MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bacillus thuringiensis serovar chinensis CT-43 plasmid pCT72

Total Repeats: 1751

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_017205	AT	3	6	61659	61664	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_017205	A	6	6	61823	61828	100 %	0 %	0 %	0 %	384189657
1503	NC_017205	CTA	2	6	61843	61848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384189657
1504	NC_017205	A	6	6	61940	61945	100 %	0 %	0 %	0 %	384189657
1505	NC_017205	TTA	2	6	62026	62031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384189657
1506	NC_017205	A	6	6	62045	62050	100 %	0 %	0 %	0 %	384189657
1507	NC_017205	TA	3	6	62060	62065	50 %	50 %	0 %	0 %	384189657
1508	NC_017205	AGC	2	6	62088	62093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384189657
1509	NC_017205	A	7	7	62114	62120	100 %	0 %	0 %	0 %	384189657
1510	NC_017205	ATGT	2	8	62164	62171	25 %	50 %	25 %	0 %	384189657
1511	NC_017205	GAT	2	6	62277	62282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384189657
1512	NC_017205	AAT	2	6	62293	62298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384189657
1513	NC_017205	AAAT	2	8	62338	62345	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_017205	ATT	2	6	62352	62357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_017205	AT	3	6	62361	62366	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_017205	AAT	2	6	62375	62380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_017205	ATAA	3	12	62390	62401	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_017205	TAA	2	6	62452	62457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384189658
1519	NC_017205	A	6	6	62535	62540	100 %	0 %	0 %	0 %	384189658
1520	NC_017205	TGTAA	2	10	62541	62550	40 %	40 %	20 %	0 %	384189658
1521	NC_017205	TTA	2	6	62565	62570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384189658
1522	NC_017205	A	7	7	62707	62713	100 %	0 %	0 %	0 %	384189658
1523	NC_017205	AT	3	6	62752	62757	50 %	50 %	0 %	0 %	384189659
1524	NC_017205	A	7	7	62825	62831	100 %	0 %	0 %	0 %	384189659
1525	NC_017205	ATG	2	6	62853	62858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384189659
1526	NC_017205	CATA	2	8	62891	62898	50 %	25 %	0 %	25 %	384189659
1527	NC_017205	A	6	6	62929	62934	100 %	0 %	0 %	0 %	384189659
1528	NC_017205	ATTCAT	2	12	62943	62954	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384189659
1529	NC_017205	A	7	7	63006	63012	100 %	0 %	0 %	0 %	384189659
1530	NC_017205	TA	3	6	63018	63023	50 %	50 %	0 %	0 %	384189659
1531	NC_017205	TA	3	6	63120	63125	50 %	50 %	0 %	0 %	384189659
1532	NC_017205	AAGTC	2	10	63137	63146	40 %	20 %	20 %	20 %	384189659
1533	NC_017205	AAG	2	6	63151	63156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384189659
1534	NC_017205	TTG	2	6	63164	63169	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384189659
1535	NC_017205	ACAA	2	8	63266	63273	75 %	0 %	0 %	25 %	384189660
1536	NC_017205	GTTC	2	8	63287	63294	0 %	50 %	25 %	25 %	384189660
1537	NC_017205	AAG	2	6	63321	63326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384189660
1538	NC_017205	TGA	2	6	63343	63348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384189660
1539	NC_017205	AGAAAG	2	12	63358	63369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384189660
1540	NC_017205	TTA	2	6	63417	63422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_017205	CTA	2	6	63425	63430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1542	NC_017205	TGAT	2	8	63431	63438	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_017205	T	7	7	63448	63454	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_017205	T	9	9	63497	63505	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_017205	TGGA	2	8	63516	63523	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_017205	A	7	7	63530	63536	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_017205	GGT	2	6	63539	63544	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_017205	AAAT	2	8	63587	63594	75 %	25 %	0 %	0 %	384189661
1549	NC_017205	A	6	6	63651	63656	100 %	0 %	0 %	0 %	384189661
1550	NC_017205	TGAAGG	2	12	63690	63701	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	384189661
1551	NC_017205	TAA	2	6	63738	63743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384189661
1552	NC_017205	A	6	6	63790	63795	100 %	0 %	0 %	0 %	384189661
1553	NC_017205	TAT	2	6	63813	63818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384189661
1554	NC_017205	GA	3	6	63819	63824	50 %	0 %	50 %	0 %	384189661
1555	NC_017205	TCA	2	6	63839	63844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384189661
1556	NC_017205	TGC	2	6	63893	63898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384189661
1557	NC_017205	AT	3	6	63933	63938	50 %	50 %	0 %	0 %	384189661
1558	NC_017205	AGA	2	6	63966	63971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384189661
1559	NC_017205	AATT	2	8	64046	64053	50 %	50 %	0 %	0 %	384189661
1560	NC_017205	CAA	2	6	64070	64075	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384189661
1561	NC_017205	CA	3	6	64130	64135	50 %	0 %	0 %	50 %	384189661
1562	NC_017205	AT	3	6	64187	64192	50 %	50 %	0 %	0 %	384189661
1563	NC_017205	AAAT	2	8	64204	64211	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_017205	TA	3	6	64216	64221	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_017205	ATA	2	6	64224	64229	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_017205	TTA	2	6	64237	64242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_017205	G	6	6	64279	64284	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_017205	ATCC	2	8	64317	64324	25 %	25 %	0 %	50 %	384189662
