %	25 %	25 %	384191431
64	NC_017215	TTTC	2	8	23072	23079	0 %	75 %	0 %	25 %	384191431
65	NC_017215	CCAA	2	8	23265	23272	50 %	0 %	0 %	50 %	384191432
66	NC_017215	GAGC	2	8	23872	23879	25 %	0 %	50 %	25 %	384191433
67	NC_017215	CGCA	2	8	24469	24476	25 %	0 %	25 %	50 %	384191433
68	NC_017215	GTGA	2	8	24953	24960	25 %	25 %	50 %	0 %	384191433
69	NC_017215	GCGA	2	8	25001	25008	25 %	0 %	50 %	25 %	384191433
70	NC_017215	GCCT	2	8	25227	25234	0 %	25 %	25 %	50 %	384191433
71	NC_017215	GGCG	2	8	25402	25409	0 %	0 %	75 %	25 %	384191433
72	NC_017215	GAGT	2	8	26063	26070	25 %	25 %	50 %	0 %	384191433
73	NC_017215	CCGA	2	8	26306	26313	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
74	NC_017215	ATGC	2	8	26347	26354	25 %	25 %	25 %	25 %	384191434
75	NC_017215	CATT	2	8	27430	27437	25 %	50 %	0 %	25 %	384191435
76	NC_017215	GACG	2	8	27833	27840	25 %	0 %	50 %	25 %	384191435
77	NC_017215	AAGG	2	8	28154	28161	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017215	ACTG	2	8	28408	28415	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_017215	GTCG	2	8	28680	28687	0 %	25 %	50 %	25 %	384191436
80	NC_017215	GCTT	2	8	29082	29089	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_017215	GCAG	2	8	29467	29474	25 %	0 %	50 %	25 %	384191437
82	NC_017215	AATC	2	8	29601	29608	50 %	25 %	0 %	25 %	384191437
83	NC_017215	GACT	2	8	29978	29985	25 %	25 %	25 %	25 %	384191437
84	NC_017215	GTTT	2	8	30023	30030	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017215	GCTT	2	8	32018	32025	0 %	50 %	25 %	25 %	384191441
86	NC_017215	TGGC	2	8	32703	32710	0 %	25 %	50 %	25 %	384191443
87	NC_017215	TTTC	2	8	32943	32950	0 %	75 %	0 %	25 %	384191443
88	NC_017215	ATTT	2	8	33224	33231	25 %	75 %	0 %	0 %	384191443
89	NC_017215	ACGA	2	8	33240	33247	50 %	0 %	25 %	25 %	384191443
90	NC_017215	CTTG	2	8	33397	33404	0 %	50 %	25 %	25 %	384191443
91	NC_017215	TTTA	2	8	33413	33420	25 %	75 %	0 %	0 %	384191443
92	NC_017215	ATTC	2	8	33695	33702	25 %	50 %	0 %	25 %	384191443
93	NC_017215	TGAT	2	8	34126	34133	25 %	50 %	25 %	0 %	384191444
94	NC_017215	GTTT	2	8	34229	34236	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017215	AATT	2	8	34368	34375	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017215	GAGC	2	8	34899	34906	25 %	0 %	50 %	25 %	384191445
97	NC_017215	GCCA	2	8	35717	35724	25 %	0 %	25 %	50 %	384191445
98	NC_017215	CTCG	2	8	36237	36244	0 %	25 %	25 %	50 %	384191446
99	NC_017215	TGTC	2	8	37000	37007	0 %	50 %	25 %	25 %	384191446
100	NC_017215	TGCT	2	8	37718	37725	0 %	50 %	25 %	25 %	384191448
101	NC_017215	TGGG	2	8	37765	37772	0 %	25 %	75 %	0 %	384191448
102	NC_017215	AGCG	2	8	37807	37814	25 %	0 %	50 %	25 %	384191448
103	NC_017215	GAAA	2	8	38345	38352	75 %	0 %	25 %	0 %	384191448
