MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Bacillus megaterium WSH-002 plasmid WSH-002_p1

Total Repeats: 147

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017139	TA	3	6	90	95	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017139	AG	3	6	435	440	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017139	AT	5	10	702	711	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017139	AC	3	6	821	826	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_017139	GC	3	6	966	971	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_017139	TG	3	6	2097	2102	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017139	AT	3	6	2337	2342	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017139	TA	3	6	2386	2391	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017139	AT	3	6	2540	2545	50 %	50 %	0 %	0 %	384044107
10	NC_017139	TA	3	6	3220	3225	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017139	TA	3	6	3535	3540	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017139	AT	3	6	3630	3635	50 %	50 %	0 %	0 %	384044109
13	NC_017139	TA	3	6	3969	3974	50 %	50 %	0 %	0 %	384044109
14	NC_017139	CT	3	6	4134	4139	0 %	50 %	0 %	50 %	384044110
15	NC_017139	AT	3	6	4930	4935	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017139	AT	3	6	5857	5862	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017139	GA	3	6	6737	6742	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017139	AT	3	6	7210	7215	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017139	TA	3	6	7595	7600	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017139	AT	3	6	7619	7624	50 %	50 %	0 %	0 %	384044114
21	NC_017139	TA	3	6	8186	8191	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017139	TC	3	6	8624	8629	0 %	50 %	0 %	50 %	384044115
23	NC_017139	TC	3	6	8878	8883	0 %	50 %	0 %	50 %	384044115
24	NC_017139	TA	3	6	9078	9083	50 %	50 %	0 %	0 %	384044116
25	NC_017139	AT	3	6	9084	9089	50 %	50 %	0 %	0 %	384044116
26	NC_017139	AT	3	6	10420	10425	50 %	50 %	0 %	0 %	384044120
27	NC_017139	TA	3	6	10608	10613	50 %	50 %	0 %	0 %	384044121
28	NC_017139	AT	3	6	11315	11320	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017139	TA	3	6	11363	11368	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017139	CT	4	8	11380	11387	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_017139	TA	3	6	11447	11452	50 %	50 %	0 %	0 %	384044123
32	NC_017139	AC	3	6	12184	12189	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_017139	AT	3	6	13322	13327	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017139	TA	4	8	13537	13544	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017139	TA	3	6	13822	13827	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017139	TA	3	6	14356	14361	50 %	50 %	0 %	0 %	384044125
37	NC_017139	AT	3	6	14660	14665	50 %	50 %	0 %	0 %	384044125
38	NC_017139	TA	3	6	14834	14839	50 %	50 %	0 %	0 %	384044125
39	NC_017139	AC	3	6	15265	15270	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_017139	AT	3	6	17328	17333	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017139	AT	3	6	17340	17345	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017139	AG	3	6	17365	17370	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017139	TA	3	6	18351	18356	50 %	50 %	0 %	0 %	384044127
44	NC_017139	TA	3	6	18819	18824	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017139	AC	3	6	23892	23897	50 %	0 %	0 %	50 %	384044128
46	NC_017139	TA	4	8	24057	24064	50 %	50 %	0 %	0 %	384044128
47	NC_017139	AC	3	6	24564	24569	50 %	0 %	0 %	50 %	384044128
48	NC_017139	AC	3	6	26211	26216	50 %	0 %	0 %	50 %	384044128
49	NC_017139	TA	3	6	27028	27033	50 %	50 %	0 %	0 %	384044128
50	NC_017139	TA	3	6	27303	27308	50 %	50 %	0 %	0 %	384044128
51	NC_017139	AC	3	6	29700	29705	50 %	0 %	0 %	50 %	384044128
52	NC_017139	TA	3	6	30994	30999	50 %	50 %	0 %	0 %	384044129
53	NC_017139	TG	3	6	31278	31283	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017139	AT	3	6	31516	31521	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017139	AT	3	6	32174	32179	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017139	AT	4	8	32926	32933	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017139	GA	3	6	32991	32996	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017139	AT	5	10	33286	33295	50 %	50 %	0 %	0 %	384044133
59	NC_017139	TA	3	6	34415	34420	50 %	50 %	0 %	0 %	384044135
60	NC_017139	TA	4	8	34981	34988	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017139	TA	3	6	35315	35320	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017139	AT	3	6	35428	35433	50 %	50 %	0 %	0 %	384044136
63	NC_017139	CA	3	6	36189	36194	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_017139	TA	3	6	36224	36229	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017139	TA	3	6	37491	37496	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017139	AT	3	6	37601	37606	50 %	50 %	0 %	0 %	384044139
67	NC_017139	CA	3	6	37805	37810	50 %	0 %	0 %	50 %	384044139
68	NC_017139	AT	3	6	37972	37977	50 %	50 %	0 %	0 %	384044139
69	NC_017139	TC	3	6	38196	38201	0 %	50 %	0 %	50 %	384044139
70	NC_017139	AT	3	6	38271	38276	50 %	50 %	0 %	0 %	384044139
71	NC_017139	GA	3	6	38290	38295	50 %	0 %	50 %	0 %	384044139
72	NC_017139	TA	4	8	38509	38516	50 %	50 %	0 %	0 %	384044139
