MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bradyrhizobium sp. S23321

Total Repeats: 180391

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_017082	CGCTT	2	10	216027	216036	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
5502	NC_017082	CGG	2	6	216156	216161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383768483
5503	NC_017082	GCA	2	6	216168	216173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383768483
5504	NC_017082	CG	3	6	216185	216190	0 %	0 %	50 %	50 %	383768483
5505	NC_017082	TCA	2	6	216215	216220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383768483
5506	NC_017082	CGC	2	6	216241	216246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383768483
5507	NC_017082	GCA	2	6	216291	216296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383768483
5508	NC_017082	TCG	2	6	216314	216319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383768483
5509	NC_017082	GC	3	6	216335	216340	0 %	0 %	50 %	50 %	383768483
5510	NC_017082	GGCC	2	8	216393	216400	0 %	0 %	50 %	50 %	383768483
5511	NC_017082	ACG	2	6	216404	216409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383768483
5512	NC_017082	CAGCGA	2	12	216432	216443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383768483
5513	NC_017082	TCG	2	6	216461	216466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383768483
5514	NC_017082	GGA	2	6	216498	216503	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383768483
5515	NC_017082	GAC	2	6	216550	216555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383768483
5516	NC_017082	GTC	2	6	216565	216570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383768483
5517	NC_017082	ATG	2	6	216598	216603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383768483
5518	NC_017082	GCCG	2	8	216618	216625	0 %	0 %	50 %	50 %	383768483
5519	NC_017082	CG	3	6	216673	216678	0 %	0 %	50 %	50 %	383768483
5520	NC_017082	CGCT	2	8	216698	216705	0 %	25 %	25 %	50 %	383768483
5521	NC_017082	GCC	2	6	216706	216711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383768483
5522	NC_017082	TCG	2	6	216719	216724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383768483
5523	NC_017082	AGG	2	6	216725	216730	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383768483
5524	NC_017082	CGTC	2	8	216738	216745	0 %	25 %	25 %	50 %	383768483
5525	NC_017082	GAG	2	6	216766	216771	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383768483
5526	NC_017082	GC	3	6	216799	216804	0 %	0 %	50 %	50 %	383768483
5527	NC_017082	G	6	6	216811	216816	0 %	0 %	100 %	0 %	383768483
5528	NC_017082	CGAT	2	8	216836	216843	25 %	25 %	25 %	25 %	383768483
5529	NC_017082	GTCA	2	8	216886	216893	25 %	25 %	25 %	25 %	383768483
5530	NC_017082	CGG	2	6	216903	216908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383768483
5531	NC_017082	CGA	2	6	216945	216950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383768483
5532	NC_017082	TGA	2	6	216953	216958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383768483
5533	NC_017082	GC	3	6	216974	216979	0 %	0 %	50 %	50 %	383768483
5534	NC_017082	AG	3	6	217043	217048	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5535	NC_017082	GA	4	8	217082	217089	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5536	NC_017082	CGC	2	6	217110	217115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383768484
5537	NC_017082	GGC	3	9	217157	217165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383768484
5538	NC_017082	TTGC	2	8	217175	217182	0 %	50 %	25 %	25 %	383768484
5539	NC_017082	GCT	2	6	217207	217212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383768484
5540	NC_017082	GAT	2	6	217214	217219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383768484
5541	NC_017082	GCG	2	6	217221	217226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383768484
5542	NC_017082	CGGC	2	8	217264	217271	0 %	0 %	50 %	50 %	383768484
5543	NC_017082	CCG	2	6	217299	217304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383768484
5544	NC_017082	CGG	3	9	217312	217320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383768484
5545	NC_017082	GAT	2	6	217388	217393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383768484
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5547	NC_017082	CGA	2	6	217474	217479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383768484
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5549	NC_017082	CG	3	6	217628	217633	0 %	0 %	50 %	50 %	383768484
5550	NC_017082	TCC	2	6	217674	217679	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383768484
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5553	NC_017082	GCG	2	6	217762	217767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383768484
5554	NC_017082	CGCC	2	8	217783	217790	0 %	0 %	25 %	75 %	383768484
5555	NC_017082	GCG	2	6	217883	217888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383768484
5556	NC_017082	GCC	2	6	217889	217894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383768484
5557	NC_017082	GCG	2	6	217900	217905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383768484
5558	NC_017082	TCG	2	6	217950	217955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383768484
5559	NC_017082	TCG	2	6	217992	217997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383768484
5560	NC_017082	CGG	2	6	217999	218004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383768484
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5562	NC_017082	GAT	2	6	218063	218068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383768484
5563	NC_017082	CGGC	2	8	218069	218076	0 %	0 %	50 %	50 %	383768484
5564	NC_017082	GGGC	2	8	218085	218092	0 %	0 %	75 %	25 %	383768484
5565	NC_017082	GCC	2	6	218132	218137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5566	NC_017082	GTC	2	6	218143	218148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5567	NC_017082	CGT	2	6	218226	218231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383768485
