MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bifidobacterium animalis subsp. lactis CNCM I-2494 chromosome

Total Repeats: 43527

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_017215	ATG	2	6	193285	193290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384191590
4502	NC_017215	CGT	2	6	193294	193299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384191590
4503	NC_017215	ACG	2	6	193303	193308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384191590
4504	NC_017215	CAT	2	6	193364	193369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4505	NC_017215	A	6	6	193379	193384	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4506	NC_017215	TC	3	6	193426	193431	0 %	50 %	0 %	50 %	384191591
4507	NC_017215	CGG	2	6	193576	193581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384191591
4508	NC_017215	TGC	2	6	193587	193592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384191591
4509	NC_017215	GCTCG	2	10	193600	193609	0 %	20 %	40 %	40 %	384191591
4510	NC_017215	CGC	2	6	193639	193644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384191591
4511	NC_017215	GC	3	6	193643	193648	0 %	0 %	50 %	50 %	384191591
4512	NC_017215	GGC	2	6	193651	193656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384191591
4513	NC_017215	GCTC	2	8	193677	193684	0 %	25 %	25 %	50 %	384191591
4514	NC_017215	CGA	2	6	193758	193763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384191591
4515	NC_017215	TCA	2	6	193788	193793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384191591
4516	NC_017215	TCA	2	6	193812	193817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384191591
4517	NC_017215	TCA	2	6	193908	193913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384191591
4518	NC_017215	GCA	2	6	193963	193968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384191591
4519	NC_017215	CGA	2	6	193975	193980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384191591
4520	NC_017215	CG	3	6	193995	194000	0 %	0 %	50 %	50 %	384191591
4521	NC_017215	CGT	2	6	194020	194025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384191591
4522	NC_017215	GC	3	6	194026	194031	0 %	0 %	50 %	50 %	384191591
4523	NC_017215	AC	3	6	194091	194096	50 %	0 %	0 %	50 %	384191591
4524	NC_017215	CG	3	6	194111	194116	0 %	0 %	50 %	50 %	384191591
4525	NC_017215	TGA	2	6	194124	194129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384191591
4526	NC_017215	TCGC	2	8	194162	194169	0 %	25 %	25 %	50 %	384191591
4527	NC_017215	GTT	2	6	194227	194232	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384191591
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4529	NC_017215	CG	3	6	194316	194321	0 %	0 %	50 %	50 %	384191591
4530	NC_017215	AGG	2	6	194409	194414	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384191591
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4532	NC_017215	ATC	2	6	194429	194434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384191591
4533	NC_017215	CGA	2	6	194461	194466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384191591
4534	NC_017215	CG	3	6	194523	194528	0 %	0 %	50 %	50 %	384191591
4535	NC_017215	ATC	2	6	194582	194587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384191591
4536	NC_017215	GTC	2	6	194608	194613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384191591
4537	NC_017215	TCA	2	6	194616	194621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384191591
4538	NC_017215	GACG	2	8	194647	194654	25 %	0 %	50 %	25 %	384191591
4539	NC_017215	TCCT	2	8	194738	194745	0 %	50 %	0 %	50 %	384191591
4540	NC_017215	TCGAA	2	10	194760	194769	40 %	20 %	20 %	20 %	384191591
4541	NC_017215	CGA	2	6	194791	194796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384191591
4542	NC_017215	GC	3	6	194876	194881	0 %	0 %	50 %	50 %	384191591
4543	NC_017215	AGG	2	6	194895	194900	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384191591
4544	NC_017215	GCGAG	2	10	194913	194922	20 %	0 %	60 %	20 %	384191591
4545	NC_017215	GGC	2	6	195008	195013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384191591
4546	NC_017215	GC	4	8	195035	195042	0 %	0 %	50 %	50 %	384191591
4547	NC_017215	CGA	2	6	195073	195078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384191591
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4549	NC_017215	CGA	2	6	195150	195155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384191591
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4551	NC_017215	GCAC	2	8	195240	195247	25 %	0 %	25 %	50 %	384191591
4552	NC_017215	GAG	3	9	195305	195313	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384191591
4553	NC_017215	GCG	2	6	195331	195336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4554	NC_017215	GATA	2	8	195365	195372	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4555	NC_017215	GC	3	6	195416	195421	0 %	0 %	50 %	50 %	384191592
4556	NC_017215	GAT	2	6	195436	195441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384191592
4557	NC_017215	CGG	2	6	195444	195449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384191592
4558	NC_017215	TCGGCG	2	12	195515	195526	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384191592
