MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bifidobacterium animalis subsp. lactis CNCM I-2494 chromosome

Total Repeats: 43527

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
43001	NC_017215	CGA	2	6	1920685	1920690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384193051
43002	NC_017215	ATGG	2	8	1920707	1920714	25 %	25 %	50 %	0 %	384193051
43003	NC_017215	CGA	2	6	1920855	1920860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384193051
43004	NC_017215	CTA	2	6	1920874	1920879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384193051
43005	NC_017215	CAG	2	6	1920892	1920897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384193051
43006	NC_017215	GGTG	2	8	1920964	1920971	0 %	25 %	75 %	0 %	384193051
43007	NC_017215	CGTC	2	8	1920983	1920990	0 %	25 %	25 %	50 %	384193051
43008	NC_017215	CGA	2	6	1921027	1921032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384193051
43009	NC_017215	ACCC	2	8	1921063	1921070	25 %	0 %	0 %	75 %	384193051
43010	NC_017215	CG	3	6	1921106	1921111	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43011	NC_017215	AT	3	6	1921160	1921165	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43012	NC_017215	CCGAG	2	10	1921174	1921183	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
43013	NC_017215	TG	3	6	1921197	1921202	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
43014	NC_017215	CG	3	6	1921206	1921211	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43015	NC_017215	CCT	2	6	1921278	1921283	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43016	NC_017215	GCC	2	6	1921304	1921309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
43017	NC_017215	GTC	2	6	1921323	1921328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43018	NC_017215	AGG	2	6	1921343	1921348	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43019	NC_017215	C	6	6	1921451	1921456	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
43020	NC_017215	AGC	2	6	1921478	1921483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43021	NC_017215	TC	4	8	1921530	1921537	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43022	NC_017215	CGA	2	6	1921665	1921670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43023	NC_017215	GCG	2	6	1921679	1921684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
43024	NC_017215	ATG	2	6	1921758	1921763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384193052
43025	NC_017215	CTG	2	6	1921812	1921817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384193052
43026	NC_017215	TTC	2	6	1921824	1921829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384193052
43027	NC_017215	ACC	3	9	1921872	1921880	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384193052
43028	NC_017215	CAC	2	6	1921883	1921888	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384193052
43029	NC_017215	CACCGT	2	12	1921991	1922002	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384193052
43030	NC_017215	GAC	2	6	1922018	1922023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384193052
43031	NC_017215	CAG	2	6	1922040	1922045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384193052
43032	NC_017215	CTT	2	6	1922090	1922095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384193052
43033	NC_017215	CGG	2	6	1922162	1922167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384193052
43034	NC_017215	CGGTC	2	10	1922186	1922195	0 %	20 %	40 %	40 %	384193052
43035	NC_017215	CGC	2	6	1922246	1922251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384193052
43036	NC_017215	ACC	2	6	1922349	1922354	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384193052
43037	NC_017215	GAC	2	6	1922406	1922411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384193052
43038	NC_017215	AGG	2	6	1922443	1922448	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384193052
43039	NC_017215	AGG	2	6	1922500	1922505	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384193052
43040	NC_017215	ACC	2	6	1922526	1922531	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384193052
43041	NC_017215	ATC	2	6	1922556	1922561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384193052
43042	NC_017215	GAAG	2	8	1922597	1922604	50 %	0 %	50 %	0 %	384193052
43043	NC_017215	ACG	2	6	1922623	1922628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384193052
43044	NC_017215	ACGA	2	8	1922670	1922677	50 %	0 %	25 %	25 %	384193052
43045	NC_017215	ACA	2	6	1922698	1922703	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384193052
43046	NC_017215	CGC	2	6	1922711	1922716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384193052
43047	NC_017215	TCC	2	6	1922733	1922738	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384193052
43048	NC_017215	CAG	2	6	1922763	1922768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384193052
43049	NC_017215	CGAG	2	8	1922782	1922789	25 %	0 %	50 %	25 %	384193052
43050	NC_017215	CGA	2	6	1922794	1922799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384193052
43051	NC_017215	CA	3	6	1922825	1922830	50 %	0 %	0 %	50 %	384193052
43052	NC_017215	AGC	2	6	1922842	1922847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384193052
