MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Bacillus amyloliquefaciens XH7 chromosome

Total Repeats: 1406

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017191	AAAAGA	2	12	4197	4208	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384166628
2	NC_017191	TGAAGA	2	12	8494	8505	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384166631
3	NC_017191	TTTGAA	2	12	12614	12625	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017191	ACGAAT	2	12	17892	17903	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384166638
5	NC_017191	TTCGGC	2	12	19804	19815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384166641
6	NC_017191	GAAGGT	2	12	24139	24150	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	384166646
7	NC_017191	TTAAAT	2	12	24645	24656	50 %	50 %	0 %	0 %	384166646
8	NC_017191	GAAAAA	2	12	43272	43283	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384166665
9	NC_017191	TTGTCG	2	12	44087	44098	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	384166666
10	NC_017191	AGCGGA	2	12	50531	50542	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	384166674
11	NC_017191	TTGCCA	2	12	53941	53952	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384166678
12	NC_017191	ATTGTT	2	12	54531	54542	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384166679
13	NC_017191	GAATCG	2	12	56146	56157	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384166681
14	NC_017191	TGTTAG	2	12	57603	57614	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	384166683
15	NC_017191	GTGAGA	2	12	68410	68421	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	384166692
16	NC_017191	ATCTGA	2	12	71301	71312	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384166695
17	NC_017191	AGCTGC	2	12	72140	72151	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384166695
18	NC_017191	TGTCGG	2	12	73881	73892	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	384166697
19	NC_017191	AACACC	2	12	75278	75289	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_017191	GACGGA	2	12	79586	79597	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	384166702
21	NC_017191	AGGATC	2	12	83256	83267	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384166707
22	NC_017191	GGAAAA	2	12	85106	85117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384166710
23	NC_017191	AGTCAA	2	12	91729	91740	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_017191	TGGCAC	2	12	93920	93931	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384166714
25	NC_017191	GTGAAG	2	12	93998	94009	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	384166714
26	NC_017191	GCAAAA	2	12	96121	96132	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	384166714
27	NC_017191	TGCCGA	2	12	98699	98710	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384166716
28	NC_017191	ATGAAA	2	12	104476	104487	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384166723
29	NC_017191	CATTTA	2	12	109090	109101	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384166731
30	NC_017191	TCTGGT	2	12	109155	109166	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	384166731
31	NC_017191	GAAGCT	2	12	109672	109683	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384166732
32	NC_017191	CTTGCA	2	12	110817	110828	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384166733
33	NC_017191	CTGTAG	2	12	111024	111035	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384166734
34	NC_017191	ACACAA	2	12	113539	113550	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384166736
35	NC_017191	AACGAA	2	12	118454	118465	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	384166737
36	NC_017191	AATCAC	2	12	121154	121165	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	384166740
37	NC_017191	AGTTGA	2	12	121241	121252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384166740
38	NC_017191	AAACAG	2	12	121318	121329	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	384166740
39	NC_017191	TAAAGG	2	12	126367	126378	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384166744
40	NC_017191	GTCGGT	2	12	132988	132999	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	384166756
41	NC_017191	AATAAA	2	12	134367	134378	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384166759
42	NC_017191	CATTAA	2	12	136520	136531	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384166762
43	NC_017191	GAAAAG	2	12	138219	138230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384166764
44	NC_017191	AAACAA	2	12	138260	138271	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	384166764
45	NC_017191	AAAAAG	2	12	139988	139999	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384166766
46	NC_017191	TTAACT	2	12	144785	144796	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_017191	CGGTTG	2	12	145229	145240	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	384166772
48	NC_017191	AATGGC	2	12	146150	146161	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384166774
49	NC_017191	ATTTTT	2	12	149521	149532	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	384166778
50	NC_017191	TTATTT	2	12	156223	156234	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017191	GGTTTT	2	12	165857	165868	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384166784
52	NC_017191	ACGGAT	2	12	167379	167390	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384166786
53	NC_017191	GCTCCG	2	12	170631	170642	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384166789
54	NC_017191	TAAATA	2	12	172283	172294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384166791
55	NC_017191	TCTGAT	2	12	172303	172314	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384166791
56	NC_017191	ATCGTC	2	12	175247	175258	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384166793
57	NC_017191	GTTGAA	2	12	186164	186175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384166804
58	NC_017191	TGTTGA	2	12	186379	186390	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	384166804
59	NC_017191	AGACAA	2	12	187045	187056	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	384166804
60	NC_017191	TGGCTG	2	12	189786	189797	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	384166808
61	NC_017191	GAAATG	2	12	190298	190309	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384166808
62	NC_017191	AGATGA	2	12	191428	191439	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384166809
63	NC_017191	GAAAAT	2	12	192949	192960	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384166810
64	NC_017191	AGCGAT	2	12	193396	193407	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384166810
65	NC_017191	AATTAA	2	12	194745	194756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384166810
66	NC_017191	TTAATA	2	12	195853	195864	50 %	50 %	0 %	0 %	384166810
67	NC_017191	TTTATT	2	12	198155	198166	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	384166812
68	NC_017191	GTGAAA	2	12	198243	198254	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384166812
69	NC_017191	TGCGGA	2	12	200947	200958	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384166815
70	NC_017191	TATCTT	2	12	203048	203059	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384166818
71	NC_017191	GATTTT	2	12	203618	203629	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384166818
72	NC_017191	TGTCTA	2	12	203963	203974	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384166818
73	NC_017191	TCGGCA	2	12	204226	204237	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384166818
74	NC_017191	AAACTG	2	12	206363	206374	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384166821
75	NC_017191	TGAACA	2	12	208491	208502	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384166823
76	NC_017191	CTTTTC	2	12	209249	209260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384166824
