MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bifidobacterium animalis subsp. lactis CNCM I-2494 chromosome

Total Repeats: 43527

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017215	TCT	2	6	21142	21147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384191429
502	NC_017215	TAA	2	6	21354	21359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_017215	TCTGT	2	10	21413	21422	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
504	NC_017215	TGC	2	6	21680	21685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_017215	TCT	2	6	21703	21708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
506	NC_017215	GC	3	6	21732	21737	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
507	NC_017215	TGAC	2	8	21739	21746	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
508	NC_017215	CAGT	2	8	21846	21853	25 %	25 %	25 %	25 %	384191430
509	NC_017215	GT	3	6	21869	21874	0 %	50 %	50 %	0 %	384191430
510	NC_017215	TGA	2	6	21911	21916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384191430
511	NC_017215	GAT	2	6	22026	22031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384191430
512	NC_017215	GCT	3	9	22051	22059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384191430
513	NC_017215	AT	3	6	22113	22118	50 %	50 %	0 %	0 %	384191430
514	NC_017215	TGA	2	6	22136	22141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384191430
515	NC_017215	CCA	2	6	22151	22156	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384191430
516	NC_017215	GTC	2	6	22179	22184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384191430
517	NC_017215	GC	4	8	22235	22242	0 %	0 %	50 %	50 %	384191430
518	NC_017215	CTG	2	6	22305	22310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384191430
519	NC_017215	GCA	2	6	22315	22320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384191430
520	NC_017215	CCA	2	6	22330	22335	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384191430
521	NC_017215	CGG	2	6	22448	22453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384191430
522	NC_017215	CGC	2	6	22466	22471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384191430
523	NC_017215	TCT	2	6	22484	22489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384191430
524	NC_017215	GCC	2	6	22557	22562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384191430
525	NC_017215	GTA	2	6	22682	22687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384191430
526	NC_017215	GAA	2	6	22892	22897	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384191431
527	NC_017215	CTG	2	6	22898	22903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384191431
528	NC_017215	AGT	2	6	22923	22928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384191431
529	NC_017215	TG	3	6	22993	22998	0 %	50 %	50 %	0 %	384191431
530	NC_017215	CGC	2	6	23017	23022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384191431
531	NC_017215	GCAT	2	8	23045	23052	25 %	25 %	25 %	25 %	384191431
532	NC_017215	TTTC	2	8	23072	23079	0 %	75 %	0 %	25 %	384191431
533	NC_017215	TG	3	6	23107	23112	0 %	50 %	50 %	0 %	384191431
534	NC_017215	ATG	2	6	23153	23158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384191431
535	NC_017215	ATG	2	6	23186	23191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384191431
536	NC_017215	CAC	2	6	23218	23223	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384191431
537	NC_017215	CCAA	2	8	23265	23272	50 %	0 %	0 %	50 %	384191432
538	NC_017215	GCA	2	6	23284	23289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384191432
539	NC_017215	AC	3	6	23339	23344	50 %	0 %	0 %	50 %	384191432
540	NC_017215	GGC	2	6	23358	23363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384191432
541	NC_017215	TCG	2	6	23454	23459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384191432
542	NC_017215	GC	3	6	23473	23478	0 %	0 %	50 %	50 %	384191432
543	NC_017215	CGG	2	6	23491	23496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384191432
544	NC_017215	CG	3	6	23503	23508	0 %	0 %	50 %	50 %	384191432
545	NC_017215	GGC	2	6	23561	23566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_017215	TGG	2	6	23646	23651	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384191433
547	NC_017215	ATC	2	6	23680	23685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384191433
548	NC_017215	CGC	2	6	23720	23725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384191433
549	NC_017215	CGC	3	9	23753	23761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384191433
550	NC_017215	GCG	2	6	23772	23777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384191433
551	NC_017215	GCC	2	6	23806	23811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384191433
552	NC_017215	GCA	2	6	23853	23858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384191433
553	NC_017215	GAGC	2	8	23872	23879	25 %	0 %	50 %	25 %	384191433
554	NC_017215	ATC	2	6	23981	23986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384191433
555	NC_017215	GGA	2	6	24001	24006	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384191433
556	NC_017215	GGA	2	6	24025	24030	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384191433
557	NC_017215	GCG	2	6	24048	24053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384191433
558	NC_017215	GAA	2	6	24301	24306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384191433
559	NC_017215	TCA	2	6	24417	24422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384191433
560	NC_017215	GAG	2	6	24425	24430	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384191433
561	NC_017215	CAA	2	6	24460	24465	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384191433
562	NC_017215	CGCA	2	8	24469	24476	25 %	0 %	25 %	50 %	384191433
563	NC_017215	GAT	2	6	24572	24577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384191433
564	NC_017215	TCG	2	6	24600	24605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384191433
565	NC_017215	CGCAC	2	10	24617	24626	20 %	0 %	20 %	60 %	384191433