1569	NC_017205	T	7	7	64325	64331	0 %	100 %	0 %	0 %	384189662
1570	NC_017205	T	7	7	64373	64379	0 %	100 %	0 %	0 %	384189662
1571	NC_017205	T	6	6	64398	64403	0 %	100 %	0 %	0 %	384189662
1572	NC_017205	TTG	2	6	64439	64444	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384189662
1573	NC_017205	TAT	2	6	64561	64566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384189662
1574	NC_017205	GAA	2	6	64575	64580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384189662
1575	NC_017205	GAA	2	6	64595	64600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384189662
1576	NC_017205	AC	3	6	64632	64637	50 %	0 %	0 %	50 %	384189662
1577	NC_017205	TTA	2	6	64644	64649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384189662
1578	NC_017205	TAAA	2	8	64667	64674	75 %	25 %	0 %	0 %	384189662
1579	NC_017205	TCT	2	6	64710	64715	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384189662
1580	NC_017205	TTTG	2	8	64724	64731	0 %	75 %	25 %	0 %	384189662
1581	NC_017205	ATT	2	6	64740	64745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384189662
1582	NC_017205	CTTC	2	8	64788	64795	0 %	50 %	0 %	50 %	384189662
1583	NC_017205	AT	3	6	64819	64824	50 %	50 %	0 %	0 %	384189662
1584	NC_017205	AGCCC	2	10	64929	64938	20 %	0 %	20 %	60 %	384189662
1585	NC_017205	ATA	2	6	64965	64970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384189662
1586	NC_017205	CCT	2	6	65014	65019	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1587	NC_017205	ACA	2	6	65033	65038	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1588	NC_017205	TTA	2	6	65059	65064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1589	NC_017205	ATTT	2	8	65098	65105	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_017205	T	7	7	65103	65109	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_017205	TATTC	2	10	65145	65154	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1592	NC_017205	TAA	2	6	65178	65183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_017205	A	6	6	65187	65192	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_017205	TGA	2	6	65264	65269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_017205	AAC	2	6	65272	65277	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1596	NC_017205	TTTA	2	8	65299	65306	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_017205	TA	3	6	65322	65327	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1598	NC_017205	GAT	2	6	65396	65401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_017205	TAT	2	6	65409	65414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_017205	ATTT	2	8	65441	65448	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_017205	GTT	2	6	65458	65463	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_017205	ATA	2	6	65480	65485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_017205	AT	3	6	65491	65496	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_017205	A	7	7	65501	65507	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_017205	A	7	7	65511	65517	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_017205	A	6	6	65525	65530	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_017205	GAT	2	6	65532	65537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_017205	CAT	2	6	65546	65551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1609	NC_017205	CAT	2	6	65553	65558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1610	NC_017205	AGT	2	6	65559	65564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_017205	CAT	3	9	65609	65617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1612	NC_017205	TG	3	6	65635	65640	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_017205	T	6	6	65670	65675	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_017205	GTT	2	6	65723	65728	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_017205	CTG	2	6	65731	65736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1616	NC_017205	A	7	7	65738	65744	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_017205	AAC	2	6	65751	65756	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1618	NC_017205	T	6	6	65759	65764	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_017205	GTT	2	6	65765	65770	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_017205	GAT	2	6	65905	65910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384189663
1621	NC_017205	AG	3	6	65915	65920	50 %	0 %	50 %	0 %	384189663
1622	NC_017205	AG	3	6	65941	65946	50 %	0 %	50 %	0 %	384189663
1623	NC_017205	GTT	2	6	65953	65958	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384189663
1624	NC_017205	ACT	2	6	65965	65970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384189663
1625	NC_017205	AGT	2	6	66010	66015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384189663
1626	NC_017205	AC	3	6	66049	66054	50 %	0 %	0 %	50 %	384189663
1627	NC_017205	AAT	2	6	66088	66093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384189663
1628	NC_017205	A	7	7	66151	66157	100 %	0 %	0 %	0 %	384189663
1629	NC_017205	GAA	2	6	66166	66171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384189663
1630	NC_017205	GCA	3	9	66181	66189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384189663
1631	NC_017205	GAA	2	6	66310	66315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384189663
1632	NC_017205	AGA	2	6	66357	66362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384189663
1633	NC_017205	ATA	2	6	66443	66448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384189663
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.