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5569	NC_017082	CG	3	6	218280	218285	0 %	0 %	50 %	50 %	383768485
5570	NC_017082	CG	3	6	218330	218335	0 %	0 %	50 %	50 %	383768485
5571	NC_017082	CGT	2	6	218340	218345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383768485
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5578	NC_017082	GCCGT	2	10	218509	218518	0 %	20 %	40 %	40 %	383768485
5579	NC_017082	GC	3	6	218559	218564	0 %	0 %	50 %	50 %	383768485
5580	NC_017082	CG	3	6	218567	218572	0 %	0 %	50 %	50 %	383768485
5581	NC_017082	CGG	2	6	218592	218597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383768485
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5587	NC_017082	CTT	2	6	218881	218886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383768486
5588	NC_017082	ACC	2	6	218900	218905	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383768486
5589	NC_017082	CTC	2	6	218998	219003	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383768486
5590	NC_017082	CAT	2	6	219016	219021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383768486
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5593	NC_017082	GGA	2	6	219102	219107	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383768486
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5623	NC_017082	TGA	2	6	219905	219910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383768486
5624	NC_017082	TCC	2	6	219944	219949	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383768486
5625	NC_017082	GCA	2	6	219951	219956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383768486
5626	NC_017082	CCGGCA	2	12	219975	219986	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	383768486
5627	NC_017082	CCGTCA	2	12	220193	220204	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	383768486
5628	NC_017082	TGA	2	6	220218	220223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383768486
5629	NC_017082	GAC	2	6	220255	220260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383768486
5630	NC_017082	TTG	2	6	220283	220288	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383768486
5631	NC_017082	CG	3	6	220411	220416	0 %	0 %	50 %	50 %	383768486
5632	NC_017082	GAT	2	6	220453	220458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383768486
5633	NC_017082	TCT	2	6	220476	220481	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383768486
5634	NC_017082	TTC	2	6	220514	220519	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383768486
5635	NC_017082	GCG	2	6	220520	220525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383768486
5636	NC_017082	CTGC	2	8	220527	220534	0 %	25 %	25 %	50 %	383768486
5637	NC_017082	AAC	2	6	220577	220582	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383768486
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5639	NC_017082	CGT	2	6	220630	220635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383768486
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5642	NC_017082	CGG	2	6	220914	220919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383768486
5643	NC_017082	TCT	2	6	220938	220943	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383768486
5644	NC_017082	GTA	2	6	220954	220959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383768486
5645	NC_017082	TCCAG	2	10	220989	220998	20 %	20 %	20 %	40 %	383768486
5646	NC_017082	GCT	2	6	221019	221024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383768486
5647	NC_017082	TGT	2	6	221040	221045	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383768486
5648	NC_017082	GGC	2	6	221083	221088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383768486
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5650	NC_017082	GCA	2	6	221130	221135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383768486
5651	NC_017082	GC	3	6	221150	221155	0 %	0 %	50 %	50 %	383768486
5652	NC_017082	TCG	2	6	221264	221269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383768486
5653	NC_017082	GTC	2	6	221293	221298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383768486
5654	NC_017082	GGC	2	6	221302	221307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383768486
5655	NC_017082	GCC	2	6	221382	221387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5656	NC_017082	CGG	2	6	221394	221399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5657	NC_017082	CGC	2	6	221452	221457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5658	NC_017082	GCT	2	6	221461	221466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5659	NC_017082	TTG	2	6	221487	221492	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5660	NC_017082	GCC	2	6	221523	221528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383768487
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5664	NC_017082	GCAG	2	8	221676	221683	25 %	0 %	50 %	25 %	383768487
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5667	NC_017082	GGTC	2	8	221945	221952	0 %	25 %	50 %	25 %	383768487
5668	NC_017082	GC	4	8	221970	221977	0 %	0 %	50 %	50 %	383768487
5669	NC_017082	CGA	2	6	221980	221985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383768487
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5671	NC_017082	GAG	2	6	222063	222068	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383768487
5672	NC_017082	CGGA	2	8	222075	222082	25 %	0 %	50 %	25 %	383768487
5673	NC_017082	CGA	2	6	222116	222121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383768487
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5676	NC_017082	TGC	2	6	222262	222267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383768487
5677	NC_017082	CAG	2	6	222282	222287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383768487
5678	NC_017082	GC	3	6	222297	222302	0 %	0 %	50 %	50 %	383768487
5679	NC_017082	TGC	2	6	222328	222333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383768487
5680	NC_017082	TCA	2	6	222373	222378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383768487
