MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Bacillus thuringiensis serovar chinensis CT-43 plasmid pCT51

Total Repeats: 149

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017204	TTCT	2	8	809	816	0 %	75 %	0 %	25 %	384183549
2	NC_017204	AAAT	2	8	1913	1920	75 %	25 %	0 %	0 %	384183550
3	NC_017204	TAAA	2	8	2041	2048	75 %	25 %	0 %	0 %	384183550
4	NC_017204	GAAA	2	8	2313	2320	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017204	GAAA	2	8	2614	2621	75 %	0 %	25 %	0 %	384183551
6	NC_017204	CTTT	2	8	2794	2801	0 %	75 %	0 %	25 %	384183552
7	NC_017204	ACAA	2	8	3094	3101	75 %	0 %	0 %	25 %	384183552
8	NC_017204	TAGA	2	8	4228	4235	50 %	25 %	25 %	0 %	384183555
9	NC_017204	TCAT	2	8	4315	4322	25 %	50 %	0 %	25 %	384183555
10	NC_017204	ATTA	2	8	4394	4401	50 %	50 %	0 %	0 %	384183556
11	NC_017204	GGTT	2	8	4862	4869	0 %	50 %	50 %	0 %	384183556
12	NC_017204	AAGC	2	8	5213	5220	50 %	0 %	25 %	25 %	384183557
13	NC_017204	ATGG	2	8	5639	5646	25 %	25 %	50 %	0 %	384183558
14	NC_017204	ATTT	2	8	6543	6550	25 %	75 %	0 %	0 %	384183559
15	NC_017204	ACAA	2	8	6624	6631	75 %	0 %	0 %	25 %	384183559
16	NC_017204	TCAT	2	8	7757	7764	25 %	50 %	0 %	25 %	384183559
17	NC_017204	TGGA	2	8	7981	7988	25 %	25 %	50 %	0 %	384183559
18	NC_017204	AAAG	2	8	8107	8114	75 %	0 %	25 %	0 %	384183559
19	NC_017204	AAAG	2	8	8392	8399	75 %	0 %	25 %	0 %	384183559
20	NC_017204	TAAA	2	8	8727	8734	75 %	25 %	0 %	0 %	384183559
21	NC_017204	AACA	2	8	9386	9393	75 %	0 %	0 %	25 %	384183560
22	NC_017204	CATG	2	8	9435	9442	25 %	25 %	25 %	25 %	384183560
23	NC_017204	CGGA	2	8	11087	11094	25 %	0 %	50 %	25 %	384183561
24	NC_017204	TTGA	2	8	11302	11309	25 %	50 %	25 %	0 %	384183562
25	NC_017204	AAAG	2	8	11368	11375	75 %	0 %	25 %	0 %	384183562
26	NC_017204	ATTT	2	8	12265	12272	25 %	75 %	0 %	0 %	384183564
27	NC_017204	GAAA	2	8	12731	12738	75 %	0 %	25 %	0 %	384183565
28	NC_017204	AAGT	2	8	12923	12930	50 %	25 %	25 %	0 %	384183565
29	NC_017204	CAAA	2	8	13048	13055	75 %	0 %	0 %	25 %	384183565
30	NC_017204	AGAA	2	8	13675	13682	75 %	0 %	25 %	0 %	384183565
31	NC_017204	AACG	2	8	13897	13904	50 %	0 %	25 %	25 %	384183566
32	NC_017204	TATT	2	8	14546	14553	25 %	75 %	0 %	0 %	384183566
33	NC_017204	GAAT	2	8	16103	16110	50 %	25 %	25 %	0 %	384183567
34	NC_017204	CAGA	2	8	16249	16256	50 %	0 %	25 %	25 %	384183567
35	NC_017204	CGAG	2	8	16297	16304	25 %	0 %	50 %	25 %	384183567
36	NC_017204	GAAA	2	8	16785	16792	75 %	0 %	25 %	0 %	384183567
37	NC_017204	AAAT	2	8	17077	17084	75 %	25 %	0 %	0 %	384183567
38	NC_017204	ATTT	2	8	17356	17363	25 %	75 %	0 %	0 %	384183567
39	NC_017204	TTTG	2	8	17402	17409	0 %	75 %	25 %	0 %	384183567
40	NC_017204	CTTA	2	8	17444	17451	25 %	50 %	0 %	25 %	384183567
41	NC_017204	ACAA	2	8	17614	17621	75 %	0 %	0 %	25 %	384183567
42	NC_017204	CAAT	2	8	18113	18120	50 %	25 %	0 %	25 %	384183568
43	NC_017204	TGTT	2	8	18458	18465	0 %	75 %	25 %	0 %	384183568
44	NC_017204	TTAT	2	8	18550	18557	25 %	75 %	0 %	0 %	384183568
45	NC_017204	AGGT	2	8	18934	18941	25 %	25 %	50 %	0 %	384183568
46	NC_017204	AAAG	2	8	19068	19075	75 %	0 %	25 %	0 %	384183568
47	NC_017204	CTTC	2	8	19662	19669	0 %	50 %	0 %	50 %	384183568
48	NC_017204	GATT	2	8	19994	20001	25 %	50 %	25 %	0 %	384183568
49	NC_017204	ATTT	2	8	20076	20083	25 %	75 %	0 %	0 %	384183568
50	NC_017204	TTAT	2	8	20310	20317	25 %	75 %	0 %	0 %	384183569
51	NC_017204	ACAA	2	8	20415	20422	75 %	0 %	0 %	25 %	384183569
52	NC_017204	AAAT	2	8	21844	21851	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017204	TTAC	2	8	22746	22753	25 %	50 %	0 %	25 %	384183572
