MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Bacillus thuringiensis serovar chinensis CT-43 plasmid pCT127

Total Repeats: 394

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017202	ATAA	2	8	89	96	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017202	TATC	2	8	589	596	25 %	50 %	0 %	25 %	384183675
3	NC_017202	ATGA	2	8	600	607	50 %	25 %	25 %	0 %	384183675
4	NC_017202	ATCG	2	8	714	721	25 %	25 %	25 %	25 %	384183675
5	NC_017202	CTGG	2	8	1198	1205	0 %	25 %	50 %	25 %	384183676
6	NC_017202	TATG	2	8	1490	1497	25 %	50 %	25 %	0 %	384183676
7	NC_017202	CAAA	2	8	1923	1930	75 %	0 %	0 %	25 %	384183676
8	NC_017202	AGCA	2	8	1957	1964	50 %	0 %	25 %	25 %	384183676
9	NC_017202	CAAT	2	8	2804	2811	50 %	25 %	0 %	25 %	384183676
10	NC_017202	TAAA	2	8	3643	3650	75 %	25 %	0 %	0 %	384183676
11	NC_017202	CAAT	2	8	3658	3665	50 %	25 %	0 %	25 %	384183676
12	NC_017202	CTTT	2	8	4179	4186	0 %	75 %	0 %	25 %	384183677
13	NC_017202	GATA	2	8	4749	4756	50 %	25 %	25 %	0 %	384183677
14	NC_017202	ACCT	2	8	5092	5099	25 %	25 %	0 %	50 %	384183677
15	NC_017202	AGAA	2	8	5639	5646	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017202	AACA	2	8	6193	6200	75 %	0 %	0 %	25 %	384183678
17	NC_017202	AGTG	2	8	7010	7017	25 %	25 %	50 %	0 %	384183680
18	NC_017202	AAAG	2	8	7192	7199	75 %	0 %	25 %	0 %	384183680
19	NC_017202	AGAA	2	8	7467	7474	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017202	TCGT	2	8	8363	8370	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_017202	TGAA	2	8	8971	8978	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017202	TAAT	2	8	10081	10088	50 %	50 %	0 %	0 %	384183683
23	NC_017202	TTTC	2	8	10107	10114	0 %	75 %	0 %	25 %	384183683
24	NC_017202	CAAT	2	8	10343	10350	50 %	25 %	0 %	25 %	384183683
25	NC_017202	AGAC	2	8	10570	10577	50 %	0 %	25 %	25 %	384183683
26	NC_017202	GAGT	2	8	10769	10776	25 %	25 %	50 %	0 %	384183684
27	NC_017202	ATTT	2	8	12024	12031	25 %	75 %	0 %	0 %	384183685
28	NC_017202	TAAT	2	8	12140	12147	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017202	TACT	2	8	12195	12202	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_017202	TTTA	2	8	12911	12918	25 %	75 %	0 %	0 %	384183686
31	NC_017202	AGAA	2	8	13738	13745	75 %	0 %	25 %	0 %	384183687
32	NC_017202	TCAT	2	8	14241	14248	25 %	50 %	0 %	25 %	384183688
33	NC_017202	TCCG	2	8	14690	14697	0 %	25 %	25 %	50 %	384183688
34	NC_017202	ATAA	2	8	15278	15285	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017202	TATC	2	8	15778	15785	25 %	50 %	0 %	25 %	384183689
36	NC_017202	ATGA	2	8	15789	15796	50 %	25 %	25 %	0 %	384183689
37	NC_017202	ATCG	2	8	15903	15910	25 %	25 %	25 %	25 %	384183689
38	NC_017202	CTGG	2	8	16387	16394	0 %	25 %	50 %	25 %	384183690
39	NC_017202	TATG	2	8	16679	16686	25 %	50 %	25 %	0 %	384183690
40	NC_017202	CAAA	2	8	17112	17119	75 %	0 %	0 %	25 %	384183690
41	NC_017202	AGCA	2	8	17146	17153	50 %	0 %	25 %	25 %	384183690
42	NC_017202	CAAT	2	8	17993	18000	50 %	25 %	0 %	25 %	384183690
43	NC_017202	TAAA	2	8	18832	18839	75 %	25 %	0 %	0 %	384183690
44	NC_017202	CAAT	2	8	18847	18854	50 %	25 %	0 %	25 %	384183690
45	NC_017202	CTTT	2	8	19678	19685	0 %	75 %	0 %	25 %	384183691
46	NC_017202	CAGT	2	8	20427	20434	25 %	25 %	25 %	25 %	384183692
47	NC_017202	TGGT	2	8	21253	21260	0 %	50 %	50 %	0 %	384183692
