MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Bacillus thuringiensis serovar finitimus YBT-020 plasmid pBMB26

Total Repeats: 180

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017201	CGATT	2	10	2033	2042	20 %	40 %	20 %	20 %	384183360
2	NC_017201	TAAAA	2	10	2044	2053	80 %	20 %	0 %	0 %	384183360
3	NC_017201	TATAC	2	10	2176	2185	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_017201	CATTA	2	10	3659	3668	40 %	40 %	0 %	20 %	384183363
5	NC_017201	TTCTG	2	10	3771	3780	0 %	60 %	20 %	20 %	384183363
6	NC_017201	TATTT	2	10	5081	5090	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017201	TGGCA	2	10	7146	7155	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
8	NC_017201	AATAA	2	10	7478	7487	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017201	TTTTA	2	10	12559	12568	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017201	ATTCG	2	10	13919	13928	20 %	40 %	20 %	20 %	384183373
11	NC_017201	ACAAA	2	10	16219	16228	80 %	0 %	0 %	20 %	384183376
12	NC_017201	GTTTT	2	10	21929	21938	0 %	80 %	20 %	0 %	384183380
13	NC_017201	TTTGA	2	10	25766	25775	20 %	60 %	20 %	0 %	384183386
14	NC_017201	TTCAC	2	10	26714	26723	20 %	40 %	0 %	40 %	384183388
15	NC_017201	ATTTC	2	10	28370	28379	20 %	60 %	0 %	20 %	384183391
16	NC_017201	GAAAA	2	10	29017	29026	80 %	0 %	20 %	0 %	384183392
17	NC_017201	TTTTA	2	10	29447	29456	20 %	80 %	0 %	0 %	384183393
18	NC_017201	CATAA	2	10	31821	31830	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_017201	AGTTT	2	10	31967	31976	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017201	TAACA	2	10	32593	32602	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_017201	ATAAA	2	10	33240	33249	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017201	GGTTA	2	10	33316	33325	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017201	AAAAT	2	10	33712	33721	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017201	AGAAA	2	10	34069	34078	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017201	TATCT	2	10	34761	34770	20 %	60 %	0 %	20 %	384183403
26	NC_017201	CTCAA	2	10	34893	34902	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
27	NC_017201	CAAAT	2	10	35629	35638	60 %	20 %	0 %	20 %	384183405
28	NC_017201	TTTCT	2	10	36059	36068	0 %	80 %	0 %	20 %	384183405
29	NC_017201	CTCTC	2	10	40873	40882	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
30	NC_017201	GTTGA	2	10	43422	43431	20 %	40 %	40 %	0 %	384183414
31	NC_017201	AAAGA	2	10	45034	45043	80 %	0 %	20 %	0 %	384183414
32	NC_017201	AGAAT	2	10	45280	45289	60 %	20 %	20 %	0 %	384183414
33	NC_017201	GTAAA	2	10	47486	47495	60 %	20 %	20 %	0 %	384183415
34	NC_017201	GTACT	2	10	48921	48930	20 %	40 %	20 %	20 %	384183416
35	NC_017201	TCTTT	2	10	48990	48999	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_017201	AAATT	2	10	50756	50765	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017201	ATGCA	2	10	51827	51836	40 %	20 %	20 %	20 %	384183419
38	NC_017201	TACAT	2	10	52256	52265	40 %	40 %	0 %	20 %	384183419
39	NC_017201	TTGTC	2	10	52460	52469	0 %	60 %	20 %	20 %	384183419
40	NC_017201	TTCTT	2	10	53469	53478	0 %	80 %	0 %	20 %	384183419
41	NC_017201	TAAAA	2	10	53488	53497	80 %	20 %	0 %	0 %	384183419
42	NC_017201	ATCTT	2	10	54982	54991	20 %	60 %	0 %	20 %	384183420
43	NC_017201	TAAAA	2	10	56398	56407	80 %	20 %	0 %	0 %	384183421
44	NC_017201	ATATT	2	10	56829	56838	40 %	60 %	0 %	0 %	384183421
45	NC_017201	ATTTT	2	10	57685	57694	20 %	80 %	0 %	0 %	384183423