4559	NC_017215	CGA	2	6	195573	195578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384191592
4560	NC_017215	CTGC	2	8	195592	195599	0 %	25 %	25 %	50 %	384191592
4561	NC_017215	TGC	2	6	195620	195625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384191592
4562	NC_017215	TCGA	2	8	195628	195635	25 %	25 %	25 %	25 %	384191592
4563	NC_017215	GAT	2	6	195717	195722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384191592
4564	NC_017215	GC	3	6	195756	195761	0 %	0 %	50 %	50 %	384191592
4565	NC_017215	CGA	2	6	195804	195809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384191592
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4570	NC_017215	ATG	2	6	195931	195936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384191592
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4573	NC_017215	TGA	2	6	196010	196015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384191592
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4580	NC_017215	CGT	3	9	196245	196253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384191592
4581	NC_017215	CGGCG	2	10	196263	196272	0 %	0 %	60 %	40 %	384191592
4582	NC_017215	TCGA	2	8	196288	196295	25 %	25 %	25 %	25 %	384191592
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4590	NC_017215	TCGA	2	8	196684	196691	25 %	25 %	25 %	25 %	384191592
4591	NC_017215	TGC	2	6	196748	196753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384191592
4592	NC_017215	GAAG	2	8	196803	196810	50 %	0 %	50 %	0 %	384191592
4593	NC_017215	CGA	2	6	196818	196823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384191592
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4596	NC_017215	TGCCG	2	10	196840	196849	0 %	20 %	40 %	40 %	384191592
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4604	NC_017215	CGT	2	6	197069	197074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384191592
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4606	NC_017215	CA	3	6	197157	197162	50 %	0 %	0 %	50 %	384191592
4607	NC_017215	AGC	2	6	197340	197345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384191593
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4621	NC_017215	GGC	2	6	197894	197899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384191593
4622	NC_017215	GTGA	2	8	197949	197956	25 %	25 %	50 %	0 %	384191593
4623	NC_017215	GCG	2	6	198042	198047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384191593
4624	NC_017215	GCC	2	6	198060	198065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384191593
4625	NC_017215	GCT	2	6	198106	198111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384191593
4626	NC_017215	CGC	2	6	198121	198126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384191593
4627	NC_017215	GC	4	8	198140	198147	0 %	0 %	50 %	50 %	384191593
4628	NC_017215	TGCTCG	2	12	198208	198219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384191593
4629	NC_017215	GTC	2	6	198251	198256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384191593
4630	NC_017215	CGAG	2	8	198289	198296	25 %	0 %	50 %	25 %	384191593
4631	NC_017215	GTC	2	6	198311	198316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384191593
4632	NC_017215	TTGC	2	8	198330	198337	0 %	50 %	25 %	25 %	384191593
4633	NC_017215	GTG	2	6	198420	198425	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384191593
4634	NC_017215	GCG	2	6	198471	198476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384191593
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4640	NC_017215	GGTT	2	8	198605	198612	0 %	50 %	50 %	0 %	384191593
4641	NC_017215	CGG	2	6	198631	198636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384191593
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4645	NC_017215	TGCCC	2	10	198745	198754	0 %	20 %	20 %	60 %	384191593
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4650	NC_017215	CG	3	6	199006	199011	0 %	0 %	50 %	50 %	384191593
4651	NC_017215	GC	3	6	199063	199068	0 %	0 %	50 %	50 %	384191593
4652	NC_017215	AGCCG	2	10	199095	199104	20 %	0 %	40 %	40 %	384191593
4653	NC_017215	CGG	2	6	199105	199110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384191593
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4655	NC_017215	AGC	2	6	199187	199192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384191594
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4687	NC_017215	CGT	2	6	200424	200429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384191594
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4693	NC_017215	GAAGT	2	10	200617	200626	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
4694	NC_017215	GC	4	8	200640	200647	0 %	0 %	50 %	50 %	384191595
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4700	NC_017215	GCT	2	6	200814	200819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384191595
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4710	NC_017215	TTG	2	6	201132	201137	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4724	NC_017215	AGA	3	9	201616	201624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384191596
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4727	NC_017215	AAAC	2	8	201987	201994	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4728	NC_017215	CCT	2	6	202068	202073	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384191598