48	NC_017202	ATAA	2	8	22422	22429	75 %	25 %	0 %	0 %	384183693
49	NC_017202	GATG	2	8	23159	23166	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017202	ATTA	2	8	23258	23265	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017202	TTCT	2	8	23616	23623	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_017202	AGTA	2	8	23762	23769	50 %	25 %	25 %	0 %	384183694
53	NC_017202	GTAT	2	8	24324	24331	25 %	50 %	25 %	0 %	384183694
54	NC_017202	AGAT	2	8	24396	24403	50 %	25 %	25 %	0 %	384183694
55	NC_017202	GAAT	2	8	24468	24475	50 %	25 %	25 %	0 %	384183694
56	NC_017202	TTTA	2	8	24697	24704	25 %	75 %	0 %	0 %	384183694
57	NC_017202	ATTG	2	8	24785	24792	25 %	50 %	25 %	0 %	384183694
58	NC_017202	TAAT	2	8	25395	25402	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017202	TTCC	2	8	25476	25483	0 %	50 %	0 %	50 %	384183695
60	NC_017202	TCCT	2	8	26848	26855	0 %	50 %	0 %	50 %	384183695
61	NC_017202	CCAT	2	8	26881	26888	25 %	25 %	0 %	50 %	384183695
62	NC_017202	GATG	2	8	26959	26966	25 %	25 %	50 %	0 %	384183695
63	NC_017202	TTTC	2	8	26990	26997	0 %	75 %	0 %	25 %	384183695
64	NC_017202	TATT	2	8	28287	28294	25 %	75 %	0 %	0 %	384183695
65	NC_017202	TCGT	2	8	28461	28468	0 %	50 %	25 %	25 %	384183695
66	NC_017202	CTAG	2	8	28895	28902	25 %	25 %	25 %	25 %	384183695
67	NC_017202	TCCT	2	8	29729	29736	0 %	50 %	0 %	50 %	384183696
68	NC_017202	AGGA	2	8	29921	29928	50 %	0 %	50 %	0 %	384183696
69	NC_017202	GTTT	2	8	29999	30006	0 %	75 %	25 %	0 %	384183696
70	NC_017202	CCTT	2	8	30772	30779	0 %	50 %	0 %	50 %	384183698
71	NC_017202	ATTC	2	8	31032	31039	25 %	50 %	0 %	25 %	384183698
72	NC_017202	GATA	2	8	31094	31101	50 %	25 %	25 %	0 %	384183698
73	NC_017202	GTAA	2	8	31652	31659	50 %	25 %	25 %	0 %	384183698
74	NC_017202	GGAT	2	8	31911	31918	25 %	25 %	50 %	0 %	384183698
75	NC_017202	ATTA	2	8	32118	32125	50 %	50 %	0 %	0 %	384183698
76	NC_017202	TGTT	2	8	32194	32201	0 %	75 %	25 %	0 %	384183698
77	NC_017202	AGAA	2	8	32315	32322	75 %	0 %	25 %	0 %	384183698
78	NC_017202	TTAC	2	8	32491	32498	25 %	50 %	0 %	25 %	384183698
79	NC_017202	ACAT	2	8	32583	32590	50 %	25 %	0 %	25 %	384183699
80	NC_017202	ATCT	2	8	32816	32823	25 %	50 %	0 %	25 %	384183699
81	NC_017202	TGTA	2	8	32828	32835	25 %	50 %	25 %	0 %	384183699
82	NC_017202	AGCT	2	8	33398	33405	25 %	25 %	25 %	25 %	384183699
83	NC_017202	TTTA	2	8	33666	33673	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017202	GAAA	2	8	33879	33886	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017202	TACA	2	8	33958	33965	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_017202	ATTC	2	8	34561	34568	25 %	50 %	0 %	25 %	384183701
87	NC_017202	TCCT	2	8	34692	34699	0 %	50 %	0 %	50 %	384183701
88	NC_017202	TGTT	2	8	34944	34951	0 %	75 %	25 %	0 %	384183702
89	NC_017202	TGCT	2	8	35156	35163	0 %	50 %	25 %	25 %	384183702
90	NC_017202	TTTC	2	8	35517	35524	0 %	75 %	0 %	25 %	384183703
91	NC_017202	CTTC	2	8	35997	36004	0 %	50 %	0 %	50 %	384183703
92	NC_017202	TTCC	2	8	36194	36201	0 %	50 %	0 %	50 %	384183703
93	NC_017202	ATAG	2	8	36348	36355	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017202	ATTT	2	8	36837	36844	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017202	TTAT	2	8	36850	36857	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017202	GATG	2	8	36964	36971	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017202	CTTT	2	8	37384	37391	0 %	75 %	0 %	25 %	384183704