104	NC_017215	CTTG	2	8	41647	41654	0 %	50 %	25 %	25 %	384191450
105	NC_017215	GCTT	2	8	41688	41695	0 %	50 %	25 %	25 %	384191450
106	NC_017215	TGAT	2	8	42051	42058	25 %	50 %	25 %	0 %	384191450
107	NC_017215	CAAT	2	8	42288	42295	50 %	25 %	0 %	25 %	384191450
108	NC_017215	CGCA	2	8	42940	42947	25 %	0 %	25 %	50 %	384191451
109	NC_017215	AGTG	2	8	43615	43622	25 %	25 %	50 %	0 %	384191451
110	NC_017215	GGTC	2	8	43988	43995	0 %	25 %	50 %	25 %	384191451
111	NC_017215	GATT	2	8	44142	44149	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017215	GTCG	2	8	44361	44368	0 %	25 %	50 %	25 %	384191452
113	NC_017215	AGAA	2	8	44673	44680	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017215	TTTG	2	8	44909	44916	0 %	75 %	25 %	0 %	384191453
115	NC_017215	AAGG	2	8	45121	45128	50 %	0 %	50 %	0 %	384191454
116	NC_017215	GGAT	2	8	45729	45736	25 %	25 %	50 %	0 %	384191455
117	NC_017215	TGCT	2	8	45977	45984	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
118	NC_017215	CGGT	2	8	46521	46528	0 %	25 %	50 %	25 %	384191456
119	NC_017215	GTGA	2	8	46788	46795	25 %	25 %	50 %	0 %	384191456
120	NC_017215	CGGT	2	8	47270	47277	0 %	25 %	50 %	25 %	384191457
121	NC_017215	GCTG	2	8	47757	47764	0 %	25 %	50 %	25 %	384191458
122	NC_017215	CGGC	2	8	48109	48116	0 %	0 %	50 %	50 %	384191459
123	NC_017215	GGGC	2	8	48515	48522	0 %	0 %	75 %	25 %	384191459
124	NC_017215	CCTG	2	8	48698	48705	0 %	25 %	25 %	50 %	384191459
125	NC_017215	CCCT	2	8	49263	49270	0 %	25 %	0 %	75 %	384191459
126	NC_017215	GTGC	2	8	49282	49289	0 %	25 %	50 %	25 %	384191459
127	NC_017215	CGGT	2	8	49825	49832	0 %	25 %	50 %	25 %	384191459
128	NC_017215	CGAA	2	8	49949	49956	50 %	0 %	25 %	25 %	384191459
129	NC_017215	TGAA	2	8	50407	50414	50 %	25 %	25 %	0 %	384191459
130	NC_017215	CAAT	2	8	50549	50556	50 %	25 %	0 %	25 %	384191460
131	NC_017215	GGTA	2	8	51085	51092	25 %	25 %	50 %	0 %	384191461
132	NC_017215	TGGC	2	8	51801	51808	0 %	25 %	50 %	25 %	384191462
133	NC_017215	GAGG	2	8	52536	52543	25 %	0 %	75 %	0 %	384191463
134	NC_017215	GCTC	2	8	53918	53925	0 %	25 %	25 %	50 %	384191464
135	NC_017215	CAGG	2	8	54942	54949	25 %	0 %	50 %	25 %	384191464
136	NC_017215	GCAC	2	8	55234	55241	25 %	0 %	25 %	50 %	384191464
137	NC_017215	ATCG	2	8	55323	55330	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
138	NC_017215	GCCG	2	8	55393	55400	0 %	0 %	50 %	50 %	384191465
139	NC_017215	AGGT	2	8	55563	55570	25 %	25 %	50 %	0 %	384191465
140	NC_017215	CCCA	2	8	55707	55714	25 %	0 %	0 %	75 %	384191465
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142	NC_017215	CTCG	2	8	56630	56637	0 %	25 %	25 %	50 %	384191465
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