43053	NC_017215	CCCA	2	8	1922871	1922878	25 %	0 %	0 %	75 %	384193052
43054	NC_017215	GCA	2	6	1922918	1922923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384193052
43055	NC_017215	GCC	2	6	1922950	1922955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384193052
43056	NC_017215	CGGC	2	8	1922992	1922999	0 %	0 %	50 %	50 %	384193052
43057	NC_017215	GCTG	2	8	1923070	1923077	0 %	25 %	50 %	25 %	384193052
43058	NC_017215	GTC	2	6	1923095	1923100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384193052
43059	NC_017215	GCA	2	6	1923133	1923138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384193052
43060	NC_017215	AGA	2	6	1923167	1923172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384193052
43061	NC_017215	CGC	2	6	1923173	1923178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384193052
43062	NC_017215	GGT	2	6	1923268	1923273	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384193052
43063	NC_017215	GTG	2	6	1923318	1923323	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384193053
43064	NC_017215	GCA	2	6	1923335	1923340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384193053
43065	NC_017215	CA	3	6	1923386	1923391	50 %	0 %	0 %	50 %	384193053
43066	NC_017215	CA	3	6	1923397	1923402	50 %	0 %	0 %	50 %	384193053
43067	NC_017215	AGCA	2	8	1923413	1923420	50 %	0 %	25 %	25 %	384193053
43068	NC_017215	CGG	2	6	1923440	1923445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384193053
43069	NC_017215	CTG	2	6	1923450	1923455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384193053
43070	NC_017215	CGC	2	6	1923479	1923484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384193053
43071	NC_017215	CGA	2	6	1923502	1923507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384193053
43072	NC_017215	GGCG	2	8	1923566	1923573	0 %	0 %	75 %	25 %	384193053
43073	NC_017215	CCG	2	6	1923658	1923663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384193053
43074	NC_017215	GATC	2	8	1923668	1923675	25 %	25 %	25 %	25 %	384193053
43075	NC_017215	CGC	2	6	1923800	1923805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384193053
43076	NC_017215	TGG	2	6	1923817	1923822	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384193053
43077	NC_017215	GCT	2	6	1923863	1923868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384193053
43078	NC_017215	TCCT	2	8	1923891	1923898	0 %	50 %	0 %	50 %	384193053
43079	NC_017215	GAC	2	6	1924086	1924091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384193053
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43081	NC_017215	CCT	2	6	1924150	1924155	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384193053
43082	NC_017215	CG	3	6	1924221	1924226	0 %	0 %	50 %	50 %	384193053
43083	NC_017215	CTGCC	2	10	1924381	1924390	0 %	20 %	20 %	60 %	384193054
43084	NC_017215	GGC	2	6	1924436	1924441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384193054
43085	NC_017215	GCG	2	6	1924467	1924472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384193054
43086	NC_017215	ACGGTG	2	12	1924487	1924498	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384193054
43087	NC_017215	CGA	2	6	1924569	1924574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384193054
43088	NC_017215	CGG	2	6	1924701	1924706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384193054
43089	NC_017215	GCG	2	6	1924709	1924714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384193054
43090	NC_017215	GCC	2	6	1924784	1924789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384193054
43091	NC_017215	CGG	2	6	1924819	1924824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384193054
43092	NC_017215	TCG	2	6	1924947	1924952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384193054
43093	NC_017215	GCA	2	6	1925038	1925043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384193054
43094	NC_017215	CGC	2	6	1925044	1925049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384193054
43095	NC_017215	GCG	2	6	1925070	1925075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384193054
43096	NC_017215	CAG	2	6	1925093	1925098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384193054
43097	NC_017215	CGA	2	6	1925106	1925111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384193054
43098	NC_017215	GTG	2	6	1925150	1925155	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384193054
43099	NC_017215	GAC	2	6	1925159	1925164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384193054
43100	NC_017215	CG	4	8	1925181	1925188	0 %	0 %	50 %	50 %	384193054
43101	NC_017215	CAT	2	6	1925218	1925223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384193054
43102	NC_017215	CCG	2	6	1925279	1925284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
43103	NC_017215	ACC	2	6	1925311	1925316	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43104	NC_017215	AAT	2	6	1925347	1925352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384193055
43105	NC_017215	GAA	2	6	1925362	1925367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384193055
43106	NC_017215	TCG	2	6	1925446	1925451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384193055
43107	NC_017215	CTGTTC	2	12	1925452	1925463	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	384193055