54	NC_017204	TCTA	2	8	23372	23379	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_017204	ATTT	2	8	23758	23765	25 %	75 %	0 %	0 %	384183573
56	NC_017204	TTTG	2	8	24023	24030	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017204	TTAC	2	8	24515	24522	25 %	50 %	0 %	25 %	384183574
58	NC_017204	GATT	2	8	24552	24559	25 %	50 %	25 %	0 %	384183574
59	NC_017204	TAAA	2	8	24761	24768	75 %	25 %	0 %	0 %	384183574
60	NC_017204	ATTT	2	8	25196	25203	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017204	ATTT	2	8	26042	26049	25 %	75 %	0 %	0 %	384183576
62	NC_017204	TTCA	2	8	26340	26347	25 %	50 %	0 %	25 %	384183576
63	NC_017204	AATC	2	8	26644	26651	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_017204	TACC	2	8	26775	26782	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_017204	TCCT	2	8	27057	27064	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_017204	TAAT	2	8	27235	27242	50 %	50 %	0 %	0 %	384183577
67	NC_017204	TAAA	2	8	27721	27728	75 %	25 %	0 %	0 %	384183577
68	NC_017204	AAGT	2	8	28166	28173	50 %	25 %	25 %	0 %	384183577
69	NC_017204	CATT	2	8	28643	28650	25 %	50 %	0 %	25 %	384183579
70	NC_017204	CATC	2	8	29047	29054	25 %	25 %	0 %	50 %	384183580
71	NC_017204	ACTT	2	8	29174	29181	25 %	50 %	0 %	25 %	384183580
72	NC_017204	TCTT	2	8	29216	29223	0 %	75 %	0 %	25 %	384183580
73	NC_017204	CACT	2	8	29484	29491	25 %	25 %	0 %	50 %	384183581
74	NC_017204	AAAC	2	8	30300	30307	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_017204	TAAA	2	8	30345	30352	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017204	AATG	2	8	31283	31290	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017204	TGCA	2	8	31513	31520	25 %	25 %	25 %	25 %	384183583
78	NC_017204	TAAA	2	8	31552	31559	75 %	25 %	0 %	0 %	384183584
79	NC_017204	TAAA	2	8	31581	31588	75 %	25 %	0 %	0 %	384183584
80	NC_017204	TTTC	2	8	32168	32175	0 %	75 %	0 %	25 %	384183585
81	NC_017204	TTTG	2	8	32200	32207	0 %	75 %	25 %	0 %	384183585
82	NC_017204	ATTT	2	8	32382	32389	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017204	TTAA	2	8	32468	32475	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017204	TACA	2	8	32557	32564	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_017204	TGAT	2	8	32643	32650	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017204	TAGT	2	8	32695	32702	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017204	TTTA	2	8	32741	32748	25 %	75 %	0 %	0 %	384183586
88	NC_017204	TCTT	2	8	32940	32947	0 %	75 %	0 %	25 %	384183586
89	NC_017204	TGAA	2	8	33475	33482	50 %	25 %	25 %	0 %	384183587
90	NC_017204	GTAA	2	8	33553	33560	50 %	25 %	25 %	0 %	384183587
91	NC_017204	GTAA	2	8	33989	33996	50 %	25 %	25 %	0 %	384183587
92	NC_017204	ATTA	2	8	34024	34031	50 %	50 %	0 %	0 %	384183587
93	NC_017204	ATCC	2	8	34963	34970	25 %	25 %	0 %	50 %	384183588
94	NC_017204	TTTA	2	8	35830	35837	25 %	75 %	0 %	0 %	384183589
95	NC_017204	ACTT	2	8	36237	36244	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_017204	CAAG	2	8	36284	36291	50 %	0 %	25 %	25 %	384183590
97	NC_017204	AAGA	2	8	36377	36384	75 %	0 %	25 %	0 %	384183590
98	NC_017204	TAAT	2	8	36896	36903	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017204	ATGT	2	8	37182	37189	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017204	ATGC	2	8	37328	37335	25 %	25 %	25 %	25 %	384183592
101	NC_017204	AAAT	2	8	37368	37375	75 %	25 %	0 %	0 %	384183592
