MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Bacillus thuringiensis serovar chinensis CT-43 plasmid pCT9547

Total Repeats: 107

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017212	GGA	2	6	17	22	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017212	TCT	2	6	50	55	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384189579
3	NC_017212	TAG	2	6	247	252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384189579
4	NC_017212	CAA	2	6	293	298	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384189579
5	NC_017212	TTG	2	6	363	368	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384189579
6	NC_017212	ATA	2	6	408	413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384189579
7	NC_017212	TAT	2	6	520	525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384189579
8	NC_017212	AGG	2	6	538	543	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384189579
9	NC_017212	AAC	2	6	546	551	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384189579
10	NC_017212	TTA	2	6	648	653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384189579
11	NC_017212	GTC	2	6	683	688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384189579
12	NC_017212	TTA	2	6	717	722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384189579
13	NC_017212	CTT	2	6	742	747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384189579
14	NC_017212	ACT	2	6	826	831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384189579
15	NC_017212	GAA	2	6	1166	1171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384189580
16	NC_017212	TCT	2	6	1253	1258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384189580
17	NC_017212	TTA	2	6	1274	1279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384189580
18	NC_017212	CAA	2	6	1292	1297	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384189580
19	NC_017212	AAT	2	6	1310	1315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384189580
20	NC_017212	TTC	2	6	1368	1373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384189580
21	NC_017212	ATG	2	6	1799	1804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384189580
22	NC_017212	TTA	2	6	1887	1892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384189580
23	NC_017212	GAA	2	6	1991	1996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384189580
24	NC_017212	AAC	2	6	2001	2006	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384189580
25	NC_017212	TTA	2	6	2084	2089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384189580
26	NC_017212	CGA	2	6	2109	2114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384189580
27	NC_017212	ATG	3	9	2238	2246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384189580
28	NC_017212	TAT	2	6	2267	2272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384189580
29	NC_017212	CAT	2	6	2342	2347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384189580
30	NC_017212	TGA	2	6	2356	2361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384189580
31	NC_017212	ATG	2	6	2376	2381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384189580
32	NC_017212	AGA	2	6	2569	2574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384189580
33	NC_017212	CTT	2	6	2594	2599	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384189580
34	NC_017212	ATG	3	9	2838	2846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384189580
35	NC_017212	ATC	2	6	2899	2904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384189580
36	NC_017212	CTT	3	9	2925	2933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384189580
37	NC_017212	TAC	2	6	3067	3072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384189580
38	NC_017212	CTT	2	6	3107	3112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384189580
39	NC_017212	CAT	2	6	3113	3118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384189580
40	NC_017212	GAA	2	6	3137	3142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384189580
41	NC_017212	TTG	2	6	3194	3199	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384189580
42	NC_017212	CTC	2	6	3213	3218	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384189580
43	NC_017212	TGG	2	6	3259	3264	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384189580
44	NC_017212	AGA	2	6	3265	3270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384189580
45	NC_017212	TAA	2	6	3318	3323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384189580
46	NC_017212	TAA	2	6	3496	3501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384189580
47	NC_017212	ATT	2	6	3647	3652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384189580
48	NC_017212	AGA	2	6	3697	3702	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384189580
49	NC_017212	AGA	2	6	3727	3732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384189580
50	NC_017212	CAT	2	6	4005	4010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_017212	TCC	2	6	4040	4045	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_017212	ATT	2	6	4049	4054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017212	AGT	2	6	4273	4278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384189581
54	NC_017212	TTG	2	6	4402	4407	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384189581
55	NC_017212	CTA	2	6	4473	4478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384189581
56	NC_017212	CTG	2	6	4482	4487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384189581
57	NC_017212	TCA	2	6	4562	4567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384189581
58	NC_017212	ATT	2	6	4603	4608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384189581
59	NC_017212	TTC	2	6	4687	4692	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384189581
60	NC_017212	CTT	2	6	4746	4751	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384189581
61	NC_017212	AAT	2	6	4783	4788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384189581
62	NC_017212	CAG	2	6	4794	4799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384189581
63	NC_017212	ATT	2	6	4888	4893	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017212	TTA	2	6	4975	4980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017212	AAT	2	6	4985	4990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017212	GAA	2	6	5092	5097	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017212	CTA	2	6	5316	5321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_017212	TTA	2	6	5337	5342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017212	GTT	2	6	5497	5502	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384189582
70	NC_017212	ATA	2	6	5530	5535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384189582
71	NC_017212	TAA	2	6	5543	5548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384189582
72	NC_017212	TTC	2	6	5781	5786	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384189582
73	NC_017212	CTT	3	9	5936	5944	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_017212	TTA	2	6	6100	6105	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017212	TGA	2	6	6522	6527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017212	CAT	2	6	6566	6571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_017212	ATT	2	6	6657	6662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017212	ACA	2	6	6738	6743	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_017212	AAC	2	6	6797	6802	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_017212	ACA	2	6	6928	6933	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_017212	TTA	2	6	6963	6968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017212	TGA	2	6	7225	7230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017212	CTT	2	6	7289	7294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384189583
84	NC_017212	TAA	2	6	7356	7361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384189583
85	NC_017212	CTT	2	6	7491	7496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384189583
86	NC_017212	ATT	2	6	7537	7542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384189583
87	NC_017212	TCT	2	6	7556	7561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384189583
88	NC_017212	TAT	2	6	7569	7574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384189583
89	NC_017212	TCT	2	6	7611	7616	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384189583
90	NC_017212	TCT	2	6	7713	7718	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384189583
91	NC_017212	GTT	2	6	7748	7753	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384189583
92	NC_017212	TCT	2	6	7769	7774	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384189583
93	NC_017212	TTG	2	6	7873	7878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384189583
94	NC_017212	TGT	2	6	7928	7933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384189583
95	NC_017212	ACT	2	6	7952	7957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384189583
96	NC_017212	TCT	2	6	8171	8176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384189583
97	NC_017212	GTG	2	6	8205	8210	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384189583
98	NC_017212	TTC	2	6	8305	8310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384189583
99	NC_017212	TAC	2	6	8347	8352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384189583
100	NC_017212	CAA	2	6	8452	8457	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384189583
101	NC_017212	AAT	2	6	8481	8486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384189583
102	NC_017212	ACT	2	6	8628	8633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_017212	TCT	2	6	9015	9020	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_017212	TAT	2	6	9182	9187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017212	ATA	2	6	9322	9327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017212	TGT	2	6	9464	9469	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017212	TAA	2	6	9481	9486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.