MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bacillus amyloliquefaciens LL3 chromosome

Total Repeats: 85934

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_017190	ATA	2	6	239394	239399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5002	NC_017190	TGAA	2	8	239455	239462	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_017190	AGA	2	6	239463	239468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_017190	GCAA	2	8	239472	239479	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5005	NC_017190	TTC	2	6	239482	239487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5006	NC_017190	ATC	2	6	239491	239496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5007	NC_017190	GCA	2	6	239551	239556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384162641
5008	NC_017190	GAAA	2	8	239590	239597	75 %	0 %	25 %	0 %	384162641
5009	NC_017190	TCA	2	6	239639	239644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384162641
5010	NC_017190	TTTTAG	2	12	239652	239663	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384162641
5011	NC_017190	TAAA	2	8	239727	239734	75 %	25 %	0 %	0 %	384162641
5012	NC_017190	CGTTT	2	10	239764	239773	0 %	60 %	20 %	20 %	384162641
5013	NC_017190	AG	3	6	239799	239804	50 %	0 %	50 %	0 %	384162641
5014	NC_017190	GAT	2	6	239836	239841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384162641
5015	NC_017190	GAT	2	6	239884	239889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384162641
5016	NC_017190	GAT	2	6	239930	239935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384162641
5017	NC_017190	ATG	2	6	239951	239956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384162641
5018	NC_017190	GAAA	2	8	239968	239975	75 %	0 %	25 %	0 %	384162641
5019	NC_017190	A	6	6	239973	239978	100 %	0 %	0 %	0 %	384162641
5020	NC_017190	CG	3	6	239994	239999	0 %	0 %	50 %	50 %	384162641
5021	NC_017190	A	7	7	240071	240077	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_017190	CAT	2	6	240089	240094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5023	NC_017190	TGA	2	6	240184	240189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5024	NC_017190	ATC	2	6	240242	240247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5025	NC_017190	GTGG	2	8	240259	240266	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
5026	NC_017190	CAT	2	6	240280	240285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5027	NC_017190	CGT	2	6	240316	240321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5028	NC_017190	AT	3	6	240406	240411	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5029	NC_017190	TGA	2	6	240418	240423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_017190	G	6	6	240464	240469	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_017190	A	6	6	240555	240560	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5032	NC_017190	CAT	2	6	240580	240585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5033	NC_017190	AAG	2	6	240606	240611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5034	NC_017190	TGAT	2	8	240654	240661	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5035	NC_017190	TGC	2	6	240769	240774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5036	NC_017190	CGG	2	6	240778	240783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5037	NC_017190	CCG	2	6	240831	240836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5038	NC_017190	ATG	2	6	240847	240852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5039	NC_017190	CT	3	6	240885	240890	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5040	NC_017190	GCT	2	6	240929	240934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5041	NC_017190	GA	3	6	240947	240952	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_017190	GATT	2	8	240957	240964	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_017190	GAA	2	6	240985	240990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_017190	ACAT	2	8	241000	241007	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5045	NC_017190	GCA	2	6	241054	241059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5046	NC_017190	CAT	2	6	241060	241065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5047	NC_017190	ATA	2	6	241066	241071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5048	NC_017190	TTG	2	6	241109	241114	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384162642
5049	NC_017190	TGGTG	2	10	241132	241141	0 %	40 %	60 %	0 %	384162642
5050	NC_017190	ATT	2	6	241165	241170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384162642
5051	NC_017190	CGC	2	6	241243	241248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384162642
5052	NC_017190	TATT	2	8	241290	241297	25 %	75 %	0 %	0 %	384162642
5053	NC_017190	TCC	2	6	241308	241313	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384162642
5054	NC_017190	GCT	2	6	241322	241327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384162642
5055	NC_017190	CAT	2	6	241546	241551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5056	NC_017190	GCAAA	2	10	241565	241574	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
5057	NC_017190	A	7	7	241572	241578	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5058	NC_017190	TGA	2	6	241622	241627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5059	NC_017190	AGG	2	6	241657	241662	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5060	NC_017190	TGA	2	6	241667	241672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384162643
5061	NC_017190	CATT	2	8	241690	241697	25 %	50 %	0 %	25 %	384162643
5062	NC_017190	TTA	2	6	241715	241720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384162643
5063	NC_017190	AGA	2	6	241854	241859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384162643
5064	NC_017190	CTT	2	6	241897	241902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384162643
5065	NC_017190	GA	3	6	241929	241934	50 %	0 %	50 %	0 %	384162643
5066	NC_017190	GAA	2	6	241963	241968	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384162643
5067	NC_017190	T	6	6	242081	242086	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5068	NC_017190	ATAAA	2	10	242111	242120	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5069	NC_017190	AGAA	2	8	242121	242128	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5070	NC_017190	GTT	2	6	242214	242219	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5071	NC_017190	GCA	2	6	242293	242298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5072	NC_017190	AAATC	2	10	242326	242335	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