46	NC_017201	AACCA	2	10	58914	58923	60 %	0 %	0 %	40 %	384183425
47	NC_017201	CAATC	2	10	58929	58938	40 %	20 %	0 %	40 %	384183425
48	NC_017201	CTTTA	2	10	59044	59053	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_017201	AGTTC	2	10	61498	61507	20 %	40 %	20 %	20 %	384183428
50	NC_017201	TCACA	2	10	62572	62581	40 %	20 %	0 %	40 %	384183428
51	NC_017201	ATCAA	2	10	63086	63095	60 %	20 %	0 %	20 %	384183429
52	NC_017201	TTGAA	2	10	63716	63725	40 %	40 %	20 %	0 %	384183429
53	NC_017201	CTTTT	2	10	64234	64243	0 %	80 %	0 %	20 %	384183430
54	NC_017201	AATTT	2	10	64354	64363	40 %	60 %	0 %	0 %	384183430
55	NC_017201	GAAAG	2	10	65287	65296	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017201	AAATG	2	10	66681	66690	60 %	20 %	20 %	0 %	384183434
57	NC_017201	TTTTA	2	10	67586	67595	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017201	ATTTG	2	10	67719	67728	20 %	60 %	20 %	0 %	384183436
59	NC_017201	ATTTA	2	10	69957	69966	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017201	ATTGT	2	10	69995	70004	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017201	CTTTT	2	10	73258	73267	0 %	80 %	0 %	20 %	384183443
62	NC_017201	AAATT	2	10	74259	74268	60 %	40 %	0 %	0 %	384183443
63	NC_017201	TGTAC	2	10	74649	74658	20 %	40 %	20 %	20 %	384183443
64	NC_017201	GCAAA	2	10	74727	74736	60 %	0 %	20 %	20 %	384183443
65	NC_017201	AAAGC	2	10	75078	75087	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
66	NC_017201	ATTCA	2	10	75187	75196	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_017201	ATACT	2	10	75787	75796	40 %	40 %	0 %	20 %	384183444
68	NC_017201	AAAAG	2	10	78858	78867	80 %	0 %	20 %	0 %	384183447
69	NC_017201	TTGAA	2	10	79728	79737	40 %	40 %	20 %	0 %	384183447
70	NC_017201	TCATT	2	10	79804	79813	20 %	60 %	0 %	20 %	384183447
71	NC_017201	GGTTT	2	10	83059	83068	0 %	60 %	40 %	0 %	384183449
72	NC_017201	TTCTT	2	10	83499	83508	0 %	80 %	0 %	20 %	384183449
73	NC_017201	TTTTA	2	10	84017	84026	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017201	ATTTT	2	10	85184	85193	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017201	AATTT	2	10	87016	87025	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017201	CAATC	2	10	87091	87100	40 %	20 %	0 %	40 %	384183452
77	NC_017201	TTTTC	2	10	87186	87195	0 %	80 %	0 %	20 %	384183452
78	NC_017201	TAAAG	2	10	88040	88049	60 %	20 %	20 %	0 %	384183453
79	NC_017201	TTAAA	2	10	88093	88102	60 %	40 %	0 %	0 %	384183453
80	NC_017201	ATTAC	2	10	88680	88689	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NC_017201	ACTCC	2	10	89381	89390	20 %	20 %	0 %	60 %	384183455
82	NC_017201	CATCT	2	10	89470	89479	20 %	40 %	0 %	40 %	384183455
83	NC_017201	TTCAA	2	10	89749	89758	40 %	40 %	0 %	20 %	384183456
84	NC_017201	ATTCC	2	10	92704	92713	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
85	NC_017201	TTGTT	2	10	93756	93765	0 %	80 %	20 %	0 %	384183464
86	NC_017201	ACAAT	2	10	94542	94551	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
87	NC_017201	ATAAA	2	10	95594	95603	80 %	20 %	0 %	0 %	384183468
88	NC_017201	TCTCC	2	10	97266	97275	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
89	NC_017201	CTTAT	2	10	97394	97403	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
90	NC_017201	GAAAA	2	10	97965	97974	80 %	0 %	20 %	0 %	384183470
91	NC_017201	CATTA	2	10	98563	98572	40 %	40 %	0 %	20 %	384183470
92	NC_017201	AAATT	2	10	98739	98748	60 %	40 %	0 %	0 %	384183471
93	NC_017201	TGTAA	2	10	99873	99882	40 %	40 %	20 %	0 %	384183472
94	NC_017201	CTTTT	2	10	101984	101993	0 %	80 %	0 %	20 %	384183473
