MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bacillus amyloliquefaciens LL3 chromosome

Total Repeats: 85934

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_017190	GAA	2	6	146197	146202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384162546
3002	NC_017190	CGG	2	6	146235	146240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384162546
3003	NC_017190	TAAAT	2	10	146277	146286	60 %	40 %	0 %	0 %	384162546
3004	NC_017190	GAAA	2	8	146346	146353	75 %	0 %	25 %	0 %	384162546
3005	NC_017190	GCA	2	6	146558	146563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384162547
3006	NC_017190	CTA	2	6	146584	146589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384162547
3007	NC_017190	GCA	2	6	146608	146613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384162547
3008	NC_017190	AGC	2	6	146621	146626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384162547
3009	NC_017190	A	6	6	146661	146666	100 %	0 %	0 %	0 %	384162547
3010	NC_017190	GAG	2	6	146706	146711	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384162547
3011	NC_017190	A	6	6	146757	146762	100 %	0 %	0 %	0 %	384162547
3012	NC_017190	GCG	2	6	146848	146853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384162547
3013	NC_017190	TCA	2	6	146981	146986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384162547
3014	NC_017190	GGA	2	6	147026	147031	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384162547
3015	NC_017190	CGC	2	6	147032	147037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384162547
3016	NC_017190	CGA	2	6	147047	147052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384162547
3017	NC_017190	GAT	2	6	147053	147058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384162547
3018	NC_017190	TTTG	2	8	147104	147111	0 %	75 %	25 %	0 %	384162547
3019	NC_017190	GCC	2	6	147231	147236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384162547
3020	NC_017190	CTTT	2	8	147250	147257	0 %	75 %	0 %	25 %	384162547
3021	NC_017190	AGG	2	6	147259	147264	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384162547
3022	NC_017190	ATG	2	6	147275	147280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384162547
3023	NC_017190	ATC	2	6	147313	147318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384162548
3024	NC_017190	TGTA	2	8	147370	147377	25 %	50 %	25 %	0 %	384162548
3025	NC_017190	T	7	7	147381	147387	0 %	100 %	0 %	0 %	384162548
3026	NC_017190	AAC	2	6	147392	147397	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384162548
3027	NC_017190	GTTT	2	8	147420	147427	0 %	75 %	25 %	0 %	384162548
3028	NC_017190	TC	4	8	147612	147619	0 %	50 %	0 %	50 %	384162548
3029	NC_017190	CGTTT	2	10	147620	147629	0 %	60 %	20 %	20 %	384162548
3030	NC_017190	GAC	2	6	147643	147648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384162548
3031	NC_017190	GCT	2	6	147649	147654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384162548
3032	NC_017190	ATGGA	2	10	147687	147696	40 %	20 %	40 %	0 %	384162548
3033	NC_017190	TGA	2	6	147750	147755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384162548
3034	NC_017190	GCT	2	6	147883	147888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384162548
3035	NC_017190	TCA	2	6	148029	148034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384162548
3036	NC_017190	TAT	2	6	148047	148052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384162548
3037	NC_017190	AAG	2	6	148063	148068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384162548
3038	NC_017190	TGC	2	6	148076	148081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3039	NC_017190	ATTT	2	8	148119	148126	25 %	75 %	0 %	0 %	384162549
3040	NC_017190	TGC	2	6	148255	148260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384162549
3041	NC_017190	TCAT	2	8	148269	148276	25 %	50 %	0 %	25 %	384162549
3042	NC_017190	CTG	2	6	148331	148336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384162549
3043	NC_017190	TGA	2	6	148339	148344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384162549
3044	NC_017190	CAG	2	6	148359	148364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384162549
3045	NC_017190	GAT	2	6	148373	148378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384162549
3046	NC_017190	TTA	2	6	148694	148699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384162549
3047	NC_017190	TGA	2	6	148726	148731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384162549
3048	NC_017190	GCACC	2	10	148776	148785	20 %	0 %	20 %	60 %	384162549
3049	NC_017190	GTAT	2	8	148884	148891	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3050	NC_017190	TTGTG	2	10	148921	148930	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
3051	NC_017190	A	6	6	148956	148961	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3052	NC_017190	AGG	2	6	148975	148980	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_017190	ACA	2	6	148994	148999	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3054	NC_017190	GTT	2	6	149039	149044	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3055	NC_017190	GCA	2	6	149048	149053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3056	NC_017190	AC	3	6	149121	149126	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3057	NC_017190	ATC	3	9	149153	149161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384162550
3058	NC_017190	A	6	6	149169	149174	100 %	0 %	0 %	0 %	384162550
3059	NC_017190	CTA	2	6	149209	149214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384162550
3060	NC_017190	GTC	2	6	149334	149339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384162550
3061	NC_017190	TTAA	2	8	149422	149429	50 %	50 %	0 %	0 %	384162550
3062	NC_017190	CGT	2	6	149476	149481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3063	NC_017190	GC	3	6	149494	149499	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3064	NC_017190	TCG	2	6	149528	149533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3065	NC_017190	TAA	2	6	149535	149540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3066	NC_017190	TTAACT	2	12	149599	149610	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3067	NC_017190	ATG	2	6	149627	149632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3068	NC_017190	GGC	2	6	149653	149658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3069	NC_017190	TGCTT	2	10	149700	149709	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