77	NC_017191	AAGCGA	2	12	214016	214027	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	384166830
78	NC_017191	GAACAT	2	12	219955	219966	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384166837
79	NC_017191	TGAGGC	2	12	221317	221328	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384166840
80	NC_017191	GAAAAA	2	12	222144	222155	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384166841
81	NC_017191	TTTTAT	2	12	224552	224563	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	384166844
82	NC_017191	AATACA	2	12	226657	226668	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	384166847
83	NC_017191	CTGCCG	2	12	227906	227917	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384166848
84	NC_017191	GAGACG	2	12	229848	229859	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	384166851
85	NC_017191	TCCACA	2	12	230566	230577	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	384166851
86	NC_017191	ATGCCG	2	12	233686	233697	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384166854
87	NC_017191	TCCACG	2	12	234277	234288	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384166854
88	NC_017191	GAGGAT	2	12	236172	236183	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	384166856
89	NC_017191	TTTTAG	2	12	240803	240814	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384166861
90	NC_017191	GCGGAA	2	12	244586	244597	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	384166869
91	NC_017191	CGTTTG	2	12	245742	245753	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	384166871
92	NC_017191	AGCGGG	2	12	246462	246473	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	384166871
93	NC_017191	CAGGAT	2	12	251655	251666	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384166877
94	NC_017191	CCTGAA	2	12	257100	257111	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384166882
95	NC_017191	CGGCAG	2	12	257705	257716	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384166882
96	NC_017191	TGAGAT	2	12	260225	260236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384166885
97	NC_017191	ATGAGC	2	12	262883	262894	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384166887
98	NC_017191	TTTTCA	2	12	262905	262916	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384166887
99	NC_017191	TCATTG	2	12	265007	265018	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384166890
100	NC_017191	GAAGAG	2	12	265372	265383	50 %	0 %	50 %	0 %	384166890
101	NC_017191	CCACAG	2	12	265407	265418	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	384166890
102	NC_017191	TTCTGC	2	12	267412	267423	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	384166892
103	NC_017191	TCAAAG	2	12	267581	267592	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384166893
104	NC_017191	TGATTT	2	12	269538	269549	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384166896
105	NC_017191	GAAGCG	2	12	269764	269775	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	384166896
106	NC_017191	ATCGGA	2	12	270900	270911	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384166898
107	NC_017191	AAAATC	2	12	273139	273150	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	384166900
108	NC_017191	CTGTCA	2	12	273922	273933	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384166900
109	NC_017191	CATTGA	2	12	274061	274072	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384166900
110	NC_017191	TAAAAA	2	12	276018	276029	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384166902
111	NC_017191	AGAGTG	2	12	281762	281773	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	384166907
112	NC_017191	TTGCCG	2	12	282023	282034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384166907
113	NC_017191	GGAAAA	2	12	286774	286785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384166912
114	NC_017191	AGGATG	2	12	290373	290384	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	384166916
115	NC_017191	AGAATG	2	12	290528	290539	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384166916
116	NC_017191	ATTGAT	2	12	293525	293536	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384166919
117	NC_017191	AGCGAC	2	12	295274	295285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384166921
118	NC_017191	GATCTC	2	12	296454	296465	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384166922
119	NC_017191	GATAAA	2	12	300289	300300	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017191	TATTGA	2	12	301696	301707	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017191	GTCGAG	2	12	307985	307996	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384166931
122	NC_017191	TTTGAG	2	12	308426	308437	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	384166931
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142	NC_017191	CGGAAA	2	12	376965	376976	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	384166987
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145	NC_017191	ATTCGG	2	12	383916	383927	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384166994
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156	NC_017191	AGGAGC	2	12	422268	422279	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
157	NC_017191	CCATTG	2	12	423038	423049	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384167035
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180	NC_017191	GCAAGA	2	12	493660	493671	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	384167120
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214	NC_017191	TGGATC	2	12	589153	589164	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384167222
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220	NC_017191	TTCTTG	2	12	599861	599872	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	384167233
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232	NC_017191	CTTTCT	2	12	615910	615921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
233	NC_017191	GCGGGT	2	12	621362	621373	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	384167256
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260	NC_017191	GGCTCA	2	12	695455	695466	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384167329
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345	NC_017191	AAAAAG	2	12	923725	923736	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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347	NC_017191	CAGCTG	2	12	938218	938229	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384167572
348	NC_017191	TATCGG	2	12	941242	941253	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384167575
349	NC_017191	ATGACA	2	12	943361	943372	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384167577
350	NC_017191	TTTCGA	2	12	944491	944502	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384167578
351	NC_017191	CGCCTC	2	12	946000	946011	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	384167581
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354	NC_017191	GCTGGA	2	12	950872	950883	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384167585
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361	NC_017191	AAAGCG	2	12	970260	970271	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	384167608
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370	NC_017191	TCTTTT	2	12	994326	994337	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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381	NC_017191	CCCGAT	2	12	1030510	1030521	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384167672
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457	NC_017191	AAATTT	2	12	1249102	1249113	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
458	NC_017191	AATAAA	2	12	1249971	1249982	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384167914
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