MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Bacillus thuringiensis serovar chinensis CT-43 plasmid pCT72

Total Repeats: 38

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017205	GCAGCT	2	12	967	978	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017205	GATATT	2	12	5958	5969	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384189590
3	NC_017205	ATAAAA	2	12	7524	7535	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384189592
4	NC_017205	AGAACA	2	12	10472	10483	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	384189593
5	NC_017205	AAAAAG	2	12	15188	15199	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384189597
6	NC_017205	GGATCA	2	12	17203	17214	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384189600
7	NC_017205	AAATAT	2	12	19341	19352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017205	ACAGGA	2	12	20053	20064	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	384189602
9	NC_017205	GCAATG	2	12	22055	22066	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384189604
10	NC_017205	ACAGCA	2	12	23645	23656	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	384189606
11	NC_017205	TTTGGT	2	12	23822	23833	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384189606
12	NC_017205	CAAGTT	2	12	27766	27777	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384189608
13	NC_017205	TGAATT	2	12	29680	29691	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384189610
14	NC_017205	GAAAAA	2	12	29856	29867	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384189611
15	NC_017205	AAGATG	2	12	31911	31922	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384189612
16	NC_017205	ACAGGA	2	12	33385	33396	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	384189614
17	NC_017205	TGGTTT	2	12	34664	34675	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017205	TTTTGT	2	12	35147	35158	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	384189617
19	NC_017205	TTTAAT	2	12	35200	35211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384189617
20	NC_017205	TCAAAA	2	12	35276	35287	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	384189617
21	NC_017205	AATGAA	2	12	39463	39474	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384189627
22	NC_017205	TTTTAT	2	12	40401	40412	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	384189630
23	NC_017205	TTTAGT	2	12	43591	43602	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384189636
24	NC_017205	GTTAAT	2	12	43683	43694	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384189636
25	NC_017205	ATCTAA	2	12	45308	45319	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_017205	ATCTAA	2	12	46937	46948	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384189638
27	NC_017205	TTTTGT	2	12	49468	49479	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017205	CTAAAG	2	12	49998	50009	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384189641
29	NC_017205	GCAGCT	2	12	50909	50920	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_017205	AAAAGT	2	12	53648	53659	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384189648
31	NC_017205	TATGAA	2	12	56762	56773	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384189652
32	NC_017205	AATACG	2	12	56898	56909	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384189652
33	NC_017205	TTTTAA	2	12	58842	58853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384189654
34	NC_017205	TATATG	2	12	61608	61619	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017205	ATTCAT	2	12	62943	62954	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384189659
36	NC_017205	AGAAAG	2	12	63358	63369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384189660
37	NC_017205	TGAAGG	2	12	63690	63701	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	384189661
38	NC_017205	CCATAT	2	12	68227	68238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384189665

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.