3070	NC_017190	TCT	2	6	149751	149756	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3071	NC_017190	A	6	6	149785	149790	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3072	NC_017190	TCG	2	6	149808	149813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3073	NC_017190	CTT	2	6	149864	149869	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3074	NC_017190	T	7	7	149878	149884	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3075	NC_017190	T	7	7	149888	149894	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3076	NC_017190	TTGT	2	8	149931	149938	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3077	NC_017190	CATA	2	8	149990	149997	50 %	25 %	0 %	25 %	384162551
3078	NC_017190	A	6	6	150015	150020	100 %	0 %	0 %	0 %	384162551
3079	NC_017190	CGGTTG	2	12	150043	150054	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	384162551
3080	NC_017190	A	6	6	150078	150083	100 %	0 %	0 %	0 %	384162551
3081	NC_017190	CGG	2	6	150124	150129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384162552
3082	NC_017190	AGG	2	6	150176	150181	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384162552
3083	NC_017190	GCTG	2	8	150200	150207	0 %	25 %	50 %	25 %	384162552
3084	NC_017190	GCA	2	6	150310	150315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384162552
3085	NC_017190	TTG	2	6	150382	150387	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384162552
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3087	NC_017190	A	7	7	150428	150434	100 %	0 %	0 %	0 %	384162552
3088	NC_017190	CGT	2	6	150467	150472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384162552
3089	NC_017190	AGG	2	6	150499	150504	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384162552
3090	NC_017190	ATTCC	2	10	150523	150532	20 %	40 %	0 %	40 %	384162552
3091	NC_017190	A	6	6	150561	150566	100 %	0 %	0 %	0 %	384162552
3092	NC_017190	AAT	2	6	150585	150590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384162552
3093	NC_017190	GGC	2	6	150681	150686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384162552
3094	NC_017190	ATAC	2	8	150709	150716	50 %	25 %	0 %	25 %	384162552
3095	NC_017190	AAG	2	6	150725	150730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384162552
3096	NC_017190	T	7	7	150769	150775	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3097	NC_017190	TCA	2	6	150811	150816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3098	NC_017190	GGA	2	6	150893	150898	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3099	NC_017190	CAA	2	6	150909	150914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3100	NC_017190	AATGGC	2	12	150964	150975	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384162553
3101	NC_017190	TAT	2	6	150981	150986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384162553
3102	NC_017190	GAA	2	6	151027	151032	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384162553
3103	NC_017190	TATT	2	8	151163	151170	25 %	75 %	0 %	0 %	384162553
3104	NC_017190	GGC	2	6	151172	151177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384162553
3105	NC_017190	AGG	2	6	151242	151247	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384162553
3106	NC_017190	T	7	7	151264	151270	0 %	100 %	0 %	0 %	384162553
3107	NC_017190	TTC	2	6	151303	151308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384162553
3108	NC_017190	TGG	2	6	151358	151363	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384162553
3109	NC_017190	A	6	6	151385	151390	100 %	0 %	0 %	0 %	384162553
3110	NC_017190	TTC	2	6	151422	151427	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3111	NC_017190	TTA	2	6	151441	151446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3112	NC_017190	GGGA	2	8	151462	151469	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3113	NC_017190	T	6	6	151501	151506	0 %	100 %	0 %	0 %	384162554
3114	NC_017190	ATT	2	6	151522	151527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384162554
3115	NC_017190	ATG	2	6	151554	151559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384162554
3116	NC_017190	GGC	2	6	151566	151571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384162554
3117	NC_017190	ATC	2	6	151598	151603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384162554
3118	NC_017190	CGG	2	6	151621	151626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384162554
3119	NC_017190	CGG	2	6	151633	151638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384162554
3120	NC_017190	TCA	2	6	151728	151733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384162554
3121	NC_017190	CAG	2	6	151783	151788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384162554
3122	NC_017190	ATC	2	6	151823	151828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384162554
3123	NC_017190	GCG	2	6	151893	151898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384162554
3124	NC_017190	AT	3	6	151948	151953	50 %	50 %	0 %	0 %	384162554
3125	NC_017190	AATT	2	8	151969	151976	50 %	50 %	0 %	0 %	384162554
3126	NC_017190	TGG	2	6	152052	152057	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384162554
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3246	NC_017190	TCGTG	2	10	156797	156806	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3247	NC_017190	GGA	2	6	156900	156905	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3248	NC_017190	ATC	2	6	156924	156929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3250	NC_017190	AC	3	6	157120	157125	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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3252	NC_017190	AGCC	2	8	157183	157190	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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