98	NC_017202	GAAA	2	8	37455	37462	75 %	0 %	25 %	0 %	384183704
99	NC_017202	GAAA	2	8	37728	37735	75 %	0 %	25 %	0 %	384183705
100	NC_017202	TGAT	2	8	37907	37914	25 %	50 %	25 %	0 %	384183705
101	NC_017202	TTTA	2	8	39143	39150	25 %	75 %	0 %	0 %	384183707
102	NC_017202	TAAT	2	8	39171	39178	50 %	50 %	0 %	0 %	384183707
103	NC_017202	TAGG	2	8	39506	39513	25 %	25 %	50 %	0 %	384183707
104	NC_017202	ATGT	2	8	39784	39791	25 %	50 %	25 %	0 %	384183707
105	NC_017202	ATTA	2	8	40657	40664	50 %	50 %	0 %	0 %	384183708
106	NC_017202	TTTC	2	8	40728	40735	0 %	75 %	0 %	25 %	384183708
107	NC_017202	ATTT	2	8	40767	40774	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017202	ATTA	2	8	40968	40975	50 %	50 %	0 %	0 %	384183709
109	NC_017202	AAGA	2	8	41348	41355	75 %	0 %	25 %	0 %	384183709
110	NC_017202	ATAG	2	8	41680	41687	50 %	25 %	25 %	0 %	384183709
111	NC_017202	TTTA	2	8	41904	41911	25 %	75 %	0 %	0 %	384183709
112	NC_017202	GAAA	2	8	42011	42018	75 %	0 %	25 %	0 %	384183710
113	NC_017202	GAAG	2	8	43716	43723	50 %	0 %	50 %	0 %	384183711
114	NC_017202	TAGG	2	8	43981	43988	25 %	25 %	50 %	0 %	384183711
115	NC_017202	AATT	2	8	44238	44245	50 %	50 %	0 %	0 %	384183712
116	NC_017202	TAAA	2	8	44346	44353	75 %	25 %	0 %	0 %	384183712
117	NC_017202	TAGA	2	8	44784	44791	50 %	25 %	25 %	0 %	384183712
118	NC_017202	TGTT	2	8	44829	44836	0 %	75 %	25 %	0 %	384183712
119	NC_017202	TTGC	2	8	45083	45090	0 %	50 %	25 %	25 %	384183712
120	NC_017202	TTGC	2	8	45125	45132	0 %	50 %	25 %	25 %	384183712
121	NC_017202	AATT	2	8	45536	45543	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017202	TTGT	2	8	45599	45606	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017202	AATA	2	8	45646	45653	75 %	25 %	0 %	0 %	384183713
124	NC_017202	TAAA	2	8	46086	46093	75 %	25 %	0 %	0 %	384183713
125	NC_017202	TTAA	2	8	46193	46200	50 %	50 %	0 %	0 %	384183713
126	NC_017202	TTTA	2	8	46579	46586	25 %	75 %	0 %	0 %	384183713
127	NC_017202	TACA	2	8	46666	46673	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_017202	TTTA	2	8	46734	46741	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017202	GTTC	2	8	46751	46758	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
130	NC_017202	GTAT	2	8	47324	47331	25 %	50 %	25 %	0 %	384183714
131	NC_017202	TTAA	2	8	47571	47578	50 %	50 %	0 %	0 %	384183714
132	NC_017202	ATGA	2	8	47646	47653	50 %	25 %	25 %	0 %	384183714
133	NC_017202	GATG	2	8	47825	47832	25 %	25 %	50 %	0 %	384183714
134	NC_017202	TAAA	2	8	47956	47963	75 %	25 %	0 %	0 %	384183714
135	NC_017202	TTGC	2	8	48168	48175	0 %	50 %	25 %	25 %	384183714
136	NC_017202	CTTT	2	8	48534	48541	0 %	75 %	0 %	25 %	384183714
137	NC_017202	TTAT	2	8	48680	48687	25 %	75 %	0 %	0 %	384183714
138	NC_017202	TTTC	2	8	49371	49378	0 %	75 %	0 %	25 %	384183714
139	NC_017202	ACCC	2	8	49587	49594	25 %	0 %	0 %	75 %	384183714
140	NC_017202	TAAA	2	8	49834	49841	75 %	25 %	0 %	0 %	384183714
141	NC_017202	ATCA	2	8	49978	49985	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_017202	AAGA	2	8	50715	50722	75 %	0 %	25 %	0 %	384183715
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.