MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bifidobacterium animalis subsp. lactis CNCM I-2494 chromosome

Total Repeats: 43527

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017215	CGA	2	6	46933	46938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384191456
1002	NC_017215	AAC	2	6	47048	47053	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384191456
1003	NC_017215	GT	3	6	47162	47167	0 %	50 %	50 %	0 %	384191457
1004	NC_017215	GCC	2	6	47245	47250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384191457
1005	NC_017215	GAG	2	6	47263	47268	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384191457
1006	NC_017215	CGGT	2	8	47270	47277	0 %	25 %	50 %	25 %	384191457
1007	NC_017215	GCG	2	6	47278	47283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384191457
1008	NC_017215	CG	3	6	47303	47308	0 %	0 %	50 %	50 %	384191457
1009	NC_017215	GAT	2	6	47378	47383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384191457
1010	NC_017215	CCA	2	6	47428	47433	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384191458
1011	NC_017215	GC	4	8	47461	47468	0 %	0 %	50 %	50 %	384191458
1012	NC_017215	GAG	2	6	47471	47476	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384191458
1013	NC_017215	CAG	2	6	47480	47485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384191458
1014	NC_017215	CCG	2	6	47568	47573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384191458
1015	NC_017215	CCGAC	2	10	47694	47703	20 %	0 %	20 %	60 %	384191458
1016	NC_017215	GCTG	2	8	47757	47764	0 %	25 %	50 %	25 %	384191458
1017	NC_017215	TCG	2	6	47778	47783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384191458
1018	NC_017215	CTTCGA	2	12	47833	47844	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384191458
1019	NC_017215	CGA	2	6	47851	47856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384191458
1020	NC_017215	TTC	2	6	47900	47905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384191458
1021	NC_017215	GC	4	8	47953	47960	0 %	0 %	50 %	50 %	384191458
1022	NC_017215	TA	3	6	47976	47981	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_017215	GTG	3	9	48007	48015	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_017215	CCA	2	6	48044	48049	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1025	NC_017215	ATG	2	6	48091	48096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384191459
1026	NC_017215	CGGC	2	8	48109	48116	0 %	0 %	50 %	50 %	384191459
1027	NC_017215	CAG	2	6	48126	48131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384191459
1028	NC_017215	TGG	2	6	48137	48142	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384191459
1029	NC_017215	AGC	2	6	48163	48168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384191459
1030	NC_017215	ATG	2	6	48193	48198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384191459
1031	NC_017215	CTG	2	6	48210	48215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384191459
1032	NC_017215	GCC	2	6	48249	48254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384191459
1033	NC_017215	GTC	2	6	48261	48266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384191459
1034	NC_017215	TCG	2	6	48274	48279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384191459
1035	NC_017215	GGA	2	6	48285	48290	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384191459
1036	NC_017215	TGA	2	6	48357	48362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384191459
1037	NC_017215	CTCGG	2	10	48412	48421	0 %	20 %	40 %	40 %	384191459
1038	NC_017215	CTG	2	6	48439	48444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384191459
1039	NC_017215	TCT	2	6	48491	48496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384191459
1040	NC_017215	GGGC	2	8	48515	48522	0 %	0 %	75 %	25 %	384191459
1041	NC_017215	GGC	2	6	48525	48530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384191459
1042	NC_017215	GC	3	6	48574	48579	0 %	0 %	50 %	50 %	384191459
1043	NC_017215	CCTG	2	8	48698	48705	0 %	25 %	25 %	50 %	384191459
1044	NC_017215	GTA	2	6	48717	48722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384191459
1045	NC_017215	TCG	2	6	48796	48801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384191459
1046	NC_017215	GCC	2	6	48879	48884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384191459
1047	NC_017215	AGC	2	6	48895	48900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384191459
1048	NC_017215	ACC	2	6	48973	48978	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384191459
1049	NC_017215	GAA	2	6	49089	49094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384191459
1050	NC_017215	CAC	2	6	49098	49103	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384191459
1051	NC_017215	GCCAT	2	10	49112	49121	20 %	20 %	20 %	40 %	384191459
1052	NC_017215	GCG	2	6	49144	49149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384191459
1053	NC_017215	ACG	2	6	49226	49231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384191459
1054	NC_017215	CCCT	2	8	49263	49270	0 %	25 %	0 %	75 %	384191459
1055	NC_017215	GTGC	2	8	49282	49289	0 %	25 %	50 %	25 %	384191459
1056	NC_017215	CGG	2	6	49325	49330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384191459
1057	NC_017215	AGC	2	6	49360	49365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384191459
1058	NC_017215	CTG	2	6	49434	49439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384191459
1059	NC_017215	AGC	2	6	49449	49454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384191459
1060	NC_017215	CAA	2	6	49509	49514	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384191459
1061	NC_017215	ACC	2	6	49534	49539	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384191459
1062	NC_017215	GGC	2	6	49558	49563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384191459
1063	NC_017215	CAC	2	6	49629	49634	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384191459
1064	NC_017215	TCG	2	6	49651	49656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384191459
1065	NC_017215	AGC	2	6	49672	49677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384191459
1066	NC_017215	CG	3	6	49807	49812	0 %	0 %	50 %	50 %	384191459
1067	NC_017215	CGGT	2	8	49825	49832	0 %	25 %	50 %	25 %	384191459
1068	NC_017215	GTT	2	6	49839	49844	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384191459