5073	NC_017190	ACC	2	6	242386	242391	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5074	NC_017190	TCA	2	6	242398	242403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5075	NC_017190	GAT	2	6	242421	242426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384162644
5076	NC_017190	A	6	6	242465	242470	100 %	0 %	0 %	0 %	384162644
5077	NC_017190	A	7	7	242478	242484	100 %	0 %	0 %	0 %	384162644
5078	NC_017190	A	6	6	242486	242491	100 %	0 %	0 %	0 %	384162644
5079	NC_017190	GAA	2	6	242595	242600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384162644
5080	NC_017190	GAAA	2	8	242667	242674	75 %	0 %	25 %	0 %	384162645
5081	NC_017190	ACAAA	2	10	242679	242688	80 %	0 %	0 %	20 %	384162645
5082	NC_017190	A	6	6	242686	242691	100 %	0 %	0 %	0 %	384162645
5083	NC_017190	A	6	6	242700	242705	100 %	0 %	0 %	0 %	384162645
5084	NC_017190	CAT	2	6	242706	242711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384162645
5085	NC_017190	T	6	6	242744	242749	0 %	100 %	0 %	0 %	384162645
5086	NC_017190	A	6	6	242772	242777	100 %	0 %	0 %	0 %	384162645
5087	NC_017190	TCA	2	6	242800	242805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384162646
5088	NC_017190	GATA	2	8	242806	242813	50 %	25 %	25 %	0 %	384162646
5089	NC_017190	ATG	3	9	242838	242846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384162646
5090	NC_017190	TCC	2	6	242876	242881	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384162646
5091	NC_017190	ACA	2	6	242919	242924	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384162646
5092	NC_017190	CGC	2	6	242951	242956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384162646
5093	NC_017190	GCA	2	6	242977	242982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384162646
5094	NC_017190	TCA	2	6	243028	243033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384162646
5095	NC_017190	GCA	2	6	243034	243039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384162646
5096	NC_017190	AAT	2	6	243086	243091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384162646
5097	NC_017190	TCC	2	6	243150	243155	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5098	NC_017190	TCA	2	6	243183	243188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384162647
5099	NC_017190	T	7	7	243204	243210	0 %	100 %	0 %	0 %	384162647
5100	NC_017190	TGTC	2	8	243235	243242	0 %	50 %	25 %	25 %	384162647
5101	NC_017190	ATG	2	6	243264	243269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384162647
5102	NC_017190	ATG	2	6	243294	243299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384162647
5103	NC_017190	GCT	2	6	243344	243349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384162648
5104	NC_017190	GCGGAA	2	12	243354	243365	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	384162648
5105	NC_017190	TGC	2	6	243385	243390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384162648
5106	NC_017190	AATC	2	8	243407	243414	50 %	25 %	0 %	25 %	384162648
5107	NC_017190	CG	3	6	243523	243528	0 %	0 %	50 %	50 %	384162648
5108	NC_017190	CCG	2	6	243548	243553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384162648
5109	NC_017190	GCC	2	6	243608	243613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384162648
5110	NC_017190	CCG	2	6	243624	243629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384162648
5111	NC_017190	T	7	7	243758	243764	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5112	NC_017190	GAA	2	6	243775	243780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5113	NC_017190	CCG	2	6	243885	243890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5114	NC_017190	T	6	6	243945	243950	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5115	NC_017190	GAA	2	6	243971	243976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5116	NC_017190	TGACA	2	10	243985	243994	40 %	20 %	20 %	20 %	384162649
5117	NC_017190	CCG	2	6	244063	244068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384162649
5118	NC_017190	GGC	2	6	244265	244270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384162649
5119	NC_017190	TGA	2	6	244312	244317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384162649
5120	NC_017190	CGTTTG	2	12	244509	244520	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	384162649
5121	NC_017190	CAG	2	6	244529	244534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384162649
5122	NC_017190	TAT	2	6	244547	244552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384162649
5123	NC_017190	GAAT	2	8	244630	244637	50 %	25 %	25 %	0 %	384162649
5124	NC_017190	CAG	2	6	244669	244674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384162649
5125	NC_017190	GCC	2	6	244745	244750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384162649
5126	NC_017190	CGC	2	6	244753	244758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384162649
5127	NC_017190	TTA	2	6	244879	244884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384162649
5128	NC_017190	TGA	2	6	245041	245046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384162649
5129	NC_017190	GA	3	6	245050	245055	50 %	0 %	50 %	0 %	384162649
5130	NC_017190	GCC	2	6	245111	245116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384162649
5131	NC_017190	GCA	2	6	245143	245148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384162649
5132	NC_017190	AAC	2	6	245176	245181	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384162649
5133	NC_017190	AGCGGG	2	12	245229	245240	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	384162649
5134	NC_017190	TCA	2	6	245241	245246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384162649
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5138	NC_017190	T	6	6	245459	245464	0 %	100 %	0 %	0 %	384162649
5139	NC_017190	CGCC	2	8	245499	245506	0 %	0 %	25 %	75 %	384162649
5140	NC_017190	GTG	2	6	245528	245533	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384162649
5141	NC_017190	CTTC	2	8	245574	245581	0 %	50 %	0 %	50 %	384162649
5142	NC_017190	TC	3	6	245616	245621	0 %	50 %	0 %	50 %	384162649
5143	NC_017190	TTC	2	6	245675	245680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384162649
5144	NC_017190	GAAA	2	8	245712	245719	75 %	0 %	25 %	0 %	384162649