43108	NC_017215	GGT	2	6	1925470	1925475	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384193055
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43110	NC_017215	GCA	2	6	1925552	1925557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384193055
43111	NC_017215	CG	3	6	1925591	1925596	0 %	0 %	50 %	50 %	384193055
43112	NC_017215	GTG	2	6	1925665	1925670	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384193055
43113	NC_017215	CAC	2	6	1925709	1925714	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384193055
43114	NC_017215	GATG	2	8	1925787	1925794	25 %	25 %	50 %	0 %	384193055
43115	NC_017215	TGG	2	6	1925810	1925815	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384193055
43116	NC_017215	AC	3	6	1925946	1925951	50 %	0 %	0 %	50 %	384193055
43117	NC_017215	CGCT	2	8	1926016	1926023	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
43118	NC_017215	CGG	2	6	1926025	1926030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
43119	NC_017215	CGA	2	6	1926034	1926039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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43235	NC_017215	CGA	2	6	1930945	1930950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384193058
43236	NC_017215	TCA	2	6	1930979	1930984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384193059
43237	NC_017215	CTG	2	6	1931035	1931040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384193059
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43241	NC_017215	CGG	2	6	1931127	1931132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384193059
43242	NC_017215	GCT	3	9	1931229	1931237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384193059
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43262	NC_017215	GCT	2	6	1932021	1932026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384193059
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43264	NC_017215	CTGC	2	8	1932087	1932094	0 %	25 %	25 %	50 %	384193059
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43284	NC_017215	GAATC	2	10	1932923	1932932	40 %	20 %	20 %	20 %	384193059
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43295	NC_017215	CTCGC	2	10	1933330	1933339	0 %	20 %	20 %	60 %	384193059
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43307	NC_017215	GCCG	2	8	1934025	1934032	0 %	0 %	50 %	50 %	384193059
43308	NC_017215	GAAC	2	8	1934073	1934080	50 %	0 %	25 %	25 %	384193059
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43329	NC_017215	AAG	2	6	1934728	1934733	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384193059
43330	NC_017215	TCA	2	6	1934753	1934758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384193059
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43332	NC_017215	GGC	2	6	1934854	1934859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384193059
43333	NC_017215	ACC	2	6	1934860	1934865	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384193059
43334	NC_017215	CCG	2	6	1935033	1935038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
43335	NC_017215	AAT	2	6	1935181	1935186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384193060
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43340	NC_017215	CGT	3	9	1935312	1935320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384193060
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43343	NC_017215	CGA	2	6	1935465	1935470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384193060
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43345	NC_017215	GCG	2	6	1935518	1935523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384193060
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43347	NC_017215	GTG	2	6	1935673	1935678	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384193060
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43349	NC_017215	GGA	2	6	1935699	1935704	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384193060
43350	NC_017215	TCG	2	6	1935730	1935735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384193060
43351	NC_017215	CGA	2	6	1935756	1935761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384193060
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43460	NC_017215	CGGC	2	8	1940270	1940277	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43461	NC_017215	CGCAC	2	10	1940285	1940294	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
43462	NC_017215	ACT	2	6	1940320	1940325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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43465	NC_017215	GGC	2	6	1940429	1940434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
43466	NC_017215	GTC	2	6	1940438	1940443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384193066
43467	NC_017215	CTC	2	6	1940522	1940527	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384193066
43468	NC_017215	CACG	2	8	1940557	1940564	25 %	0 %	25 %	50 %	384193066
43469	NC_017215	GAT	2	6	1940573	1940578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384193066
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43497	NC_017215	CCGG	2	8	1941746	1941753	0 %	0 %	50 %	50 %	384193068
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