566	NC_017215	ACTCGG	2	12	24640	24651	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384191433
567	NC_017215	CG	3	6	24715	24720	0 %	0 %	50 %	50 %	384191433
568	NC_017215	CGA	2	6	24760	24765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384191433
569	NC_017215	GTC	3	9	24848	24856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384191433
570	NC_017215	TGC	2	6	24873	24878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384191433
571	NC_017215	ATC	2	6	24893	24898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384191433
572	NC_017215	GGC	2	6	24926	24931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384191433
573	NC_017215	GTGA	2	8	24953	24960	25 %	25 %	50 %	0 %	384191433
574	NC_017215	GCGA	2	8	25001	25008	25 %	0 %	50 %	25 %	384191433
575	NC_017215	CGA	2	6	25054	25059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384191433
576	NC_017215	CGC	2	6	25083	25088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384191433
577	NC_017215	GC	3	6	25112	25117	0 %	0 %	50 %	50 %	384191433
578	NC_017215	GCCT	2	8	25227	25234	0 %	25 %	25 %	50 %	384191433
579	NC_017215	GC	4	8	25243	25250	0 %	0 %	50 %	50 %	384191433
580	NC_017215	GAT	2	6	25279	25284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384191433
581	NC_017215	CGACG	2	10	25285	25294	20 %	0 %	40 %	40 %	384191433
582	NC_017215	CGA	2	6	25345	25350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384191433
583	NC_017215	GCG	2	6	25354	25359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384191433
584	NC_017215	GC	3	6	25367	25372	0 %	0 %	50 %	50 %	384191433
585	NC_017215	GCG	2	6	25379	25384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384191433
586	NC_017215	GGCG	2	8	25402	25409	0 %	0 %	75 %	25 %	384191433
587	NC_017215	ACA	2	6	25419	25424	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384191433
588	NC_017215	CGCTG	2	10	25431	25440	0 %	20 %	40 %	40 %	384191433
589	NC_017215	GAA	2	6	25567	25572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384191433
590	NC_017215	GCG	2	6	25654	25659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384191433
591	NC_017215	GCG	2	6	25740	25745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384191433
592	NC_017215	CG	3	6	25781	25786	0 %	0 %	50 %	50 %	384191433
593	NC_017215	TGTTCG	2	12	25800	25811	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	384191433
594	NC_017215	CGA	2	6	25818	25823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384191433
595	NC_017215	ATC	2	6	25943	25948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384191433
596	NC_017215	GGC	3	9	25961	25969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384191433
597	NC_017215	CGG	2	6	25975	25980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384191433
598	NC_017215	TCG	2	6	25986	25991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384191433
599	NC_017215	GAGT	2	8	26063	26070	25 %	25 %	50 %	0 %	384191433
600	NC_017215	GCCGT	2	10	26096	26105	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
601	NC_017215	GTT	2	6	26165	26170	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
602	NC_017215	AG	3	6	26210	26215	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
603	NC_017215	GGT	2	6	26223	26228	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
604	NC_017215	GGT	2	6	26275	26280	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
605	NC_017215	CCGA	2	8	26306	26313	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
606	NC_017215	GGT	2	6	26320	26325	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
607	NC_017215	ATGC	2	8	26347	26354	25 %	25 %	25 %	25 %	384191434
608	NC_017215	ATG	2	6	26364	26369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384191434
609	NC_017215	CGG	2	6	26394	26399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384191434
610	NC_017215	GAA	2	6	26407	26412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384191434
611	NC_017215	GCA	2	6	26525	26530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384191434
612	NC_017215	GCG	3	9	26623	26631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384191434
613	NC_017215	GCA	2	6	26633	26638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384191434
614	NC_017215	GCCGTT	2	12	26771	26782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384191434
615	NC_017215	GGC	2	6	26898	26903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384191434
616	NC_017215	GAG	2	6	26937	26942	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384191434
617	NC_017215	ACG	2	6	26980	26985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384191434
618	NC_017215	GCT	3	9	26999	27007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384191434
619	NC_017215	CGA	2	6	27008	27013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384191434
620	NC_017215	CGA	2	6	27044	27049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384191434
621	NC_017215	CGG	2	6	27056	27061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384191434
622	NC_017215	GC	4	8	27086	27093	0 %	0 %	50 %	50 %	384191434
623	NC_017215	GGGGA	2	10	27111	27120	20 %	0 %	80 %	0 %	384191434
624	NC_017215	ATC	2	6	27333	27338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384191435
625	NC_017215	TCT	2	6	27367	27372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384191435
626	NC_017215	CATT	2	8	27430	27437	25 %	50 %	0 %	25 %	384191435
627	NC_017215	GCC	2	6	27507	27512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384191435
628	NC_017215	GTG	2	6	27531	27536	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384191435
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633	NC_017215	GTG	2	6	27711	27716	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384191435
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754	NC_017215	TA	3	6	33717	33722	50 %	50 %	0 %	0 %	384191443
755	NC_017215	AT	3	6	33739	33744	50 %	50 %	0 %	0 %	384191443
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