MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Bacillus thuringiensis serovar chinensis CT-43 plasmid pCT72

Total Repeats: 66

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017205	TAGTT	2	10	48	57	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017205	AAAAG	2	10	696	705	80 %	0 %	20 %	0 %	384189585
3	NC_017205	AAAGA	2	10	1503	1512	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017205	CATTT	2	10	2484	2493	20 %	60 %	0 %	20 %	384189588
5	NC_017205	CTCTT	2	10	3624	3633	0 %	60 %	0 %	40 %	384189588
6	NC_017205	GGGAT	2	10	5754	5763	20 %	20 %	60 %	0 %	384189590
7	NC_017205	GATTA	2	10	6209	6218	40 %	40 %	20 %	0 %	384189590
8	NC_017205	TAATT	2	10	6230	6239	40 %	60 %	0 %	0 %	384189590
9	NC_017205	AATTG	2	10	6431	6440	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017205	CAATA	2	10	6468	6477	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_017205	AGAGG	2	10	7606	7615	40 %	0 %	60 %	0 %	384189592
12	NC_017205	TGATT	2	10	7941	7950	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017205	GAACT	2	10	11223	11232	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
14	NC_017205	GTATG	2	10	11370	11379	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017205	ACTAA	2	10	11826	11835	60 %	20 %	0 %	20 %	384189595
16	NC_017205	ATTAG	2	10	11946	11955	40 %	40 %	20 %	0 %	384189595
17	NC_017205	GAAAA	2	10	14333	14342	80 %	0 %	20 %	0 %	384189596
18	NC_017205	AGATA	2	10	15564	15573	60 %	20 %	20 %	0 %	384189598
19	NC_017205	AAAAG	2	10	17446	17455	80 %	0 %	20 %	0 %	384189601
20	NC_017205	AAAAG	2	10	18397	18406	80 %	0 %	20 %	0 %	384189601
21	NC_017205	AGAAA	2	10	18923	18932	80 %	0 %	20 %	0 %	384189601
22	NC_017205	CTTTT	2	10	19535	19544	0 %	80 %	0 %	20 %	384189602
23	NC_017205	AAAAT	2	10	20174	20183	80 %	20 %	0 %	0 %	384189602
24	NC_017205	AATTT	2	10	22763	22772	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017205	GAAAA	2	10	24251	24260	80 %	0 %	20 %	0 %	384189606
26	NC_017205	ACTTA	2	10	24910	24919	40 %	40 %	0 %	20 %	384189606
27	NC_017205	CAAAT	2	10	25762	25771	60 %	20 %	0 %	20 %	384189607
28	NC_017205	TAGGG	2	10	26632	26641	20 %	20 %	60 %	0 %	384189607
29	NC_017205	AAGTG	2	10	28502	28511	40 %	20 %	40 %	0 %	384189609
30	NC_017205	TACAA	2	10	29559	29568	60 %	20 %	0 %	20 %	384189610
31	NC_017205	AGTAC	2	10	31038	31047	40 %	20 %	20 %	20 %	384189611
32	NC_017205	AAAAG	2	10	34237	34246	80 %	0 %	20 %	0 %	384189616
33	NC_017205	CAAAG	2	10	34318	34327	60 %	0 %	20 %	20 %	384189616
34	NC_017205	AATTG	2	10	36724	36733	40 %	40 %	20 %	0 %	384189620
35	NC_017205	TTAAT	2	10	37089	37098	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017205	GAAAT	3	15	37523	37537	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017205	CAAAA	2	10	39866	39875	80 %	0 %	0 %	20 %	384189628
38	NC_017205	AACGA	2	10	40224	40233	60 %	0 %	20 %	20 %	384189629
39	NC_017205	TTTCT	2	10	41146	41155	0 %	80 %	0 %	20 %	384189632
40	NC_017205	TAAAA	2	10	42715	42724	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017205	TACAA	2	10	43779	43788	60 %	20 %	0 %	20 %	384189636
42	NC_017205	ACAGT	2	10	43865	43874	40 %	20 %	20 %	20 %	384189636
43	NC_017205	TAATT	2	10	45340	45349	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017205	AACTA	2	10	46073	46082	60 %	20 %	0 %	20 %	384189638
45	NC_017205	ATTAA	2	10	47733	47742	60 %	40 %	0 %	0 %	384189638
46	NC_017205	CAATA	2	10	48495	48504	60 %	20 %	0 %	20 %	384189639
47	NC_017205	TAATT	2	10	49401	49410	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017205	GATGA	2	10	49496	49505	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017205	TAAAT	2	10	50305	50314	60 %	40 %	0 %	0 %	384189641
50	NC_017205	TAATT	2	10	50395	50404	40 %	60 %	0 %	0 %	384189641
51	NC_017205	ATTAT	2	10	50488	50497	40 %	60 %	0 %	0 %	384189641
52	NC_017205	AAAAC	2	10	50987	50996	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_017205	CAAGA	2	10	51139	51148	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
54	NC_017205	CAACT	2	10	51217	51226	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
55	NC_017205	TTTCA	2	10	51614	51623	20 %	60 %	0 %	20 %	384189643
56	NC_017205	AATAA	2	10	53551	53560	80 %	20 %	0 %	0 %	384189647
57	NC_017205	ATGCT	2	10	54984	54993	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
58	NC_017205	CTCAA	2	10	55201	55210	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
59	NC_017205	TGTAA	2	10	62541	62550	40 %	40 %	20 %	0 %	384189658
60	NC_017205	AAGTC	2	10	63137	63146	40 %	20 %	20 %	20 %	384189659
61	NC_017205	AGCCC	2	10	64929	64938	20 %	0 %	20 %	60 %	384189662
62	NC_017205	TATTC	2	10	65145	65154	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_017205	CTTTA	2	10	66451	66460	20 %	60 %	0 %	20 %	384189663
64	NC_017205	AATTT	2	10	67933	67942	40 %	60 %	0 %	0 %	384189664
65	NC_017205	TAAAC	2	10	70115	70124	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_017205	AATGA	2	10	71563	71572	60 %	20 %	20 %	0 %	384189670

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.