1069	NC_017215	CGC	2	6	49845	49850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384191459
1070	NC_017215	CGAA	2	8	49949	49956	50 %	0 %	25 %	25 %	384191459
1071	NC_017215	GCCCG	2	10	49989	49998	0 %	0 %	40 %	60 %	384191459
1072	NC_017215	AGC	2	6	49999	50004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384191459
1073	NC_017215	CGG	2	6	50097	50102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384191459
1074	NC_017215	GCC	2	6	50248	50253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384191459
1075	NC_017215	CTG	2	6	50292	50297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384191459
1076	NC_017215	TG	3	6	50347	50352	0 %	50 %	50 %	0 %	384191459
1077	NC_017215	TGAA	2	8	50407	50414	50 %	25 %	25 %	0 %	384191459
1078	NC_017215	GC	3	6	50427	50432	0 %	0 %	50 %	50 %	384191459
1079	NC_017215	AT	3	6	50474	50479	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_017215	GCT	2	6	50495	50500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1081	NC_017215	CAAT	2	8	50549	50556	50 %	25 %	0 %	25 %	384191460
1082	NC_017215	GGTCGA	2	12	50693	50704	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384191460
1083	NC_017215	TCG	2	6	50725	50730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384191460
1084	NC_017215	ATG	2	6	50734	50739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384191460
1085	NC_017215	AGT	2	6	50750	50755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384191460
1086	NC_017215	GAT	2	6	50802	50807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384191460
1087	NC_017215	CGT	2	6	50816	50821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384191460
1088	NC_017215	GCA	2	6	50966	50971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384191460
1089	NC_017215	CGC	2	6	51035	51040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1090	NC_017215	CG	3	6	51045	51050	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1091	NC_017215	AGC	2	6	51055	51060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1092	NC_017215	GGTA	2	8	51085	51092	25 %	25 %	50 %	0 %	384191461
1093	NC_017215	GTC	2	6	51132	51137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384191461
1094	NC_017215	GC	3	6	51141	51146	0 %	0 %	50 %	50 %	384191461
1095	NC_017215	CGC	2	6	51168	51173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384191461
1096	NC_017215	GCC	2	6	51213	51218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384191461
1097	NC_017215	CG	3	6	51233	51238	0 %	0 %	50 %	50 %	384191461
1098	NC_017215	GAG	2	6	51247	51252	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384191461
1099	NC_017215	CTG	2	6	51253	51258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384191461
1100	NC_017215	GT	3	6	51326	51331	0 %	50 %	50 %	0 %	384191461
1101	NC_017215	GGAAAA	2	12	51393	51404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_017215	GA	3	6	51516	51521	50 %	0 %	50 %	0 %	384191462
1103	NC_017215	GA	3	6	51526	51531	50 %	0 %	50 %	0 %	384191462
1104	NC_017215	CGC	2	6	51548	51553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384191462
1105	NC_017215	AAG	2	6	51742	51747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384191462
1106	NC_017215	ACT	2	6	51755	51760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384191462
1107	NC_017215	TGGC	2	8	51801	51808	0 %	25 %	50 %	25 %	384191462
1108	NC_017215	TGG	2	6	51926	51931	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384191462
1109	NC_017215	TGC	2	6	51956	51961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384191462
1110	NC_017215	TG	3	6	51977	51982	0 %	50 %	50 %	0 %	384191462
1111	NC_017215	TGG	2	6	52089	52094	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_017215	GAA	2	6	52192	52197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_017215	GT	3	6	52341	52346	0 %	50 %	50 %	0 %	384191463
1114	NC_017215	GCT	2	6	52365	52370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384191463
1115	NC_017215	TGG	2	6	52397	52402	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384191463
1116	NC_017215	GAGG	2	8	52536	52543	25 %	0 %	75 %	0 %	384191463
1117	NC_017215	CGGTC	2	10	52572	52581	0 %	20 %	40 %	40 %	384191463
1118	NC_017215	GTC	2	6	52584	52589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384191463
1119	NC_017215	CAT	2	6	52602	52607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384191463
1120	NC_017215	CGC	2	6	52613	52618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384191463
1121	NC_017215	GTC	2	6	52626	52631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384191463
1122	NC_017215	CGT	2	6	52664	52669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384191463
1123	NC_017215	TCG	2	6	52747	52752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384191463
1124	NC_017215	CAG	2	6	52758	52763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384191463
1125	NC_017215	GC	3	6	52765	52770	0 %	0 %	50 %	50 %	384191463
1126	NC_017215	GGC	2	6	52829	52834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384191463
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1233	NC_017215	AAG	2	6	57590	57595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1235	NC_017215	ATG	2	6	57626	57631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1236	NC_017215	CTT	2	6	57673	57678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1237	NC_017215	GGT	2	6	57716	57721	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384191466
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1248	NC_017215	CGGC	2	8	58055	58062	0 %	0 %	50 %	50 %	384191466
1249	NC_017215	GGC	2	6	58083	58088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384191466
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1251	NC_017215	ATG	2	6	58182	58187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384191466
1252	NC_017215	CCGA	2	8	58213	58220	25 %	0 %	25 %	50 %	384191466
1253	NC_017215	GGT	2	6	58263	58268	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384191466
1254	NC_017215	C	7	7	58463	58469	0 %	0 %	0 %	100 %	384191466
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1256	NC_017215	TAC	2	6	58530	58535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384191466
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