95	NC_017201	TAAAT	2	10	103409	103418	60 %	40 %	0 %	0 %	384183473
96	NC_017201	ATTTC	2	10	103553	103562	20 %	60 %	0 %	20 %	384183474
97	NC_017201	AGTTT	2	10	103967	103976	20 %	60 %	20 %	0 %	384183474
98	NC_017201	TACCT	2	10	104960	104969	20 %	40 %	0 %	40 %	384183475
99	NC_017201	TTATT	2	10	106003	106012	20 %	80 %	0 %	0 %	384183475
100	NC_017201	ACTAA	2	10	106553	106562	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
101	NC_017201	TTAAG	2	10	109028	109037	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017201	GATTT	2	10	109613	109622	20 %	60 %	20 %	0 %	384183479
103	NC_017201	TGAGT	2	10	110421	110430	20 %	40 %	40 %	0 %	384183479
104	NC_017201	GCTTT	2	10	110929	110938	0 %	60 %	20 %	20 %	384183479
105	NC_017201	ATTGT	2	10	113205	113214	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017201	TACAA	2	10	114073	114082	60 %	20 %	0 %	20 %	384183480
107	NC_017201	TGAAA	2	10	115216	115225	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017201	GTTTT	2	10	117155	117164	0 %	80 %	20 %	0 %	384183482
109	NC_017201	ATTTA	2	10	117287	117296	40 %	60 %	0 %	0 %	384183482
110	NC_017201	CATTG	2	10	117659	117668	20 %	40 %	20 %	20 %	384183483
111	NC_017201	TCCCC	2	10	119045	119054	0 %	20 %	0 %	80 %	384183483
112	NC_017201	AACAT	2	10	119367	119376	60 %	20 %	0 %	20 %	384183483
113	NC_017201	AGTAT	2	10	120026	120035	40 %	40 %	20 %	0 %	384183483
114	NC_017201	TGGAA	2	10	122096	122105	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017201	ATGAA	2	10	122146	122155	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017201	CTTTC	2	10	123202	123211	0 %	60 %	0 %	40 %	384183485
117	NC_017201	CGAAA	2	10	124307	124316	60 %	0 %	20 %	20 %	384183487
118	NC_017201	GATTT	2	10	124784	124793	20 %	60 %	20 %	0 %	384183487
119	NC_017201	AAGAA	2	10	125080	125089	80 %	0 %	20 %	0 %	384183487
120	NC_017201	TCTAC	2	10	125309	125318	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
121	NC_017201	TTTGT	2	10	126121	126130	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017201	AAAAG	2	10	126793	126802	80 %	0 %	20 %	0 %	384183490
123	NC_017201	AAGAG	2	10	127039	127048	60 %	0 %	40 %	0 %	384183491
124	NC_017201	ATTCT	2	10	127408	127417	20 %	60 %	0 %	20 %	384183491
125	NC_017201	ATGTA	2	10	127701	127710	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017201	AATTT	2	10	131665	131674	40 %	60 %	0 %	0 %	384183495
127	NC_017201	TGGTT	2	10	132066	132075	0 %	60 %	40 %	0 %	384183496
128	NC_017201	TAGAA	2	10	133336	133345	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017201	TGTAT	2	10	133761	133770	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017201	AAAAT	2	10	135147	135156	80 %	20 %	0 %	0 %	384183499
131	NC_017201	GAATG	2	10	136290	136299	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017201	AAGAA	2	10	140311	140320	80 %	0 %	20 %	0 %	384183506
133	NC_017201	AGAAA	2	10	140821	140830	80 %	0 %	20 %	0 %	384183507
134	NC_017201	TCTTT	2	10	140982	140991	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_017201	ATTTT	2	10	141410	141419	20 %	80 %	0 %	0 %	384183508
136	NC_017201	ATGGG	2	10	142970	142979	20 %	20 %	60 %	0 %	384183512
137	NC_017201	CAAAA	2	10	143290	143299	80 %	0 %	0 %	20 %	384183513
138	NC_017201	GTATC	2	10	143307	143316	20 %	40 %	20 %	20 %	384183513
139	NC_017201	TTAAA	2	10	143534	143543	60 %	40 %	0 %	0 %	384183513
140	NC_017201	AAAAT	2	10	143555	143564	80 %	20 %	0 %	0 %	384183513
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.