5145	NC_017190	TCA	2	6	245805	245810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384162650
5146	NC_017190	GCCG	2	8	245849	245856	0 %	0 %	50 %	50 %	384162650
5147	NC_017190	GCT	2	6	245860	245865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384162650
5148	NC_017190	CTT	2	6	245987	245992	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5149	NC_017190	AGG	2	6	246000	246005	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5150	NC_017190	A	6	6	246020	246025	100 %	0 %	0 %	0 %	384162651
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5152	NC_017190	CTG	2	6	246112	246117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384162651
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5154	NC_017190	ATG	2	6	246206	246211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384162651
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5157	NC_017190	GCTTT	2	10	246311	246320	0 %	60 %	20 %	20 %	384162651
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5164	NC_017190	CGC	2	6	246615	246620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384162651
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5172	NC_017190	GAT	2	6	246945	246950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384162652
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5177	NC_017190	TTCA	2	8	247117	247124	25 %	50 %	0 %	25 %	384162652
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5182	NC_017190	T	6	6	247372	247377	0 %	100 %	0 %	0 %	384162652
5183	NC_017190	A	6	6	247385	247390	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5184	NC_017190	CTTTT	2	10	247396	247405	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
5185	NC_017190	AT	3	6	247426	247431	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5186	NC_017190	GCT	2	6	247523	247528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384162653
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5194	NC_017190	GAA	2	6	247840	247845	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384162653
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5203	NC_017190	GGC	2	6	248271	248276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384162653
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5211	NC_017190	GC	3	6	248569	248574	0 %	0 %	50 %	50 %	384162653
5212	NC_017190	TA	3	6	248577	248582	50 %	50 %	0 %	0 %	384162653
5213	NC_017190	A	6	6	248582	248587	100 %	0 %	0 %	0 %	384162653
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5215	NC_017190	CTG	2	6	248607	248612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5220	NC_017190	TCCG	2	8	248861	248868	0 %	25 %	25 %	50 %	384162654
5221	NC_017190	CGG	2	6	248879	248884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384162654
5222	NC_017190	CGTT	2	8	248899	248906	0 %	50 %	25 %	25 %	384162654
5223	NC_017190	CAT	2	6	248915	248920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384162654
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5231	NC_017190	TCA	2	6	249271	249276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384162654
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5236	NC_017190	CAAGA	2	10	249512	249521	60 %	0 %	20 %	20 %	384162654
5237	NC_017190	ATG	2	6	249609	249614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384162654
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5240	NC_017190	GCA	3	9	249691	249699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384162654
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5242	NC_017190	TCG	2	6	249817	249822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384162654
5243	NC_017190	GCA	3	9	249832	249840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384162654
5244	NC_017190	CGT	2	6	249884	249889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384162654
5245	NC_017190	TCA	2	6	249928	249933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384162654
5246	NC_017190	GTCA	2	8	249935	249942	25 %	25 %	25 %	25 %	384162654
5247	NC_017190	CT	3	6	250062	250067	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5248	NC_017190	TC	3	6	250083	250088	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5249	NC_017190	GAT	2	6	250133	250138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384162655
5250	NC_017190	T	6	6	250151	250156	0 %	100 %	0 %	0 %	384162655
5251	NC_017190	ATG	2	6	250170	250175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384162655
5252	NC_017190	CCG	2	6	250213	250218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384162655
5253	NC_017190	TCA	2	6	250224	250229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384162655
5254	NC_017190	CTG	2	6	250298	250303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384162655
5255	NC_017190	CTT	2	6	250314	250319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384162655
5256	NC_017190	CAGGAT	2	12	250423	250434	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384162655
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5259	NC_017190	GCT	2	6	250504	250509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384162655
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5261	NC_017190	AAT	2	6	250565	250570	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384162655
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5263	NC_017190	TGAT	2	8	250677	250684	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5264	NC_017190	TAT	2	6	250711	250716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5265	NC_017190	ATG	2	6	250804	250809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384162656
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5268	NC_017190	TTAT	2	8	250999	251006	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5269	NC_017190	ATA	2	6	251023	251028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5270	NC_017190	T	6	6	251034	251039	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5271	NC_017190	AGG	2	6	251086	251091	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5281	NC_017190	CGG	2	6	251505	251510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384162658
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5287	NC_017190	ATA	2	6	251846	251851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5373	NC_017190	ATG	2	6	255486	255491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384162663
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