5681	NC_017082	GC	3	6	222380	222385	0 %	0 %	50 %	50 %	383768487
5682	NC_017082	TGC	2	6	222427	222432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383768487
5683	NC_017082	ACCGG	2	10	222466	222475	20 %	0 %	40 %	40 %	383768487
5684	NC_017082	CG	3	6	222510	222515	0 %	0 %	50 %	50 %	383768487
5685	NC_017082	GGC	2	6	222534	222539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383768487
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5688	NC_017082	CGC	2	6	222575	222580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383768487
5689	NC_017082	CAT	3	9	222606	222614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383768488
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5691	NC_017082	TTG	2	6	222661	222666	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383768488
5692	NC_017082	GCG	2	6	222682	222687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383768488
5693	NC_017082	GGC	2	6	222750	222755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383768488
5694	NC_017082	GGCA	2	8	222802	222809	25 %	0 %	50 %	25 %	383768488
5695	NC_017082	CG	3	6	222825	222830	0 %	0 %	50 %	50 %	383768488
5696	NC_017082	GCA	3	9	222875	222883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383768488
5697	NC_017082	CTC	2	6	222891	222896	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383768488
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5700	NC_017082	CAGG	2	8	222966	222973	25 %	0 %	50 %	25 %	383768488
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5702	NC_017082	TGC	2	6	223060	223065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383768488
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5704	NC_017082	TCGA	2	8	223132	223139	25 %	25 %	25 %	25 %	383768488
5705	NC_017082	GCTCGC	2	12	223175	223186	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	383768488
5706	NC_017082	GCTG	2	8	223187	223194	0 %	25 %	50 %	25 %	383768488
5707	NC_017082	CG	3	6	223218	223223	0 %	0 %	50 %	50 %	383768488
5708	NC_017082	CGGC	2	8	223241	223248	0 %	0 %	50 %	50 %	383768488
5709	NC_017082	GC	3	6	223257	223262	0 %	0 %	50 %	50 %	383768488
5710	NC_017082	CG	4	8	223263	223270	0 %	0 %	50 %	50 %	383768488
5711	NC_017082	CGG	2	6	223343	223348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383768488
5712	NC_017082	GC	3	6	223355	223360	0 %	0 %	50 %	50 %	383768488
5713	NC_017082	ACG	2	6	223378	223383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383768488
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5717	NC_017082	CG	3	6	223500	223505	0 %	0 %	50 %	50 %	383768488
5718	NC_017082	CGG	2	6	223517	223522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383768488
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5720	NC_017082	TGT	2	6	223595	223600	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383768488
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5724	NC_017082	CGG	2	6	223673	223678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383768488
5725	NC_017082	ACG	2	6	223747	223752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383768488
5726	NC_017082	ACA	2	6	223808	223813	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383768488
5727	NC_017082	CTG	2	6	223866	223871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383768488
5728	NC_017082	ACAT	2	8	223903	223910	50 %	25 %	0 %	25 %	383768488
5729	NC_017082	GTT	2	6	223911	223916	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383768488
5730	NC_017082	CAG	2	6	223953	223958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383768488
5731	NC_017082	CG	3	6	223992	223997	0 %	0 %	50 %	50 %	383768488
5732	NC_017082	GCC	2	6	224022	224027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383768488
5733	NC_017082	CGAC	2	8	224069	224076	25 %	0 %	25 %	50 %	383768488
5734	NC_017082	CG	5	10	224152	224161	0 %	0 %	50 %	50 %	383768488
5735	NC_017082	ACCC	2	8	224302	224309	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
5736	NC_017082	CGC	2	6	224453	224458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383768489
5737	NC_017082	GCGCG	2	10	224493	224502	0 %	0 %	60 %	40 %	383768489
5738	NC_017082	GC	3	6	224504	224509	0 %	0 %	50 %	50 %	383768489
5739	NC_017082	CGC	2	6	224570	224575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383768489
5740	NC_017082	AGG	2	6	224608	224613	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383768489
5741	NC_017082	CAA	2	6	224687	224692	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383768489
5742	NC_017082	GAG	2	6	224823	224828	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383768489
5743	NC_017082	CCG	2	6	224925	224930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383768489
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5864	NC_017082	CGAAT	2	10	229736	229745	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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5990	NC_017082	CAC	2	6	235198	235203	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383768499
5991	NC_017082	GCC	2	6	235207	235212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383768499
5992	NC_017082	CTT	2	6	235231	235236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383768499
5993	NC_017082	TCG	2	6	235265	235270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383768499
5994	NC_017082	CGC	3	9	235294	235302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383768499
5995	NC_017082	CCGGG	2	10	235347	235356	0 %	0 %	60 %	40 %	383768499
5996	NC_017082	GAAC	2	8	235410	235417	50 %	0 %	25 %	25 %	383768499
5997	NC_017082	CGA	2	6	235458	235463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383768499
5998	NC_017082	GGGC	2	8	235467	235474	0 %	0 %	75 %	25 %	383768499
5999	NC_017082	CGC	2	6	235480	235485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383768499
6000	NC_017082	GGT	2	6	235561	235566	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383768499

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