73	NC_017139	AT	3	6	39072	39077	50 %	50 %	0 %	0 %	384044140
74	NC_017139	AG	3	6	39192	39197	50 %	0 %	50 %	0 %	384044140
75	NC_017139	AG	3	6	39622	39627	50 %	0 %	50 %	0 %	384044140
76	NC_017139	TC	4	8	40239	40246	0 %	50 %	0 %	50 %	384044141
77	NC_017139	AT	3	6	41839	41844	50 %	50 %	0 %	0 %	384044142
78	NC_017139	CT	3	6	42416	42421	0 %	50 %	0 %	50 %	384044144
79	NC_017139	TA	3	6	42674	42679	50 %	50 %	0 %	0 %	384044144
80	NC_017139	AT	3	6	42768	42773	50 %	50 %	0 %	0 %	384044144
81	NC_017139	AT	3	6	42813	42818	50 %	50 %	0 %	0 %	384044144
82	NC_017139	AT	3	6	44131	44136	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017139	TA	3	6	44335	44340	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017139	AT	3	6	44673	44678	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017139	TA	3	6	45778	45783	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017139	AG	3	6	46285	46290	50 %	0 %	50 %	0 %	384044149
87	NC_017139	GA	3	6	46534	46539	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017139	TA	3	6	46637	46642	50 %	50 %	0 %	0 %	384044150
89	NC_017139	AC	3	6	47396	47401	50 %	0 %	0 %	50 %	384044150
90	NC_017139	TA	3	6	47825	47830	50 %	50 %	0 %	0 %	384044150
91	NC_017139	GA	3	6	48375	48380	50 %	0 %	50 %	0 %	384044152
92	NC_017139	AC	3	6	49073	49078	50 %	0 %	0 %	50 %	384044153
93	NC_017139	TG	3	6	49215	49220	0 %	50 %	50 %	0 %	384044153
94	NC_017139	AT	3	6	49307	49312	50 %	50 %	0 %	0 %	384044153
95	NC_017139	GA	3	6	50247	50252	50 %	0 %	50 %	0 %	384044154
96	NC_017139	TG	3	6	50731	50736	0 %	50 %	50 %	0 %	384044154
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99	NC_017139	AT	3	6	52305	52310	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017139	TA	3	6	52668	52673	50 %	50 %	0 %	0 %	384044157
101	NC_017139	GA	3	6	52865	52870	50 %	0 %	50 %	0 %	384044157
102	NC_017139	TA	3	6	53124	53129	50 %	50 %	0 %	0 %	384044157
103	NC_017139	TA	3	6	53193	53198	50 %	50 %	0 %	0 %	384044157
104	NC_017139	TA	3	6	54697	54702	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017139	GA	3	6	54703	54708	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017139	GA	3	6	54738	54743	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017139	TA	3	6	54978	54983	50 %	50 %	0 %	0 %	384044159
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109	NC_017139	CT	4	8	55637	55644	0 %	50 %	0 %	50 %	384044159
110	NC_017139	AT	3	6	55973	55978	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017139	GA	3	6	56074	56079	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017139	TA	3	6	56534	56539	50 %	50 %	0 %	0 %	384044160
113	NC_017139	TA	3	6	56713	56718	50 %	50 %	0 %	0 %	384044160
114	NC_017139	GA	3	6	57219	57224	50 %	0 %	50 %	0 %	384044161
115	NC_017139	TA	3	6	58018	58023	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017139	GA	3	6	58405	58410	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017139	AC	3	6	58959	58964	50 %	0 %	0 %	50 %	384044163
118	NC_017139	TC	3	6	59319	59324	0 %	50 %	0 %	50 %	384044164
119	NC_017139	TC	3	6	59508	59513	0 %	50 %	0 %	50 %	384044164
120	NC_017139	AT	3	6	61186	61191	50 %	50 %	0 %	0 %	384044165
121	NC_017139	AC	3	6	61369	61374	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_017139	GA	3	6	62579	62584	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017139	AG	3	6	62772	62777	50 %	0 %	50 %	0 %	384044167
124	NC_017139	TA	3	6	63007	63012	50 %	50 %	0 %	0 %	384044167
125	NC_017139	TA	3	6	63310	63315	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017139	TA	3	6	63691	63696	50 %	50 %	0 %	0 %	384044168
127	NC_017139	AT	3	6	64456	64461	50 %	50 %	0 %	0 %	384044168
128	NC_017139	CA	3	6	64508	64513	50 %	0 %	0 %	50 %	384044168
129	NC_017139	AG	3	6	64842	64847	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017139	GT	3	6	65197	65202	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017139	AT	4	8	65782	65789	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017139	TG	3	6	67189	67194	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017139	AT	3	6	68993	68998	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017139	AT	3	6	69331	69336	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017139	AG	3	6	69544	69549	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017139	GC	4	8	70292	70299	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
137	NC_017139	AC	3	6	70944	70949	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_017139	AC	3	6	71113	71118	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_017139	TC	3	6	71320	71325	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_017139	TC	3	6	72344	72349	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_017139	GC	3	6	72984	72989	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
142	NC_017139	GA	3	6	73187	73192	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017139	GA	3	6	73267	73272	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017139	GA	3	6	73525	73530	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017139	AC	3	6	74200	74205	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_017139	TG	3	6	74251	74256	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017139	GA	3	6	74470	74475	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.