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4734	NC_017215	TTC	2	6	202277	202282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384191598
4735	NC_017215	GCCGC	2	10	202301	202310	0 %	0 %	40 %	60 %	384191598
4736	NC_017215	CGT	2	6	202344	202349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384191598
4737	NC_017215	TCG	2	6	202374	202379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384191598
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4741	NC_017215	TCG	2	6	202605	202610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384191598
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4864	NC_017215	CGA	2	6	207355	207360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384191601
4865	NC_017215	GGT	2	6	207394	207399	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384191601
4866	NC_017215	CAC	2	6	207422	207427	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384191601
4867	NC_017215	GAA	2	6	207437	207442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384191601
4868	NC_017215	GAGCAT	2	12	207464	207475	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384191601
4869	NC_017215	CGT	2	6	207493	207498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384191601
4870	NC_017215	GAA	2	6	207548	207553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384191601
4871	NC_017215	GC	3	6	207562	207567	0 %	0 %	50 %	50 %	384191601
4872	NC_017215	CAT	2	6	207581	207586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384191601
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4874	NC_017215	CATG	2	8	207658	207665	25 %	25 %	25 %	25 %	384191601
4875	NC_017215	AGCG	2	8	207701	207708	25 %	0 %	50 %	25 %	384191601
4876	NC_017215	ATG	2	6	207762	207767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384191601
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4881	NC_017215	GCG	2	6	207949	207954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384191601
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4883	NC_017215	TGC	2	6	208060	208065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384191601
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4888	NC_017215	TG	3	6	208242	208247	0 %	50 %	50 %	0 %	384191601
4889	NC_017215	TGCG	2	8	208339	208346	0 %	25 %	50 %	25 %	384191601
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4912	NC_017215	CCT	2	6	209538	209543	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4913	NC_017215	TAG	2	6	209599	209604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4916	NC_017215	ACGAG	2	10	209797	209806	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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4953	NC_017215	TGC	2	6	211164	211169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384191603
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4962	NC_017215	CGG	2	6	211713	211718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384191604
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4978	NC_017215	GGC	2	6	212521	212526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384191604
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4981	NC_017215	CGA	2	6	212586	212591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384191604
4982	NC_017215	CCA	2	6	212613	212618	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384191604
4983	NC_017215	TGC	2	6	212621	212626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384191604
4984	NC_017215	GTGC	2	8	212667	212674	0 %	25 %	50 %	25 %	384191604
4985	NC_017215	TCG	2	6	212675	212680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384191604
4986	NC_017215	ACG	3	9	212687	212695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384191604
4987	NC_017215	GCC	2	6	212701	212706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384191604
4988	NC_017215	TCG	3	9	212814	212822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384191605
4989	NC_017215	GTA	2	6	212837	212842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384191605
4990	NC_017215	TCG	2	6	212874	212879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384191605
4991	NC_017215	GC	3	6	212959	212964	0 %	0 %	50 %	50 %	384191605
4992	NC_017215	CGT	2	6	213043	213048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384191605
4993	NC_017215	CGT	2	6	213142	213147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384191605
4994	NC_017215	CACGC	2	10	213203	213212	20 %	0 %	20 %	60 %	384191605
4995	NC_017215	AGC	2	6	213228	213233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384191605
4996	NC_017215	CTG	2	6	213287	213292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384191605
4997	NC_017215	TG	3	6	213291	213296	0 %	50 %	50 %	0 %	384191605
4998	NC_017215	TCG	2	6	213318	213323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384191605
4999	NC_017215	TTGG	2	8	213332	213339	0 %	50 %	50 %	0 %	384191605
5000	NC_017215	TCG	2	6	213343	213348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384191605

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