102	NC_017204	GTTG	2	8	37623	37630	0 %	50 %	50 %	0 %	384183592
103	NC_017204	TCCC	2	8	37690	37697	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
104	NC_017204	TTAT	2	8	37743	37750	25 %	75 %	0 %	0 %	384183593
105	NC_017204	TTAG	2	8	38181	38188	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017204	AACT	2	8	38203	38210	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_017204	GTTT	2	8	38318	38325	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017204	AGTT	2	8	38351	38358	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017204	TTAT	2	8	38509	38516	25 %	75 %	0 %	0 %	384183594
110	NC_017204	ACAG	2	8	38673	38680	50 %	0 %	25 %	25 %	384183595
111	NC_017204	ATAG	2	8	39066	39073	50 %	25 %	25 %	0 %	384183595
112	NC_017204	GAAA	2	8	39236	39243	75 %	0 %	25 %	0 %	384183595
113	NC_017204	CTAA	2	8	39743	39750	50 %	25 %	0 %	25 %	384183596
114	NC_017204	GATG	2	8	40912	40919	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017204	AAAT	2	8	40957	40964	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017204	ATTA	2	8	41043	41050	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017204	AATG	2	8	41078	41085	50 %	25 %	25 %	0 %	384183599
118	NC_017204	TGCT	2	8	41705	41712	0 %	50 %	25 %	25 %	384183600
119	NC_017204	ATTG	2	8	42511	42518	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017204	TTAG	2	8	42881	42888	25 %	50 %	25 %	0 %	384183602
121	NC_017204	ACAA	2	8	43007	43014	75 %	0 %	0 %	25 %	384183603
122	NC_017204	AGAA	2	8	43432	43439	75 %	0 %	25 %	0 %	384183604
123	NC_017204	AGTT	2	8	43591	43598	25 %	50 %	25 %	0 %	384183604
124	NC_017204	AGCG	2	8	43916	43923	25 %	0 %	50 %	25 %	384183604
125	NC_017204	GAAA	2	8	44125	44132	75 %	0 %	25 %	0 %	384183606
126	NC_017204	GAAT	2	8	44456	44463	50 %	25 %	25 %	0 %	384183606
127	NC_017204	AGTA	2	8	44622	44629	50 %	25 %	25 %	0 %	384183607
128	NC_017204	TGAT	2	8	44648	44655	25 %	50 %	25 %	0 %	384183607
129	NC_017204	TAAA	2	8	44663	44670	75 %	25 %	0 %	0 %	384183607
130	NC_017204	TGAA	2	8	46088	46095	50 %	25 %	25 %	0 %	384183612
131	NC_017204	TAAA	2	8	46168	46175	75 %	25 %	0 %	0 %	384183612
132	NC_017204	TTTA	2	8	46179	46186	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017204	GAAA	2	8	46343	46350	75 %	0 %	25 %	0 %	384183613
134	NC_017204	AACA	2	8	47556	47563	75 %	0 %	0 %	25 %	384183616
135	NC_017204	ATAA	2	8	47687	47694	75 %	25 %	0 %	0 %	384183616
136	NC_017204	ATAA	2	8	47916	47923	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017204	GCAA	2	8	47932	47939	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
138	NC_017204	AAGA	2	8	48069	48076	75 %	0 %	25 %	0 %	384183617
139	NC_017204	ATAA	2	8	48612	48619	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017204	ATAA	2	8	48782	48789	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017204	AGAA	2	8	49143	49150	75 %	0 %	25 %	0 %	384183618
142	NC_017204	GCTT	2	8	49296	49303	0 %	50 %	25 %	25 %	384183618
143	NC_017204	TTCT	2	8	49674	49681	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_017204	AGCT	2	8	49686	49693	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
145	NC_017204	GTCA	2	8	49869	49876	25 %	25 %	25 %	25 %	384183619
146	NC_017204	AGGT	2	8	50221	50228	25 %	25 %	50 %	0 %	384183619
147	NC_017204	CTCC	2	8	50738	50745	0 %	25 %	0 %	75 %	384183619
148	NC_017204	AAAG	2	8	51134	51141	75 %	0 %	25 %	0 %	384183619
149	NC_017204	TTTA	2	8	51393	51400	25 %	75 %	0 %	0 %	384183620

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.